云南独龙鸡和白来航鸡卵巢组织转录组水平的比较分析

作     者：任宇 丁玥竹 农燕鸿 郭爱伟 刘莉莉 REN Yu;DING Yuezhu;NONG Yanhong;GUO Aiwei;LIU Lili

作者机构：西南林业大学生命科学学院昆明650224 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2022年第53卷第1期

页      面：43-52页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：云南省科技厅基础研究青年项目(2019FD06) 国家自然科学基金项目(31902152) 云南省教育厅科学研究基金项目(2018 JS333)。 

主　　题：独龙鸡 白来航鸡 卵巢组织 转录组测序 差异表达基因 

摘      要：旨在利用RNA-seq技术筛选和分析云南独龙鸡和白来航鸡卵巢组织的差异表达基因,为独龙鸡后续基因功能、品种改良和种质特性等研究奠定基础。本研究采集了3只43周龄健康状况良好的独龙鸡卵巢组织进行转录组测序,并与相似饲养条件和周龄的白来航鸡卵巢组织进行比较。结果表明,与白来航鸡相比,独龙鸡中共有1273个差异表达基因,其中上调基因522个,下调基因751个。GO和KEGG富集分析显示,差异表达基因主要参与蛋白水解、翻译、细胞外泌体、膜组分、结合和催化等过程,在蛋白合成、ECM-受体相互作用、氧化磷酸化、粘着斑等通路中起到重要作用。对显著性通路分析发现独龙鸡在蛋品质和免疫抗性上具有一定优势,但在产蛋性能上与白来航鸡还存在一定差距。本研究筛选到的RPL22、ATP5I、COX5A、JAKMIP1、CATH2基因主要富集在抗性、产蛋性能和蛋品质相关通路中,可作为重要候选基因进一步深入研究。