MALDI-TOF MS技术和AFLP技术在肺炎链球菌同源性分析中的应用

作     者：黄阿环 陈文标 陈清清 雷莹 李湘琪 陈慧玲 HUANG A-huan;CHEN Wen-biao;CHEN Qing-qing;LEI Ying;LI Xiang-qi;CHEN Hui-ling

作者机构：泉州医学高等专科学校检验预防学院福建362011 泉州医学高等专科学校高品医学检验研发孵化基地 泉州医学高等专科学校基础医学部 泉州市第一医院 泉州市儿童妇幼保健院 

出 版 物：《医学动物防制》 (Journal of Medical Pest Control)

年 卷 期：2022年第38卷第3期

页      面：265-270页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：福建省中青年教师教育科研项目(JAT160851) 泉州市科技计划项目(2016Z057) 

主　　题：基质辅助激光解吸飞行时间质谱 扩增片段长度多态性 肺炎链球菌 同源性 应用 分析 

摘      要：目的探讨基质辅助激光解吸飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)技术和扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism, AFLP)技术在肺炎链球菌的鉴定和同源性分析中的应用。方法收集2016年11月—2017年12月泉州市儿童妇幼保健院临床分离的52株肺炎链球菌标本,用全自动细菌鉴定仪和Optochin试验进行鉴定验证,分别使用MALDI-TOF MS技术和AFLP技术进行同源性分析,形成聚类树,研究两种方法在肺炎链球菌同源性分析中的应用。结果 MALDI-TOF MS技术检测52株细菌均为肺炎链球菌。经过IVD MALDI Biotyper软件获得聚类树图,分为两大簇包括Ⅰ型13株、Ⅱ型39株,其中Ⅱ型又分为两小簇(Ⅱa型24株、Ⅱb型15株)。AFLP技术检测52株肺炎链球菌基因组DNA样本,以电泳条带位置计算出样本间的遗传距离,建构样本的系统发育树,分为两大簇包括Ⅰ型1株、Ⅱ型51株,其中Ⅱ型又分为两小簇(Ⅱa型48株、Ⅱb型3株)。结论 MALDI-TOF MS技术能准确、快速鉴定肺炎链球菌;Biotyper软件进行同源性分析十分快速、便捷,按照0.5差异水平,与AFLP技术的结果有一致性,但也存在差异。