野菊bZIP转录因子全基因组鉴定及生物信息学分析

作     者：刘贺 黄沁梅 刘颖婕 何淼 周蕴薇 

作者机构：东北林业大学园林学院 吉林农业大学园艺学院 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家自然科学基金(31870687)资助 

主　　题：野菊 bZIP 转录因子 基因家族 生物信息学 

摘      要：野菊(Chrysanthemum indicum)是重要的资源植物，广泛分布于东北、华北、华中、华南和西南地区，具有较高的药用和观赏价值。bZIP转录因子参与许多种植物的生物学过程，对植物抵抗逆境胁迫起着较高的调控作用。利用生物信息学分析的方法在野菊全基因组数据库中对野菊bZIP转录因子进行全基因组鉴定，预测和分析基因结构、蛋白性质、蛋白结构、启动子。结果表明，野菊bZIP转录因子家族共有75个基因；亲缘关系较近的野菊bZIP基因的基因结构较为相似；保守基序分析结果表明，每个基因所包含的保守基序的种类、数量及分布位置具有一定相似性，但也存在差异；聚在同一亚家族的基因所含有的保守基序的种类、数量和分布位置相似。bZIP转录因子家族基因的启动子中有多种顺式作用元件，其中光反应性元件最多，其次是植物激素反应性元件。野菊bZIP转录因子家族的分析结果可为进一步研究野菊bZIP基因的功能和分子机制提供了依据。