万安玻璃红鲤鱼PKR的克隆鉴定与系统进化分析

作     者：罗辉 陈洁 邵敏 曾菲 万力 朱圆玉 胡有生 LUO Hui;CHEN Jie;SHAO Min;ZENG Fei;WAN Li;ZHU Yuan-yu;HU You-sheng

作者机构：井冈山大学医学部江西吉安343009 吉安县疾病预防控制中心江西吉安县343100 南昌大学抚州医学院江西抚州344000 

出 版 物：《井冈山大学学报（自然科学版）》 (Journal of Jinggangshan University (Natural Science))

年 卷 期：2021年第42卷第6期

页      面：35-40页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31560595) 井冈山大学博士科研启动项目(2019) 井冈山大学2020年校级大学生创新创业训练项目(214) 井冈山大学2021年省级大学生创新创业训练计划项目(80) 

主　　题：万安玻璃红鲤鱼 双链RNA依赖的蛋白激酶 基因克隆 基因鉴定 

摘      要：本研究以万安玻璃红鲤鱼为材料,通过同源克隆的方法克隆了万安玻璃红鲤鱼双链RNA激活的蛋白激酶(PKRCcvwPKR),并首次克隆到CcvwPKR的剪接异构体。CcvwPKR全长为2145 bp,编码714个氨基酸,CcvwPKR剪接异构体全长1431 bp,编码476个氨基酸。CcvwPKR的剪接异构体是CcvwPKR第477个密码子的G突变为T(gaa477taa),从而使得CcvwPKR的翻译提前终止。氨基酸序列比对和空间结构SMART预测显示,CcvwPKR和CcvwPKR剪接异构体都含有三个双链RNA结合模体(dsRBM),CcvwPKR剪接异构体缺失PKR的C端的激酶结构域。系统进化分析表明,万安玻璃红鲤鱼PKR在进化上与鲤鱼和鲫鱼密切相关。万安玻璃红鲤鱼和目前已有研究的鲤科鱼类PKR一样,分子结构都含有三个dsRBM,三个dsRBM使得其具有更强的结合dsRNA的作用,推测可能与其较强的抗病能力有关。