兔出血症病毒2型TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用
Establishment and application of a TaqMan-based fluorescence quantitative real-time PCR assay for detection of rabbit hemorrhagic disease virus type 2作者机构:江苏省农业科学院兽医研究所/农业部兽用生物制品工程重点实验室江苏南京210014
出 版 物:《江苏农业学报》 (Jiangsu Journal of Agricultural Sciences)
年 卷 期:2021年第37卷第6期
页 面:1476-1480页
核心收录:
学科分类:090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金:国家自然科学基金项目(31702274) 现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-43-C-1)。
主 题:兔出血症病毒2型 TaqMan探针 荧光定量RT-PCR 敏感性 特异性
摘 要:以新发生的兔出血症病毒2型(RHDV2)SC 2020/04株VP60基因序列为参考,设计出1对特异性引物和TaqMan探针,建立了一种快速、灵敏且特异的用于检测新型病毒的荧光定量RT-PCR检测方法。试验结果显示:本研究建立的方法,标准曲线线性关系良好,R^(2)值达到0.999;其特异性较好,与兔出血症病毒1型(RHDV1)、仙台病毒(SV)和轮状病毒(RRV)病原均无交叉反应;灵敏性高,最低检出量为1μl 1×10拷贝;且重复性良好,批内和批间试验的变异系数平均值均小于2%。临床检测结果表明,利用该方法对108份临床病料进行检测,检出RHDV2阳性样品72份,检出率为66.7%,明显高于常规的RT-PCR方法(62.0%)。结果证明,新建立的TaqMan荧光定量RT-PCR方法适合于RHDV2感染的特异性诊断。