基于生物信息学分析HLA-DMA基因在LGG中的表达和功能

作     者：李泽艳 王晓旋 来明名 马雪艳 LI Ze-yan;WANG Xiao-xuan;LAI Ming-ming;MA Xue-yan

作者机构：大理大学基础医学院 

出 版 物：《医学信息》 (Journal of Medical Information)

年 卷 期：2021年第34卷第24期

页      面：21-26页

学科分类：0711[理学-系统科学] 1002[医学-临床医学] 07[理学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金地区基金项目(编号:82160504) 

主　　题：LGG HLA-DMA 免疫调节 

摘      要：目的基于生物信息学方法探讨HLA-DMA基因在低级别脑胶质瘤(LGG)中的表达和功能。方法基于GEPIA数据库分析HLA-DMA在LGG和正常组织中的表达差异;从TCGA数据库中下载正常组织和LGG组织基因表达数据和临床资料,采用R软件分析HLA-DMA表达水平与临床病理特征和预后的关系;利用Coexpedia构建HLA-DMA在LGG中的共表达基因网络,并用FunRich软件对共表达基因进行注释;借助GSEA探讨HLA-DMA参与的信号通路。结果 LGG组织中HLADMA表达高于正常组织,差异有统计学意义(P0.05),且与肿瘤分级和预后相关;单、多因素Cox分析显示,HLA-DMA可作为LGG患者的独立预后因素(P0.05);HLA-DMA与共表达基因所参与的分子生物学功能主要与免疫调节相关;GSEA结果显示,HLA-DMA高表达主要富集于免疫调节相关通路和凋亡通路。结论 HLA-DMA在LGG中呈高表达,可作为LGG治疗和预后评估的潜在靶点。