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Brain Tumor Detection and Segmentation Using RCNN

Computers, Materials & Continua 2022年第6期71卷 5005-5020页

作者： Maham Khan Syed Adnan Shah Tenvir Ali Quratulain Aymen Khan Gyu Sang Choi Department of Computer Science University of Engineering&TechnologyTaxila47080Pakistan Faculty of Computing The Islamia University of BahawalpurBahawalpur63100Pakistan Department of Information and Communication Engineering Yeungnam UniversityGyeongbuk38541Korea

Brain tumors are considered as most fatal cancers.To reduce the risk of death,early identification of the disease is required.One of the best available methods to evaluate brain tumors is Magnetic resonance Images(MRI).Brain tumor detection and segmentation are tough as brain tumors may vary in size,shape,and location.That makes manual detection of brain tumors by exploring MRI a tedious job for radiologists and doctors’.So an automated brain tumor detection and segmentation is required.This work suggests a Region-based Convolution Neural Network(RCNN)approach for automated brain tumor identification and segmentation using MR images,which helps solve the difficulties of brain tumor identification efficiently and accurately.Our methodology is based on the accurate and efficient selection of tumorous areas.That reduces computational complexity and time.We have validated the designed experimental setup on a standard dataset,BraTS 2020.We used binary evaluation matrices based on Dice Similarity Coefficient(DSC)and Mean Average Precision(mAP).The segmentation results are compared with state-of-the-art methodologies to demonstrate the effectiveness of the proposed method.The suggested approach attained an averageDSC of 0.92 andmAP 0.92 for 10 patients,while on the whole dataset,the scores are DSC 0.89 and mAP 0.90.The following results clearly show the performance efficiency of the proposed methodology.

关键词： Brain tumor MRI preprocessing image segmentation brain tumor localization medical ML RCNN BraTS 2020 LGG HGG

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Bioinformatics comprehensive analysis confirmed the potential involvement of SLC22A1 in lower-grade glioma progression and prognosis

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BIOCELL 2024年第5期48卷 803-815页

作者： JING HUI NANA SUN YONG LIU CHUNBO YU YONG KE YONG CAO ANXIAO YU QINGHONG KONG YUN LIU Guizhou Provincial College-Based Key Lab for Tumor Prevention and Treatment with DistinctiveMedicines Zunyi Medical UniversityZunyi563000China College of Basic Medicine Zunyi Medical UniversityZunyi563000China Department of Dermatology Guizhou Province Cosmetic Plastic Surgery HospitalAffiliated Hospital of Zunyi Medical UniversityZunyi563000China School of Forensic Medicine Zunyi Medical UniversityZunyi563000China

Background:Although it has been established that the human Solute Carrier Family 22(SLC22)functions as a cationic transporter,influencing cellular biological metabolism by modulating the uptake of various cations,its impact on cancer prognosis remains unclear.Methods:We conducted a comprehensive analysis utilizing data from The Cancer Genome Atlas(TCGA)and other databases to assess the prognostic value and functional implications across various tumors.Silence of SLC22A1 RNA in glioma U251 cells was performed to access the impact of SLC22A1 on lowergrade glioma(LGG)progression.Results:Our findings demonstrated a significant correlation between SLC22A1 expression and the survival time of patients with various cancers(pLGG.Further examination of the SLC22A1-LGG relationship revealed its status as an independent risk factor for LGG,suggesting its potential involvement in regulating diverse immune pathways and metabolic activities.Chinese Glioma Genome Atlas(CGGA)data supported the reliability of the risk score as a prognostic and recurrence indicator,emphasizing the accuracy of the nomograph(1,3,and 5-year-AUC>0.8).Cell proliferation and clone formation experiment proved that decreased expression of SLC22A1 in glioma U251 cells inhibited glioma cell growth.Conclusion:Our findings suggest SLC22A1 has huge prospects as a promising biomarker and therapeutic target for LGG prognosis.SLC22A1 has only been proved to support cellular function previously.Our findings demonstrated a robust connection between the tumor microenvironment and functional proteins that maintain basal cell metabolism,which gifts unique tumor immune characteristics of gliomas.Additionally,we provide a highly practical prediction model for estimating the survival rate of LGG patients.

关键词： SLC22A1 LGG prognosis immune nomogram

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不同途径给予益生菌对雏鸡感染H9N2亚型禽流感病毒的保护作用研究

不同途径给予益生菌对雏鸡感染H9N2亚型禽流感病毒的保护作用研究

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作者：李梓君吉林农业大学

学位级别：硕士

H9N2亚型禽流感病毒(AIV)这些年一直给我国家禽养殖业带来严重危害,虽然造成的死亡率低,但是会影响禽类的产蛋产肉的性能,已经严重危害到我国禽养殖业;目前尚未发现针对该亚型的特效药,通常是依靠接种疫苗来实现对该疾病的控制,但是疫... 详细信息

H9N2亚型禽流感病毒(AIV)这些年一直给我国家禽养殖业带来严重危害,虽然造成的死亡率低,但是会影响禽类的产蛋产肉的性能,已经严重危害到我国禽养殖业;目前尚未发现针对该亚型的特效药,通常是依靠接种疫苗来实现对该疾病的控制,但是疫苗的接种效果也不甚理想,并且感染后继发其他疾病感染的概率也极高,此前我国对H9N2亚型AIV还没有足够的重视,所以应该提高对H9N2亚型AIV的关注,争取找到有效地防治措施,从而将损失降低。在防控这类呼吸道疾病时,抗生素的添加已经造成了耐药菌株的出现和环境污染的严重后果,微生态制剂成为更理想的选择。口服益生菌仍是最常用的微生物组调控策略,大多数关于微生物疗法抗病毒作用的研究都是基于微生物区系与肠道免疫刺激和气道免疫之间的串扰,简化口服益生菌给药。除了口服外,将有益细菌直接局部输送到呼吸道正成为一种安全且更有效的策略,但是仍然很少有研究将呼吸道微生物区系的调节作为治疗手段。因此,实验选择雏鸡为对象,在雏鸡14日龄时开始给予三种益生菌:大肠杆菌Nissle 1917(Ec N)、枯草芽孢杆菌(BSH)、鼠李糖乳杆菌(LGG)分别通过消化道和呼吸道给药的方式,也就是灌胃和滴鼻连续7天,然后感染H9N2亚型AIV,之后记录雏鸡的体重、生长状态,在攻毒后第5天和第14天取肺脏制作病理切片,取盲肠扁桃体和脾脏进行流式细胞术,结果发现口服Ec N的雏鸡对H9N2亚型AIV的抵抗效果最佳,能够使体重回涨得更快,更好地维持了肺脏组织的完整性,使雏鸡盲肠扁桃体内的CD8T细胞水平显著上调,证明Nissle 1917从消化道进入机体后能一定程度上产生对H9N2亚型AIV的保护效果。为进一步研究了雏鸡给予Ec N后上呼吸道内菌群的变化,以此来探究其如何调节气管内菌群的分布来抵抗H9N2亚型AIV的感染。将Ec N和PBS连续给予雏鸡7天,然后感染H9N2亚型AIV病毒。在病毒感染后的第5天和第14天,取雏鸡的气管灌洗液进行16Sr RNA测序分析,经Ec N处理的雏鸡在感染H9N2亚型AIV后,其气管灌洗液较对照组相比呼吸道内的微生物拥有更多的数量和更丰富的种类,分布得也更加均匀,同为益生菌的布劳特菌属(Blautia)乳杆菌属(Lactobacillus)丰度也显著增加,在病毒感染后期,Ec N使得乳杆菌(Lactobacillus)和肠球菌属(Enterococcus)的相对丰度显著增加,说明它可以通过调整上呼吸道内微生态区系的平衡来促进雏鸡产生对H9N2亚型AIV的抵抗力。

关键词：益生菌 H9N2亚型AIV EcN LGG

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CNPY4在低级别胶质瘤中的预后价值及临床意义的研究

CNPY4在低级别胶质瘤中的预后价值及临床意义的研究

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作者：王壮壮山西医科大学

学位级别：硕士

目的:研究冠层FGF信号调节器4(Canopy FGF Signaling Regulator 4,CNPY4)的表达在低级别胶质瘤(Low-Grade Glioma,LGG)中的表达和预后差异,分析CNPY4与肿瘤免疫之间关系,并预测CNPY4在胶质瘤中对替莫唑胺(Temozolomide,TMZ)和顺铂的药物敏感性。方法:通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和中国胶质瘤基因组图谱(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)两个独立的数据库以及基因型组织表达(The Genotype-Tissue Expression,GTEx)正常组织数据库,得到CNPY4的表达信息、预后信息和临床表型特征,然后通过在线分析软件以及R软件进行数据整理和分析。首先分析CNPY4在胶质瘤中的在RNA水平的差异表达,并通过人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas,HPA)数据库验证CNPY4在蛋白水平的表达差异,然后分析CNPY4的差异表达对胶质瘤生存的影响。此外,通过肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)和肿瘤免疫系统交互的集成存储库门户(Integrated Repository Portal for Tumor-Immune System Interactions,TISIDB)来研究CNPY4与肿瘤浸润免疫细胞(Tumor Infiltrating Iimmune Cells,TIICs)之间的相关性,然后使用肿瘤免疫功能紊乱和排除(Tumor Immune Dysfunction and Exclusion,TIDE)算法预测CNPY4的表达对免疫检查点阻断(Immune Checkpoint Blockade,ICB)的响应性。最后通过基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)来分析CNPY4可能的功能通路,并用COX回归和半数最大抑制浓度(Half-Maximal Inhibitory Concentration,IC50)分析CNPY4对胶质瘤预后和药物敏感性的影响。结果:1、CNPY4在胶质瘤中高表达,作为胶质瘤的关键基因,与较高的胶质瘤世界卫生组织(World Health Organization,WHO)分级相关;2、CNPY4作为一种新型分子标志物是LGG的独立预后因素,CNPY4的高表达提示LGG预后不良;3、CNPY4可能通过调节TIICs及其调节分子影响LGG的预后和发展,CNPY4低表达的胶质瘤患者具有更高的ICB响应性;4、CNPY4的高表达可能提示LGG患者对替莫唑胺和顺铂的敏感性。结论:1、CNPY4作为一种新型分子标志物是低级别胶质瘤(LGG)的独立预后因素,CNPY4的高表达提示LGG预后不良;2、CNPY4可能是潜在的免疫治疗靶点并可预测替莫唑胺和顺铂的高敏感性。

关键词： CNPY4 LGG 肿瘤免疫细胞浸润免疫检查点分子标志物

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纳米二氧化钛对代谢综合征小鼠肝脏和肠道损伤及益生菌干预机制研究

纳米二氧化钛对代谢综合征小鼠肝脏和肠道损伤及益生菌干预机制研...

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作者：赵宇南昌大学

学位级别：硕士

纳米二氧化钛(Titanium dioxide nanoparticles,TiO NPs)是一种白色疏松的粉末,因其优异的抗菌、抗紫外、增白等性能,被广泛应用于食品、药品、个人护理品等领域。TiO NPs日益广泛的使用,导致人类直接或间接对其摄入量不断增大,因此其... 详细信息

纳米二氧化钛(Titanium dioxide nanoparticles,TiO NPs)是一种白色疏松的粉末,因其优异的抗菌、抗紫外、增白等性能,被广泛应用于食品、药品、个人护理品等领域。TiO NPs日益广泛的使用,导致人类直接或间接对其摄入量不断增大,因此其对机体的安全性值得关注。代谢综合征是一种机体碳水化合物、脂肪或蛋白质代谢紊乱的病理状态,由于TiO NPs在食品和医疗品领域的普遍应用,使得代谢综合征病人接触TiO NPs的机会更大。然而,目前TiO NPs的毒理学研究普遍基于健康机体,针对代谢综合征疾病机体的毒理学研究较为匮乏。本研究旨在评估TiO NPs对代谢综合征机体的安全风险,并提出益生菌干预策略。通过动物实验证明TiO NPs对代谢综合征小鼠肝脏和肠道损伤的加剧效应,探究益生菌鼠李糖乳杆菌GG(LGG)干预TiO NPs诱导的肝脏和肠道损伤及引起肠道菌群紊乱作用,并通过粪菌移植实验证明肠道菌群是TiO NPs引起代谢综合征小鼠肝脏和肠道损伤的重要机制。各章内容分述如下:第一章:综述了TiO NPs对健康机体和部分疾病群体肝脏和肠道损伤的作用和机制,及益生菌干预的策略和研究进展。第二章:为了探究经口暴露TiO NPs对代谢综合征小鼠肝脏和肠道损伤的加剧效应,本研究对暴露前后小鼠的机体指标、葡萄糖耐受能力、肝脏和肠道病理损伤情况、肝脏组织TiO NPs与内毒素含量、肝脏和肠道炎症和氧化应激效应进行了综合评估。结果发现,暴露TiO NPs并未影响果糖饮水诱导代谢综合征模型的形成。然而,代谢综合征小鼠肝功能指标变化加剧、肝脏和肠道组织病理损伤明显增加、肝脏和肠道氧化应激反应加剧。暴露相同剂量TiO NPs后,代谢综合征小鼠肝脏中Ti元素含量和内毒素水平明显增加,可能是由于TiONPs诱导代谢综合征小鼠肠道通透性明显增加,紧密连接蛋白和基因表达显著下调,肠道屏障进一步受损,导致更多的TiO NPs与内毒素迁移至肝脏。上述结果表明,TiO NPs能加剧代谢综合征小鼠肝脏和肠道损伤。第三章:为了研究益生菌LGG对TiO NPs引起的代谢综合征小鼠肝脏和肠道炎症损伤的干预保护作用,本研究对暴露前后小鼠的体重、附睾脂肪、葡萄糖耐受能力、血脂水平进行了综合评估,结果表明LGG能够有效抑制果糖饮水引起的代谢综合征形成。此外,本研究对小鼠组织病理损伤情况、肝脏和肠道炎症、结肠紧密连接情况进行了综合评估。结果发现,干预LGG后,暴露TiO NPs的代谢综合征小鼠肝功能指标正常化、肝脏和结肠组织病理损伤得到缓解、粪便和血清内毒素水平降低、肝脏和结肠促炎细胞因子水平下降、机体抑炎细胞因子水平升高、结肠紧密连接蛋白基因表达明显上调。上述结果表明,LGG干预后改善了果糖引起的小鼠代谢紊乱,并缓解了TiO NPs引起的代谢综合征小鼠肝脏和肠道炎症损伤。第四章:为了探究TiO NPs对代谢综合征小鼠肠道菌群的影响及LGG干预作用,本研究利用16S rDNA高通量测序技术分析了小鼠肠道菌群变化。结果表明,TiO NPs能够进一步加剧代谢综合征小鼠肠道菌群α多样性和β多样性改变。暴露TiO NPs后,代谢综合征小鼠肠道差异菌群种类数相比正常小鼠进一步增多;促进炎症发生的菌群相对丰度明显增大;肠道代谢通路预测分析结果表明,TiO NPs可能进一步促进代谢综合征小鼠代谢紊乱。在补充LGG后,TiONPs引起的上述肠道菌群结构和功能变化得到有效恢复。上述结果表明,LGG干预能够抑制TiO NPs诱导的代谢综合征小鼠肠道菌群紊乱。第五章:为了探究TiO NPs对代谢综合征小鼠肝脏和肠道炎症损伤的机制,本研究将暴露TiO NPs的代谢综合征小鼠肠道菌群移植给已清除肠道微生物的受体小鼠,然后对受体小鼠肝脏和肠道损伤情况进行综合评价。结果发现,受体小鼠血清肝功能指标发生异常、血清内毒素水平明显升高、肝脏和肠道组织出现明显炎症病理损伤、肝脏和肠道炎性细胞因子水平显著增加。上述结果表明,肠道菌群在TiO NPs加剧代谢综合征小鼠肝脏和肠道的损伤效应中发挥重要的介导作用。综上所述,本研究发现TiO NPs可诱导代谢综合征小鼠肝脏和肠道炎症损伤加剧,并引起代谢综合征小鼠肠道菌群紊乱。益生菌LGG干预后,TiO NPs对代谢综合征小鼠肝脏和肠道的炎症损伤被有效抑制,小鼠肠道菌群结构和功能也得到有效恢复。此外,粪菌移植实验证明肠道菌群可能是TiO NPs诱导代谢综合征小鼠肝脏和肠道炎症损伤的重要机制。

关键词：纳米二氧化钛代谢综合征 LGG 肝肠损伤肠道菌群粪菌移植

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Muc2基因沉默可降低益生菌抑制大肠杆菌黏附和侵袭的能力

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南方医科大学学报 2016年第6期36卷 819-823页

作者：邱嘉文何肖龙张宝杜蕾曾庆李森熊欢欢龙敏罗军曹虹南方医科大学公共卫生与热带医学学院//广东省热带病研究重点实验室微生物学系广东广州510515 南方医科大学P3实验室广东广州510515 南方医科大学第一临床医学院广东广州510515

目的建立抑制肠上皮细胞基因组中Muc2基因表达的CRISPR/Cas9系统并探索粘蛋白Muc2在鼠李糖乳杆菌GG株（LGG）抑制大肠杆菌K1（Escherichia coli,E.coli k1）株E44黏附和侵袭肠上皮中的作用机制。方法设计2个长20～25 bp的sg RNA分别靶向... 详细信息

目的建立抑制肠上皮细胞基因组中Muc2基因表达的CRISPR/Cas9系统并探索粘蛋白Muc2在鼠李糖乳杆菌GG株（LGG）抑制大肠杆菌K1（Escherichia coli,E.coli k1）株E44黏附和侵袭肠上皮中的作用机制。方法设计2个长20～25 bp的sg RNA分别靶向Muc2,合成sg RNA寡核苷酸序列并构建CRISPR表达载体,转染野生型人结肠癌Ht29细胞,蛋白免疫印迹法检测抑制效率及通过MTT法检测其细胞活力及生长情况后,竞争性排斥分析验证粘蛋白Muc2在益生菌抑制E44黏附侵袭肠上皮中的作用。结果目的sg RNA寡核苷酸双链成功插入酶切后的lenticrisprv2质粒载体中且序列正确;稳定抑制Muc2表达的细胞株筛选成功;Muc2基因沉默后,与空白对照组相比,其表达水平明显降低,抑制率可达81%（P〈0.01）;黏附侵袭实验中E44相对黏附率为72.23%（P〈0.01）,相对侵袭率为81.49%（P〈0.01）,益生菌LGG的抑制E44黏附和侵袭作用明显下调。结论Muc2基因下调明显降低益生菌抑制E44黏附和侵袭肠上皮细胞的能力,提示益生菌刺激Muc2表达上调可能是其强化加固肠粘膜屏障和拮抗致病菌功能的关键性机制之一,并可为肠道细菌性感染疾病的预防治疗提供了一个新手段。

关键词： Muc2 LGG E.coli K1 CRISPER/Cas9 Ht29 侵袭

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脑胶质瘤IDH基因表型的放射基因组学研究

脑胶质瘤IDH基因表型的放射基因组学研究

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作者：梅东东暨南大学

学位级别：硕士

第一部分脑胶质瘤MRI特征与IDH基因表型的相关性目的探讨脑胶质瘤MRI特征与异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)基因表型之间的相关性。材料与方法回顾性分析深圳市人民医院2010年1月8日018年8月31日66例经病理证实且术前行MR... 详细信息

第一部分脑胶质瘤MRI特征与IDH基因表型的相关性目的探讨脑胶质瘤MRI特征与异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)基因表型之间的相关性。材料与方法回顾性分析深圳市人民医院2010年1月8日018年8月31日66例经病理证实且术前行MRI检查的脑胶质瘤患者临床资料。采用荧光PCR-毛细管电泳测序法检测肿瘤IDH1/IDH2的突变状态。比较IDH野生型及突变型胶质瘤之间的MR特征。ΡLGG),11例(36.7%)为高级别胶质瘤(high grade gliomas,HGG);36例为IDH野生型,其中6例(16.7%)为LGG,30例(83.3%)为HGG。LGG中IDH突变率为73.2%,高于HGG中的26.8%,差异有统计学意义(p=0.000)。IDH突变胶质瘤好发于额叶,其次是颞叶,而IDH野生型胶质瘤没有分布优势。IDH野生型及突变型胶质瘤的位置分布有统计学意义(p=0.032)。本组IDH突变型胶质瘤的增强率为(41.2±42.0)%,低于IDH野生型肿瘤的(82.4±57.0)%,差异有统计学意义(p=0.001)。IDH突变型胶质瘤常表现为条片状强化,而IDH野生型胶质瘤多为环形强化。IDH突变组与野生型组之间MR强化方式差异具有统计学意义(p=0.022)。IDH突变型和IDH野生型胶质瘤在直径和水肿程度及ADC值差异无统计学意义(p>0.05)结论MRI特征与脑胶质瘤IDH基因表型有关,影像特征有可能成为评价IDH基因表型的影像学标记。第二部分基于多参数MRI放射组学特征预测脑胶质瘤分级和IDH基因表型的研究目的探讨基于多参数放射组学特征与高级别(high grade glioma,HGG)、低级别(low grade glioma,LGG)脑胶质瘤及IDH基因表型的相关性和在体预测胶质瘤分级及IDH基因表型的价值。材料与方法回顾性研究纳入61例经病理证实且术前行MRI检查的脑胶质瘤患者,每位患者共计提取T2WI,ADC,DWI(b=1000)及T1WI增强扫描图影像组学特征428个。采用荧光PCR-毛细管电泳测序法检测肿瘤IDH的基因表型。运用单因素分析比较特征与分级及IDH基因表型的相关性,将有统计学意义的特征(pLGG和HGG间差别有统计学意义(p<0.05)。LASSO回归筛选出11个放射组学特征为HGG发生的独立预测因子。利用年龄、性别和影像放射组学信号分数构建诺模图,并进行内部验证,模型具有较高的预测胶质瘤分级能力,C-index为0.963[95%CI(0.922-0.999)],灵敏度为86.1%,特异度为96.0%。⑵临床特征中,年龄与IDH基因表型有相关性。428个放射组学特征中,单因素分析表明有36个特征在IDH突变型组和IDH野生型组间差异存在统计学意义。LASSO回归筛选出9个放射组学特征为IDH突变的独立预测因子。诺模图预测模型保留了年龄和放射组学信号分数,进行内部验证,模型具有较高的预测IDH突变能力,C-index为0.913,灵敏度为89.7%,特异度为81.2%。结论基于多参数MRI的放射组学特征与脑胶质瘤分级和IDH基因表型有关。结合放射组学特征及临床特征的诺模图模型具有较高的预测价值;基于多参数MRI的放射组学信号有望成为在体预测胶质瘤分级和IDH基因表型的替代影像学生物标记,为临床脑胶质瘤的精准诊断提供决策支持。

关键词：脑胶质瘤 IDH 表型 MRI 放射组学 HGG LGG IDH表型放射组学信号分数诺模图

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低级胶质瘤候选靶标及预后标志物SLC4A家族的生物信息学分析

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中南医学科学杂志 2023年第4期51卷 492-496页

作者：刘红云张金峰莫黎怡李国庆孟莉娟南华大学衡阳医学院基础医学院细胞生物学与遗传学教研室细胞应激生物学衡阳市重点实验室湖南衡阳421001 南华大学衡阳医学院附属第二医院湖南衡阳421001

目的采用生物信息学分析,筛选SLC4A基因家族中可作为低级胶质瘤(LGG)的候选靶标及预后标志物的基因。方法利用TCGA、GTEx、UCSCXENA、GEPIA、cBioPortal、GeneMANIA、String等数据库,分析LGG患者SLC4A的差异表达、预后价值、遗传改变和... 详细信息

目的采用生物信息学分析,筛选SLC4A基因家族中可作为低级胶质瘤(LGG)的候选靶标及预后标志物的基因。方法利用TCGA、GTEx、UCSCXENA、GEPIA、cBioPortal、GeneMANIA、String等数据库,分析LGG患者SLC4A的差异表达、预后价值、遗传改变和蛋白互作等,根据数据筛选SLC4A基因家族中可作为LGG候选靶标及预后标志物的基因。结果LGG组织中SLC4A2、SLC4A4、SLC4A7、SLC4A8表达升高,而SLC4A1、SLC4A3、SLC4A9、SLC4A10表达降低。SLC4A2、SLC4A3、SLC4A4、SLC4A7、SLC4A10在LGG肿瘤分级中表达存在显著差异。预后价值总生存率的分析发现,高表达SLC4A2、SLC4A3、SLC4A7、SLC4A8和低表达SLC4A5、SLC4A10的患者预后较差;无病生存率的分析发现,高表达SLC4A2、SLC4A3、SLC4A8和低表达SLC4A10的患者预后较差。结论SLC4A2、SLC4A3、SLC4A7、SLC4A8、SLC4A10可能是LGG潜在候选靶标及预后标志物。

关键词： LGG 预后标志物 SLC4A家族生物信息学分析

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基于生物信息学分析HLA-DMA基因在LGG中的表达和功能

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医学信息 2021年第24期34卷 21-26页

作者：李泽艳王晓旋来明名马雪艳大理大学基础医学院

目的基于生物信息学方法探讨HLA-DMA基因在低级别脑胶质瘤(LGG)中的表达和功能。方法基于GEPIA数据库分析HLA-DMA在LGG和正常组织中的表达差异;从TCGA数据库中下载正常组织和LGG组织基因表达数据和临床资料,采用R软件分析HLA-DMA表达水... 详细信息

目的基于生物信息学方法探讨HLA-DMA基因在低级别脑胶质瘤(LGG)中的表达和功能。方法基于GEPIA数据库分析HLA-DMA在LGG和正常组织中的表达差异;从TCGA数据库中下载正常组织和LGG组织基因表达数据和临床资料,采用R软件分析HLA-DMA表达水平与临床病理特征和预后的关系;利用Coexpedia构建HLA-DMA在LGG中的共表达基因网络,并用FunRich软件对共表达基因进行注释;借助GSEA探讨HLA-DMA参与的信号通路。结果 LGG组织中HLADMA表达高于正常组织,差异有统计学意义(PLGG患者的独立预后因素(PLGG中呈高表达,可作为LGG治疗和预后评估的潜在靶点。

关键词： LGG HLA-DMA 免疫调节

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鼠李糖乳杆菌GG株联合氨基酸奶粉治疗婴儿牛奶蛋白过敏的临床研究

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中国科技期刊数据库医药 2023年第8期 0021-0025页

作者：秦弦陈红兵周平重庆大学附属三峡医院儿童消化血液肾脏病区重庆404100

探讨鼠李糖杆菌GG株(LGG)联合氨基酸配方奶粉和单纯氨基酸配方奶粉喂养相比,能否缩短牛奶蛋白过敏患儿的临床症状缓解时间,同时使牛奶蛋白过敏患儿更早实现口服免疫耐受。方法选取2019年5月-2022年5月于我院儿童消化科门诊就诊的牛奶... 详细信息

探讨鼠李糖杆菌GG株(LGG)联合氨基酸配方奶粉和单纯氨基酸配方奶粉喂养相比,能否缩短牛奶蛋白过敏患儿的临床症状缓解时间,同时使牛奶蛋白过敏患儿更早实现口服免疫耐受。方法选取2019年5月-2022年5月于我院儿童消化科门诊就诊的牛奶蛋白过敏婴儿80例,随机分为对照组(40例)和治疗组(40例),对照组采用常规治疗+氨基酸配方奶粉喂养,治疗组在对照组基础上加用鼠李糖乳杆菌GG株(LGG),定期随访牛奶蛋白过敏婴儿临床症状的缓解时间及获得口服免疫耐受时间。结果 1、治疗组和对照组婴儿腹泻、腹胀、拒奶等症状均能在2周内缓解,两组比较差异没有统计学意义(P>0.05);2、治疗组和对照组湿疹在治疗后3个月缓解率分别为80%和65%,两组比较差异有统计学意义(PLGG)联合氨基酸配方奶粉治疗组在治疗后6个月时有42.5%患儿实现口服免疫耐受,单纯氨基酸配方奶粉喂养组在治疗6个月后实现口服免疫耐受率为17.5%,两组比较差异有统计学意义(PLGG)联合氨基酸配方奶粉喂养较单纯氨基酸奶粉喂养能更早缓解牛奶蛋白过敏婴儿的湿疹情况,同时能更早实现口服免疫耐受。

关键词：鼠李糖乳杆菌GG株牛奶蛋白过敏 LGG 口服免疫耐受。

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