A型塞尼卡病毒与O型、A型、亚洲I型口蹄疫病毒多重TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用
ESTABLISHMENT AND APPLICATION OF A MULTIPLEX TAQMAN REAL-TIME RT-PCR FOR DIFFERENTIAL DETECTION OF SENECAVIRUS A AND SEROTYPES O, A, ASIA I OF FMDV作者机构:广西动物疫病预防控制中心 广西大学动物科学技术学院
出 版 物:《中国动物传染病学报》 (Chinese Journal of Animal Infectious Diseases)
年 卷 期:2021年
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金:广西科技重大专项(桂科AA17204057) 广西水产畜牧科技项目(桂渔牧科201528017) 广西农业科技项目(Z201954)
主 题:A型塞尼卡病毒 口蹄疫病毒 荧光定量RT-PCR 检测方法
摘 要:为建立鉴别检测A型塞尼卡病毒(SVA)与O型、A型、亚洲I型口蹄疫病毒(FMDV)的方法,针对SVA 3D基因与O型、A型、亚洲I型FMDV VP1基因,分别设计特异性引物和TaqMan探针,经优化反应条件,建立了同时检测SVA与O型、A型、亚洲I型FMDV的TaqMan荧光定量RT-PCR方法。所建立的方法能特异性扩增SVA及O型、A型、亚洲I型FMDV,与其他主要猪源病毒无交叉反应;对SVA与O型、A型、亚洲I型FMDV质粒标准品的检出下限分别为2.50×10;、2.50×10;、2.50×10;、2.50×10;拷贝/μL;组内与组间重复性试验的变异系数均小于2%。应用所建立方法检测2019年来自广西的30份临床疑似样品,SVA和O型FMDV的检出阳性率分别为20%和70%,而未能检出A型和亚洲I型FMDV。表明,本研究所建立的多重荧光定量RT-PCR方法为SVA与O型、A型、亚洲I型FMDV的临床检测和流行病学调查提供了特异、敏感、高效的技术手段。