非小细胞肺癌自适应放疗患者血浆外泌体微小RNA差异表达谱和生物信息学分析
Differential Expression of Plasma Exosomal MicroRNA in Non-small Cell Lung Cancer Patients with Adaptive Radiotherapy and Its Bioinformatic Analysis作者机构:浙江中医药大学浙江杭州310053 温州医科大学附属浙江省台州医院浙江台州317000 中国科学院大学附属肿瘤医院(浙江省肿瘤医院)中国科学院基础医学与肿瘤研究所浙江杭州310022
出 版 物:《肿瘤学杂志》 (Journal of Chinese Oncology)
年 卷 期:2021年第27卷第9期
页 面:728-734页
学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学]
基 金:浙江省基础公益研究计划(LGF21H160027) 浙江省医药卫生科技计划项目(2020PY001,2021PY038)
主 题:非小细胞肺癌 自适应放疗 血浆 外泌体miRNA 生物信息学分析
摘 要:[目的]分析Ⅲ期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)自适应放疗中不同放射敏感性患者的血浆外泌体微小RNA(microRNA,miRNA)差异表达谱,并应用生物信息学分析外泌体miRNA的作用。[方法]NSCLC患者接受自适应放疗20次时的胸部增强CT进行肿瘤评估,划分为放射敏感组与放射抵抗组,从中筛选出5对进行下一步研究。通过QIAseq建库方法构建稳定的miRNA特异文库,并利用Illumina高通量测序技术检测miRNA差异表达谱。对差异miRNA靶基因进行生物信息学分析,分析其涉及的主要生物学功能及信号通路。[结果]与放射敏感患者相比,放射抵抗患者血浆外泌体中共有142个miRNA异常表达,其中下调42个,上调100个。通过基因本体富集及京都基因与基因组百科全书的通路富集分析,上述差异表达miRNA的靶基因功能主要富集于TGF-β、Hedgehog、mTOR、p53等信号通路,涉及RNA聚合酶、泛素样蛋白转移酶等多种细胞生化代谢途径,并参与细胞黏附、细胞周期、衰老等多种生物学过程。[结论]不同放射敏感性NSCLC患者血浆外泌体miRNA表达谱发生了明显变化,可能通过TGF-β等信号通路在NSCLC放射敏感性调控中发挥重要作用。