CRISPR在食源性致病菌进化分析、检测分型及毒力耐药调控中的应用进展

作     者：白芷烨 汪雯 吉小凤 肖英平 张世钦 王梓晨 李红梅 董庆利 Zhiye Bai;Wen Wang;Xiaofeng Ji;Yingping Xiao;Shiqin Zhang;Ziehen Wang;Hongmei Li;Qingli Dong

作者机构：上海理工大学医疗器械与食品学院上海200093 浙江省农业科学院农产品质量安全与营养研究所农业农村部农产品质量安全风险评估实验室(杭州)农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室浙江杭州310021 

出 版 物：《生物工程学报》 (Chinese Journal of Biotechnology)

年 卷 期：2021年第37卷第7期

页      面：2414-2424页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 0831[工学-生物医学工程（可授工学、理学、医学学位）] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 08[工学] 0836[工学-生物工程] 082203[工学-发酵工程] 0822[工学-轻工技术与工程] 

基　　金：国家重点研发计划(No.2019YFE0103800) 浙江省农业科学院省部共建农产品质量安全国家重点实验室开放基金项目(No.2010DS700124-KF2001)资助 

主　　题：CRISPR 食源性致病菌 进化分析 检测与分型 毒力与耐药 

摘      要：规律成簇间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)与其相关蛋白基因系统可通过限制基因的水平转移而有效防御噬菌体等外源基因元件的入侵,不同细菌之间的CRISPR结构有所差异。基于CRISPR系统的差异性,文中对近几年CRISPR在食源性致病菌进化分析、检测与分型、毒力与耐药中的应用研究进行概述,并对基于CRISPR序列特点开发的细菌检测分型方法以及CRISPR与食源性致病菌的毒力、耐药性之间的相关性进行重点总结分析。此外,文中探讨了CRISPR在进化分析、检测与分型、毒力与耐药应用中的不足,提出将CRISPR分型方法标准化、完善与扩充致病菌CRISPR数据库、进一步探究噬菌体与细菌之间的共进化关系等建议,为进一步探索CRISPR功能提供参考。