猪NLRC5基因启动子克隆及生物信息学分析

作     者：刘翔 尹灵丹 薛美 李亮 赵立媛 蒋成凡 王文哲 冯力 刘平黄 LIU Xiang;YIN Lingdan;XUE Mei;LI Liang;ZHAO Liyuan;JIANG Chengfan;WANG Wenzhe;FENG Li;LIU Pinghuang

作者机构：中国农业科学院哈尔滨兽医研究所哈尔滨150069 中国农业大学动物医学院北京100193 

出 版 物：《黑龙江畜牧兽医》 (Heilongjiang Animal Science And veterinary Medicine)

年 卷 期：2021年第13期

页      面：1-5,143页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 0905[农学-畜牧学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31802198) 

主　　题：启动子质粒 双荧光素酶 NLR家族含CARD结构域5(NLRC5)基因 启动子调控元件 转录因子结合位点 生物信息学 

摘      要：为了构建猪NLR家族含CARD结构域5(NOD-like receptor family caspase recruitment domain family domain-containing 5,NLRC5)基因启动子双荧光素酶报告质粒,确认其活性,进而探索其转录调控机制,试验采用PCR方法从猪睾丸细胞(swine testicular cell,ST细胞)中扩增出猪NLRC5基因启动子,将其与pGL3-Basic载体连接,测序正确后将猪NLRC5基因启动子双荧光素酶报告质粒转染至ST细胞中,通过双荧光素酶报告检测试剂盒检测荧光素酶的表达活性,并使用生物信息学软件预测该基因启动子区域的CpG岛、调控元件及转录因子结合位点。结果表明:试验成功构建猪NLRC5基因启动子双荧光素酶报告质粒,该质粒的相对荧光素酶活性极显著高于pGL3-Basic载体(P0.01)。NLRC5基因启动子区域中存在2个CpG岛,TATA box、CCAAT box和GC box等多种调控元件,以及IRF1、IRF3、STAT1、STAT3、STAT4和NF-κB转录因子结合位点。说明猪NLRC5基因的表达可能受甲基化的影响,同时也可能受顺式作用元件以及干扰素和NF-κB相关转录因子的调控。