基于COⅠ基因对东北林蛙、中国林蛙等蛙属24种的鉴定

作     者：王孟虎 孙一帆 许亮 康廷国 张腾腾 左亚锋 朱丽婷 孟祥松 汤建 徐倩 WANG Meng-hu;SUN Yi-fan;XU Liang;KANG Ting-guo;ZHANG Teng-teng;ZUO Ya-feng;ZHU Li-ting;MENG Xiang-song;TANG Jian;XU Qian

作者机构：亳州学院安徽亳州236800 辽宁中医药大学辽宁大连116600 亳州职业技术学院安徽亳州236800 安徽中医药大学第二附属医院合肥230061 

出 版 物：《中国实验方剂学杂志》 (Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae)

年 卷 期：2021年第27卷第16期

页      面：150-158页

核心收录：

学科分类：100504[医学-方剂学] 1006[医学-中西医结合] 1005[医学-中医学] 10[医学] 100602[医学-中西医结合临床] 

基　　金：中央本级重大增减支项目(2060302) 中药原料产品研发安徽普通高校重点实验室(亳州学院)建设项目(KLAHEI18032) 中药学教学团队(亳州学院)(2019jxtd131) 亳州市科技重大专项(BKJZD201801) 亳州市第二批“首席专家工作室”(亳组2020号) 安徽省高等学校省级质量工程项目(2016sxzx027,2016sjjd054) 亳州学院校级项目(BYZ2017C02)。 

主　　题：东北林蛙 中国林蛙 蛙科 蛙属 DNA条形码 线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因(COⅠ) 

摘      要：目的:利用DNA条形码线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ)技术对东北林蛙等24种进行鉴别,构建邻接(NJ)系统发育树,对24种进行系统聚类分析,为东北林蛙等蛙类的鉴别,分类及新种的发现提供一定的依据。方法:收集东北林蛙、中国林蛙、黑龙江林蛙、徂崃林蛙、桓仁林蛙各10只,提取其DNA并进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,将扩增成功的序列测序,共测得50条COⅠ基因序列;从GenBank数据库中获得蛙科蛙属24种163条COⅠ基因序列及蛙科侧褶蛙属,臭蛙属,琴蛙属,水蛙属,湍蛙属各一条COⅠ基因序列;利用MEGA X进行序列比对,分析各物种COⅠ基因序列简约性信息位点,计算种内,种间遗传距离,构建NJ树进行系统聚类分析。结果:东北林蛙等24种COⅠ基因序列长度为554 bp,共有210个简约性信息位点,各物种种内遗传距离均2%;除桑植蛙与明全蛙种间遗传距离为0.004外,其余各物种种间遗传距离范围为0.024~0.228;桑植蛙与明全蛙聚为一支,部分东北林蛙与Rana uenoi聚为一支,中国林蛙有2个独立的分支,其余各物种均独立聚为一支。结论:DNA条形码COⅠ技术能够对东北林蛙等21种进行鉴定及鉴别,支持桑植蛙与明全蛙,韩国林蛙与昆嵛林蛙为同物异名,其中一支中国林蛙可能是蛙科蛙属未下载的4个种之一或新种。这表明DNA条形码COⅠ技术不仅可以鉴定及鉴别东北林蛙等24种蛙类,也可以为蛙科蛙属的分类,新种或亚种的发现提供一定的科学依据。