基于线粒体控制区的江苏湖鲚群体遗传多样性和遗传结构分析

作     者：李大命 唐晟凯 刘燕山 谷先坤 殷稼雯 蒋琦辰 朱凛 李春宁 张彤晴 潘建林 LI Daming;TANG Shengkai;LIU Yanshan;GU Xiankun;YIN Jiawen;JIANG Qichen;ZHU Lin;LI Chunning;ZHANG Tongqing;PAN Jianlin

作者机构：江苏省淡水水产研究所江苏省内陆水域渔业资源重点实验室南京210017 

出 版 物：《海洋渔业》 (Marine Fisheries)

年 卷 期：2021年第43卷第2期

页      面：149-159页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：江苏省水生生物资源重大专项(ZYHB16-3) 江苏省海洋与渔业资源环保项目(ZYHJ2018-2) 

主　　题：湖鲚 线粒体控制区 遗传多样性 遗传结构 

摘      要：为掌握江苏省重要湖泊湖鲚(Coilia nasus taihuensis)群体的遗传多样性和遗传结构,利用线粒体控制区(D-loop)全序列分析了6个湖泊(太湖、滆湖、高邮湖、白马湖、洪泽湖和骆马湖)湖鲚野生群体的遗传多样性水平和群体分化情况。结果表明,6个群体共214尾样本的D-loop序列中,共发现103个变异位点,92种单倍型。6个群体的单倍型多样性为0.726~0.951,核苷酸多样性为0.00552~0.01036,6个群体整体的单倍型和核苷酸多样性分别为0.857和0.00729,表明湖鲚群体的遗传多样性较高,且符合高单倍型多样性和低核苷酸多样性特点。分子方差分析(AMOVA)结果表明,群体间变异百分比为6.20%,群体内变异百分比为93.80%,说明遗传变异主要来自群体内部。群体总的遗传分化系数(F_(st))为0.06199(P0.05)。单倍型分子系统进化树和网络进化图显示,6个群体的单倍型形成了2个谱系,但谱系组成与群体地理分布无相关性。中性检验分析结果显示,湖鲚群体进化过程中经历过种群扩张,扩张时间大约发生在0.089~0.160百万年前。研究结果表明,湖鲚群体具有较高的遗传多样性,滆湖群体与其他群体具有极显著的遗传分化,且拥有多个独享单倍型,应将滆湖群体单独作为一个管理单位,其他5个群体作为一个整体进行管理和利用。