山西省及周边地区利什曼原虫SSU rRNA基因和ITS-1序列克隆及序列系统进化分析
CLONING AND PHYLOGENETIC ANALYSIS OF SSU RRNA AND ITS-1 SEQUENCES OF LEISHMANIA IN SHANXI PROVINCE AND ITS SURROUNDING AREAS作者机构:首都医科大学附属北京友谊医院热带医学研究所北京100050 北京热带病防治研究北京市重点实验室北京100050
出 版 物:《寄生虫与医学昆虫学报》 (Acta Parasitologica et Medica Entomologica Sinica)
年 卷 期:2021年第28卷第1期
页 面:14-22页
学科分类:1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学]
基 金:首都医科大学附属北京友谊医院科研启动基金资助项目(No.yyqdkt2019-42)
主 题:内脏利什曼病 利什曼原虫 SSU rRNA ITS-1 山西
摘 要:为了解山西及周边地区内脏利什曼病的病原体利什曼原虫(Leishmania spp.)的虫种类型及其基因多态性,使用首都医科大学附属北京友谊医院收治的13例来自山西及周边地区的内脏利什曼病患者的骨髓样本提取DNA,分别扩增其核糖体小亚基rRNA(small subunit ribosomal RNA,SSU rRNA)和核糖体DNA内转录间隔区Ⅰ(ITS-1)并应用其序列构建系统发育树确定患者感染原虫的虫种类型及其遗传关系。结果显示,13个临床样本SSU rRNA和ITS-1序列同源性分别为99.59%和99.93%。基于SSU rRNA构建的系统发育树显示13个患者感染的虫种与杜氏利什曼原虫***、婴儿利什曼原虫***和恰氏利什曼原虫***聚为一支。基于ITS-1构建的系统发育树显示13例患者感染的利什曼原虫均属于婴儿利什曼原虫。SSU rRNA与ITS-1序列分类的结果一致,ITS-1在利什曼原虫虫种鉴定上较SSU rRNA分辨率高,可鉴定到亚种水平。13例山西及周边地区利什曼病患者感染原虫均为婴儿利什曼原虫***,感染虫株间同源性较高。