鹅源星状病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用
Establishment and application of TaqMan reverse transcriptionquantitative PCR for newly emerging goose-origin astrovirus in China作者机构:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所/兽医生物技术国家重点实验室/黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室/国家禽类实验动物资源库哈尔滨150069
出 版 物:《中国比较医学杂志》 (Chinese Journal of Comparative Medicine)
年 卷 期:2021年第31卷第3期
页 面:43-48页
学科分类:10[医学]
基 金:国家十三五重点研发计划子课题(2016YFD0500800) 黑龙江省青年科学基金项目(QC2018033) 黑龙江省自然科学基金重点项目(ZD2016006) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610302020008,1610302017013)
摘 要:目的建立一种可快速诊断鹅源星状病毒的荧光定量PCR方法。方法分析比对NCBI下载的鹅源星状病毒全基因组序列,在其ORF1a保守区设计一对特异性引物及Taq Man探针,优化反应条件,建立标准曲线,并验证其特异性,敏感性和稳定性。结果该方法最低检测线限为1.50×10^(2)copies/μL,批内和批间检测变异系数分别小于0.5%和4%,且对其他常见水禽病毒无特异性扩增。临床应用结果显示检出率明显高于常规RT-PCR方法。结论建立了一种鹅源星状病毒的Taq Man荧光定量PCR方法,该方法特异性强,灵敏度高且重复性良好,适用于鹅源星状病毒的早期检测和定量分析。