基于mtDNA控制区2个地方鸡品种遗传多样性及起源研究
Studies on the genetic diversity and origin of two local breeds based on mitochondrial DNA control region sequence作者机构:江苏省家禽科学研究所/江苏省家禽遗传育种重点实验室江苏扬州225015
出 版 物:《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 (Journal of Yangzhou University:Agricultural and Life Science Edition)
年 卷 期:2021年第42卷第1期
页 面:7-11页
学科分类:0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖]
基 金:国家自然科学基金资助项目(31702079、31672382、31501917) 江苏省“六大人才”高峰项目(NY-011) 江苏省家禽遗传育种重点实验室资助项目(JQLAB-ZZ-202002) 江苏省现代农业重点及面上项目(BE2018363)
主 题:地方鸡品种 线粒体DNA D-loop区 遗传多样性 遗传起源
摘 要:为探讨我国2个地方蛋鸡品种仙居鸡和白耳黄鸡遗传多样性和起源进化,以30只仙居鸡和30只白耳黄鸡为素材,通过PCR扩增和测序技术,对其进行线粒体DNA控制区全序列单倍型和遗传多样性分析,并结合GenBank公布的19条红色原鸡D-loop区全序列,构建系统发育树。结果表明:2个鸡品种变异区集中在第167—1 215 bp之间,共发现19个多态位点和9个单倍型,其中仙居鸡和白耳黄鸡各有3种特异单倍型。系统发育分析显示,9种单倍型可分为A、B和C共3个分支,白耳黄鸡的优势单倍型属于B分支,仙居鸡的优势单倍型属于C分支。聚类分析显示,白耳黄鸡主要与原鸡滇南亚种聚为一类,仙居鸡与原鸡印度亚种、滇南亚种、指名亚种和印尼亚种聚为一类,具有多个母系起源。这一研究从分子水平为2个蛋用型地方鸡品种仙居鸡和白耳黄鸡遗传资源开发利用和保护提供了理论依据。