大理地区猪圆环病毒3型流行病学调查与全基因进化分析

作     者：张小苗 周玉照 刘世高 陈俭 李健 

作者机构：大理农林职业技术学院云南大理671003 大理市动物疫病预防控制中心云南大理671003 云南神农农业产业集团股份有限公司云南昆明650000 云南神农大理猪业有限公司云南大理671003 

出 版 物：《上海畜牧兽医通讯》 (Shanghai Journal of Animal Husbandry and Veterinary Medicine)

年 卷 期：2021年第1期

页      面：31-36页

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：2020年云南省教育厅科学研究资金项目(2020J1059) 

主　　题：PCV3 流行病学 同源性分析 遗传进化分析 抗原指数 

摘      要：为了解大理地区猪圆环病毒3型(Porcine circovirus type 3,PCV3)的流行和进化情况,采用PCR对大理地区采集到的PCV3疑似病料进行病原学检测,并对阳性样品进行PCV3全基因扩增分析。结果表明:大理地区猪群存在PCV3的流行,流行株(命名DL 2020)的核苷酸序列与国内外18个毒株同源性为98.4%~99.5%;DL 2020与河南(PCV3-CN-Henan-13)、安徽(PCV3-CN-Anhui-14)、山东(PCV3-Shandong-2)、泰国(PCV3-Thailand-PB01-17)毒株属于同一进化分支,为PCV3b基因亚型;DL 2020的Cap氨基酸与国内外18个分离株存在多处氨基酸变异;DL 2020的Cap蛋白抗原指数与山东(PCV3-Shandong-2)、美国(PCV3-29160.1)毒株差异很大,而与其它16个毒株差异性较小,在25~38、60~70、90~110、140、160~170等区域都存在差异。说明大理区流行的PCV3毒株与国内外毒株存在差异。