植物Ⅴ类几丁酶苦瓜同源基因(McChi5)的克隆及特征分析
Cloning and Characterization of a Homologous Gene of Plant Class Ⅴ Chitinase from Balsampear, Momordica charantia Linn.作者机构:西南农业大学生物技术中心重庆400716
出 版 物:《Acta Genetica Sinica》 (ACTA GENETICA SINICA)
年 卷 期:2002年第29卷第11期
页 面:1028-1033页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种]
基 金:科技部转基因植物专项 (ZJY A 0 1) 重庆市教委科学技术研究项目资助~~
主 题:植物 V类几丁酶 苦瓜 同源基因 克隆 特征分析 抗病性
摘 要:苦瓜是一种病害很少的蔬菜作物。用 3′RACE方法从苦瓜叶片RNA中扩增了一个与烟草Ⅴ类几丁酶序列相似的片段 ,进一步用Y RACE方法扩增了相应的 5′端序列。经序列拼接 ,获得了植物Ⅴ类几丁酶苦瓜同源基因(McChi5 )的全长cDNA基因。该基因全长 1348bp ,含有一个 10 4 4bp的ORF。推测的蛋白质由 347个氨基酸组成 ,计算所得的分子量为 38.3kD ,等电点为 5 .77。同源性分析表明 ,McChi5蛋白与烟草V类几丁酶、拟南芥的推测几丁酶和类几丁酶蛋白、以及哺乳动物和细菌的一些几丁酶有序列相似性 ,并具有第 18家族糖基水解酶的保守域。Southernblotting表明 ,在苦瓜基因组中存在 2个拷贝的McChi5基因 ,同时也存在少数同源基因。RNAdotblotting分析表明 ,McChi5基因有组成性表达的特性 ,伤害处理对其表达的影响不明显。对McChi5基因可能的生物功能和应用作了进一步的讨论。