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不具有3-碱基周期性的编码序列初探

Tentative Study of the Coding Sequences Without 3-base Periodicity

作     者:张静 石秀凡 ZHANG Jing ** (The Center of Applied Statistics, Yunnan University, Kunming 650091, China) SHI Xiu Fan (Laboratory of Cellular and Molecular Evolution, Kunming Institute of Zoology, The Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223, China)

作者机构:云南大学应用统计中心昆明650091 中国科学院昆明动物研究所昆明650223 

出 版 物:《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)

年 卷 期:2002年第29卷第2期

页      面:267-272页

核心收录:

学科分类:071011[理学-生物物理学] 0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基  金:国家教育部科研重点基金资助项目 ( 0 0 2 46 )~~ 

主  题:编码序列 Fourier分析 3-碱基周期性 非3-碱基周期性 

摘      要:对 12 0个较短编码序列 (12 0 0bp)的Fourier频谱进行分析表明 ,3 碱基周期性在短编码序列中并不是绝对存在的 .统计分析提示 ,编码序列有无 3 碱基周期性与序列的碱基组成和分布、所编码蛋白质氨基酸的选用和顺序以及同义密码子的使用都有一定的关系 .一般地 ,非周期 3序列中A +U含量高于G +C含量 ,周期 3序列的情况则相反 ;非周期 3序列中碱基在密码子三个位点上的分布比周期 3序列中的分布均匀 ;非周期 3序列密码子和氨基酸的使用偏向没有周期 3序列的大 .在利用Fourier分析方法预测DNA序列中的基因和外显子时 。

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