羊栖菜硫酸多糖诱导下的人红白血病HEL细胞差异表达基因分析

作     者：丁浩淼 杜昊霏 付瑞洁 金旭东 谢策 陈彤妮 汪财生 钱国英 DING Haomiao;DU Haofei;FU Ruijie;JIN Xudong;XIE Ce;CHEN Tongni;WANG Caisheng;QIAN Guoying

作者机构：浙江万里学院生物与环境学院浙江宁波315100 

出 版 物：《核农学报》 (Journal of Nuclear Agricultural Sciences)

年 卷 期：2021年第35卷第3期

页      面：595-604页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：宁波市“十三五”海洋经济创新发展示范项目资助(NBHY-2017-S5、 NBHY-2017(1)) 宁波市高校食品科学与工程重点学科资助(2020FSEKDNB001) 浙江省“生物工程”一流学科资助(ZS2020011) 

主　　题：羊栖菜 硫酸多糖 人红白血病 转录组 差异表达基因 

摘      要：为探讨人红白血病HEL细胞经羊栖菜硫酸多糖(SFPSⅡ)处理后基因表达谱的变化,本研究用SFPSⅡ作用HEL细胞24 h,应用转录组技术筛选差异表达基因,分析差异基因富集的GO功能和KEGG信号通路,并通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对部分差异表达基因进行验证。结果表明,SFPSⅡ处理HEL细胞后,HEL细胞活力降低,呈浓度依赖性,但对正常人胚肺成纤维细胞MRC-5几乎无毒性。与对照组相比,共有1248个基因差异表达,其中219个上调,1029个下调。GO分析显示,差异表达基因主要改变DNA构象、硫酸盐转运及对肿瘤坏死因子和外在凋亡信号反应等生物学功能。KEGG信号通路分析显示,显著富集的通路与Rap 1信号通路等癌症和免疫密切相关。试验随机选择16个显著差异基因,并通过RT-qPCR进行确认,发现SFPSⅡ诱导HEL细胞后,导致表达差异基因与肿瘤生物学进程和通路显著相关。本研究结果为揭示羊栖菜硫酸多糖抗肿瘤机制的提供了理论依据。