博卡病毒2基因突变对蛋白三级结构及其进化关系的影响

作     者：施正超 余铭 李克诚 李荣洲 任宗海 孟飞 杨宁敏 Shi Zhengchao;Yu Ming;Li Kecheng;Li Rongzhou;Ren Zonghai;Meng Fei;Yang Ningmin

作者机构：浙江省瑞安市人民医院325200 杭州致远检验医学研究所 杭州致远医学检验所 

出 版 物：《中华实验和临床病毒学杂志》 (Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology)

年 卷 期：2015年第29卷第2期

页      面：133-135页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

主　　题：博卡病毒 人 腹泻 突变 蛋白质结构,三级 进化 

摘      要：目的 了解人类博卡病毒2（HBoV2）基因突变对重要功能蛋白三级结够及其进化关系的影响.方法 对瑞安地区205份小儿腹泻患者粪便标本进行HBoV2基因筛选.选取阳性样本,采用巢式PCR方法对HBoV2全基因组扩增.通过Swiss-PdbViewer对预测蛋白结构进行分析,并采用MEGA5.1软件进行进化树分析.结果 瑞安地区HBoV2阳性检出率为5.36％ （11/205）.HBoV2全基因组经过拼接后为5196 bases,与参考基因组同源性达到99.79％.其中,NP1基因未发生突变,NS1、VP1和VP2基因存在有义突变.NS1测序组和对照组蛋白表面突变氨基酸疏水性质发生变化;VP1测序组和对照组蛋白空间结构和分子内部氢键分布发生变化.系统进化树分析显示,HBoV2中NSl突变造成亲缘关系变化,突变后NS1有向HBoV4演化趋势.结论 研究证明瑞安地区小儿腹泻患者存在HBoV2感染,且阳性样本中HBoV2基因发生突变.有义突变造成重要蛋白空间结构和亲缘关系变化.这些结果对研究HBoV2病毒突变后的进化方向奠定基础.