肺泡灌洗液二代测序在重症肺炎病原菌未明患者中的应用

作     者：孙国先 刘微丽 郑庆斌 袁文杰 侯红玲 Sun Guoxian;Liu Weili;Zheng Qingbin;Yuan Wenjie;Hou Hongling

作者机构：扬州大学附属医院临床药学科225001 扬州大学附属医院重症医学科225001 扬州大学附属医院神经内科225001 

出 版 物：《中国基层医药》 (Chinese Journal of Primary Medicine and Pharmacy)

年 卷 期：2020年第27卷第24期

页      面：2951-2955页

学科分类：1002[医学-临床医学] 1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

基　　金：江苏省药学会-奥赛康医院药学科研项目(A201827) 

主　　题：基因组学 高通量核苷酸测序 肺炎 支气管肺泡灌洗液 血传病原体 诊断 治疗应用 

摘      要：目的分析宏基因组二代测序(mNGS)技术在重症肺炎病原菌未明患者中的应用价值。方法回顾性分析扬州大学附属医院2019年6月至2020年2月采用肺泡灌洗液mNGS技术辅助诊疗的重症肺炎病原菌未明患者8例的临床资料,包括肺泡灌洗液涂片、培养、mNGS检测等结果,分析患者的临床特点与mNGS检测情况。依据mNGS结果并结合临床医师的判断,将是否明确为病原菌分为病原菌确定组、病原菌未确定组,比较两组辛普森菌群多样性指数。结果8例患者中,男5例,女3例;年龄范围41~71岁,中位年龄62.5岁。除1例患者无慢性疾病外,其余患者合并糖尿病、慢性阻塞性肺疾病、肾脏移植等。8例患者mNGS检测阳性,3例患者常规检测阳性。病原菌确定组(n=5)与病原菌未确定组(n=3)辛普森菌群多样性指数比较,差异有统计学意义[(0.398±0.222)比(0.763±0.061),t=2.709,P=0.035]。2例患者mNGS检测阳性与常规检测阳性结果不同。3例卡氏肺孢子虫mNGS检测阳性患者的核酸序数为120~15580,相对丰度为24.6%~99.8%。结论肺泡灌洗液mNGS技术有助于医师快速、全面掌握病原菌信息,特别适用于重症肺炎病原菌未明患者。