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Analysis of RNA-Dependent RNA Polymerase Sequence of Infectious Flacherie Virus Isolated in China and Its Expression in BmN Cells

引用

Agricultural Sciences in China 2009年第7期8卷 872-879页

作者： LI Ming-qian LU Qi-neng WU Xiao-Feng MAN Na-na CHEN Xiao-xue JIN Wei LU Xing-meng laboratory of lnvertebrate pathology College of Animal Sciences Zhejiang University Hangzhou 310029 P.R.China

Full gene sequence of RNA-dependent RNA polymerase （RdRp） from Bombyx mori infectious flacherie virus isolated in Zhejiang Province, China （Zhejiang01/CHN/2002） was cloned. The sequence was 1 920 nucleotides in length coding 639 amino acid residues. Sequences comparison of RdRp showed Zhejiang01/CHN/2002 was 99.7% nucleotide sequence and 99.1% amino acids sequence homology with Japanese strain. The RdRp sequence was aligned with 8 representative picorna（-like） viruses and 8 highly conserved regions were detected. The result indicated their relevance function. Phylogenetic tree of 14 picorna（-like） viruses which RdRp presumed protein sequences revealed that the viruses from Iflavirus genus formed an independent clade. The RdRp was successfully expressed in BmN cells using Bac-to-Bac expression system.

关键词： infectious flacherie virus RNA-dependent RNA polymerase phylogenetic analysis BmN cells expression

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