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PolyI:C刺激猪PK15细胞后病毒感染应答基因未注释转录本鉴定及其特征分析

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中国畜牧兽医 2024年第4期51卷 1622-1631页

作者：赵为民王红徐盼陈哲陶晓莉李碧侠付言峰程金花江苏省农业科学院畜牧研究所南京210014 农业农村部种养结合重点实验室南京210014 江苏省农业种质资源保护与利用平台南京210014 南京农业大学动物科技学院南京210014 江苏农牧科技职业学院动物科技学院泰州225300 锦州医科大学基础医学院锦州121001

【目的】鉴定猪PK15细胞在类病毒聚肌胞苷酸(PolyI:C)刺激后病毒感染应答基因的未注释转录本的数量、剪接类型、新蛋白编码与分子结构,为进一步研究这些未注释转录本的功能奠定基础。【方法】将猪PK15细胞分为对照组和试验组,每组3个重... 详细信息

【目的】鉴定猪PK15细胞在类病毒聚肌胞苷酸(PolyI:C)刺激后病毒感染应答基因的未注释转录本的数量、剪接类型、新蛋白编码与分子结构,为进一步研究这些未注释转录本的功能奠定基础。【方法】将猪PK15细胞分为对照组和试验组,每组3个重复;试验组加入终浓度为20μg/mL的PolyI:C,对照组加入等体积(2μL)的PBS,两组在37℃、5%CO_(2)条件下分别刺激6 h后进行Nanopore测序,鉴定两组的总转录本与差异表达基因。对差异表达基因进行GO功能分析,进一步筛选病毒感染的应答基因。对总转录本与Ensemble注释的转录本序列进行比较,发现未注释转录本。将病毒感染应答基因的未注释转录本与其对应的Ensemble注释转录本序列进行比对,分析未注释转录本的剪接类型和编码蛋白。【结果】PolyI:C刺激后,两组共鉴定蛋白编码的转录本61505个,其中有Ensemble数据库注释的39497个,未注释的转录本22008个,未注释转录本数量占总数的35.78%。同时两组鉴定到71个差异蛋白编码基因,与对照组相比,试验组上调表达基因57个,下调表达基因14个。GO功能富集分析显示,这些差异表达基因富集到20个生物过程,其中前3个生物过程分别是防御病毒反应、Ⅰ型干扰素信号通路和病毒应答,均与病毒感染应答相关。24个病毒感染应答的基因有16个基因存在未注释转录本,其中CCL 5、IFI 6、BST 2和MX 1基因未注释转录本的数量多于其Ensemble注释的总转录本数量,且大部分未注释转录本产生新的蛋白序列。IFIT 3、OAS 2、RSAD 2、CCL 5、IFI 44、CD 40、IFI 6、BST和MX 19个基因的未注释转录本有差异表达。【结论】本研究系统地鉴定了猪PK15细胞受PolyI:C刺激后病毒感染应答基因的未注释转录本的分子特征,筛选的IFIT 3、OAS 2、RSAD 2、CCL 5、IFI 44、CD 40、IFI 6、BST和MX 19个基因的差异表达的未注释转录本可能具有重要生物学作用,为进一步解析宿主基因在抗病毒反应中的复杂转录调控机制提供了依据。

关键词： Nanopore测序 PolyI:C 病毒感染转录本选择性剪接

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清末民国时期中国女子体操学校发展考释

成都体育学院学报 2024年第5期50卷 131-142页

作者：张玉宝南京体育学院体育教育与人文学院江苏南京210014

中国女子体操学校创设于1908年(清光绪戊申年),历时约33年,培养女子体育师资千余人,期间两次中断又相继维系,经历多次战争摧毁又得以重生,开中国女子体育专业教育之先河。但现有研究对该校创办时间、创办人、学校称谓、修业年限等基本... 详细信息

中国女子体操学校创设于1908年(清光绪戊申年),历时约33年,培养女子体育师资千余人,期间两次中断又相继维系,经历多次战争摧毁又得以重生,开中国女子体育专业教育之先河。但现有研究对该校创办时间、创办人、学校称谓、修业年限等基本信息缺乏深入考证,致使体育史教材、各类辞典对其介绍存在诸多错误。本研究运用文献资料、逻辑互证等方法,对该校诸多存疑问题进行考证,并从学校名称、创设时间、负责人变化、修业年限、课程设置、师资队伍等方面梳理了该校的发展历程,以期再现该校百年前发展的真实样态,展现中国近代体育教育工作者为女子体育教育事业奋斗的心路历程,为中国体育教育事业高质量发展提供中国经验。

关键词：学校体育学体育教师教育培养培训机构中国女子体操学校

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基于RGB模型的草莓叶片光合作用指标估测

江苏农业学报 2024年第4期40卷 675-681页

作者：樊小雪李德翠李远任妮江苏省农业科学院农业信息研究所江苏南京210014 农业农村部长三角智慧农业技术重点实验室江苏南京210014

为了研究基于图像红(R)、绿(G)、蓝(B)颜色参数和叶片SPAD值预测光合作用指标的可行性,以草莓叶片为试验材料,构建多元线性回归模型和反向传播(BP)神经网络模型,对叶片蒸腾速率、气孔导度、净光合速率、胞间CO_(2)浓度进行估测,并对其... 详细信息

为了研究基于图像红(R)、绿(G)、蓝(B)颜色参数和叶片SPAD值预测光合作用指标的可行性,以草莓叶片为试验材料,构建多元线性回归模型和反向传播(BP)神经网络模型,对叶片蒸腾速率、气孔导度、净光合速率、胞间CO_(2)浓度进行估测,并对其精度进行评价和验证。结果表明,基于BP神经网络模型,使用图像RGB颜色参数和SPAD值对叶片蒸腾速率进行预测的效果较好,其次是气孔导度。BP神经网络模型的估测精度高于多元线性回归模型,蒸腾速率、气孔导度、净光合速率和胞间CO_(2)浓度的模型预测准确率分别达到91.5%、83.3%、74.4%和71.5%。BP神经网络的蒸腾速率模型、气孔导度模型的决定系数(R2)分别为0.9222、0.8423,均方根误差(RMSE)分别为0.0002、0.0259,平均绝对误差(MAE)分别为0.0001、0.0006。由结果可知,通过数码相机采集图像,并构建RGB模型,可简易快速估测草莓叶片蒸腾速率、气孔导度,能用于生产中草莓光合指标的估测。

关键词：草莓叶片 RGB模型光合指标反向传播(BP)神经网络模型

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江苏台网地震目录最小完整性震级研究

震灾防御技术 2024年第3期19卷 504-513页

作者：立凯周文杰倪昊琦陈殷晖范晓易张朋胡文涛戴波江苏省地震局南京210014 宿迁地震监测中心站江苏宿迁223800 无锡地震监测中心站江苏无锡214000 南京工业大学南京210014

区域台网完整性震级的研究对于了解测震台网监测能力、评估地震目录的可靠性以及研究地震活动特征具有重要意义,其有助于确定最小可靠震级范围,并为地震监测和地震研究提供参考。针对江苏及邻区地震目录的特点和需求,结合江苏省区域测... 详细信息

区域台网完整性震级的研究对于了解测震台网监测能力、评估地震目录的可靠性以及研究地震活动特征具有重要意义,其有助于确定最小可靠震级范围,并为地震监测和地震研究提供参考。针对江苏及邻区地震目录的特点和需求,结合江苏省区域测震台网台站建设与发展情况,使用震级-序号法、多参数方法联合研究,对江苏区域台网记录的地震活动最小完整性震级M_(C)随时间的变化趋势进行分析;通过使用完整震级范围(EMR)方法,对地震的空间分布特征进行深入探究。研究结果表明,江苏及邻区整体区域M_(C)值变化趋势大致分为2个阶段,1970-2008年M_(C)值主要分布于M_(L)1.0~M_(L)2.2之间,2009-2022年M_(C)值主要分布于M_(L)0.5~M_(L)1.5之间。江苏内陆地区1970-2008年M_(C)值主要分布于M_(L)1.0~M_(L)2.5之间,2009-2022年M_(C)值主要分布于M_(L)0.5~M_(L)2.0之间,江苏沿海黄海海域1970-2022年M_(C)值主要分布于M_(L)2.0~M_(L)3.0之间,江苏区域台网地震监测能力趋于完善。

关键词：最小完整性震级MC值区域地震目录江苏省区域测震台网

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新质生产力视域下的电影表意新空间

电影文学 2024年第19期 37-42页

作者：杨祎程南京艺术学院艺术学理论博士后流动站江苏南京210014 南京体育学院武术与艺术学院江苏南京210014

生产力与艺术发展具有重要的理论联系与实际意义。新时代“新质生产力”的提出,有力地促进艺术融入现代化的发展潮流,并与之生成艺术的新空间,而这一空间的基础、发展动力与创新机制均与空间生产存在重要联系。在促进中国电影文化高质... 详细信息

生产力与艺术发展具有重要的理论联系与实际意义。新时代“新质生产力”的提出,有力地促进艺术融入现代化的发展潮流,并与之生成艺术的新空间,而这一空间的基础、发展动力与创新机制均与空间生产存在重要联系。在促进中国电影文化高质量发展的引领下,以丰富中国电影创作理论研究参考为目标。在进一步关注“新质生产力”的应用发展过程中,将“电影表意”及新空间的生产作为观察对象,重点联系“消费变革、市场驱动、审美演进”,展开新质生产力发展框架下电影表意新空间的分析与讨论。研究认为不同时代的新思想、新方法、新技术对于电影表意新空间的生成具有积极作用。反之,新空间也有利于新质生产力的不断转型与创新。高质量的发展需要在这样的循环关系中,不断加强理论发现与实践探索。

关键词：新质生产力电影表意空间生产高质量发展

真空冷冻预干燥对压差膨化干燥果蔬脆片质地特性的影响

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农业工程学报 2024年第2期40卷 144-154页

作者：刘春菊项可心李越李大婧吴海虹牛丽影赵邯于蕊江苏省农业科学院农产品加工研究所南京210014 沈阳农业大学食品学院沈阳110161

为探索预干燥处理对不同果蔬脆片结构及质地特性的影响,该研究采用真空冷冻干燥作为预干燥,并选取了3个水分转换点(60%、45%、30%),对预干燥过程中6种典型果蔬(苹果,梨,桃,山药,马铃薯,青萝卜)水分状态、细胞结构、收缩率、孔隙度、应力... 详细信息

为探索预干燥处理对不同果蔬脆片结构及质地特性的影响,该研究采用真空冷冻干燥作为预干燥,并选取了3个水分转换点(60%、45%、30%),对预干燥过程中6种典型果蔬(苹果,梨,桃,山药,马铃薯,青萝卜)水分状态、细胞结构、收缩率、孔隙度、应力-松弛特性与质地特性进行测定与分析。结果表明,随着预干燥的进行,水分含量逐渐降低,自由水逐渐散失,以不易流动水为主,收缩率逐渐减小,孔隙度逐渐增大,硬度、咀嚼性、弹性模量逐渐增加;水分转换点为60%时不同果蔬脆片具有较高的硬脆度,其中马铃薯与山药脆片硬度较高,桃与梨的脆片脆度较高;水分转换点为30%时,6种果蔬的孔隙度最高,且青萝卜的孔隙度显著高于其他果蔬(P <0.05);在干燥后期,果蔬样品骨架基本形成,且收缩率较低,致使内部孔隙度变大;由相关性分析可知真空冷冻预干燥过程中水分转换点、孔隙度与果蔬脆片质地特性极显著相关(P <0.05),研究结果可为预干燥对果蔬脆片质地影响提供参考。

关键词：预干燥真空冷冻干燥压差膨化干燥果蔬脆片质地特性

复方五凤草液负压滴灌治疗Ⅲ-Ⅳ期压力性损伤的疗效及其作用机制

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解放军医学杂志 2024年第4期49卷 396-407页

作者：曹丽敏黄子慧王裕玲钱佳燕高贝贝陈思琪翁嘉晨南京中医药大学附属南京市中西医结合医院瘰疬科江苏南京210014

目的观察复方五凤草液负压滴灌治疗(NPWTi)Ⅲ-Ⅳ期压力性损伤(PI)的临床疗效,并初步探索其作用机制。方法(1)临床研究:选取2019年1月-2022年10月于南京市中西医结合医院瘰疬科病区及伤口护理门诊就诊的60例PI患者,随机分为生理盐水NPWT... 详细信息

目的观察复方五凤草液负压滴灌治疗(NPWTi)Ⅲ-Ⅳ期压力性损伤(PI)的临床疗效,并初步探索其作用机制。方法(1)临床研究:选取2019年1月-2022年10月于南京市中西医结合医院瘰疬科病区及伤口护理门诊就诊的60例PI患者,随机分为生理盐水NPWTi组与复方五凤草液NPWTi组,每组30例。两组均在全身基础治疗的前提下进行NPWTi,分别于治疗前及治疗第1、2、3周拆除负压装置后统计PI愈合计分量表(PUSH)评分、创面细菌培养检出率及创面愈合时间,并用ELISA法检测创面组织血管内皮生长因子(VEGF)的含量。(2)动物实验:24只SD大鼠随机分为空白组、模型组、生理盐水NPWTi组与复方五凤草液NPWTi组,每组6只,通过局部组织缺血/再灌注损伤法建立PI大鼠模型,每天治疗结束后将负压装置拆除。分别于治疗前及治疗3、7、10 d观察各组大鼠创面形态,HE染色观察创面组织病理情况,免疫组化检测创面组织CD34阳性细胞百分比,并用ELISA法及RT-qPCR分别检测各组大鼠血液、创面组织中p38丝裂原活化蛋白激酶(p38 MAPK)、核因子-κB p65(NF-κB p65)、诱导型一氧化氮合酶(iNOS)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、精氨酸酶-1(Arg-1)、转化生长因子-β(TGF-β)的表达水平。结果(1)临床研究:两组均能有效降低PUSH评分和创面细菌培养检出率,缩短创面愈合时间,促进创面组织VEGF表达,复方五凤草液NPWTi组优于生理盐水NPWTi组(P<0.05)。(2)动物实验:与空白组相比,模型组大鼠创面炎症反应及组织损伤明显,CD34阳性细胞百分比,以及血液和创面组织p38 MAPK、NF-κB p65、iNOS、TNF-α水平明显升高,Arg-1、TGF-β水平明显降低,差异均有统计学意义(P<0.05);与模型组相比,生理盐水NPWTi组与复方五凤草液NPWTi组治疗7 d后创面形态评分明显降低,组织病理学形态明显改善,CD34阳性细胞百分比明显升高,血液及创面组织p38 MAPK、NF-κB p65、iNOS、TNF-α水平明显降低,Arg-1、TGF-β水平明显升高,差异均有统计学意义(P<0.05),且复方五凤草液NPWTi组优于生理盐水NPWTi组(P<0.05)。结论复方五凤草液NPWTi可有效促进PI创面的愈合,其作用机制可能是通过抑制p38 MAPK/NF-κB信号通路的活化及表达,进而调节M1/M2巨噬细胞极化平衡。

关键词：压力性损伤负压滴灌治疗复方五凤草液巨噬细胞极化 p38 MAPK/NF-κB信号通路

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江苏地区荷斯坦成母牛长寿性状遗传参数估计

畜牧兽医学报 2024年第3期55卷 1030-1039页

作者：夏淑雯陈坤琳沈阳阳安振江赵芳丁强仲跻峰林志平王慧利江苏省农业科学院畜牧研究所南京210014 江苏省畜禽精准育种工程研究中心南京210014 农业农村部种养结合重点实验室南京210014 南京农业大学动物科技学院南京210095 江苏优源奶业产业研究院有限公司南京211100

旨在估计荷斯坦成母牛长寿性状遗传参数及评估育种值,为提高生产性能及实施平衡育种提供参考。本研究共收集江苏地区9个规模化牧场2017—2023年间19 756头荷斯坦成母牛的离群记录,分析牛只的长寿性和淘汰情况。利用R软件的GLM程序对影... 详细信息

旨在估计荷斯坦成母牛长寿性状遗传参数及评估育种值,为提高生产性能及实施平衡育种提供参考。本研究共收集江苏地区9个规模化牧场2017—2023年间19 756头荷斯坦成母牛的离群记录,分析牛只的长寿性和淘汰情况。利用R软件的GLM程序对影响奶牛长寿性状的固定效应(包括牧场、出生年季、头胎产犊月龄)进行显著性检验;采用BLUPF90软件进行遗传参数估计以及育种值评估,并绘制遗传趋势图。结果表明:江苏地区规模化牧场成母牛平均在群寿命为1 640.87 d,生产寿命为917.15 d,平均利用胎次为2.60胎;长寿性状遗传力估计值变化范围为0.07~0.15,属低遗传力性状;7个长寿性状(在群天数、生产寿命、利用胎次和L1-L4)间均具有中等到较高的遗传和表型相关(0.27~0.99),其中在群寿命与生产寿命的相关性趋近于1;通过计算长寿性状的育种值,绘制遗传趋势图,发现近年来长寿性状遗传进展缓慢且整体呈下降趋势。本研究对江苏地区规模化牧场成母牛长寿性状进行了系统的遗传分析,可为制定南方地区奶牛长寿性状育种规划提供参考。

关键词：荷斯坦牛长寿性状遗传力遗传相关育种值

基于改进DeepLabV3+的梨树冠层分割方法

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中国农机化学报 2024年第4期45卷 155-161页

作者：陈鲁威曾锦袁全春夏烨潘健吕晓兰江苏大学农业工程学院江苏镇江212013 江苏省农业科学院农业设施与装备研究所南京市210014 农业农村部园艺作物农业装备重点实验室南京市210014

针对杂草和阴影等较复杂背景影响梨树冠层图像信息提取精度的问题,提出一种改进DeepLabV3+的梨树冠层图像分割方法。该方法将注意力机制引入到DeepLabV3+编码部分的主干网络与空洞空间金字塔池化模块之间和解码部分的主干网络之后,重要... 详细信息

针对杂草和阴影等较复杂背景影响梨树冠层图像信息提取精度的问题,提出一种改进DeepLabV3+的梨树冠层图像分割方法。该方法将注意力机制引入到DeepLabV3+编码部分的主干网络与空洞空间金字塔池化模块之间和解码部分的主干网络之后,重要的特征信息将得到关注,提高模型分割精度的同时保证分割效率。以Y字形棚架梨园为试验对象,通过无人机采集梨树冠层照片,进行冠层分割试验。结果表明,提出的CBAM-DeepLabV3+模型对梨树冠层图像分割的平均交并比、类别平均像素准确率和准确率分别为88.72%、94.56%和96.65%,分割单张图像时间为0.107 s。CBAM-DeepLabV3+模型分割梨树冠层的类别平均像素准确率相比DeepLabV3+和SE-DeepLabV3+分别提高2.28%和0.56%。

关键词：梨树冠层图像分割 DeepLabV3+ 注意力机制深度学习

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