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小麦PLC基因家族鉴定及其低温下的表达模式分析

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植物生理学报 2024年第2期60卷 339-352页

作者：娄贵成任治鹏姜云爽彭瞰看包雨卓王多佳苍晶东北农业大学生命科学学院哈尔滨150030

质体蓝素蛋白(PLC)是一种I型蓝色铜蛋白,在植物生长发育以及响应胁迫过程中具有重要作用,然而目前对小麦(Triticum aestivum) PLC基因家族的研究报道较少。为探究小麦PLC基因的特征,本研究对小麦全基因组进行了分析,共鉴定到74个小麦PL... 详细信息

质体蓝素蛋白(PLC)是一种I型蓝色铜蛋白,在植物生长发育以及响应胁迫过程中具有重要作用,然而目前对小麦(Triticum aestivum) PLC基因家族的研究报道较少。为探究小麦PLC基因的特征,本研究对小麦全基因组进行了分析,共鉴定到74个小麦PLC家族基因,系统发育树分析将其分为6组。将这些基因定位于小麦染色体上,并对它们的理化性质、基因结构、进化树以及共线性进行分析,结果表明:小麦PLC蛋白多数为弱碱性蛋白,亚细胞定位发现主要分布在细胞质和质膜中;小麦PLC蛋白结构域与核心基序排列有序稳定,高度保守。进一步以强抗寒冬小麦品种‘东农冬麦1号’为材料,对其转录组数据库中低温差异表达的12个PLC基因进行实时荧光定量PCR验证,发现这12个基因在不同组织(分蘖节和叶片)中表达量均有差异;在不同温度下,大多数PLC具有相似的表达模式。PLC在小麦抗寒过程中发挥重要作用。

关键词：小麦 PLC 系统发生分析低温胁迫

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江苏省蛇类新纪录——东亚腹链蛇

野生动物学报 2024年第1期45卷 216-221页

作者：叶琳朱文启章铁睿虞磊高国富包浩然南京农业大学生命科学学院南京210095 南京八三医院南京211131 安徽师范大学生命科学学院芜湖241000 安徽大学生命科学学院合肥230601

2022年7—9月,在江苏省宁镇山脉的南京汤山(32°3’59’’N,119°1’2’’E;海拔179 m)和句容市宝华山(32°7’40’’N,119°5’33’’E;海拔288 m)共采集到蛇类标本5号。通过形态学比对和分子系统学分析,确认标本均为水游蛇科(Natricid... 详细信息

2022年7—9月,在江苏省宁镇山脉的南京汤山(32°3’59’’N,119°1’2’’E;海拔179 m)和句容市宝华山(32°7’40’’N,119°5’33’’E;海拔288 m)共采集到蛇类标本5号。通过形态学比对和分子系统学分析,确认标本均为水游蛇科(Natricidae)东亚腹链蛇属(Hebius)东亚腹链蛇[***(Boie,1826)],为江苏省蛇类分布新纪录,也是本种在长江以南地区的首次发现。

关键词：东亚腹链蛇新分布纪录系统发生分析江苏省宁镇山脉

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青藏高原东缘两种马先蒿植物花性状与报酬的遗传力和遗传相关

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生态学杂志 2024年第6期43卷 1646-1654页

作者：路宁娜杨海年陈小爽卢颖蔡维陈洋洋何灏城蒋芩王银银李亚洁张颖西北师范大学生命科学学院兰州730000

与报酬质量信息相关的花性状通常受到传粉者的偏好和选择,而遗传变异和遗传相关可反映这些性状的进化潜能。青藏高原广泛分布的马先蒿属植物具有多样的花冠类型,其演化已被证明与传粉者选择作用密切相关。本研究以青藏高原东缘分布的无... 详细信息

与报酬质量信息相关的花性状通常受到传粉者的偏好和选择,而遗传变异和遗传相关可反映这些性状的进化潜能。青藏高原广泛分布的马先蒿属植物具有多样的花冠类型,其演化已被证明与传粉者选择作用密切相关。本研究以青藏高原东缘分布的无蜜的半扭卷马先蒿(Pedicularis semitorta)和有蜜的甘肃马先蒿(***)为对象,通过数量遗传实验分析花吸引性状和报酬(花粉、花蜜)的遗传力及两者间的遗传相关大小。结果表明:半扭卷马先蒿的花高、花大小和花粉量遗传力较高,但花序数和花数目遗传力较低;甘肃马先蒿的花高、盔高和糖含量遗传力较高,而花大小、花序数、花数目、糖浓度和花蜜量遗传力较低;半扭卷马先蒿的花粉量与花性状间无显著相关性,说明花吸引性状不能反映其报酬量;甘肃马先蒿的糖浓度与花序数、花数目之间具有显著正的表型相关,但遗传相关不显著;花蜜量与花大小、花高、花数目等具有显著正的表型相关,花蜜量与花大小和花高具有显著正的遗传相关,糖含量与所测花性状的表型与遗传相关均为显著正的关系;这说明多个花性状可作为甘肃马先蒿报酬的诚实信号;甘肃马先蒿花性状和报酬之间的表型和遗传相关大小显著高于半扭卷马先蒿;这可能与马先蒿属植物花冠形态演化有关;较强的遗传相关可能限制甘肃马先蒿花性状与报酬的独立进化,而半扭卷马先蒿的花性状具有较高的独立进化的潜能。本研究有助于更好理解青藏高原植物多样性的形成与维持。

关键词：花性状报酬遗传力遗传相关半扭卷马先蒿甘肃马先蒿

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软枣猕猴桃根围AM真菌多样性分析

分子植物育种 2024年

作者：耿晓进苏彦苹付亚娟侯晓强孙艳香廊坊师范学院生命科学学院

为探明软枣猕猴桃根围AM (Arbuscular Mycorrhizal)真菌多样性及其与土壤因子之间关系，本研究分别采集燕山地区野生软枣猕猴桃和廊坊地区4个主栽品种软枣猕猴桃根围土壤，采用高通量测序技术分析AM真菌多样性，并测定土壤理化性质，分... 详细信息

为探明软枣猕猴桃根围AM (Arbuscular Mycorrhizal)真菌多样性及其与土壤因子之间关系，本研究分别采集燕山地区野生软枣猕猴桃和廊坊地区4个主栽品种软枣猕猴桃根围土壤，采用高通量测序技术分析AM真菌多样性，并测定土壤理化性质，分析AM真菌多样性与土壤因子之间关系。结果表明：从软枣猕猴桃根围共获得483个AM真菌OUT，分属于球囊霉门(Glomeromycota)的1纲3目4科6属，包括球囊霉属(Glomus)、近明球囊霉属(Claroideoglomus)、根孢囊霉属(Rhizophagus)、隔球囊霉属(Septoglomus)、类球囊霉属(Paraglomus)和双型囊霉属(Ambispora)。其中球囊霉属是所有样本的共同优势属，根孢囊霉属和隔球囊霉属是共同稀有属，5个样本均未出现特有属。野外样本AM真菌丰富度和均匀度低于栽培品种，但其多样性高；不同栽培品种AM真菌丰度和多样性存在差异，具体表现为Chao1指数: HSJY > RNW > LE >WJ，Shannon和Simpson指数：HSJY>LE>WJ>RNW。冗余分析表明，5个样本AM真菌群落分离较远，土壤有机碳、碱解氮和pH是影响AM真菌群落的主要土壤因子，AM真菌多样性与土壤碱解氮、有机碳正相关，与pH负相关。本研究阐明了软枣猕猴桃根围AM真菌多样性及优势种，揭示了土壤因子与其多样性间的关系，为利用菌根生物技提高果实产量和品质提供一定的参考。

关键词：软枣猕猴桃高通量测序 AM真菌多样性土壤因子

猪流行性腹泻病毒在规模化抗体阳性猪场的动态传播

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微生物学通报 2024年

作者：亢麒翔胡广利耿瑞王暄慈邝展鹏黄逸晖曾思莹彭欧阳张灏曹永长中山大学生命科学学院

【背景】猪流行性腹泻病毒（porcine epidemic diarrhea virus，PEDV）是导致仔猪腹泻的最主要的病原之一。因其发病迅速难以记录，目前尚无关于PEDV感染仔猪后病原在猪场内分布的动态研究报道。【目的】探索PEDV在规模化猪场内的动态... 详细信息

【背景】猪流行性腹泻病毒（porcine epidemic diarrhea virus，PEDV）是导致仔猪腹泻的最主要的病原之一。因其发病迅速难以记录，目前尚无关于PEDV感染仔猪后病原在猪场内分布的动态研究报道。【目的】探索PEDV在规模化猪场内的动态传播过程，改进防控PED的策略。【方法】首次模拟了PEDV在封闭的规模化养殖场中感染仔猪后的传播过程，检测了猪群及场内不同区域的病毒丰度。【结果】仔猪肛拭子和空气样品病毒丰度在仔猪感染PEDV初期具有明显的一致性变化，PEDV在场内的传播与员工移动密切相关，并且洗澡间可能是PEDV的重要藏匿点。【结论】猪舍空气的病毒丰度有可能作为PED早期的监测指标，并且员工相关的介质和场地是PEDV生物安全防控的重要对象。本研究为改进猪场针对PED的生物安全防控提供了一定参考，并且为类似病毒在规模化猪场传播的研究工作奠定了基础。

关键词：猪流行性腹泻病毒外环境生物安全防控

磁性氮化碳复合材料的制备及其对磷酸化肽的富集

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色谱 2024年第6期42卷 564-571页

作者：姜丽艳张玮璐赵璐胡良海吉林大学生命科学学院吉林长春130012

蛋白质的磷酸化在细胞信号传导和疾病发生发展中起着重要作用,但磷酸化的动态变化和低丰度的特点使得对其直接分析有着较大的困难。为了解决磷酸化肽难离子化、检测丰度低的瓶颈问题,本研究制备了一种磁性氮化碳复合材料,结合基质辅助... 详细信息

蛋白质的磷酸化在细胞信号传导和疾病发生发展中起着重要作用,但磷酸化的动态变化和低丰度的特点使得对其直接分析有着较大的困难。为了解决磷酸化肽难离子化、检测丰度低的瓶颈问题,本研究制备了一种磁性氮化碳复合材料,结合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS),建立了一种对复杂样品中低丰度磷酸化肽富集与分析的方法。采用电子显微镜、红外光谱分析及X射线衍射分析等手段对合成的磁性氮化碳材料进行表征。以酪蛋白酶解产物为实验模型,发现磁性氮化碳材料能够实现对磷酸化肽的高选择性富集和高灵敏度检测,检出限为0.1 fmol。选择脱脂牛奶、人唾液和人血清为实际分析样品,发现磁性氮化碳材料对微量蛋白生物样品中磷酸化肽的分析具有较高的应用潜力。

关键词：氮化碳磁性固相萃取基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱磷酸化肽富集

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低温处理对段殖黄线藻生长、油脂积累、光合及抗氧化酶活性的影响

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水生生物学报 2024年第4期48卷 653-664页

作者：邓仟朱瑞鸿高保燕于博涵唐子涵张成武暨南大学生命科学学院生态学系广州510632

以丝状产油微藻段殖黄线藻(Xanthonema hormidioides)作为实验材料,经过低温(5℃)预处理后的藻种与常温(25℃)条件下的藻种进行对比实验,研究段殖黄线藻在不同温度(5℃、10℃、15℃、20℃、25℃)和高、低氮浓度(18和3 mmol/L)条件下的... 详细信息

以丝状产油微藻段殖黄线藻(Xanthonema hormidioides)作为实验材料,经过低温(5℃)预处理后的藻种与常温(25℃)条件下的藻种进行对比实验,研究段殖黄线藻在不同温度(5℃、10℃、15℃、20℃、25℃)和高、低氮浓度(18和3 mmol/L)条件下的生长和油脂积累及低温(5℃)对这两种状态下的藻种光合活性和抗氧化酶系统的影响。结果显示:低温预处理后的段殖黄线藻在各温度下积累的生物量要高于常温条件下的段殖黄线藻,在15℃时可达到最高生物量为10.1 g/L,20℃条件下可获得最高油脂和脂肪酸绝对含量,分别占干重的64.20%和49.05%(3 mmol/L),蛋白质含量在15℃时达到最高为43.5%(18 mmol/L),总碳水化合物则基本维持在10%—25%。5℃下段殖黄线藻对光的利用率(α)及最大电子传递速率(ETRmax)均受到明显抑制,低温预处理后的段殖黄线藻叶绿素a含量、Fv/Fm和Fv/Fo值均在第9天后超过常温实验组,最高分别可达9.98 mg/g、2.99和0.75(3 mmol/L)。与常温实验组相反,低温预处理后段殖黄线藻在5℃下ETRmax和对强光的耐受能力(IK)均有所升高。此外,低温预处理后段殖黄线藻超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)的最大活性可达65.6和0.56 U/mg protein,均显著高于常温段殖黄线藻(P<0.05)。综上,低温预处理后的段殖黄线藻生长和代谢产物的积累更具优势,并且在低温适应性、光合效率及抗氧化应激方面的能力也得到显著提升。

关键词：低温预处理生长油脂积累光合活性抗氧化酶段殖黄线藻

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大别山黏菌的物种多样性调查

生物多样性 2024年第2期32卷 81-90页

作者：林迪陈双林杜榷宋文龙饶固闫淑珍南京师范大学生命科学学院南京210023

为揭示大别山黏菌的物种组成和分布特征,在2020年8月至2022年9月期间,作者先后对大别山21个自然保护区和国家森林公园进行了黏菌物种调查。通过野外采集和基物湿室培养,获得黏菌标本984份。按照形态分类学鉴定为6目13科32属93种,其中,1... 详细信息

为揭示大别山黏菌的物种组成和分布特征,在2020年8月至2022年9月期间,作者先后对大别山21个自然保护区和国家森林公园进行了黏菌物种调查。通过野外采集和基物湿室培养,获得黏菌标本984份。按照形态分类学鉴定为6目13科32属93种,其中,11种为丰富种(相对多度RA>3%),8种为常见种(RA=1.5%–3%),30种为偶见种(RA=0.5%–1.5%),44种为稀有种(RA<0.5%)。苔生高杯菌(Crateriummuscorum)和易碎双皮菌(Didermafragile)在我国现仅知分布于大别山,掌状夹被菌(Ophiothecapedata)、草生发网菌(Stemonitisherbatica)、环壁团毛菌(Trichiavaria)等48种首次在大别山报道。丰富度分析表明,大别山不同调查地点、林型和基物类型的黏菌物种数量和种属比存在差异,大别山区域的河南董寨自然保护区黏菌物种数量高于其他地点,发现黏菌41种,种属比为1.95,特有种为3种;针阔混交林中的黏菌物种数量高于针叶林和阔叶林两种单一林型,生长黏菌81种,种属比为2.89,独有种有28种;生长于腐木上的黏菌77种,物种数量高于凋落物、活草和树皮等基物,种属比为2.75,腐木上特有种有42种。研究结果表明,黏菌在大别山21个自然保护区和国家森林公园具有不同的物种组成和丰富度,从而形成了不同的分布格局,且物种多样性在腐木上和针阔混交林中高于其他生长基物和单一林型,为全面认识大别山的黏菌生物多样性奠定了良好基础。

关键词：华中地区黏菌物种组成相对多度分布格局

两个与中华拟同形溞生殖相关基因的筛选及其RNA干扰研究

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水生生物学报 2024年第1期48卷 176-184页

作者：赵雅洁李国庆王业平金齐德邓道贵淮北师范大学生命科学学院淮北235000

为了筛选与中华拟同形溞(Daphnia sinensis)生殖相关的基因,选择4个生长阶段的中华拟同形溞(雌性幼溞JF、成熟前1龄雌溞BM、第1成龄雌溞MA和第4成龄雌溞RF)进行转录组测序。在BM ***、MA ***、RF ***、RF ***、MA ***、RF ***等6个组合... 详细信息

为了筛选与中华拟同形溞(Daphnia sinensis)生殖相关的基因,选择4个生长阶段的中华拟同形溞(雌性幼溞JF、成熟前1龄雌溞BM、第1成龄雌溞MA和第4成龄雌溞RF)进行转录组测序。在BM ***、MA ***、RF ***、RF ***、MA ***、RF ***等6个组合中,选择每个组合的前30个上调基因进行筛选,获得了163个差异表达基因。这些差异表达基因以鱼类信息素培养的第4成龄雌溞为样本进行RT-qPCR检测,共筛选出19个与生殖相关的候选基因,选择其中2个基因(Cluster-13168.32243,Dsussp和Cluster-13168.22885,Dsmapk)进行RNAi实验。在RNAi后,Dsussp和Dsmapk基因的表达量在含有其dsRNA的大肠杆菌(Escherichia coli)浓度组均显著小于对照组(Enhanced Green Fluorescent Protein,EGFP),且与EGFP组相比,Dsmapk和Dsussp基因的表达量在2%和5%大肠杆菌浓度组分别下降了28.1%和32.3%、41.1%和55.6%。在RNAi后,中华拟同形溞在Dsussp和Dsmapk组的怀卵数及产幼溞数与对照组相比均减少,且5%大肠杆菌浓度组均小于2%大肠杆菌浓度组。随着龄数的增加,RNAi对中华拟同形溞怀卵数和产幼溞数的抑制影响均加强。因此,Dsussp和Dsmapk基因被证实在中华拟同形溞的生殖发育中起重要作用。

关键词： RNA干扰生殖转录组测序中华拟同形溞

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