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草莓YABBY基因家族的鉴定及表达分析

生物工程学报 2024年第1期40卷 104-121页

作者：余婷婷沈淑容许以灵王欣雨余瑶马伯军陈析丰浙江师范大学生命科学学院浙江金华321004

YABBY蛋白是一类调控植物形态建成与器官发育的重要转录因子。为了研究草莓YABBY,通过生物信息学技术鉴定了森林草莓(二倍体)与栽培草莓(八倍体)的YABBY基因家族成员及其序列特征,构建了各成员与植物YABBY的系统发育树与共线性关系图,... 详细信息

YABBY蛋白是一类调控植物形态建成与器官发育的重要转录因子。为了研究草莓YABBY,通过生物信息学技术鉴定了森林草莓(二倍体)与栽培草莓(八倍体)的YABBY基因家族成员及其序列特征,构建了各成员与植物YABBY的系统发育树与共线性关系图,并利用RNA-seq数据与定量逆转录聚合酶链反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,qRT-PCR)技术分析其表达模式,构建绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)融合表达载体,在烟草叶细胞中瞬时表达观察其亚细胞定位。研究结果表明,森林草莓有6个FvYABBY基因,栽培草莓有26个FxaYABBY基因;FvYABBY基因家族成员可归为5个不同的进化分支,与拟南芥AtYABBY基因家族存在5对直系同源。在森林草莓中,所有Fv YABBY在根和花托中基本不表达,FvYABBY1、FvYABBY2、FvYABBY5和FvYABBY6在叶、茎、花和瘦果中高表达;在栽培草莓中,FxaYABBY1、FxaYABBY2、FxaYABBY5和FxaYABBY6在瘦果中表达,所有FxaYABBY在花托中为低表达或不表达。此外,在低温、高盐和干旱等非生物胁迫下,FvYABBY1、FvYABBY3、FvYABBY4和FvYABBY6下调表达,FvYABBY5上调表达,FvYABBY2则先上调后下调表达。在烟草叶细胞中,所有FvYABBY蛋白均定位在细胞核。以上结果为草莓YABBY基因的后续功能研究奠定了基础。

关键词：草莓 YABBY基因家族序列分析表达模式亚细胞定位

普通油茶良种资源表型性状多样性分析与综合评价

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浙江大学学报（农业与生命科学版） 2024年第2期50卷 244-257页

作者：邢凯峰张剑陈尚张立冬谢昊星赵耀戎俊南昌大学生命科学学院江西南昌330031

普通油茶(Camellia oleifera)是我国总产油量最高、栽培面积最广的木本油料作物。为促进我国普通油茶良种资源的挖掘与利用,本研究使用主成分分析、相关性分析、聚类分析、巢式方差分析、多元回归分析等方法以及变异系数、表型分化系数... 详细信息

普通油茶(Camellia oleifera)是我国总产油量最高、栽培面积最广的木本油料作物。为促进我国普通油茶良种资源的挖掘与利用,本研究使用主成分分析、相关性分析、聚类分析、巢式方差分析、多元回归分析等方法以及变异系数、表型分化系数、香农-维纳多样性指数,探究560份普通油茶良种资源的表型性状多样性及其与环境因子的相关性,并使用熵权TOPSIS法对560份普通油茶良种资源进行综合评价和排序。结果表明,560份普通油茶良种资源存在丰富的遗传多样性,34个表型性状的香农-维纳多样性指数为0.05~2.35,均值为1.06,数量性状的变异系数为3.02%~53.33%,均值为23.25%。普通油茶良种资源34个表型性状种源间和种源内的方差分量均值分别为53.591%和32.382%,说明普通油茶良种资源表型性状种源内相似性较高,其分化主要来自种源间。随着纬度的升高和年平均温度的降低,普通油茶良种资源平均单果质量、种仁含油率及饱和脂肪酸含量呈现下降趋势,而不饱和脂肪酸含量呈现上升趋势,表明纬度和年平均温度是限制普通油茶生长的主要因子。熵权TOPSIS法综合评价和排序结果显示,长林4号综合得分指数最高,浙江、云南、安徽、湖南等地区均有多个选育的良种综合排名在前30以内。本研究结果为普通油茶育种及良种推广提供了数据支撑。

关键词：普通油茶良种资源表型性状熵权TOPSIS法综合评价

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鬼针草提取物对PRRSV诱导炎症反应的抑制作用

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中国兽医杂志 2024年第6期60卷 117-123页

作者：李佳铠广倩张龙泽江雨蔓曹翀陈洪博邱龙新龙岩学院生命科学学院福建龙岩364012 福建农林大学动物科学学院(蜂学学院) 福建福州350002 预防兽医学与生物技术福建省高等学校重点实验室福建龙岩364012

为研究鬼针草提取物(BPE)对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)诱导炎症反应的抑制作用,以非洲绿猴胚胎肾细胞(Marc-145)为研究对象,将其分为4个不同浓度(100、200、400和800μg/mL)BPE处理组、空白对照组和病毒对照组,通过观察细胞病变(CPE... 详细信息

为研究鬼针草提取物(BPE)对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)诱导炎症反应的抑制作用,以非洲绿猴胚胎肾细胞(Marc-145)为研究对象,将其分为4个不同浓度(100、200、400和800μg/mL)BPE处理组、空白对照组和病毒对照组,通过观察细胞病变(CPE)和CCK-8法测定PRRSV感染后的细胞活力;实时荧光定量PCR(qPCR)检测BPE对PRRSV诱导Marc-145细胞IL-6、IL-8和TNF-α mRNA相对表达量的影响;将21日龄断奶仔猪分为空白组、病毒对照组、鬼针草高剂量组、中剂量组和低剂量组,空白组和病毒对照组饲喂基础日粮,给药组待仔猪出现临床症状后分别饲喂添加量为0.4%、0.8%和1.2%BPE的基础日粮,分别于第7、14、28天分离血清,使用ELISA试剂盒检测IL-6、IL-8和TNF-α含量,qPCR检测PRRSV载量,第28天剖检并采集肺脏进行组织病理学观察。结果显示,BPE可改善PRRSV诱导Marc-145细胞产生的病变,提高Marc-145细胞活力,有效降低PRRSV诱导的IL-6和TNF-α mRNA相对表达量;BPE能够降低攻毒仔猪血清中的炎症因子含量和PRRSV载量;肺脏组织病理学观察结果显示,病毒对照组仔猪的肺脏呈现典型的间质性肺炎,肺泡壁增厚,成纤维细胞增生,有大量炎性细胞浸润,肺中可见散在大小不一的出血灶,而各给药组仔猪肺脏的病理组织学变化有所改善。结果表明,BPE可通过抑制PRRSV诱导的炎症因子产生,降低PRRSV对仔猪肺脏的损伤。本试验结果可为鬼针草用于猪繁殖与呼吸综合征的临床治疗提供参考。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒鬼针草提取物炎症反应猪

三叶木通叶片解剖结构和生理特征对酸雨胁迫的响应及钛的缓解效应

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热带亚热带植物学报 2024年

作者：王凯陶兴梅李小琴谯祖勤刘朝张永福昆明学院农学与生命科学学院

为探讨三叶木通(Akebia trifoliata)对酸雨胁迫的响应机制和外源钛[Ti(SO?)?]对其耐酸性的影响，经模拟酸雨和外源钛处理，对叶片解剖结构和生理特征的变化进行了研究，并进行主成分分析和相关性分析。结果表明，与对照相比，模拟酸雨(... 详细信息

为探讨三叶木通(Akebia trifoliata)对酸雨胁迫的响应机制和外源钛[Ti(SO?)?]对其耐酸性的影响，经模拟酸雨和外源钛处理，对叶片解剖结构和生理特征的变化进行了研究，并进行主成分分析和相关性分析。结果表明，与对照相比，模拟酸雨(T0)处理的叶片侧脉及表皮结构受损严重，叶主脉、主脉维管束、叶片和栅栏组织加厚，叶绿素含量显著降低，氧自由基产生速率、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性均显著升高，而外源钛处理(T1?T3)均有效缓解叶侧脉和表皮的受损情况，并显著提高了叶绿素含量、SOD、POD和CAT活性，且氧自由基产生速率维持在较低水平。主成分分析表明，主脉、主脉维管束和叶厚等指标在三叶木通对酸雨胁迫逆境应答的机制中起关键作用。相关性分析表明，主脉维管束厚度、栅栏组织厚度、叶片组织结构紧密度、SOD、POD和CAT活性间呈极显著正相关关系。三叶木通幼苗通过改变叶片解剖结构、提高SOD、POD和CAT活性等方式来适应酸雨胁迫，且适当的Ti能够有效缓解酸雨胁迫造成的损伤，以0.2 mmol/L Ti效果最好。

关键词：三叶木通酸雨胁迫解剖结构生理特征耐酸性钛

光周期调控维西堇菜与裂叶堇菜开放花和闭锁花的发育

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生物多样性 2024年第6期32卷 47-55页

作者：李巧峡李有龙李纪纲陈晨龙孙坤西北师范大学生命科学学院兰州730070

两型闭花受精现象是指在植物个体发育的不同时期或不同部位会形成两种形态完全不同的花,即异花传粉的开放花(chasmogamous flower,CH)与自花传粉的闭锁花(cleistogamous flower,CL)。维西堇菜(Viola monbeigii)与裂叶堇菜(***)在早春时... 详细信息

两型闭花受精现象是指在植物个体发育的不同时期或不同部位会形成两种形态完全不同的花,即异花传粉的开放花(chasmogamous flower,CH)与自花传粉的闭锁花(cleistogamous flower,CL)。维西堇菜(Viola monbeigii)与裂叶堇菜(***)在早春时期为CH花,夏季为CL花,光周期可能调控着两种花型的发育。本研究对维西堇菜和裂叶堇菜不同光周期下的花型进行了形态观察与统计,以探究光周期对两种花型发育的调控作用,并阐明两种花型不同发育阶段的主要形态差异。结果表明:维西堇菜和裂叶堇菜的CH和CL花的差异主要体现在花瓣与雄蕊的大小与数量、蜜腺体的有无、花丝长短、柱头有无弯曲等方面。CH花5个花瓣,下花瓣有一长距,5枚雄蕊,花丝很短,2枚雄蕊背部的蜜腺体伸入下花瓣形成的距中,雌蕊花柱直立并高于雄蕊;CL花雄蕊2枚,花丝较长,无蜜腺体,其余雄蕊与5个花瓣均为原基状,雌蕊的柱头通常弯向2枚发育最好的雄蕊。另外存在着花瓣与雄蕊数量介于CH与CL花之间的过渡闭锁花(intermediate cleistogamous flower,inCL),其花部特征与闭锁花一样,花萼一直包裹着其他3轮花器官。中短日照(12 h及以下光照)下诱导的花芽大部分为CH花,长日照(16 h光照)下诱导的大部分花芽为完全CL花。两个物种的CH花与CL花在4轮花器官原基形成后出现明显的形态差异,并随着花芽发育的成熟,形态差异更加明显。本研究揭示了光周期对维西堇菜与裂叶堇菜CH和CL花发育的调控作用,阐明了CH与CL花出现明显差异的时期与具体形态差异,为堇菜属两型闭花受精适应性进化研究提供了理论依据。

关键词：光周期调控花发育维西堇菜裂叶堇菜

中国早白垩世脉翅目螳蛉科化石的新发现——孙氏逸仙蛉

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科学通报 2024年第18期69卷 2547-2552页

作者：师超凡杨强任东中山大学地球科学与工程学院广东省地质过程与矿产资源探查重点实验室珠海519080 广州大学生命科学学院广州510006 首都师范大学生命科学学院北京100048

脉翅目螳蛉科昆虫化石记录较为丰富,在中生代以绝灭亚科Mesomantispinae和Doratomantispinae的属种最多,其中中螳蛉亚科Mesomantispinae分布时代更早,集中于中侏罗世至早白垩世.本文记述了采集自我国辽宁省北票市黄半吉沟下白垩统义县... 详细信息

脉翅目螳蛉科昆虫化石记录较为丰富,在中生代以绝灭亚科Mesomantispinae和Doratomantispinae的属种最多,其中中螳蛉亚科Mesomantispinae分布时代更早,集中于中侏罗世至早白垩世.本文记述了采集自我国辽宁省北票市黄半吉沟下白垩统义县组地层的螳蛉科中螳蛉亚科一新属新种,孙氏逸仙蛉Yatsenia suni gen. et sp. nov.该新属种与同亚科其他属在前翅脉序和翅斑上具显著差异,包括Sc与R1融合于近翅中部, CuP双分叉, 1A栉状分叉等特征,揭示了白垩纪螳蛉更为丰富的形态与物种多样性.

关键词：化石昆虫螳蛉热河生物群中生代

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灵宝杜鹃SBP基因家族鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

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西北植物学报 2024年第4期44卷 582-592页

作者：于相丽陈燕赵若航李勇慧周晓君洛阳师范学院生命科学学院河南洛阳471934

【目的】SQUAMOSA启动子结合蛋白(SBP)家族在植物发育和非生物胁迫等方面起重要作用,该研究可为灵宝杜鹃SBP基因家族成员的生物学功能和在非生物胁迫响应的调控功能提供参考,并为灵宝杜鹃物种保护奠定基础。【方法】用生物信息学方法对... 详细信息

【目的】SQUAMOSA启动子结合蛋白(SBP)家族在植物发育和非生物胁迫等方面起重要作用,该研究可为灵宝杜鹃SBP基因家族成员的生物学功能和在非生物胁迫响应的调控功能提供参考,并为灵宝杜鹃物种保护奠定基础。【方法】用生物信息学方法对灵宝杜鹃(Rhododendron henanense ***)SBP基因家族成员进行全基因组鉴定和分析,基于转录组数据分析组织特异性,并用qRT-PCR方法检测SBP在非生物胁迫下的表达。【结果】(1)从灵宝杜鹃基因组中共鉴定出19个含SBP保守结构域SBP成员,依次命名为RhlSBP1-RhlSBP19,基因不均匀分布在8条染色体上,编码的氨基酸长度为179~1072 aa,分子质量为20.26~118.73 kD;蛋白定位于细胞核;(2)系统发育分析将19个RhlSBP分为5个亚族,大部分RhlSBP与拟南芥AtSPL家族成员聚类;(3)所有的RhlSBP共有motif 1、motif 2和motif 4,基因结构显示Ⅳ、Ⅴ亚族内含子数量远多于Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ亚族;(4)RhlSBP启动子中含有大量光响应元件、激素响应元件和环境胁迫响应元件,推测RhlSBP可能在灵宝杜鹃响应光调控、环境胁迫中发挥重要作用;(5)灵宝杜鹃与其同科植物羊踟蹰、圆叶杜鹃的SBP基因有更高的共线性;(6)RhlSBP基因亚家族成员具有相似的组织表达模式;(7)RhlSBP基因对非生物胁迫具有响应作用,但不同成员在不同胁迫下的响应程度存在差异。茉莉酸甲酯和低温处理后,基因表达总体呈上调趋势,高盐会抑制RhlSBP基因表达,干旱条件下,RhlSBP基因表达呈先上调再下调趋势。【结论】RhlSBP1、RhlSBP8可能是干旱、低温和MeJA诱导关键基因。

关键词：灵宝杜鹃 SBP基因家族生物信息学非生物胁迫

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OsGSK2与OsGLK1互作调控水稻叶绿素合成与叶绿体发育

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植物遗传资源学报 2024年第3期25卷 472-481页

作者：赵楚瑄纪晓楠刘梦雨韩丹许可可刘喜淮阴师范学院生命科学学院江苏淮安223300

叶绿素是水稻光合作用的重要色素,叶绿素的合成决定光合作用的效率,影响植物的产量和品质。在本研究中,发现糖原合成酶激酶OsGSK2过表达植株Go-2成熟期呈现叶片深绿色的表型。相比野生型,Go-2植株叶绿素a、叶绿素b以及类胡萝卜素含量显... 详细信息

叶绿素是水稻光合作用的重要色素,叶绿素的合成决定光合作用的效率,影响植物的产量和品质。在本研究中,发现糖原合成酶激酶OsGSK2过表达植株Go-2成熟期呈现叶片深绿色的表型。相比野生型,Go-2植株叶绿素a、叶绿素b以及类胡萝卜素含量显著升高。透射电镜观察结果显示,相比野生型,Go-2植株叶绿体类囊体片层增多。酵母双杂交“一对一”实验证实OsGSK2与Golden2-Like转录因子OsGLK1存在互作,并进一步通过双分子荧光互补实验确认OsGSK2与OsGLK1存在互作。在水稻原生质体中检测双荧光素酶活性发现,相比单转OsGLK1,OsGSK2与OsGLK1共转显著提高下游靶基因的表达水平。荧光定量PCR结果表明,相比野生型,在Go-2植株中OsGLK1直接调控的靶基因OsPORB、OsCAO1、LHCB6等转录水平显著上调。研究结果初步揭示了OsGSK2与OsGLK1互作调控水稻叶绿素合成和叶绿体发育的分子机理,进一步拓展了水稻糖原合成酶激酶的分子功能,丰富了水稻叶色调控的分子网络,为水稻高光合分子育种提供了理论依据。

关键词：水稻 OsGSK2 OsGLK1 叶绿素合成叶绿体发育

NLRP3炎症小体在PRRSV调控机体炎症中的作用

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中国兽医杂志 2024年第6期60卷 93-100页

作者：李鸿喜章蓓雯唐歆田颖邱龙新陈洪博龙岩学院生命科学学院福建龙岩364012 福建农林大学动物科学学院(蜂学学院) 福建福州350002 预防兽医学与生物技术福建省高等学校重点实验室福建龙岩364012

猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)是一种严重危害猪类养殖业的病毒,引起了广泛关注,炎症作为机体对PRRSV感染的主要反应之一,在病毒感染过程中发挥重要作用。NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)炎症小体作为一种重要的细胞内炎症调节... 详细信息

猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)是一种严重危害猪类养殖业的病毒,引起了广泛关注,炎症作为机体对PRRSV感染的主要反应之一,在病毒感染过程中发挥重要作用。NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)炎症小体作为一种重要的细胞内炎症调节机制,在PRRSV感染中扮演着不可忽视的角色。本文重点综述NLRP3炎症小体对PRRSV感染机体炎症的调控作用,并探讨其在PRRSV防控中的潜在应用价值,为PRRSV感染的机制和治疗研究提供参考。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)炎症小体炎症