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ZNF638/NP220同源蛋白及其生物学作用的研究进展

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生理科学进展 2023年第3期54卷 214-221页

作者：孟思帆程杉首都医科大学基础医学院医学遗传学与发育生物学学系北京100069

一些具有锌指结构域的蛋白质可以识别特定的靶RNA分子并与之结合,在细胞中参与或介导重要的生物学作用,这一发现拓展了人们对锌指蛋白专职转录调控并且高度依赖于特异结合靶DNA序列的认知。ZNF638/NP220及其同源蛋白Matrin3和RBM20是一... 详细信息

一些具有锌指结构域的蛋白质可以识别特定的靶RNA分子并与之结合,在细胞中参与或介导重要的生物学作用,这一发现拓展了人们对锌指蛋白专职转录调控并且高度依赖于特异结合靶DNA序列的认知。ZNF638/NP220及其同源蛋白Matrin3和RBM20是一类在生物进化中相当保守的特殊锌指蛋白,定位于细胞核基质的核斑中,含有特殊的蛋白结构域,可以特定靶向RNA分子,在细胞的转录调控和RNA加工的不同阶段发挥作用,特别是RNA转录和剪接事件的偶联以及改变RNA分子的成熟和稳定性等方面。本文将对近年来有关ZNF638同源蛋白成员的发现、结构、分子机制及其在细胞分化、胚胎发育、病毒的感染等生命过程中调控作用的研究进展进行总结讨论。

关键词：锌指蛋白 ZNF638 同源蛋白 RNA结合结构域 Matrin3 RBM20

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RNA m^(6)A甲基化与神经发育

中国生物化学与分子生物学报 2022年第3期38卷 249-261页

作者：薛李婷赵天叶海虹首都医科大学基础医学院医学遗传学与发育生物学教研室北京100069 首都医科大学神经再生与修复北京市重点实验室北京100069

中枢神经系统控制高级神经活动,例如知觉、运动、语言和认知等。作为人体神经系统最重要的部分,其正常的发育及功能活动在人体发育过程中至关重要。更好地了解调节神经系统发育的基本分子途径以及对大脑的基本生物学理解,可以帮助诊断... 详细信息

中枢神经系统控制高级神经活动,例如知觉、运动、语言和认知等。作为人体神经系统最重要的部分,其正常的发育及功能活动在人体发育过程中至关重要。更好地了解调节神经系统发育的基本分子途径以及对大脑的基本生物学理解,可以帮助诊断和治疗各种神经疾病。RNA分子m^(6)A修饰状态的动态变化及其功能主要由m^(6)A甲基转移酶、m^(6)A去甲基化酶和m^(6)A阅读蛋白等蛋白质复合物共同调控。本文对此进行了详细介绍,并详细概述m^(6)A修饰对神经发育的影响,重点介绍表观转录组学在基因调控中的作用。此外,还强调m^(6)A修饰在神经发育过程中的生物学意义,包括神经发生、神经分化、轴突导向、突触形成及突触可塑性等。根据不同的实验原理和实验技术,本文详细介绍了最近发展的几种检测m^(6)A位点的技术,每种方法都有各自的优点,据此将能够更广泛和更深入地研究这一修饰,并选择合适的方法去研究课题。RNA m^(6)A甲基化是神经科学领域的一个新前沿。近年来,随着m^(6)A检测技术的发展,m^(6)A甲基化在神经系统发育过程中及神经疾病发生中的作用研究逐渐成为热点,具有很大潜力,为神经发育和神经疾病的研究提供了新视角。

关键词：表观转录组学 N^(6)-腺苷酸甲基化神经发育神经发生突触

基因突变动物模型在《医学遗传学》实验教学中的应用

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中国比较医学杂志 2017年第10期27卷 123-126页

作者：唐佐青霍学云韩玉英王晶叶海虹赵天李振坤陈振文首都医科大学基础医学院医学遗传学与发育生物学学系北京100069

目的在《医学遗传学》实验教学中引入基因突变动物模型,并调查其在分子遗传诊断课程中的应用价值,以期促进医学生对基因突变检测原理与技术的理解,并有效提高医学生解决实际遗传诊断问题的能力。方法对首都医科大学2011级和2012级基础... 详细信息

目的在《医学遗传学》实验教学中引入基因突变动物模型,并调查其在分子遗传诊断课程中的应用价值,以期促进医学生对基因突变检测原理与技术的理解,并有效提高医学生解决实际遗传诊断问题的能力。方法对首都医科大学2011级和2012级基础医学专业80名本科生开设分子遗传诊断实验,以无毛突变小鼠为实验对象,通过动物组织提取基因组DNA,并以提取的DNA作为模板,采用PCR方法对目的片段进行扩增,电泳鉴定PCR产物及应用凝胶成像系统对结果进行分析,观察基因突变动物模型—无毛小鼠表型特征与其基因型的内在联系。针对实验效果,设计调查问卷,分析学生反馈。结果问卷调查各项指标满意率均达到90%以上,98.7%的学生认为新的实验教学模式有助于对专业实验技能的掌握,96%的学生认为该实验课程有效提高了他们解决问题的能力。结论应用基因突变动物模型开展分子遗传诊断实验能够切实提高学生的学习效果,培养学生的综合素质。同时也为医学院校在教学中如何充分利用实验动物模型拓展教学内容和教学手段提供了借鉴。

关键词：基因突变动物模型实验课教学分子遗传诊断

人类起源的探索--2022年诺贝尔生理学或医学奖

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首都医科大学学报 2022年第5期43卷 804-806页

作者：董凌月王宇童首都医科大学基础医学院细胞生物学系北京100069

北京时间2022年10月3日,瑞典斯德哥尔摩卡罗琳斯卡医学院宣布将2022年诺贝尔生理学或医学奖授予瑞典进化遗传学家斯万特•佩博(Svante Paabo),以表彰他在“关于已灭绝古人类基因组和人类进化方面的发现”中做出的杰出贡献。本文对斯万特... 详细信息

北京时间2022年10月3日,瑞典斯德哥尔摩卡罗琳斯卡医学院宣布将2022年诺贝尔生理学或医学奖授予瑞典进化遗传学家斯万特•佩博(Svante Paabo),以表彰他在“关于已灭绝古人类基因组和人类进化方面的发现”中做出的杰出贡献。本文对斯万特•佩博的生平、科学贡献和意义加以介绍。

关键词： 2022年诺贝尔生理学或医学奖古人类基因组人类进化

LINC02870对肝细胞性肝癌细胞增殖的影响及机制

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山东医药 2022年第31期62卷 48-51页

作者：郭梦雅邵晓雯黄佳宁白楠李茗鹤李咏梅天津医科大学基础医学院病原生物学系天津300070 天津医科大学基础医学院遗传学系

目的探讨长链非编码RNA-02870(LINC02870)对肝细胞性肝癌(HCC)细胞(PLC细胞)增殖的影响及机制。方法常规培养PLC细胞并随机分为对照组、过表达组,分别转染载体对照pcDNA3.1+质粒、LINC02870质粒,48 h后常规进行细胞传代。采用实时定... 详细信息

目的探讨长链非编码RNA-02870(LINC02870)对肝细胞性肝癌(HCC)细胞(PLC细胞)增殖的影响及机制。方法常规培养PLC细胞并随机分为对照组、过表达组,分别转染载体对照pcDNA3.1+质粒、LINC02870质粒,48 h后常规进行细胞传代。采用实时定量聚合酶链式反应检测细胞内LINC02870表达,用CCK8实验、EdU染色法检测细胞增殖能力,用Western blotting法检测细胞内磷酸化真核细胞起始因子4E结合蛋白1(p-4EBP-1)表达。结果对照组、过表达组LINC02870相对表达量分别为1.00±0.07、113.40±1.57,两组比较差异有统计学意义(P<0.05)。培养24、48、72 h,过表达组OD值逐渐升高,且均高于对照组同期(P均<0.05);过表达组EdU染色阳性细胞比例高于对照组(P<0.05)。过表达组p-4EBP-1蛋白相对表达量高于对照组(P均<0.05)。结论 LINC02870可促进HCC细胞增殖,其机制可能与调控4EBP-1蛋白磷酸化有关。

关键词：肝细胞性肝癌细胞增殖长链非编码RNA-02870 真核细胞起始因子4E结合蛋白1

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RNA m;A甲基化与神经发育（英文）

中国生物化学与分子生物学报 2021年

作者：薛李婷赵天叶海虹首都医科大学基础医学院医学遗传学与发育生物学教研室首都医科大学神经再生与修复北京市重点实验室

中枢神经系统控制高级神经活动，例如知觉、运动、语言和认知等。它作为人体神经系统最重要的部分，其正常的发育及功能活动在人体发育过程中至关重要。更好地了解调节神经系统发育的基本分子途径以及对大脑的基本生物学理解，可以帮助... 详细信息

中枢神经系统控制高级神经活动，例如知觉、运动、语言和认知等。它作为人体神经系统最重要的部分，其正常的发育及功能活动在人体发育过程中至关重要。更好地了解调节神经系统发育的基本分子途径以及对大脑的基本生物学理解，可以帮助诊断和治疗各种神经疾病。RNA分子m;A修饰状态的动态变化及其功能主要由m;A甲基转移酶、m;A去甲基化酶和m;A阅读蛋白等蛋白质复合物共同调控。本文对此进行了详细介绍，并详细概述了m;A修饰对神经发育的影响，重点介绍了表观转录组学在基因调控中的作用。此外，还强调了m;A修饰在神经发育过程中的生物学意义，包括神经发生、神经分化、轴突导向、突触形成及突触可塑性等。根据不同的实验原理和实验技术，本文详细介绍了最近发展的几种检测m;A位点的技术，每种方法都有各自的优点，据此将能够更广泛和更深入地研究这一修饰，并选择合适的方法去研究课题。RNA m;A甲基化是神经科学领域的一个新前沿。近年来，随着m;A检测技术的发展，m;A甲基化在神经系统发育过程中及神经疾病发生中的作用研究逐渐成为热点，具有很大潜力，为神经发育和神经疾病的研究提供了新视角。

关键词：表观转录组学 N -腺苷酸甲基化神经发育神经发生突触

两种不同方法提取骨髓间充质干细胞来源外泌体的比较

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宁夏医科大学学报 2023年第5期45卷 475-481页

作者：徐彧徐海瑾李家瑞孔斌李卉陆宏宋辉宁夏医科大学基础医学院医学遗传学与细胞生物学系银川750004 宁夏医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系银川750004 宁夏医科大学基础医学院人体解剖与组织胚胎学系银川750004

目的探讨骨髓间充质干细胞(BMMSCs)外泌体的提取方法。方法提取大鼠原代BMMSCs,分别采用超速差速离心法和ExoQuick-TC^(TM)法提取外泌体,随后采用透射电子显微镜(TEM)观察形态特征,BCA测定蛋白浓度,Western blot检测典型标志蛋白质,... 详细信息

目的探讨骨髓间充质干细胞(BMMSCs)外泌体的提取方法。方法提取大鼠原代BMMSCs,分别采用超速差速离心法和ExoQuick-TC^(TM)法提取外泌体,随后采用透射电子显微镜(TEM)观察形态特征,BCA测定蛋白浓度,Western blot检测典型标志蛋白质,纳米颗粒跟踪分析仪(NTA)分析其粒径。结果通过TEM和NTA分析表明,两种提取方法均可得到具有双层膜、茶托样结构的囊泡,直径为30~150 nm。超速差速离心法提取的外泌体颗粒浓度[(399.00±55.56)×10^(8)particles·mL^(-1)vs.(7.94±0.50)×10^(8)particles·mL^(-1)]及电镜下数量[(13.53±2.55)个vs.(1.60±0.20)个]均较ExoQuick-TCTM法增加(P均<0.05),粒径峰值[(109.53±6.45)nm]较ExoQuick-TCTM法[(139.27±1.45)nm]降低(P<0.05)。BCA测定蛋白浓度显示,超速差速离心法提取的外泌体蛋白浓度[(12.43±0.98)mg·mL^(-1)]较ExoQuick-TCTM法[(4.30±0.48)mg·mL^(-1)]增高(P<0.05)。Western blot检测结果显示,超速差速离心法提取的外泌体标志性蛋白CD63和CD81的表达呈阳性,而ExoQuick-TC^(TM)法提取的外泌体呈阴性。结论超速差速离心法是一种更为可靠有效的BMMSCs外泌体提取方法。

关键词：大鼠骨髓间充质干细胞外泌体超速差速离心法 ExoQuick-TC^(TM)法

表观遗传调控:基于染色质环境的DNA双链断裂修复

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中国生物化学与分子生物学报 2019年第4期35卷 353-360页

作者：葛同石磊天津医科大学基础医学院免疫学系天津300070 天津医学表观遗传学协同创新中心天津市医学表观遗传学重点实验室天津医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系天津300070

DNA双链断裂(DNA double-strand breaks, DSBs)是威胁基因组完整性和细胞存活的最有害的DNA损伤类型。同源重组(homologous recombination,HR)和非同源末端连接(non-homologous end joining,NHEJ)是修复DNA双链断裂的两种主要途径。DSB修复涉及到损伤部位修复蛋白的募集和染色质结构的改变。在DNA双链断裂诱导下,染色质结构的动态变化在时间和空间上受到严格调控,进而对DNA双链断裂修复过程进行精细调节。特定的染色质修饰形成利于修复的染色质状态,有助于DNA双链断裂修复机器的招募、修复途径的选择和DNA损伤检查点的活化;其中修复途径的选择对于基因组稳定性至关重要。修复不当或失败可导致基因组不稳定性,甚至促进肿瘤的发生。本文综述了染色质结构和染色质修饰的动态变化在DSB修复中的重要作用。此外,文章还总结了在癌症治疗中靶向关键染色质调控因子在基因组稳定性维持、肿瘤发生发展以及潜在临床应用价值等方面的进展。

关键词： DNA双链断裂修复途径染色质修饰染色质结构表观遗传调控

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副突变及其表观遗传机制的研究进展

生理科学进展 2016年第1期47卷 7-13页

作者：程杉王晓荣丁卫首都医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系北京100069

经典遗传学的研究方法为许多遗传性疾病和遗传相关性疾病的预防、诊断和治疗提供了在分子水平上的直接线索,然而人类疾病的遗传表现始终存在着经典遗传学法则所不能解释的现象。副突变(paramutation)是上世纪50年代首次在玉米中发现的... 详细信息

经典遗传学的研究方法为许多遗传性疾病和遗传相关性疾病的预防、诊断和治疗提供了在分子水平上的直接线索,然而人类疾病的遗传表现始终存在着经典遗传学法则所不能解释的现象。副突变(paramutation)是上世纪50年代首次在玉米中发现的一种非孟氏遗传模式,其传递的等位基因不存在核苷酸序列的差异,提示了表观遗传机制可能参与了基因表达和表型的可遗传变化。近期的研究发现关于副突变现象的解释可能涉及一种新的表观遗传学调控机制,即由RNA(特别是非编码RNA)引发的基因组改变参与了副突变的发生和维持。其中DNA甲基转移酶II所介导的RNA甲基化发挥了极其重要的作用。对副突变及其机制的研究不仅能够深化人类对遗传和生命本质的认识,还有助于开拓在生物工程和疾病诊疗等应用领域的新思路。本文综述了副突变的分子机制和研究进展,并且探讨了副突变在疾病研究和基因治疗中的应用前景。

关键词：副突变表观遗传学非孟氏遗传重复序列 DNA甲基转移酶