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2010-2012年青岛地区手足口病病原谱及柯萨奇 A10型的分子流行病学研究

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中华微生物学和免疫学杂志 2014年第10期34卷 731-736页

作者：柴青宫金伶赵丹史晓燕于萍汪照国青岛市疾病预防控制中心微生物与寄生虫检验科 266033

目的：阐明2010-2012年青岛地区手足口病（ HFMD）病原谱及相关柯萨奇病毒A10（ CVA10）型基因特征。方法用荧光RT-PCR法对HFMD患者咽拭子标本进行总肠道病毒（ EV）、柯萨奇病毒A16（CVA16）型和肠道病毒71（EV71）型检测，然后用半巢... 详细信息

目的：阐明2010-2012年青岛地区手足口病（ HFMD）病原谱及相关柯萨奇病毒A10（ CVA10）型基因特征。方法用荧光RT-PCR法对HFMD患者咽拭子标本进行总肠道病毒（ EV）、柯萨奇病毒A16（CVA16）型和肠道病毒71（EV71）型检测，然后用半巢式反转录PCR进行肠道病毒VP1基因部分序列扩增，再结合序列分析鉴定血清型；对CVA10阳性分离株进行VP1基因全长序列扩增及基因序列测定，用MEGA5．0软件进行系统发育分析及分子特征分析。结果2010-2012年间，共检测1919个手足口病门诊轻症病例和1336个住院重症病例；门诊轻症病例中，2010年和2012年以CVA16为主，各占轻症病例总阳性数的53％和73％，而2011年以EV71为主，占轻症病例总阳性数的78％；住院重症病例中，EV71为2010年和2011年主要病原，各占重症病例总阳性数的70％和86％；其他型别（非CVA16、非EV71）肠道病毒在2012年住院重症病例中成为主要病原，占重症病例总阳性数的44％；2010-2012年分别检出其他型别肠道病毒19株、16株和22株，其中CVA10检出率最高；23株CVA10的VP1全长基因序列进化分析表明这23株CVA10病毒全部属于C基因型，它们VP1基因氨基酸序列同源性为97．3％～100．0％，与其他地区同期参考株相比无显著差异。结论2010-2012年间，CVA16和EV71是引起青岛地区手足口病流行的主要病原，同时伴有多种其他型别肠道病毒流行，其中C基因型CVA10分离率较高，它们相互间同源性较高，与其他地区同期参考株相似。

关键词：手足口病肠道病毒柯萨奇病毒A10 系统进化分析

安徽省山丘型血吸虫病流行区野鼠血吸虫感染状况调查

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医学动物防制 2025年第1期 1-4+10页

作者：汪峰峰章乐生尹晓梅朱海朱磊黄殷殷慈胜利陈雪峰汪天平安徽省血吸虫病防治研究所寄生虫病媒介生物控制室池州市贵池区血吸虫病防治站石台县疾病预防控制中心

目的了解安徽省2个山丘型血吸虫病流行区野鼠的血吸虫感染状况，为血吸虫病防治策略的制定提供依据。方法选择安徽省池州市2个山丘型血吸虫病流行区（贵池区和石台县）,每个县（区）分别选择1个有感染性钉螺分布的村为观察村，未发现... 详细信息

目的了解安徽省2个山丘型血吸虫病流行区野鼠的血吸虫感染状况，为血吸虫病防治策略的制定提供依据。方法选择安徽省池州市2个山丘型血吸虫病流行区（贵池区和石台县）,每个县（区）分别选择1个有感染性钉螺分布的村为观察村，未发现感染性钉螺的村为对照村。采取夹夜法捕获野鼠，计算鼠密度。采用肝脏组织压片镜检、肠系膜组织镜检和改良加藤厚涂片法（Kato-katz法）检测野鼠血吸虫的感染情况，并利用χ2检验比较不同鼠种日本血吸虫的感染率差异。结果贵池区观察村（栗坑村）,共捕获黑线姬鼠、黄毛鼠、黄胸鼠、褐家鼠和社鼠5种野鼠，鼠密度为4.44%,日本血吸虫感染率为39.56%,不同种类野鼠日本血吸虫的感染率差异有统计学意义（χ2=7.584,P=0.023）;对照村（龙池村）的鼠密度为2.24%,未发现野鼠日本血吸虫感染。石台县观察村（东庄村）,共捕获黑线姬鼠、黄毛鼠、褐家鼠和社鼠4种野鼠，鼠密度为11.73%,日本血吸虫感染率为46.90%,不同种类野鼠日本血吸虫的感染率差异有统计学意义（χ2=10.637,P=0.014）;对照村（七都村）鼠密度为8.78%,未发现野鼠感染日本血吸虫。结论安徽部分山丘地区野鼠种类多、密度高、血吸虫感染率高，其可能是血吸虫病传播的潜在传染源，应加强监测。

关键词：安徽省山丘型血吸虫病流行区野鼠血吸虫病感染率

2013 年青岛地区手足口病病原谱及三种主要肠道病毒青岛分离株的基因特征分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2015年第10期35卷 765-770页

作者：史晓燕柴青宫金伶庄桂丽赵丹张秀莲汪照国青岛市疾病预防控制中心微生物与寄生虫检验科 660033

目的阐明2013年青岛地区手足口病（HFMD）病原谱及肠道病毒71（EV71）型、柯萨奇病毒A16（CVA16）型和柯萨奇病毒A6（CVA6）型青岛分离株的基因特征. 方法用荧光RT-PCR法检测2013年青岛地区HFMD患者咽拭子标本中的总肠道病毒（ EV）、... 详细信息

目的阐明2013年青岛地区手足口病（HFMD）病原谱及肠道病毒71（EV71）型、柯萨奇病毒A16（CVA16）型和柯萨奇病毒A6（CVA6）型青岛分离株的基因特征. 方法用荧光RT-PCR法检测2013年青岛地区HFMD患者咽拭子标本中的总肠道病毒（ EV）、EV71、CVA16和CVA6,对阳性分离株进行VP1基因全长序列扩增、基因序列测定及系统进化分析. 结果 2013年共检测841个手足口病轻症病例和107 个重症病例,肠道病毒阳性率64 .3%,主要病原构成为EV71 （ 44 .8%）、CVA6（28.2%）和CVA16（9.5%）. CVA6超过CVA16成为手足口病的第二大致病原,占3岁以下儿童肠道病毒构成的42 .7%,占重症病例分离病原的22 .2%,在手足口病病原构成中所占比例随年龄增长呈下降趋势（ P〈0 .001 ）. VP1全长的系统发生分析显示,2013年EV71属于C4基因亚型中的C4a,CVA16属于B1亚型的B1a和B1b,与其他地区同期参考株无明显差别;CVA6的VP1序列分为A^F 6个基因组,青岛地区CVA6分离株分处A和D基因组,2013年CVA6青岛分离株83 .9%位于A基因组,16 .1%位于D基因组;2012年CVA6青岛分离株66 .7%位于A基因组,33 .3%位于D基因组;2008—2011年CVA6青岛分离株全部位于D基因组. 结论 EV71、CVA6和CVA16是2013年青岛地区手足口病的主要病原;CVA6所占病原构成随年龄增长呈下降趋势;EV71 流行亚型为C4a, CVA16流行亚型为B1a和B1b;CVA6优势毒株在2008—2013年间显示出由D基因组向A基因组的改变.

关键词：手足口病肠道病毒系统进化分析基因组

青海省甘德县青海田鼠和寄生蚤的种群组成与数量分析

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医学动物防制 2025年第2期 105-108+113页

作者：魏有文熊浩明米宝玉夏辉周奎章徐守彪李积德阿明马英青海省地方病预防控制所鼠疫预防控制科国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室青海省果洛州疾病预防控制中心

目的了解冬季青海田鼠和寄生蚤的种群组成以及在不同生境的分布情况，为当地动物鼠疫流行病学的研究提供数据。方法 2023年3月选取4种生境设置样地，用堵洞盗开洞法计数洞口数，在24h内捕获青海田鼠并收集寄生蚤；用构成比对分类变量... 详细信息

目的了解冬季青海田鼠和寄生蚤的种群组成以及在不同生境的分布情况，为当地动物鼠疫流行病学的研究提供数据。方法 2023年3月选取4种生境设置样地，用堵洞盗开洞法计数洞口数，在24h内捕获青海田鼠并收集寄生蚤；用构成比对分类变量进行描述，用SSPS 20.0软件进行独立样本t检验和单因素方差分析。结果青海田鼠密度介于26.95～58.33只/hm2,平均密度为40.92只/hm2;洞口系数介于6.71～12.89,平均洞口系数为8.51;雌雄比为1.2∶1,种群组成以青年成体（32.73%）和壮年成体（29.09%）为主；24h洞外活动呈单峰型，高峰在13:00～17:00。寄生蚤隶属3科4属4种；染蚤率为49.09%,平均蚤指数为1.27;寄生蚤种组成以细钩盖蚤（48.57%）和直缘双蚤指名亚种（40.00%）为主；青海田鼠体质量在雌雄间的差异无统计学意义（t=0.85,P=0.40）,4种生境类型间青海田鼠体质量差异无统计学意义（F=1.24,P=0.31）。结论冬季青海田鼠种群结构以青年成体和壮年成体为主，雌性略多于雄性；青海田鼠24h洞外活动呈单峰型，寄生蚤蚤种组成以细钩盖蚤和直缘双蚤指名亚种为主。

关键词：种群结构生态特征青海田鼠寄生蚤甘德县分析

2009-2011年青岛市甲型H1N1流行性感冒病毒全基因组特征分析

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中华预防医学杂志 2013年第12期47卷 1105-1109页

作者：汪照国杨婷婷柴青于萍刘晓琳段海平弋英山东省青岛市疾病预防控制中心微生物与寄生虫检验科 266033

目的了解2009-2011年青岛地区甲型H1N1流行性感冒病毒（简称流感病毒）的全基因组特征.方法选取2009-2011年青岛地区流行的甲型H1N1流感病毒35株,提取病毒RNA,应用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）扩增各基因片段,并进行序列测定;用Seque... 详细信息

目的了解2009-2011年青岛地区甲型H1N1流行性感冒病毒（简称流感病毒）的全基因组特征.方法选取2009-2011年青岛地区流行的甲型H1N1流感病毒35株,提取病毒RNA,应用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）扩增各基因片段,并进行序列测定;用Sequencher软件完成序列拼接.选取GenBank收录的25条全球同期甲型H1N1流感病毒血凝素（HA）基因全长序列作为参照,用Mega 5.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析;下载2010年8月至2011年3月间全球分离的1068条该型HA序列用于氨基酸变异分析.结果在HA基因进化树上,2009-2010、2010-2011年监测季毒株各分列4个分支,每监测季各有一个优势分支.2009-2010年监测季优势分离株HA基因核苷酸同源性为99.6％～99.9％,编码氨基酸同源性为99.1％～ 99.8％,2010-2011年监测季优势分离株HA基因核苷酸同源性为99.1％～ 99.6％,编码氨基酸同源性为98.2％～99.1％,两季优势分离株间HA基因核苷酸同源性为98.8％～99.8％,编码氨基酸同源性为98.0％～99.6％.病毒HA蛋白与疫苗株比较,各监测季分别有14、12处氨基酸变异,涉及10个抗原位点及5个阳性选择位点.神经氨酸酶（NA）蛋白247位、274位氨基酸均分别为丝氨酸（247S）、组氨酸（274H）,M2蛋白31位氨基酸均为天冬酰胺（31N）.结论 2009-2011年青岛地区流行的甲型H1N1流感病毒在持续不断地发生变异而产生抗原漂移;毒株全部为烷胺类药物耐药株,但对神经氨酸酶抑制剂敏感.

关键词：流感病毒A型基因组抗原变异

MALDI-TOF MS在佩戴过的口罩细菌污染情况研究中的应用

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医学动物防制 2025年第1期 35-39页

作者：丁国涛杨国兴赵艳方彦飞高腾李伟昊邯郸市疾病预防控制中心理化微生物检验科

目的应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)分析不同佩戴时长口罩的细菌污染情况。为相关部门提出合理的口罩佩戴时长提供依据。方法 ... 详细信息

目的应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)分析不同佩戴时长口罩的细菌污染情况。为相关部门提出合理的口罩佩戴时长提供依据。方法于2022年7月招募志愿者在日常工作环境中佩戴口罩，佩戴时长为0.5h、1.0h、2.0h、4.0h、5.0h;使用倾注平板法测定不同佩戴时长口罩内外表面的细菌总数；使用MALDI-TOF MS方法鉴定并分析口罩内外表面细菌丰度。统计学分析采用校正的F检验方法。结果佩戴5.0h口罩内表面与外表面的细菌总数差异有统计学意义[平均值差值(mean deviation,MD)=380.9,P<0.001];佩戴0.5h、1.0h、2.0h和4.0h口罩内表面与外表面的细菌总数差异无统计学意义(MD=9.2,P=0.704;MD=9.3,P=0.701;MD=40.2,P=0.099;MD=19.0,P=0.433)。整个研究共分离320个单菌落。佩戴4.0h的口罩内外表面同时检出的菌属数为2,穿透率最高为33.3%。佩戴5.0h的口罩内外表面同时检出的菌属数为5,穿透率为25.0%～100.0%。结论随佩戴时间延长，口罩内外表面细菌总数增加。同一佩戴时长，口罩内表面的细菌数量高于口罩外表面；同一佩戴时长，口罩内表面的细菌种类低于口罩外表面。建议佩戴时长超过4.0h更换口罩。

关键词：基质辅助激光解析电离飞行时间质谱佩戴时长细菌污染细菌丰度细菌穿透率

济宁市城区生活污水中沙门菌分布、耐药特征及全基因组测序分析

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现代预防医学 2024年第5期51卷 930-936页

作者：王胜男祝园园杜照中聂天艳尹强济宁市疾病预防控制中心微生物检验科任城区疾病预防控制中心微生物检验科

目的了解济宁市城区生活污水中沙门菌分布、血清型、耐药特征，并进行全基因组测序分析，为沙门菌的防控提供科学依据。方法 2023年2—3月，每周采集城区3个污水厂进水口污水各2份，每份500 ml，连续采集7周，合计42份污水样本，对污... 详细信息

目的了解济宁市城区生活污水中沙门菌分布、血清型、耐药特征，并进行全基因组测序分析，为沙门菌的防控提供科学依据。方法 2023年2—3月，每周采集城区3个污水厂进水口污水各2份，每份500 ml，连续采集7周，合计42份污水样本，对污水样本进行沙门菌的培养、分离、鉴定，分离出的沙门菌进行血清凝集试验和荧光定量PCR血清分型，利用微量肉汤稀释法对41株沙门菌进行9类17种药物的最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)检测，进行全基因组测序及系统进化分析。结果济宁市城区生活污水沙门菌分离率较高，42份样本中阳性样本24份，共分离出41株沙门菌，属9种血清型，以阿贡纳和肯塔基为主，李营和济东污水厂有其独有的血清型。只有1株吉韦沙门菌不耐药，其余40株沙门菌均为多重耐药菌，对复方新诺明、四环素、氨苄西林、链霉素耐药率达90%以上，对氨苄西林/舒巴坦耐药率达80%以上，共19种耐药谱，SXT-TET-STR-AMP-AMS占首位，不同血清型沙门菌的耐药谱不同，肯塔基沙门菌、黄金海岸沙门菌、婴儿沙门菌的多重耐药非常严重，同种血清型在不同污水厂中的耐药谱也不一致，李营污水厂的沙门菌耐药现象最严重。利用CARD数据库进行耐药基因预测，主要预测出8类耐药家族的18个耐药基因，耐药表型与耐药基因几乎全部一致。不同血清型沙门菌的ST分型不同，以ST13的阿贡纳沙门菌为主，进化树分为6个簇，不同污水厂的沙门菌在不同分支，提示基因组有差异，不同源。结论济宁市城区生活污水中沙门菌血清型多样，提示可能已在人群中存在并传播，耐药严重，携带耐药基因广泛，有些型别菌株持续存在且跨区域分布，有致病风险，需持续监测，并制定对科学的防控措施以控制沙门菌的流行及耐药的加重。

关键词：血清型耐药谱耐药基因多位点序列分型系统进化树

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山西省内2株艾伯特埃希菌的分离与鉴定

中华预防医学杂志 2020年第10期54卷 1121-1126页

作者：王骥涛孟德权郭建娥闫国栋张玲万姿廷李群高丽高瑞红赵利峰王红太原市疾病预防控制中心微生物检验科 030001 自贡市疾病预防控制中心微生物检验所 643000

目的:了解山西省家禽中艾伯特埃希菌的带菌情况。方法:采集山西省不同禽类定点屠宰场鸡肠内容物经EC肉汤增菌后,PCR对其进行eae基因检测,阳性增菌液接种麦康凯琼脂,挑取不发酵乳糖菌落进行三重PCR(clpX、lysP和mdh基因)、16S rRNA基因... 详细信息

目的:了解山西省家禽中艾伯特埃希菌的带菌情况。方法:采集山西省不同禽类定点屠宰场鸡肠内容物经EC肉汤增菌后,PCR对其进行eae基因检测,阳性增菌液接种麦康凯琼脂,挑取不发酵乳糖菌落进行三重PCR(clpX、lysP和mdh基因)、16S rRNA基因序列分析及多位点序列分型(Multiocus sequence typing,MLST)鉴定。结果:本研究共采集了250份样品,经eae基因检测、生化鉴定、三重PCR检测、16S rRNA及MLST聚类分析,确定2株不发酵乳糖、木糖,无动力,eae、clpX、lysP和mdh基因阳性的菌株为艾伯特埃希菌。进一步对该2株艾伯特埃希菌毒力基因分析发现,该菌株携带Ⅱ/Ⅲ/Ⅴ组亚型cdtB基因,但均不携带stx基因。结论:本研究表明山西省鸡类中存在艾伯特埃希菌带菌的情况。

关键词：序列分析艾伯特埃希菌聚合酶链反应

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沙门菌毒力岛1缺失山夫登堡沙门菌的特性

中华预防医学杂志 2011年第10期45卷 899-903页

作者：李迎慧许学斌扈庆华石晓路林一曼邱亚群深圳市疾病预防控制中心微生物检验科 518055 上海市疾病预防控制中心微生物室

目的研究沙门菌毒力岛1（SPI-1）缺失山夫登堡沙门菌的特性。方法于2006年从上海10例腹泻患者粪便中分离得到10株山夫登堡沙门菌，运用脉冲场凝胶电泳（PFGE）、PCR、毒力基因测序及细胞侵袭试验对其进行分子分型、侵袭基因及细胞侵袭... 详细信息

目的研究沙门菌毒力岛1（SPI-1）缺失山夫登堡沙门菌的特性。方法于2006年从上海10例腹泻患者粪便中分离得到10株山夫登堡沙门菌，运用脉冲场凝胶电泳（PFGE）、PCR、毒力基因测序及细胞侵袭试验对其进行分子分型、侵袭基因及细胞侵袭能力检测，并与2002年深圳分离株（C02013）进行比较。结果10株山夫登堡沙门菌分离株编号依次为S09007～S09012、S09014～S09017，分为3种PFGE条带型，与深圳株存在明显差异，为不同来源。PCR扩增结果显示，10株菌株SPI．1上的侵袭蛋白基因（invA）、效应蛋白基因（sipA）及基因段．fhlA—hilA、hilA—spaP、spaP—invH扩增阴性。测序结果显示，10株分离株均为SPI-1基因大部分缺失菌株，orgA至invH基因缺失，orga基因部分缺失。与2002年深圳菌株相比，sprB—orgC基因存在。2002年深圳菌株和2006年上海菌株在基因缺失位置均多出1段约1000bp的基因片段，为1个简单的插入序列。10株菌（S09007～S09012、S09014～S09017）对Hela细胞的侵袭率分别为（0．0053±0．0014）％、（0．0046±0．0006）％、（0．0047±0．0003）％、（0．0064±0．0012）％、（0．0065±0．0011）％、（0．0070±0．0020）％、（0．0115±0．0030）％、（0．0099±0．0039）％、（0．0180±0．0035）％和（0．0031±0．0012）％，低于invA阳性对照株STM1344的（5．0800±0．6333）％；低于或接近invA基因缺失人工突变株STMinvA-的（0．0193±0．0045）％。结论SPI-1基因不是山夫登堡沙门菌引起人体腹泻所必需的基因。

关键词：沙门菌属毒力细菌分型技术基因细菌