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基于临床指标和MRI征象构建的列线图对原发性肝癌中医证型的诊断效能

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临床肝胆病杂志 2024年第7期40卷 1411-1419页

作者：王莹张喜荣陕西中医药大学医学技术学院陕西咸阳712000

目的探究临床指标联合MRI征象的列线图模型对原发性肝癌中医证型的判断效能。方法回顾性收集2018年9月—2023年7月在陕西中医药大学附属医院住院的138例原发性肝癌患者临床资料,并分为实证组(n=84)和虚证组(n=54),所有患者均在治疗前行... 详细信息

目的探究临床指标联合MRI征象的列线图模型对原发性肝癌中医证型的判断效能。方法回顾性收集2018年9月—2023年7月在陕西中医药大学附属医院住院的138例原发性肝癌患者临床资料,并分为实证组(n=84)和虚证组(n=54),所有患者均在治疗前行钆塞酸二钠增强MRI扫描。计数资料组间比较采用χ^(2)检验或Fisher确切概率检验。计量资料两组间比较采用成组t检验。应用Logistic回归分析原发性肝癌中医证型的独立预测因子,并构建列线图模型,将所有患者按8∶2随机分为训练组(n=110)和验证组(n=28)。通过校准曲线、受试者工作特征曲线(ROC曲线)和决策曲线评估模型的临床效能。结果实证组与虚证组比较,中性粒细胞、淋巴细胞、血小板、白蛋白、中性粒细胞/淋巴细胞比值、凝血酶原时间、甲胎蛋白、直接胆红素、间接胆红素、总胆红素、有无门静脉侵犯、肿瘤个数、肝胆期肿瘤信号和表观扩散系数差异均有统计学意义(P值均系数(OR=19.269,95%CI:3.163~117.387,P=0.001)是原发性肝癌中医证型分型的独立预测因子。训练组的ROC曲线下面积(AUC)、敏感度、特异度和准确度分别为0.962、84.1%、92.4%和89.1%,验证组的AUC、敏感度、特异度和准确度分别为0.848、63.6%、100.0%和85.7%。校准曲线显示列线图模型在训练组和验证组中的预测证型与实际证型之间有较好的一致性。决策曲线显示列线图在较大的阈值概率范围内有较好的净收益。结论基于临床指标联合MRI征象的列线图模型在判断原发性肝癌中医证型方面具有良好的临床效能和价值。

关键词：肝肿瘤辨证分型磁共振成像列线图

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影像学新技术在间质性肺疾病评价中的应用进展

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放射学实践 2024年第1期39卷 127-131页

作者：江叶海蒲豆豆任占丽于楠陕西中医药大学医学技术学院陕西712046 陕西中医药大学附属医院医学影像科陕西712000

影像学在间质性肺疾病(ILD)的诊断、评估中至关重要。近年来随着影像学新技术的不断发展,如CT、MRI、正电子发射型断层扫描(PET)为ILD诊断与评估提供了客观工具。本文将基于多模态定量影像技术在ILD的应用与探索进行综述。

关键词：间质性肺疾病体层摄影术 X线计算机磁共振成像正电子发射断层扫描

核盘菌热休克蛋白Hsp70基因的克隆及功能分析

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生物工程学报 2024年

作者：吕蕊花杨大群杜雨彤冯昭吕瑞华李依民张岗陕西中医药大学陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西中医药大学医学技术学院

为明确核盘菌热休克蛋白70 (heat shock protein 70， Hsp70)基因在菌核形成过程中的功能及其与病菌致病力的关系，本研究采用RT-PCR克隆核盘菌Hsp70基因并进行序列分析，采用qRT-PCR测定基因在病菌不同生长阶段、环磷酸腺苷(cyclic ade... 详细信息

为明确核盘菌热休克蛋白70 (heat shock protein 70， Hsp70)基因在菌核形成过程中的功能及其与病菌致病力的关系，本研究采用RT-PCR克隆核盘菌Hsp70基因并进行序列分析，采用qRT-PCR测定基因在病菌不同生长阶段、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate， cAMP)及低温和高温胁迫下的相对表达量；对Hsp70蛋白进行耐热性检测；通过农杆菌介导法构建Hsp70基因沉默转化菌株，离体油菜叶片接种法进行致病力检测，在含腐霉利和甲基托布津药物培养基进行耐药性检测。结果表明，核盘菌Hsp70基因全长1 890 bp，与叶杯菌属(Ciborinia)的Hsp70亲缘关系较高；Hsp70在菌核中表达量最高，为菌丝中的30倍以上，cAMP胁迫显著诱导Hsp70的表达，40 ℃下，Hsp70表达量呈先升后降再升高的趋势，4 ℃处理无显著影响；包涵Hsp70的重组菌株耐热性显著增加；核盘菌Hsp70沉默转化子不能形成菌核，其致病力和耐药性均下降。该研究揭示了Hsp70在核盘菌菌核形成及对抗不良环境中发挥重要作用，为下一步深入解析核盘菌Hsp70的生物学功能提供参考。

关键词：核盘菌热休克蛋白 Hsp70 表达分析基因沉默致病力

基于网络药理学及实验验证探究葛根素治疗溃疡性结肠炎的作用机制

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中国免疫学杂志 2024年第5期40卷 1055-1063页

作者：但文利赵鑫鲁星妤郭紫婵秦琪李娟唐康张慧媛施京红陈丽华陕西中医药大学医学技术学院咸阳712046 空军军医大学基础医学院西安710032

目的:探索葛根素(PUE)对溃疡性结肠炎(UC)的治疗效果及作用机制。方法:利用网络药理学和分子对接技术对PUE调控UC的靶点进行筛选和分析。C57BL/6小鼠自由饮用2.5%DSS水溶液7 d后,观测PUE对小鼠体质量变化及疾病活动指数(DAI)评分的影响... 详细信息

目的:探索葛根素(PUE)对溃疡性结肠炎(UC)的治疗效果及作用机制。方法:利用网络药理学和分子对接技术对PUE调控UC的靶点进行筛选和分析。C57BL/6小鼠自由饮用2.5%DSS水溶液7 d后,观测PUE对小鼠体质量变化及疾病活动指数(DAI)评分的影响。HE染色观察小鼠结肠组织病理变化;阿利新蓝染色观察小鼠结肠组织杯状细胞变化;qRT-PCR和ELISA检测小鼠结肠组织炎症细胞因子表达。CCK-8检测PUE对MODE-K细胞活力的影响;流式细胞术检测PUE对MODE-K细胞凋亡的影响。结果:筛选得到AKT1、TNF、STAT3、CASP3、HIF1A等38个PUE调节UC的靶点,主要涉及TNF、IL-17和PI3K-Akt等信号通路。体内实验结果显示,与DSS组相比,DSS+PUE组小鼠结肠缩短程度、体质量减轻程度和DAI评分降低,结肠组织炎症细胞浸润减少,结肠组织TNF-α、IL-1βmRNA和蛋白表达降低。体外实验证实PUE减轻DSS诱导的上皮细胞凋亡。结论:PUE可减轻DSS诱导的小鼠UC发生发展。

关键词：葛根素溃疡性结肠炎网络药理学上皮细胞凋亡

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cAMP抑制核盘菌菌核形成的差异基因表达分析

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2024年第7期52卷 143-154页

作者：吕蕊花冯昭吕瑞华李依民高静彭亮张岗陕西中医药大学医学技术学院陕西咸阳712046 陕西中医药大学、陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西咸阳712046

【目的】探究核盘菌响应环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)处理的转录组学特征,挖掘调控核盘菌菌核形成的关键基因,为靶向杀菌剂的研发提供参考。【方法】以接种在PDA培养基上生长至菌核原基形成时期的核盘菌作为CK1,开... 详细信息

【目的】探究核盘菌响应环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)处理的转录组学特征,挖掘调控核盘菌菌核形成的关键基因,为靶向杀菌剂的研发提供参考。【方法】以接种在PDA培养基上生长至菌核原基形成时期的核盘菌作为CK1,开始形成黑色素时期的核盘菌作为CK2,以接种在PDA+5 mmol/L cAMP培养基上生长相同时间(5,7 d)的核盘菌作为试验组,依次命名为M1和M2,对这4组样品进行转录组测序(RNA-seq)比较,阐释cAMP影响菌核形成的调控途径,挖掘菌核原基及菌核黑色素形成中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。【结果】外源添加的cAMP主要在M1前期影响胞内的cAMP含量。差异表达基因分析结果显示,M1和CK1之间共有681个差异表达基因;KEGG富集分析显示,这些基因主要参与各类氨基酸代谢、脂肪酸代谢、MAPK信号通路等,且通路中的大部分基因都呈上调表达模式,而MAPK及其下游作用因子钙调磷酸酶B亚基(calcineurin B subunit,CnB)和热休克蛋白70(heat shock 70 ku protein,HSP70)则明显下调。M2和CK2之间共筛选到4490个差异表达基因,主要参与各类氨基酸代谢、抗原加工提呈以及cAMP、MAPK等信号通路和自噬途径,通路中的大部分基因呈上调表达模式,且自噬相关因子ATG2、ATG20、ATG22、ATG23、ATG27和ATG29也大量上调表达,而与蛋白质和脂类合成相关的磷酸酶B(phosphatase B,PTPB)和酰基辅酶A氧化酶(acyl coenzyme A oxidase,ACO)的表达量则明显下调。在M1和M2时期,相关基因的qRT-PCR与RNA-seq差异表达分析结果趋势相同,说明转录组测序数据准确。【结论】核盘菌可通过吸收胞外高浓度的cAMP抑制菌核形成菌丝,其抑制作用主要通过影响相关蛋白质及脂类物质的合成而对菌丝形态及信号传递造成障碍。

关键词：核盘菌菌核形成环磷酸腺苷差异表达基因

基于矢状位T2WI瘤内瘤周影像组学列线图术前预测ⅠB期和ⅡA期宫颈癌的研究

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磁共振成像 2024年第8期15卷 46-51,64页

作者：徐青彭雪艳郭长义朱欣阳贺朝陕西中医药大学医学技术学院咸阳712046 陕西中医药大学第二附属医院影像中心咸阳712046 咸阳市中心医院咸阳712046

目的建立一个基于矢状位T2加权图像(T2 weighted imaging,T2WI)的瘤内结合不同瘤周区域影像组学特征和临床危险因素的列线图,评估其术前预测宫颈癌ⅠB期和ⅡA期的价值。材料与方法回顾性分析120例两家医院术前接受MRI检查和根治性子宫... 详细信息

目的建立一个基于矢状位T2加权图像(T2 weighted imaging,T2WI)的瘤内结合不同瘤周区域影像组学特征和临床危险因素的列线图,评估其术前预测宫颈癌ⅠB期和ⅡA期的价值。材料与方法回顾性分析120例两家医院术前接受MRI检查和根治性子宫切除术加盆腔淋巴清扫并经术后病理证实的ⅠB和ⅡA期宫颈癌患者的实验室检查资料和MRI图像,分为训练组和外部验证组,对矢状位T2WI图像瘤内感兴趣区(region of interest,ROI)和1~6 mm的瘤周环(ROI-1、ROI-2、ROI-3、ROI-4、ROI-5和ROI-6)分别提取影像组学特征,采用Pearson分析和最小绝对收缩和选择算子(the least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归进行特征选择。以最佳者绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线,构建0~6 mm瘤周影像组学模型,并筛选出最佳影像组学模型,基于以上最佳影像组学模型评分与临床独立危险因素构建联合模型,并绘制列线图,以校准曲线评估模型校准度,以决策曲线分析(decision curve analysis,DCA)评价模型的应用价值。结果由瘤内结合瘤周3 mm区域得到6个有效特征建立的影像组学模型预测效能最佳,在训练组和外部验证组,其曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.972和0.857。由肿瘤最大径、红细胞计数(red blood cell,RBC)的临床独立危险因素建立的临床模型预测效能次之,在训练组和外部验证组AUC分别为0.940和0.847。基于肿瘤最大径、RBC、瘤内结合瘤周3 mm的6个有效特征构建的列线图预测效能更稳定,在训练组和外部验证组AUC分别为0.952和0.939,经校准曲线和DCA分析,列线图的校准度较高,临床净收益较大。结论基于T2WI瘤内和瘤周3 mm组学特征构建的影像组学列线图可以较好地术前预测ⅠB期和ⅡA期宫颈癌,对指导患者个体化治疗有着重要临床意义。

关键词：宫颈癌子宫广泛性切除术影像组学磁共振成像列线图术前分期

决明Aux/IAA和ARF基因家族鉴定、表达及蛋白互作分析

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药学学报 2024年第3期59卷 751-763页

作者：冯昭刘世鹏吕蕊花吕瑞华胡晓晨张明英毛仁俊张岗陕西中医药大学医学技术学院陕西咸阳712046 陕西中医药大学药学院陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西咸阳712046 延安大学生命科学学院陕西延安716000

植物生长素早期响应基因家族(auxin/indole-3-acetic acid,Aux/IAA)及其与生长素响应转录因子(auxin response factor,ARF)的互作是调控植物生长发育的重要方式。本文基于药用植物决明(Senna tora L.)全基因组数据鉴定到28个StoIAA和24... 详细信息

植物生长素早期响应基因家族(auxin/indole-3-acetic acid,Aux/IAA)及其与生长素响应转录因子(auxin response factor,ARF)的互作是调控植物生长发育的重要方式。本文基于药用植物决明(Senna tora L.)全基因组数据鉴定到28个StoIAA和24个StoARF成员,分别归为10个和8个亚家族。系统发育树和共线性分析发现,决明与大豆(Glycine max)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)的IAA、ARF同源基因均存在密切的进化关系,且基因片段重复事件主导了StoIAA和StoARF的扩张。基因结构分析显示,绝大多数StoIAAs和StoARFs含有特征保守结构域。转录组数据分析显示,StoIAAs和StoARFs在叶、根和种子中均有表达,部分成员具有组织表达特异性。StoIAA和StoARF启动子区域多含有与胁迫响应、生长发育、激素诱导、次生代谢等相关的作用元件。基因表达分析显示许多StoIAAs和StoARFs能够迅速响应干旱和盐胁迫,且在两种胁迫条件下表现出相似的表达模式。酵母双杂交实验证实StoARF8和StoARF10分别与多个StoIAA蛋白之间同时存在不同程度的互作。以上研究结果为进一步开展决明Aux/IAA和ARF基因家族的生物学功能分析提供基础。

关键词：决明 Aux/IAA 生长素响应转录因子激素蛋白互作

延胡索去甲乌药碱合成酶基因CyNCS1克隆及其表达模式分析

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2024年第3期52卷 146-154页

作者：冯飞雪吕瑞华李依民高静王凯周嘉迪颜永刚张岗陕西中医药大学附属医院陕西咸阳712046 陕西中医药大学医学技术学院陕西咸阳712046 陕西中医药大学药学院/陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西咸阳712046

【目的】克隆延胡索去甲乌药碱合成酶(norcoclaurine synthase, NCS)基因,分析其在延胡索异喹啉类生物碱合成中的关键作用。【方法】基于转录组数据库,利用逆转录PCR克隆延胡索CyNCS1基因及其启动子区域序列,采用生物信息学方法分析其... 详细信息

【目的】克隆延胡索去甲乌药碱合成酶(norcoclaurine synthase, NCS)基因,分析其在延胡索异喹啉类生物碱合成中的关键作用。【方法】基于转录组数据库,利用逆转录PCR克隆延胡索CyNCS1基因及其启动子区域序列,采用生物信息学方法分析其编码蛋白的理化性质、结构特征及其启动子区域顺式作用元件,同时进行多序列比对和系统进化树分析,确定其进化关系;利用实时荧光定量PCR对其根、茎、叶及发育早、中、晚期块茎的组织表达模式进行分析;对茉莉酸甲酯(MeJA)、脱落酸(ABA)处理0,4,8,12 h的叶片进行表达谱分析,以体积分数75%酒精溶剂处理为对照(CK),确定该基因的表达特征。【结果】CyNCS1基因开放读码框长873 bp,编码291个氨基酸,编码蛋白分子量为33.09 ku,等电点为6.90,具有去甲乌药碱合成酶保守的催化结构域(GDGGVGTV/IL、YKEKF和MIEGGHLDMG),且不含信号肽,预测定位于细胞核中。多序列比对结果显示,CyNCS1与石生黄堇、罂粟的NCS蛋白同源性较高,分别为83.6%和82.1%;系统进化树结果显示,CyNCS1与石生黄堇CsNCS蛋白聚为一支,说明二者亲缘关系较近。该基因启动子区长2 238 bp,包含多种植物激素及低温、热胁迫等环境因子的顺式作用元件。实时荧光定量PCR结果显示,随着发育推进块茎中CyNCS1的表达量显著增高,且受到MeJA和ABA的诱导,MeJA处理8 h时表达量为0 h的3.10倍,ABA处理8 h为0 h的3.16倍;而对照CyNCS1表达量随时间推移无明显变化。【结论】克隆并鉴定了延胡索NCS酶基因CyNCS1,明确了其在发育进程中的表达模式,并确定该基因表达受MeJA和ABA的诱导。

关键词：延胡索去甲乌药碱合成酶异喹啉生物碱启动子顺式作用元件

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碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌感染和死亡的相关因素分析

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中华预防医学杂志 2024年第4期58卷 545-551页

作者：王晓辜依海张微蒋琰邓明惠侯轩周梦蓉王辉李晓波陕西中医药大学医学技术学院咸阳712046 三二〇一医院微生物免疫科汉中723000 浙江大学医学院附属邵逸夫医院感染科杭州310016

分析患者碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)感染和死亡的相关因素。采用病例对照研究方法,以三二〇一医院2019年1月至2021年12月CRKP感染患者作为病例组,按1∶1的比例选取同一时间段内碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌(CSKP)感染患者作为对... 详细信息

分析患者碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)感染和死亡的相关因素。采用病例对照研究方法,以三二〇一医院2019年1月至2021年12月CRKP感染患者作为病例组,按1∶1的比例选取同一时间段内碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌(CSKP)感染患者作为对照组。对研究对象随访30 d,根据是否死亡分别将2组患者分为存活组和死亡组,比较CRKP病例组和CSKP对照组的30 d病死率。采用logistic回归模型分析感染CRKP以及CRKP感染后死亡的相关因素。本研究共纳入CRKP病例组和CSKP对照组各59例。CRKP感染和CSKP感染患者30 d病死率分别为30.5%(18/59)和5.1%(3/59),差异具有统计学意义( χ^(2)=13.034, P3种( OR=7.993, P=0.016),以及感染KP前患者白蛋白<30 g/L( OR=10.463, P=0.002),性别( OR=0.078, P<0.001)及糖尿病( OR=0.076, P=0.011)为CRKP感染的相关因素。患者年龄校正Charlson合并症指数评分较高( OR=1.522, P=0.024)和感染KP前3个月内患者使用碳青霉烯类药物( OR=4.902, P=0.029)为CRKP感染患者死亡的相关因素。综上,医务人员应谨慎实施侵入性手术,严格把控抗生素的使用,尽早对高危患者予以针对性防护和治疗。

关键词：肺炎克雷伯菌危险因素碳青霉烯病例对照研究