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基于干性指数模型对肉瘤预后、免疫浸润和铁死亡调控的分析

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中国组织工程研究 2025年第19期29卷 4151-4160页

作者：魏婧娴孟莲孙皓张田田刘春霞石河子大学医学院病理学系/石河子大学第一附属医院病理科新疆维吾尔自治区石河子市832000 广州医科大学附属第二医院病理科广东省广州市510260

背景:干性指数可能与肉瘤预后、免疫浸润有关,但具体调控机制与特征基因尚不清楚。目的:利用基因干性指数模型探究肉瘤干细胞与患者预后和免疫浸润的关系,并识别肉瘤干细胞铁死亡特征基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)中获取肉瘤RNA测... 详细信息

背景:干性指数可能与肉瘤预后、免疫浸润有关,但具体调控机制与特征基因尚不清楚。目的:利用基因干性指数模型探究肉瘤干细胞与患者预后和免疫浸润的关系,并识别肉瘤干细胞铁死亡特征基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)中获取肉瘤RNA测序数据及相关临床信息。利用肉瘤干性指数,对获取的肉瘤RNA测序数据进行分组。利用生存数据进行组间预后情况分析,获取组间差异表达基因后进行通路富集和免疫浸润分析。获得铁死亡相关差异基因,构建蛋白互作网络并进行预后相关性分析。培养横纹肌肉瘤细胞系,分为贴壁细胞组和干细胞组,贴壁细胞组不予任何干预,干细胞组通过无血清培养处理以诱导横纹肌肉瘤干细胞富集,qRT-PCR验证干细胞相关标志物、铁死亡相关差异基因以及铁死亡相关标志物的mRNA表达。结果与结论:①以干性指数中位数为界将患者分成高干性指数组和低干性指数组,通过患病风险预测显示高干性指数组患者的无进展生存期低于低干性指数组,提示预后不佳;②GO、KEGG分析显示肉瘤高、低干性指数组差异表达基因参与不同的细胞通路;高干性指数组和低干性指数组之间免疫浸润存在差异;差异基因中有23个铁死亡相关基因,其中9个可构成相关性较强的蛋白互作网络,其中IDO1、IFNG、AQP5高表达的肉瘤患者预后更好,CA9高表达的肉瘤患者预后不佳;③qRT-PCR结果显示,与贴壁细胞组相比,干细胞组干细胞相关标志物NANOG、SOX2和OCT4 mRNA表达显著升高(P<0.05);与贴壁细胞组相比,干细胞组铁死亡相关标志物SLC7A11的mRNA表达显著降低(P<0.05),ACSL4、GPX4、FTH1和COX2的mRNA表达显著升高(P<0.05);与贴壁细胞组相比,干细胞组差异基因CA9的mRNA表达显著降低,IDO1、IFNG、AQP5的mRNA表达显著升高(P<0.05)。经上述生物信息学分析与实验验证,干细胞与肉瘤生存、铁死亡过程密切相关,CA9、IDO1、IFNG、AQP5在肉瘤干细胞中异常表达,可能成为肉瘤诊断标志物和治疗新靶点。

关键词：肉瘤干细胞干性指数铁死亡生存预后免疫浸润

新型超声快速处理活检标本保存不同年限对DNA质量的影响

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中国组织工程研究 2025年第13期29卷 2655-2660页

作者：石晨曦朱卫东李三恩李秀明师逢丁亚云苏州大学附属第一医院病理科江苏省苏州市215000 苏州市立医院本部皮肤科江苏省苏州市215000

背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探... 详细信息

背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探索最佳的标本存储时间。方法:收集40例乳腺穿刺小活检组织,采用超声技术制作石蜡标本,按照存储年限分为4组:3-5年组及>5年组,每组10例,对石蜡标本进行切片,每张切片厚3μm,切片10-15张,提取DNA后通过Nanophotometer N60超微量分光光度计和Qubit 4.0荧光计检测DNA的质量浓度,记录A_(260)/A_(280)比值判定DNA的纯度,利用全自动毛细管电泳核酸分析仪(Qsep 100)检测DNA片段完整性,以评估DNA片段的质量。结果与结论:4组样本A_(260)/A_(280)均值在1.8-2.0之间,达到纯度要求,无明显差异。4组样本的DNA质量浓度(Qubit浓度)均值分别为30.39,14.33,2.52,1.95 ng/μL;DNA的平均N/Q比值分别为6.48,14.18,24.56,29.86;DNA质量数均值分别为5.64,1.76,1.24,0.80;大片段占比均值分别为56.08%,17.72%,12.68%,7.90%。PCR检测内控基因Ct均值分别为15.32,17.09,18.39,21.24。与<1年组相比,其余3组DNA浓度显著降低,N/Q比值显著增加,DNA质量数和大片段占比均值显著降低,Ct值升高,差异有显著性意义(P<0.05)。实验结果表明,对于新型超声处理活检标本,应优先选择存储<1年的样本进行日常分子检测,储存3年内的样本可满足二代测序等检测要求,5年内样本仅可尝试进行PCR等检测,存储超过5年的样本不建议进行后续分子检测。

关键词：超声处理存储年限 DNA质量片段完整性降解程度二代测序

高温需求因子A1在甲状腺髓样癌组织中的表达及其临床意义

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现代肿瘤医学 2025年第1期 38-44页

作者：眭怡群夏维苏州大学附属第二医院病理科

目的:评估高温需求因子A1(high-temperature requirement factor A1,HTRA1)在甲状腺髓样癌(medullarythyroid carcinoma, MTC)组织中的表达，并探讨其与临床病理特征、预后及肿瘤免疫的关系。方法:采用免疫组化法检测26例MTC组织中HTRA... 详细信息

目的:评估高温需求因子A1(high-temperature requirement factor A1,HTRA1)在甲状腺髓样癌(medullarythyroid carcinoma, MTC)组织中的表达，并探讨其与临床病理特征、预后及肿瘤免疫的关系。方法:采用免疫组化法检测26例MTC组织中HTRA1蛋白的表达。分析HTRA1蛋白表达与临床病理特征及预后的相关性。通过生物信息学揭示HTRA1表达与肿瘤免疫的相关性。结果:HTRA1蛋白在MTC组织中主要定位于细胞浆，而在正常甲状腺组织中主要定位于细胞核。与正常甲状腺组织相比，MTC组织中HTRA1蛋白表达上调。临床病理分析显示，HTRA1蛋白表达与甲状腺被膜外侵犯、桥本氏甲状腺炎及患者的无复发生存期有关。HTRA1蛋白、术前血清降钙素及癌胚抗原的联合检测对甲状腺被膜外侵犯、肿瘤大小、肿瘤T分期及患者无复发生存期的预测价值较高。免疫浸润分析显示，HTRA1表达主要与免疫抑制细胞有关。肿瘤免疫功能障碍和排斥(tumor immune dysfunction and exclusion, TIDE)算法揭示，MTC中HTRA1表达与TIDE评分、免疫功能障碍评分、免疫排斥评分和癌相关成纤维细胞水平呈正相关；与微卫星不稳定性呈负相关。基因集富集分析结果显示，MTC中HTRA1表达主要与细胞外基质及其相关信号通路有关。结论:HTRA1可能成为MTC新的治疗靶点。HTRA1与肿瘤免疫功能的关联可能有助于MTC的免疫治疗。

关键词： HTRA1 甲状腺髓样癌肿瘤免疫细胞外基质

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喉神经内分泌肿瘤临床病理及影像分析

临床放射学杂志 2025年第1期44卷 64-68页

作者：李小芹刘善凤赵慧胡娜李进叶孙立新王林省杨珞战海宇山东省第二人民医院影像科济南250022 山东省第二人民医院病理科济南250022 山东第一医科大学第一附属医院(山东省千佛山医院)影像科济南250014

目的探讨喉神经内分泌肿瘤的临床病理及影像表现。方法回顾性分析经病理证实的13例喉神经内分泌肿瘤患者的临床病理及影像学资料。结果男11例,女2例,年龄48~74岁。G1神经内分泌瘤2例,G2神经内分泌瘤5例,小细胞神经内分泌癌4例,混合神经... 详细信息

目的探讨喉神经内分泌肿瘤的临床病理及影像表现。方法回顾性分析经病理证实的13例喉神经内分泌肿瘤患者的临床病理及影像学资料。结果男11例,女2例,年龄48~74岁。G1神经内分泌瘤2例,G2神经内分泌瘤5例,小细胞神经内分泌癌4例,混合神经内分泌和非神经内分泌肿瘤(神经内分泌癌+鳞癌)2例。声门上型10例,声门型1例,跨区(侵及声门区及声门上区)2例。CT示7例病灶呈结节型,6例病灶呈浸润型。13例病灶CT增强扫描呈轻中度渐进性不均匀强化。结论喉神经内分泌肿瘤好发于长期吸烟的老年男性,镜下多为黏膜下结节样、浸润性肿块,影像表现肿瘤常发生于声门上区,病灶形态主要分结节型和浸润型两种,增强扫描呈轻中度渐进性不均匀强化,但确诊仍依靠术后病理及免疫组织化学指标。

关键词：喉神经内分泌肿瘤病理体层摄影术 X线计算机

基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型

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中国胸心血管外科临床杂志 2025年第1期 67-72页

作者：黄润棋强光亮刘益飞史加海南通大学附属医院临床研究中心南通大学医学院北京大学第三医院胸外科南通大学附属医院病理科南通大学附属医院胸心外科

目的探讨基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型的准确性。方法回顾性分析2021年1月—2023年1月在南通大学附属医院接受肺部肿瘤切除手术患者的石蜡包埋（formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE）标本... 详细信息

目的探讨基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型的准确性。方法回顾性分析2021年1月—2023年1月在南通大学附属医院接受肺部肿瘤切除手术患者的石蜡包埋（formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE）标本。根据肿瘤的病理学分类，将患者分为3组：良性肿瘤/原位腺癌（benign tumor/adenocarcinoma in situ,BT/AIS）组、微浸润腺癌（minimally invasive adenocarcinoma,MIA）组和浸润性腺癌（invasive adenocarcinoma,IA）组。使用LungMe试剂盒通过甲基化特异性PCR(MS-PCR)测量FFPE标本的SHOX2和RASSF1A甲基化水平。以SHOX2和RASSF1A的甲基化水平为预测变量，采用机器学习算法（包括逻辑回归、XGBoost、随机森林、朴素贝叶斯）预测不同的肺腺癌病理类型，并构建网络服务器供临床使用。结果共纳入272例患者，BT/AIS组、MIA组和IA组患者的平均年龄分别为57.97岁、61.31岁和63.84岁；女性患者占比分别为55.38%、61.11%和61.36%。基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平建立的早期肺腺癌预测模型中，随机森林与XGBoost模型在预测各病理类型时表现良好。随机森林模型的C统计量在BT/AIS组、MIA组和IA组分别为0.71、0.72和0.78。XGBoost模型的C统计量在BT/AIS组、MIA组和IA组分别为0.70、0.75和0.77。朴素贝叶斯模型仅在IA组表现较为稳健，C统计量为0.73，具有一定的预测能力。逻辑回归模型在各组中的表现最差，对各组均无预测能力。通过决策曲线分析，随机森林模型在BT/AIS和MIA病理类型的预测中展示了较高的净收益，表明其在临床应用中具有潜在价值。结论基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型具有较高的准确性。

关键词：肺腺癌 SHOX2 RASSF1A 甲基化侵袭性

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基于生物信息分析及实验验证探讨赤芍-附子治疗慢加急性肝衰竭的作用机制

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中国实验方剂学杂志 2025年第1期 156-165页

作者：田晓玲张彧杜珊伍梦思谭年花陈斌湖南中医药大学第一附属医院

目的：通过网络药理学、分子对接及动物实验探究赤芍-附子治疗慢加急性肝衰竭（ACLF）的作用机制。方法：通过网络药理学获得赤芍-附子治疗ACLF的可能靶点和相关信号通路，并通过分子对接技术检验核心成分与对应关键靶点的结合活性。采... 详细信息

目的：通过网络药理学、分子对接及动物实验探究赤芍-附子治疗慢加急性肝衰竭（ACLF）的作用机制。方法：通过网络药理学获得赤芍-附子治疗ACLF的可能靶点和相关信号通路，并通过分子对接技术检验核心成分与对应关键靶点的结合活性。采用牛血清白蛋白皮下及尾静脉注射联合脂多糖（LPS）+D-氨基半乳糖（D-GalN）腹腔注射构建ACLF大鼠模型，实验设置正常组（NC）、模型组、赤芍-附子组（5.85 g·kg-1）、促肝细胞生长颗粒组（HGFG,4.05 g·kg-1）。苏木素-伊红（HE）及马松（Masson）染色观察大鼠肝组织病理变化。酶联免疫吸附测定法（ELISA）检测白细胞介素-6(IL-6)、B细胞淋巴瘤-2(Bcl-2)、胱天蛋白酶-3(Caspase-3)、白蛋白（ALB）表达水平。实时荧光定量聚合酶链式反应（Real-time PCR）、蛋白免疫印迹法（Western blot）检测磷脂酰基醇3-激酶（PI3K）、蛋白激酶B(Akt)、磷酸化（p）-PI3K、p-Akt mRNA及蛋白表达水平。结果：网络药理学筛选得到赤芍-附子活性成分49种，作用靶点103个，ACLF疾病靶点3 317个，其中74个与赤芍-附子药物靶点重合。蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络关键节点为Akt1、肿瘤坏死因子（TNF）、IL-6、Bcl-2、Caspase-3等；基因本体（GO）功能分析与京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析筛选出多种信号通路，其中PI3K/Akt信号通路出现频率最高。分子对接显示，药物核心成分与对应关键靶点均具有较好的结合活性。动物实验证实，赤芍-附子可显著改善ACLF大鼠肝组织病理损伤，减少炎症因子的释放、肝细胞凋亡，并上调PI3K/Akt信号通路表达水平。结论：通过网络药理学-分子对接和体内实验，该研究证实了赤芍-附子减轻肝细胞炎性损伤、抑制肝细胞凋亡的作用效应，并初步探索了其具体机制，可能与参与调节PI3k/Ak信号通路有关。

关键词：慢加急性肝衰竭赤芍附子磷脂酰基醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt) 网络药理学

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感染性心内膜炎患者病原菌分布特点及超声心动图的诊断价值分析

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中国病原生物学杂志 2025年第2期 234-238+243页

作者：刘慧兰王佳南福建医科大学附属泉州第一医院

目的探讨感染性心内膜炎患者病原菌的种类及其分布规律以及超声心动图在诊断该病过程中的应用价值。方法采用回顾性分析方法，对2021-2023年本院确诊的126例感染性心内膜炎患者的临床资料进行整理，分析病原菌种类及耐药率，同时对比... 详细信息

目的探讨感染性心内膜炎患者病原菌的种类及其分布规律以及超声心动图在诊断该病过程中的应用价值。方法采用回顾性分析方法，对2021-2023年本院确诊的126例感染性心内膜炎患者的临床资料进行整理，分析病原菌种类及耐药率，同时对比超声心动图检查结果与手术或病理诊断的符合率，以评估其诊断效能。结果在126例感染性心内膜炎患者中，共分离出126株病原菌，包括80株革兰阳性菌、36株革兰阴性菌和10株真菌。革兰阳性菌以草绿色链球菌和金黄色葡萄球菌为主，革兰阴性菌以大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌为主，真菌主要是白色假丝酵母菌。88.89%患者为自体瓣膜心内膜炎，其余为人工瓣膜心内膜炎。两组患者在病原菌构成上无显著差异。草绿色链球菌对红霉素、克林霉素、阿奇霉素耐药率较高，但对青霉素敏感，未对万古霉素、利奈唑胺产生耐药。金黄色葡萄球菌对青霉素、红霉素、克林霉素、阿奇霉素耐药率较高，同样未对万古霉素、利奈唑胺耐药。两种菌对青霉素、庆大霉素耐药率差异有统计学意义(P<0.05)。在126例感染性心内膜炎患者中，51例患有先天性心脏病，占40.48%。其中室间隔缺损占26.19%,动脉导管未闭占8.73%,肺动脉瓣狭窄占5.56%。风湿性心脏病患者38例，占30.16%,其中二尖瓣病变占20.63%,主动脉瓣病变占9.52%。非风湿性心脏病患者18例，占14.29%,其中二尖瓣反流占10.32%,主动脉瓣反流占3.97%。无基础心脏病变的患者有5例，占3.97%。换瓣术后患者14例，占11.11%。所有患者超声心动图均发现赘生物，其中76例赘生物≤10 mm,占60.32%;37例赘生物11～15 mm,占29.37%;11例赘生物16～20 mm,占8.73%;2例赘生物≥21 mm,占1.59%。赘生物主要分布在二尖瓣(34.13%)、三尖瓣(10.32%)、主动脉(38.10%)和肺动脉瓣(17.46%)。先天性心脏病患者中肺动脉瓣赘生物占多数，风湿性心脏病患者中主动脉瓣赘生物占多数，非风湿性心脏病患者和换瓣术后患者中主动脉赘生物占多数，无基础心脏病变患者中二尖瓣赘生物占多数。超声心动图和手术均显示，126例患者中有赘生物，确诊率100%。95例患者检出并发症，手术中确认75例，确诊率为78.95%。结论感染性心内膜炎的病原菌分布广泛，在临床治疗中，合理选择抗生素，并根据药敏结果调整治疗方案至关重要。超声心动图在此病的诊断中起到了至关重要的作用，不仅能够准确发现赘生物，还能辅助判断病情的严重程度和并发症的存在。因此，加强病原菌耐药性监测，结合超声心动图等检查手段，将有助于提高感染性心内膜炎的综合治疗效果。

关键词：感染性心内膜炎病原菌超声心动图

基于光谱CT碘密度图像的细胞外体积分数对胃癌淋巴结转移的评估

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临床放射学杂志 2025年第1期44卷 112-118页

作者：左孟哲李勇刚陈雪莲左思敏张臻王建良江苏大学附属昆山医院昆山215300 苏州大学附属第一医院 215000 墨尔本大学

目的探讨基于双层探测器光谱CT平衡期碘密度图像的细胞外体积分数(fECV)对于胃腺癌淋巴结转移(LNM)的术前评估价值。方法回顾性分析156例胃腺癌患者的临床病理学和术前光谱CT影像资料,术后病理证实LNM阳性103例,LNM阴性53例;随机分为训... 详细信息

目的探讨基于双层探测器光谱CT平衡期碘密度图像的细胞外体积分数(fECV)对于胃腺癌淋巴结转移(LNM)的术前评估价值。方法回顾性分析156例胃腺癌患者的临床病理学和术前光谱CT影像资料,术后病理证实LNM阳性103例,LNM阴性53例;随机分为训练组106例和验证组50例。测定入组病例癌灶的光谱CT常规定量指标、基于光谱CT碘密度图和混合能量图的fECV值(ECV ID和ECV ct),同时对CT图像上淋巴结状态(Nct)进行评估。分析癌灶的术前临床病理学和影像学指标在胃癌LNM阳性和阴性组间的差异,采用多因素回归分析得出LNM的独立预测指标,并构建联合预测模型;评价并验证各指标和联合模型对胃癌LNM的预测价值。结果纳入分析的术前临床病理学和影像学指标中,ECV ID和Nct是胃癌LNM的独立预测指标(OR值分别为0.122和1.202,P<0.001);CT影像学定量指标中,ECV ID对胃癌LNM的诊断效能最高[曲线下面积(AUC)值0.833];ECV ID和Nct联合预测模型对训练组和验证组的诊断效能(AUC值分别为0.888和0.840)和净效益高于上述各指标的单独应用;且联合应用ECV ID对训练组和验证组LNM评估的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和准确率较单独应用Nct均显著提高。结论基于光谱CT平衡期碘密度图的fECV有助于术前无创性评估胃腺癌LNM,改善了传统CT淋巴结状态评估的准确率。

关键词：胃腺癌光谱CT 碘密度图像细胞外体积分数淋巴结转移

乳腺癌组织内环氧化酶-2、人表皮生长因子受体2表达情况及其临床意义

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大医生 2025年第1期10卷 19-21页

作者：王军马洁王文超仪征市人民医院病理科江苏扬州211400

目的探讨乳腺癌组织内环氧化酶-2(COX-2)、人表皮生长因子受体2(c-erbB-2)的表达情况及临床意义,为临床提供参考。方法选取2022年3月至2024年3月仪征市人民医院收治的50例乳腺癌患者为观察组,另选取同期于仪征市人民医院进行体检的40... 详细信息

目的探讨乳腺癌组织内环氧化酶-2(COX-2)、人表皮生长因子受体2(c-erbB-2)的表达情况及临床意义,为临床提供参考。方法选取2022年3月至2024年3月仪征市人民医院收治的50例乳腺癌患者为观察组,另选取同期于仪征市人民医院进行体检的40例健康体检者为对照组,进行回顾性分析。比较观察组乳腺癌组织及对照组正常乳腺组织中COX-2、c-erbB-2的表达情况;比较观察组不同病理特征患者COX-2、c-erbB-2的表达情况。结果观察组研究对象COX-2、c-erbB-2阳性率均高于对照组(均P一定联系,临床应给予监测。

关键词：乳腺癌环氧化酶人表皮生长因子受体2 病理特征