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15个物种Toll样受体5基因密码子使用偏好性分析

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中国畜牧兽医 2024年第1期51卷 11-22页

作者：戴开宇杨治风郭烨星张家港市畜牧兽医站张家港215600

【目的】探究Toll样受体5(TLR5)基因的密码子使用模式,并分析TLR5基因密码子使用偏好性的影响因素。【方法】综合运用CodonW、BioEdit和R等软件对筛选的15个不同物种TLR5基因完整编码区(CDS)序列核苷酸组成和密码子使用模式进行计算和统... 详细信息

【目的】探究Toll样受体5(TLR5)基因的密码子使用模式,并分析TLR5基因密码子使用偏好性的影响因素。【方法】综合运用CodonW、BioEdit和R等软件对筛选的15个不同物种TLR5基因完整编码区(CDS)序列核苷酸组成和密码子使用模式进行计算和统计,再基于同义密码子相对使用度(RSCU)和CDS分别进行聚类分析,推测TLR5基因发挥相似生物学功能的物种,并通过ENC-plot、Neutrality-plot和PR2-plot 3种绘图分析造成密码子偏好性现象的可能因素。【结果】9个物种TLR5基因CDS密码子第3位碱基GC含量(GC3)>0.5,14个物种有效密码子数(ENC)值>35,15个物种密码子AU偏斜度(AU skew)和GC偏斜度(GC skew)值<0;不同物种TLR5基因CDS有31个高频密码子,其中21个以G或C结尾,此外GCC、AGA、AGG和CUG表现为较高的RSCU值,为优势密码子;RSCU层次聚类和系统发育聚类结果不完全相同,但两种聚类方法均提示猪、牛和羊TLR5基因的密码子使用特点相似,鸡和绿头鸭相似,虹鳟和鲫鱼相似;ENC-plot分析发现各物种TLR5基因均分布在标准曲线下方较远位置,Neutrality-plot显示密码子第1、2位GC含量的平均值(GC12)和GC3含量呈极显著正相关(P<0.01),PR2-plot则显示密码子第3位碱基使用频率不一致。【结论】不同物种TLR5基因密码子使用模式存在偏好性现象,该现象是物种进化过程中受碱基突变和翻译选择双重影响的结果,其中碱基突变是主要影响因素。研究结果可为后续TLR5基因的生物学功能挖掘提供新的角度和理论认识。

关键词： TLR5基因密码子使用偏好性碱基突变翻译选择

基于线粒体全基因组的柴达木牛母系遗传多样性、群体结构及系统发育分析

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西北农林科技大学学报(自然科学版) 2024年 1-12页

作者：魏旭东刘瑞林李瑞哲张卫忠王启辉赵海明郭卫兴许正全尕藏当周韩赟雷初朝马志杰青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海省格尔木市畜牧兽医站青海省格尔木市郭勒木德乡畜牧兽医站青海省格尔木市乌图美仁乡畜牧兽医站青海省都兰县宗加镇畜牧兽医站青海省乌兰县畜牧兽医站西北农林科技大学动物科技学院

【目的】从全线粒体基因组水平探究柴达木牛的母系遗传多样性、群体结构及与其他黄牛品种间的遗传关系。【方法】采用全基因组重测序技术对60头柴达木牛进行重测序,获取每个个体的线粒体全基因组全序列,并从Gen Bank下载已公布的我国5... 详细信息

【目的】从全线粒体基因组水平探究柴达木牛的母系遗传多样性、群体结构及与其他黄牛品种间的遗传关系。【方法】采用全基因组重测序技术对60头柴达木牛进行重测序,获取每个个体的线粒体全基因组全序列,并从Gen Bank下载已公布的我国5个北方黄牛品种(即蒙古牛、西藏牛、哈萨克牛、延边牛和安西牛)和2个国外培育品种(荷斯坦牛和日本和牛)的共129条线粒体全基因组相应序列进行综合分析,以揭示柴达木牛线粒体基因组遗传变异,明确其母系遗传多样性水平、群体遗传结构组成、母系遗传背景及与我国北方部分地方黄牛品种、国外培育品种间的遗传关系。【结果】(1)60头柴达木牛线粒体全基因组序列比对分析共发现346个多态位点,其中单一多态位点51个,简约信息位点295个;根据序列间核苷酸变异共确定37种单倍型(H1～H37)。遗传多样性分析显示,柴达木牛线粒体基因组单倍型多样度为(0.981 0±0.006 0),核苷酸多样度为(0.003 3±0.000 2),提示其拥有丰富的母系遗传多样性。(2)系统发育分析表明,柴达木牛拥有普通牛和瘤牛2大母系支系,且以普通牛T支系为主,拥有T1、T2、T3、T4、I1和I2共6种亚单倍型组,提示柴达木牛拥有普通牛和瘤牛血统,有两个母系起源。(3)群体遗传分化分析表明,柴达木牛与蒙古牛、西藏牛、哈萨克牛、延边牛、日本和牛遗传分化程度均很弱,而与安西牛、荷斯坦牛达到中等遗传分化程度。(4)聚类分析显示,柴达木牛与蒙古牛聚类关系最近,与西藏牛、哈萨克牛、安西牛、延边牛聚类关系相对较近,与日本和牛、荷斯坦牛聚类关系较远,其聚类结果与分化程度基本一致。【结论】柴达木牛拥有丰富的母系遗传多样性,由普通牛和瘤牛两个母系支系组成,含有T1、T2、T3、T4、I1和I2共6种亚单倍型组,推测其有2个母系起源。柴达木牛与蒙古牛亲缘关系最近,与西藏牛、哈萨克牛、延边牛、安西牛遗传关系较近,而与日本和牛、荷斯坦牛遗传关系较远。

关键词：柴达木牛 mt DNA 母系起源群体结构

日粮中添加黄芪多糖对肉仔鸡生产性能、脏器指数、屠宰性能及肌肉品质的影响

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中国饲料 2024年第8期 25-28页

作者：刘平平于鹏杰王霞诸城市密州畜牧兽医站山东潍坊262200

为探索日粮中添加黄芪多糖对肉仔鸡生产性能、脏器指数、屠宰性能及肌肉品质的影响,试验将600羽1日龄的白羽肉鸡随机分成4组,分为对照组(基础日粮)、试验Ⅰ组(基础日粮+0.2%黄芪多糖)、试验Ⅱ组(基础日粮+0.4%黄芪多糖)和试验Ⅲ组(基础... 详细信息

为探索日粮中添加黄芪多糖对肉仔鸡生产性能、脏器指数、屠宰性能及肌肉品质的影响,试验将600羽1日龄的白羽肉鸡随机分成4组,分为对照组(基础日粮)、试验Ⅰ组(基础日粮+0.2%黄芪多糖)、试验Ⅱ组(基础日粮+0.4%黄芪多糖)和试验Ⅲ组(基础日粮+0.6%黄芪多糖),每组3个重复,每个重复50羽鸡,试验周期42?d。结果显示,与对照组相比,日粮添加0.2%、0.4%和0.6%黄芪多糖的肉仔鸡平均日增重、平均日采食量、肌胃指数、胸肌率、腿肌率、瘦肉率、肌肉pH值、肉色和粗蛋白质含量均显著提高(P <0.05);日粮中添加0.2%、0.4%和0.6%黄芪多糖的肉仔鸡料重比、皮脂厚、失水率和粗脂肪含量均显著降低(P <0.05);添加0.2%、0.4%和0.6%黄芪多糖的肉仔鸡死亡淘汰个体数明显减少。以上结果表明,黄芪多糖不仅能提高肉仔鸡的生产性能、屠宰性能及肌肉品质,而且还能促进肉仔鸡的肌胃发育,在本试验条件下,黄芪多糖的最佳使用量为0.4%。

关键词：黄芪多糖肉仔鸡生产性能脏器指数屠宰性能肌肉品质

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鲁中某县布病防控形势与策略分析

粮油与饲料科技 2024年第4期 157-159页

作者：邵伟利宁阳县伏山镇畜牧兽医站

布病是目前牛羊最高发的疫病，也是人感染病例最多的人畜共患传染病之一，对畜牧业健康发展和人民群众身体健康造成严重危害。随着社会发展，畜禽养殖业逐步向规模化、集约化转变，人畜共患病发生率不断上升，对人畜共患病防控的要求逐... 详细信息

布病是目前牛羊最高发的疫病，也是人感染病例最多的人畜共患传染病之一，对畜牧业健康发展和人民群众身体健康造成严重危害。随着社会发展，畜禽养殖业逐步向规模化、集约化转变，人畜共患病发生率不断上升，对人畜共患病防控的要求逐渐提高。基于此，以鲁中某县为例，对该县近六年来的人间布病报告病例流调情况进行分析，研究布病流行规律，明确防控的重点和方向，提出防控策略。

关键词：布病人畜共患病疫病防控

湖羊MSTRG.96141.1转录本表达特征分析及在卵巢颗粒细胞凋亡中调控机制

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南京农业大学学报 2024年

作者：姚晓磊王汉斌刘智琳张艳丽魏宗友南京农业大学动物科技学院太仓市畜牧兽医站

[目的]本文旨在探究长链非编码RNA（long no-coding RNA，lncRNA）MSTRG.96141.1转录本表达特征及参与湖羊卵巢颗粒细胞凋亡（granulosa cell，GC）的调控机制。[方法]挖掘课题组前期高低繁湖羊(高繁，High prolificacy FecBB，HPBB；... 详细信息

[目的]本文旨在探究长链非编码RNA（long no-coding RNA，lncRNA）MSTRG.96141.1转录本表达特征及参与湖羊卵巢颗粒细胞凋亡（granulosa cell，GC）的调控机制。[方法]挖掘课题组前期高低繁湖羊(高繁，High prolificacy FecBB，HPBB；低繁，Low Prolificacy FecBB，LPBB)健康优势卵泡（> 5 mm）全转录组测序数据，鉴定到差异miR-3957-3p，采用生物信息学、双荧光素酶报告等方法确定与miR-3957-3p存在靶向关系的lncRNA；在此基础上，以湖羊GC为模型，采用过表达/干扰、qRT-PCR、FSIH、细胞流式术等技术，分析其表达特征和对湖羊GC凋亡的影响。[结果]miR-3957-3p表达水平HPBB组显著低于LPBB组；lncRNA（MSTRG.96141.1）与miR-3957-3p存在靶向关系；该转录本在湖羊生殖器官中的卵巢上表达最高，HPBB组显著高于LPBB组；进一步在湖羊卵巢GC中检测到该转录本的阳性信号，且定位于GC细胞质；干扰MSTRG.96141.1上调BAX基因mRNA表达水平和BAX:Bcl-2比率，进而促进湖羊GC凋亡；过表达miR-3957-3p上调BAX基因mRNA表达水平和BAX:Bcl-2比率，下调Bcl-2基因mRNA表达水平，进而促进湖羊GC凋亡；干扰miR-3957-3p则与之相反。[结论]MSTRG.96141.1通过吸附miR-3957-3p参与调控湖羊GC凋亡，进而影响卵泡发育。而MSTRG.96141.1能否作为湖羊繁殖力的分子标记，还需要进一步探究。

关键词：湖羊卵巢颗粒细胞 MSTRG.96141.1 miR-3957-3p 细胞凋亡

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生态猪养殖技术及发展趋势

农家科技 2024年第25期 95-97页

作者：黎力珲博白县亚山镇水产畜牧兽医站

生态养殖技术作为现代养殖业现代化的重要标志,也是乡村振兴战略下的产业振兴的重要途径,其不仅符合绿色环保理念,还可以有效提升生猪养殖的质量和品质。但从实际情况来看,目前我国生态养殖技术还相对落后,养殖户科学养殖观念以及生态... 详细信息

生态养殖技术作为现代养殖业现代化的重要标志,也是乡村振兴战略下的产业振兴的重要途径,其不仅符合绿色环保理念,还可以有效提升生猪养殖的质量和品质。但从实际情况来看,目前我国生态养殖技术还相对落后,养殖户科学养殖观念以及生态养殖的观念参差不齐。因此,本文基于上述分析,以猪养殖为例,对生态猪养殖技术及其发展趋势进行分析,希望为生态养殖技术发展与实践提供一定参考和借鉴。

关键词：生态猪养殖技术发展趋势

蛋氨酸铬对育肥猪生长性能、血液生化及免疫指标的影响

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中国饲料 2024年第4期 61-64页

作者：郭祥山东省荣成市东山畜牧兽医站山东荣成264311

文章旨在研究不同水平蛋氨酸铬对育肥猪生长性能、血液生化指标及免疫指标的影响。本试验将200头健康、日龄、体况及体重相近(100±2.0kg)的“杜×长×大”三元杂交育肥猪随机分成4组,每组10个重复,每个重复5头“杜×长×大”三元杂交... 详细信息

文章旨在研究不同水平蛋氨酸铬对育肥猪生长性能、血液生化指标及免疫指标的影响。本试验将200头健康、日龄、体况及体重相近(100±2.0kg)的“杜×长×大”三元杂交育肥猪随机分成4组,每组10个重复,每个重复5头“杜×长×大”三元杂交育肥猪,各组分别在基础日粮中添加0、0.3、0.5、0.7mg/kg蛋氨酸铬(以铬形式计),预饲验7d,试验期56d。结果表明:(1)试验3、4组育肥猪平均日增重较1组比分别显著提高13.5%、12.2%(P <0.05),料重比较1组比显著降低8.7%、7.3%(P <0.05);(2)试验3、4组育肥猪血清中TP含量较1组显著提高16.4%、16.1%(P <0.05),其血清中AST、TC、BUN含量较1组比显著降低17.8%、18.4%、12.4%、12.8%、13.3%、11.3%(P <0.05);(3)试验3、4组育肥猪血清中IgG、IL-2含量及CSFV抗体水平较1组比分别显著提高10.5%、12.3%、14.8%、22.9%、18.0%、15.6%(P <0.05)。综上所述,添加不同水平的蛋氨酸铬可以提高育肥猪生长性能,改善血液生化指标,提高免疫水平,本试验条件下,在基础日粮中添加0.5mg/kg蛋氨酸铬的效果较好。

关键词：蛋氨酸铬育肥猪血液生化免疫指标