检索结果-南通市图书馆

棘腹蛙Japonicin-pb抗菌肽的分离及表达谱分析

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动物营养学报 2015年第5期27卷 1613-1619页

作者：姜玉松陈德碧邹勇周继萍樊汶樵徐敬明重庆文理学院林学与生命科学学院重庆402160 重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心重庆402168

本试验旨在克隆棘腹蛙来源Japonicin-pb,了解该抗菌肽在不同生长温度及组织下的表达规律,为Japonicin-pb的开发提供线索。基于本实验室构建的棘腹蛙皮肤转录组数据库,利用反转录PCR从棘腹蛙皮肤组织中克隆Japonicin-pb前体序列,通过结... 详细信息

本试验旨在克隆棘腹蛙来源Japonicin-pb,了解该抗菌肽在不同生长温度及组织下的表达规律,为Japonicin-pb的开发提供线索。基于本实验室构建的棘腹蛙皮肤转录组数据库,利用反转录PCR从棘腹蛙皮肤组织中克隆Japonicin-pb前体序列,通过结构域比对的方法分析其结构。利用Real-time PCR检测3种Japonicin-pb在不同生长温度(15、18、21、24、27和30℃)及组织(血液、肌肉、肝脏和皮肤)的表达图谱。结果表明,本试验克隆到3种Japonicin-pb前体序列,结构域比对表明,三者拥有相同的N端信号肽和中间间隔区,长度分别为19、20和12个氨基酸残基的肽序列,命名为Japonicin-1apb、Japonicin-1bpb和Japonicin-3pb。Japonicin-1apb主要在皮肤组织中表达,且表达量随着生长温度的升高而逐渐增加;Japonicin-1bpb在不同组织或生长温度下的表达量差异均不明显;Japonicin-3pb主要在肝脏中表达,且生长温度对其影响不大。这些结果为棘腹蛙源3种Japonicin-pb后续功能研究以及开发应用提供了重要的序列及表达谱信息。

关键词：棘腹蛙基因克隆差异表达抗菌肽 Japonicin

不同温度对棘腹蛙宜宾种群蝌蚪生长发育的影响

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黑龙江畜牧兽医 2018年第1期 207-210页

作者：徐敬明姜玉松樊汶樵重庆文理学院林学与生命科学学院/重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心

为了探讨温度对棘腹蛙(Paa boulengeri)蝌蚪生长发育的影响,试验采用温度梯度方法即设置了15℃、17℃、19℃、21℃、23℃、25℃、27℃7个梯度研究棘腹蛙宜宾种群蝌蚪在这些温度下的生长发育情况。结果表明:棘腹蛙蝌蚪生长发育的最适水温... 详细信息

为了探讨温度对棘腹蛙(Paa boulengeri)蝌蚪生长发育的影响,试验采用温度梯度方法即设置了15℃、17℃、19℃、21℃、23℃、25℃、27℃7个梯度研究棘腹蛙宜宾种群蝌蚪在这些温度下的生长发育情况。结果表明:棘腹蛙蝌蚪生长发育的最适水温是21℃,该温度下的各项生长发育指标(全长、头体长、体宽、体重)均为最优,其中头体长、体重均高于其他几个温度下的指标,且变态率也较高。低于21℃时,温度越高生长状况相对越好;高于21℃时,温度越高变态越提前,变态时的个体因能量积累不够致使体形偏小,而不利于变态后的生存。

关键词：棘腹蛙蝌蚪生长发育温度宜宾

利用RNA-seq技术分析棘腹蛙编码区微卫星特征

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四川动物 2016年第1期35卷 24-30页

作者：姜玉松樊汶樵徐敬明重庆文理学院林学与生命科学学院重庆402160 重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心重庆402168

棘腹蛙Paa boulengeri的遗传研究和基因组信息比较匮乏,致使可有效利用的分子标记非常有限。以棘腹蛙RNA-seq高通量测序数据为基础进行微卫星分子标记的大规模发掘和特征分析,结果显示：在121.6 Mb的棘腹蛙转录组序列中发现微卫星位点3... 详细信息

棘腹蛙Paa boulengeri的遗传研究和基因组信息比较匮乏,致使可有效利用的分子标记非常有限。以棘腹蛙RNA-seq高通量测序数据为基础进行微卫星分子标记的大规模发掘和特征分析,结果显示：在121.6 Mb的棘腹蛙转录组序列中发现微卫星位点3165个,包含于3034条Contig序列中。在筛选到的1~6碱基重复核心的微卫星中,单碱基重复核心的比例最高,之后为三碱基、二碱基、四碱基、六碱基和五碱基重复核心,分别占29.0%、25.2%、21.7%、10.0%、10.0%和3.0%。其中A/T、AC/GT、AGG/CCT、ACAT/ATCT、AAAAT/ATTTT和AAAAAG/CTTTTT分别是单碱基、二碱基、三碱基、四碱基、五碱基、六碱基重复类型中对应的优势重复单元。棘腹蛙编码区微卫星多为重复长度小于24 bp的短序列,长度大于24 bp的微卫星仅占总数的0.92%。对编码区微卫星的侧翼序列分析发现,微卫星侧翼序列的GC含量显著低于转录组整体GC含量,且在含有微卫星上下游侧翼序列的Contig中,71.9%的序列可以设计特异引物扩增出含有微卫星序列的位点。研究结果为棘腹蛙的遗传研究和分子系统地理学研究提供了丰富的序列信息和标记资源。

关键词：高通量测序棘腹蛙微卫星

棘腹蛙剪接因子SRSF2基因克隆及序列分析

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黑龙江畜牧兽医 2015年第5期 23-26页

作者：付丽娜姜玉松重庆文理学院林学与生命科学学院重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心重庆402168

为了解剪接因子在棘腹蛙发育过程中的功能,首先基于棘腹蛙转录组数据库的组装结果设计特异性引物,利用RT-PCR方法克隆到棘腹蛙体内编码丝氨酸/精氨酸富集剪接因子2(Serine/Arginine-rich splicing factor 2,SRSF2)的完整开放读码框(ORF)... 详细信息

为了解剪接因子在棘腹蛙发育过程中的功能,首先基于棘腹蛙转录组数据库的组装结果设计特异性引物,利用RT-PCR方法克隆到棘腹蛙体内编码丝氨酸/精氨酸富集剪接因子2(Serine/Arginine-rich splicing factor 2,SRSF2)的完整开放读码框(ORF),其ORF长度为642 bp,编码213个氨基酸残基,利用数字表达谱和半定量RT-PCR的方法验证了SRSF2在不同温度下的表达图谱,对克隆到的SRSF2基因进行了内含子分析。结果表明:SRSF2在不同生长温度(15,21,27,30℃)下的表达量存在显著差异,在21℃环境下的表达量最高,而在15,27,30℃生长环境下的表达量都较低。说明棘腹蛙来源的SRSF2基因ORF序列内包含个1内含子和2个外显子。

关键词： SRSF2 基因克隆差异表达系统进化树内含子

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棘腹蛙“水肿病”病原的分离鉴定

动物医学进展 2016年第8期37卷 116-119页

作者：李晓英罗洁杜孝田龙方伟胡凯徐敬明樊汶樵重庆文理学院林学与生命科学学院重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心重庆402168

为了解重庆地区部分棘腹蛙养殖场"水肿病"病因,并对该病的临床防控提供参考,本研究采集了10只具有"水肿病"典型症状的2岁龄棘腹蛙成蛙,剖检后从其主要病变组织分离细菌;对分离的优势菌进行培养特性观察和回归致病性试验,同时进行生理生... 详细信息

为了解重庆地区部分棘腹蛙养殖场"水肿病"病因,并对该病的临床防控提供参考,本研究采集了10只具有"水肿病"典型症状的2岁龄棘腹蛙成蛙,剖检后从其主要病变组织分离细菌;对分离的优势菌进行培养特性观察和回归致病性试验,同时进行生理生化特性鉴定、16SrDNA序列测定和药敏试验。结果显示,从病蛙腹腔中分离到1株优势菌株并命名为CQWU201501,该菌为革兰阴性无芽胞短杆菌,主要生理生化特性符合弗氏柠檬酸杆菌的指标,16SrDNA序列与弗氏柠檬酸杆菌同源性高达99.5%;药敏试验显示该菌对绝大部分β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类和四环素类药物敏感。综上所述,棘腹蛙"水肿病"是由弗氏柠檬酸杆菌引起的;该菌对供试的16种药物敏感,仅对头孢唑啉和复方新诺明2种药物耐药,生产上可选择敏感药物治疗。

关键词：棘腹蛙水肿病分离鉴定药敏试验

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中国大鲵“烂脚病”病原菌的分离鉴定

淡水渔业 2015年第4期45卷 100-103页

作者：樊汶樵孙翰昌姜玉松徐敬明蒋丽琳赵满春吴宝红重庆文理学院林学与生命科学学院重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心重庆402168

为了解重庆地区部分中国大鲵(Andrias davidianus)养殖场流行"烂脚病"的病因,对患"烂脚病"中国大鲵进行剖检后,在其肺部分离到一株优势菌CQWU2013,对该优势菌进行致病性实验、生理生化特性鉴定、16S r DNA测序和药敏实验。结果显示:中... 详细信息

为了解重庆地区部分中国大鲵(Andrias davidianus)养殖场流行"烂脚病"的病因,对患"烂脚病"中国大鲵进行剖检后,在其肺部分离到一株优势菌CQWU2013,对该优势菌进行致病性实验、生理生化特性鉴定、16S r DNA测序和药敏实验。结果显示:中国大鲵"烂脚病"是由肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella mobilis)引起的,该菌为短链状排列的革兰氏阴性杆菌,其生理生化特性符合肺炎克雷伯氏菌的指标,16S r DNA序列同源性高达99.6%;药敏实验显示该菌对部分青霉素类、β-内酰胺类、氨基糖苷类和糖肽类药物耐药,对供试的20种药物中有7种药物出现明显的耐药现象。

关键词：中国大鲵(Andrias davidianus) “烂脚病” 分离鉴定耐药性

大鲵肺炎克雷伯菌的部分生物学特性与致病性分析

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中国预防兽医学报 2017年第8期39卷 628-632页

作者：李晓英周卫平樊汶樵重庆文理学院林学与生命科学学院/重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心重庆永川402168 重庆文理学院体育学院重庆永川402160

为确定从患病大鲵分离鉴定到的肺炎克雷伯菌的生物学特性及其对大鲵的致病性,本研究采用比色法和平板扩散法对肺炎克雷伯菌的生长条件及胞外产物进行研究,并对人工感染该菌的大鲵主要靶器官进行组织病理学分析。结果表明:肺炎克雷伯菌... 详细信息

为确定从患病大鲵分离鉴定到的肺炎克雷伯菌的生物学特性及其对大鲵的致病性,本研究采用比色法和平板扩散法对肺炎克雷伯菌的生长条件及胞外产物进行研究,并对人工感染该菌的大鲵主要靶器官进行组织病理学分析。结果表明:肺炎克雷伯菌最适宜在37℃、pH7.5和1.0%NaCl浓度的条件下生长;其胞外产物具有脂肪酶、蛋白酶、卵磷脂酶活性,无淀粉酶、明胶酶、脲酶及溶血活性;感染该菌后大鲵各器官均表现出不同程度的炎性反应,其中以肝炎和坏死性脾炎最为明显。本研究确定了肺炎克雷伯菌的最适生长条件,分析了其胞外产物主要成分,并对其感染大鲵后主要靶器官的组织病理变化进行了探究,为该菌的有效防控与致病机理的研究奠定了基础。

关键词：大鲵肺炎克雷伯菌胞外酶组织病理学

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中国大鲵主要传染病病原研究进展

中国兽医杂志 2015年第6期51卷 73-76页

作者：樊汶樵孙志芳杨帆姜玉松李晓英孙翰昌徐敬明重庆文理学院林学与生命科学学院重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心重庆永川402168

中国大鲵（Andrias davidianus），俗名“娃娃鱼”，属国家二级保护动物，是个体最大的两栖动物，也是我国珍稀名贵特产，已被列入CITES公约附录I中。自20世纪80年代后，由于环境人为破坏、过度捕捞等原因，大鲵栖息地范围严重缩小，自... 详细信息

中国大鲵（Andrias davidianus），俗名“娃娃鱼”，属国家二级保护动物，是个体最大的两栖动物，也是我国珍稀名贵特产，已被列入CITES公约附录I中。自20世纪80年代后，由于环境人为破坏、过度捕捞等原因，大鲵栖息地范围严重缩小，自然资源数量急剧减少。

关键词：中国大鲵传染病国家二级保护动物病原两栖动物人为破坏过度捕捞资源数量

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棘腹蛙Ⅰ型干扰素基因的克隆与原核表达

中国兽医杂志 2017年第4期53卷 23-26页

作者：向勤罗洁吴金芋肖朝新李颜樊汶樵杨帆重庆文理学院林学与生命科学学院重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心重庆永川402168

干扰素(IFN)具有抗病毒、抗肿瘤和免疫调节功能,具备较好的临床应用前景。为了解棘腹蛙干扰素的基因信息,本试验明确了棘腹蛙Ⅰ型IFN基因ORF编码长度为561 bp,编码的蛋白质含有1个信号肽和103aa的保守功能结构域。遗传进化分析显示,棘... 详细信息

干扰素(IFN)具有抗病毒、抗肿瘤和免疫调节功能,具备较好的临床应用前景。为了解棘腹蛙干扰素的基因信息,本试验明确了棘腹蛙Ⅰ型IFN基因ORF编码长度为561 bp,编码的蛋白质含有1个信号肽和103aa的保守功能结构域。遗传进化分析显示,棘腹蛙Ⅰ型IFN进化相对保守;其蛋白质结构主要由α螺旋构成,细胞表面受体结合能力相对保守。将目的片段装入原核表达载体pET32a并转化BL21(DE3)进行蛋白表达与纯化,获得了预期蛋白。本研究证实了棘腹蛙Ⅰ型IFN属于相对保守的典型Ⅰ型干扰素;为后期深入挖掘棘腹蛙IFN的生物学功能、促进广谱抗病毒生物制剂研发提供了参考。

关键词：棘腹蛙干扰素克隆,序列分析,表达