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海南类鼻疽伯克霍尔德菌临床分离株的基因岛特征和毒力因子分析

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中国人兽共患病学报 2024年

作者：符晓莹李欢李沙王立程王崇圳黎元莉陈海朱雄三亚市人民医院检验科

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌（B.pseudomallei）临床分离株的基因岛（genomicisland，GI）特征和毒力因子差异，为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集B.pseudomallei临床分离株，PCR检测和测序分析毒力相关GI，在Islandviewr4平台... 详细信息

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌（B.pseudomallei）临床分离株的基因岛（genomicisland，GI）特征和毒力因子差异，为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集B.pseudomallei临床分离株，PCR检测和测序分析毒力相关GI，在Islandviewr4平台上提交全基因组序列注释格式文件，整合SIGI-HMM与IslandPath-DIMOB两种算法预测GI，通过序列比对分析GI独特性和毒力因子差异。结果共收集到52株B.pseudomallei临床分离株，结果显示，52个基因组按进化距离分为3个分枝，其中82.69%（43/52）菌株集中在分枝1。52个B.pseudomallei基因组共识别出828个GI，按序列相似性聚类为157个GIcluster。GI在基因组中占比达2.05%～6.38%。GIcluster1和2存在全部菌株中，但84个（53.50%）GIcluster只聚类到单个基因组。10个GIcluster很可能是特有的，其中5个来源同属细菌，2个来源其他属，3个来源不确定。25个GIcluster与毒力相关，B.pseudomallei BP76和BP169含有其中8个，是所有菌株中毒力相关GI最多的。52株B.pseudomallei的毒力基因除了fhaB1、fhaB2、BPSL1661、cheY1、wzM、tssH-5/clpV、tssA-5、boaA和boaB存在差异，其余都表现一致。与泰国和澳大利亚B.pseudomallei临床菌株比较，boaA、boaB、cheY1和chbp在两个国家的菌株中都表现显著差异，同时fhaB1、fhaB3和bimA在澳大利亚菌株中表现显著差异。结论海南地区B. pseudomallei GI具有保守性和独特性，通过特有GI和毒力因子研究，可以发现菌株水平基因转移（Horizontal gene transfer，HGT）的来源和分子水平的毒力差异。

关键词：类鼻疽伯克霍尔德菌基因组基因岛毒力因子水平基因转移

基于LASSO回归的早期上皮性卵巢癌预测模型的建立和验证

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中华医学杂志 2024年第23期104卷 2167-2172页

作者：罗慧景王守军张晓方田文艳罗微董作亮天津医科大学总医院检验中心天津重庆市奉节县人民医院检验科重庆天津医科大学总医院妇产科天津

目的建立并验证基于最小绝对值收敛和选择算子(LASSO)回归的早期上皮性卵巢癌预测模型。方法回顾性纳入2018年1月至2023年3月因卵巢肿块在天津医科大学总医院行手术治疗的患者509例, 按7∶3比例随机分成建模组[n=356, 年龄M(Q1, Q3)为43... 详细信息

目的建立并验证基于最小绝对值收敛和选择算子(LASSO)回归的早期上皮性卵巢癌预测模型。方法回顾性纳入2018年1月至2023年3月因卵巢肿块在天津医科大学总医院行手术治疗的患者509例, 按7∶3比例随机分成建模组[n=356, 年龄M(Q1, Q3)为43(31, 61)岁]和内部验证组[n=153, 年龄为42(31, 60)岁]。另收集2023年4至11月因卵巢肿块在天津医科大学总医院行手术治疗的患者86例[年龄为44(33, 61)岁]作为外部验证组。通过LASSO回归筛选变量, 多因素logistic回归建立模型并绘制列线图, 随后对模型进行内部及外部验证。采用受试者工作特征(ROC)曲线、校准曲线及决策曲线评估模型性能及临床适用性。结果共筛选出5个预测因素, 包括年龄(OR=1.040, 95%CI:1.000～1.050, P=0.002)、糖链抗原125(CA125)(OR=1.001, 95%CI:1.000～1.010, P=0.017)、人附睾蛋白4(HE4)(OR=1.020, 95%CI:1.000～1.030, P=0.002)、糖链抗原199(CA199)(OR=1.001, 95%CI:1.000～1.020, P=0.023)和乳酸脱氢酶(LDH)(OR=1.020, 95%CI:1.010～1.022, P=0.001)是早期上皮性卵巢癌的危险因素。基于以上5个危险因素构建预测早期上皮性卵巢癌的列线图模型, ROC曲线显示该模型预测早期上皮性卵巢癌的曲线下面积(AUC)在建模组为0.915(95%CI:0.910～0.932), 内部验证组AUC为0.891(95%CI:0.874～0.905), 外部验证组AUC为0.924(95%CI:0.907～0.942)。校准曲线和临床决策曲线显示该模型的一致性和临床实用性较好。结论建立的列线图模型包括年龄、CA125、HE4、CA199和LDH, 其可以有效预测早期上皮性卵巢癌, 具有较强的临床实用性。

关键词：卵巢肿瘤早期上皮性卵巢癌 LASSO回归预测模型

CK-BB和IL-22联合检测对小儿轮状病毒肠炎诊断及病情评估研究

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中国免疫学杂志 2024年

作者：廖永强程均俞丹菁任妹尹琳洁冯晓晶萍乡市人民医院检验科

目的：探究血清CK-BB和IL-22联合检测对小儿轮状病毒肠炎（Rotavirus gastroenteritis，RVGE）的诊断及病情评估价值。方法：回顾性选取2022年1月-2022年12月我院急诊和住院儿科诊治的102例确诊为RVGE患儿为研究组，40例细菌性肠炎患儿... 详细信息

目的：探究血清CK-BB和IL-22联合检测对小儿轮状病毒肠炎（Rotavirus gastroenteritis，RVGE）的诊断及病情评估价值。方法：回顾性选取2022年1月-2022年12月我院急诊和住院儿科诊治的102例确诊为RVGE患儿为研究组，40例细菌性肠炎患儿为疾病对照组和50例儿保科体检儿童为健康对照组。102例确诊为RVGE患儿根据改良Vesikari评分分为轻度感染组(78例)和重度感染组(24例)。采用ELISA检测血清CK-BB和IL-22水平，散射速率法检测免疫球蛋白水平，免疫比浊法检测C-反应蛋白(CRP)，流式细胞术检测T淋巴细胞亚群。Pearson分析CK-BB与IL-22及体液和细胞免疫指标间的相关性，多因素Logistic回归分析病情程度的独立危险因素，受试者工作特征曲线分析CK-BB和IL-22对RVGE病情程度预测价值。结果：与疾病对照组和健康对照组相比，研究组血清CK-BB、IL-22水平、CD3+CD8+细胞显著升高(均P<0.05)，疾病对照组CRP显著高于研究组和健康对照组(均P<0.05)；CK-BB、IL-22和CD3+CD8+细胞水平随着RVGE患儿病情的增加而升高，IgA、IgM和CD3+CD4+细胞水平、CD4+/CD8+比值随着RVGE患儿病情程度增加而降低；CK-BB水平与IL-22和CD3+CD8+细胞水平呈正相关（r=0.663，0.257，均P<0.05）、与IgA、IgM、CD3+CD4+细胞水平和CD4+/CD8+比值均呈负相关(r=-0.600，-0.838，-0.456，-0.352，均P<0.05);多因素Logistic回归分析发CK-BB、IL-22、CD4+/CD8+比值和年龄均可作为病情严重程度的独立危险因素，CK-BB和IL-22联合检测对重症评估的曲线下面积为0.940，敏感性和特异性为分别为87.5%和93.6%。结论：CK-BB和IL-22联合检测对RVGE诊断和病情评估具有重要的临床价值。

关键词：轮状病毒肠炎 CK-BB IL-22 病情评估

AML化疗期间不同时间点流式细胞术MRD检测对预后的影响

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中国实验血液学杂志 2024年第4期 1051-1057页

作者：居瑞雪孙凤强王育慧潍坊市人民医院检验科

目的:探讨AML化疗期间不同时间点流式细胞术微小残留病（MRD）检测对预后的影响。方法:回顾性分析2018年3月到2022年3月确诊并规范化疗的130例成人原发AML患者，用流式细胞术检测MRD,Kaplan-Meier曲线进行生存分析，log-rank检验进行差... 详细信息

目的:探讨AML化疗期间不同时间点流式细胞术微小残留病（MRD）检测对预后的影响。方法:回顾性分析2018年3月到2022年3月确诊并规范化疗的130例成人原发AML患者，用流式细胞术检测MRD,Kaplan-Meier曲线进行生存分析，log-rank检验进行差异性分析，Cox比例风险回归模型进行影响患者生存的单因素和多因素分析。竞争风险模型进行影响患者累计复发率（CIR）的分析，Fine-Gray进行差异性分析。结果:130例患者中，CR1 81例，CR2 26例，PR 14例，NR 9例。CR1组OS高于CR2、PR、NR组。CR2组OS高于PR组，但与NR组比较无统计学差异；PR组OS与NR组比较无统计学差异。CR1和CR2的107例患者根据流式细胞术检测的MRD分组，第一次诱导化疗后MRD-和MRD+组患者的4年预期RFS率分别为65.3%和27.9%,4年预期OS率分别为58.7%和41.4%,4年预计CIR率分别为34.7%和69.7%,2组比较差异均有统计学意义（χ2=6.639,P=0.010;χ2=6.131,P=0.013;χ2=6.637,P=0.010）;第二次化疗后MRD-和MRD+组患者的4年预期RFS率分别为50.8%和37.9%,4年预期OS率分别为49.2%和44.5%,4年预计CIR率分别为49.2%和59.5%,2组比较差异均无统计学意义（χ2=1.475,P=0.225;χ2=2.432,P=0.119;χ2=1.416,P=0.234）;巩固治疗期间MRD-和MRD+组患者的4年预期RFS率分别为51.9%和29.6%,4年预期OS率分别为67.5%和24.6%,4年预计CIR率分别为48.1%和70.4%,2组比较差异均有统计学意义（χ2=20.982,P<0.001;χ2=17.794,P<0.001;χ2=19.879,P<0.001）;3个时间点MRD均为阴性和任一时间点为阳性患者的4年预期RFS率分别为69.9%和33.3%,4年预期OS率分别为59.1%和44.7%,4年预计CIR率分别为30.1%和65.1%,2组比较差异均有统计学意义（χ2=7.367,P=0.007;χ2=6.042,P=0.014;χ2=7.662,P=0.006）。单因素分析结果显示，染色体高危核型是影响患者RFS和OS的不利因素，诱导化疗2个疗程达CR、第一次诱导化疗后MRD-和第二次化疗MRD-是患者RFS和OS的保护因素；巩固治疗期间MRD-和3个时间点MRD-是患者RFS、OS和CIR的保护因素。多因素分析结果显示，诱导化疗2个疗程达CR是患者RFS和CIR的保护因素，巩固治疗期间MRD-是RFS、OS和CIR的保护因素。结论:成人AML患者早期获得CR和MRD-,特别是巩固治疗期间的MRD-是预后良好的标志，流式细胞术是AML患者MRD检测最常用的方法。

关键词：急性髓系白血病成人化疗微小残留病预后

海南省类鼻疽伯克霍尔德菌临床分离株的基因岛特征和毒力因子分析

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中国人兽共患病学报 2024年第4期40卷 359-368,390页

作者：符晓莹李欢李沙王立程王崇圳黎元莉陈海朱雄三亚市人民医院检验科三亚572000

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)临床分离株的基因岛(genomic island,GI)特征和毒力因子差异,为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集B.pseudomallei临床分离株,PCR检测和测序分析毒力相关GI,在Islandviewr 4... 详细信息

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)临床分离株的基因岛(genomic island,GI)特征和毒力因子差异,为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集B.pseudomallei临床分离株,PCR检测和测序分析毒力相关GI,在Islandviewr 4平台上提交全基因组序列注释格式文件,整合SIGI-HMM与IslandPath-DIMOB两种算法预测GI,通过序列比对分析GI独特性和毒力因子差异。结果共收集到52株B.pseudomallei临床分离株,结果显示,52个基因组按进化距离分为3个分枝,其中82.69%(43/52)菌株集中在分枝1。52个B.pseudomallei基因组共识别出828个GI,按序列相似性聚类为157个GI cluster。GI在基因组中占比达2.05%~6.38%。GI cluster1和2存在全部菌株中,但84个(53.50%)GI cluster只聚类到单个基因组。10个GI cluster很可能是特有的,其中5个来源同属细菌,2个来源其他属,3个来源不确定。25个GI cluster与毒力相关,B.pseudomallei BP76和BP169含有其中8个,是所有菌株中毒力相关GI最多的。52株B.pseudomallei的毒力基因除了fhaB1、fhaB2、BPSL1661、cheY1、wzM、tssH-5/clpV、tssA-5、boaA和boaB存在差异,其余都表现一致。与泰国和澳大利亚B.pseudomallei临床菌株比较,boaA、boaB、cheY1和chbp在两个国家的菌株中都表现出差异,同时fhaB1、fhaB3和bimA在澳大利亚菌株中表现出差异。结论海南地区B.pseudomallei GI具有保守性和独特性,通过特有GI和毒力因子研究,可以发现菌株水平基因转移(Horizontal gene transfer,HGT)的来源和分子水平的毒力差异。

关键词：类鼻疽伯克霍尔德菌基因组基因岛毒力因子水平基因转移

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小檗碱治疗肺部感染的药理作用研究进展

现代药物与临床 2024年第6期39卷 1642-1646页

作者：舒小童夏红汪天露重庆市大足区人民医院感染科重庆市大足区人民医院无痛中心

肺部感染临床常以肺炎形式存出现，治疗核心为抗感染，但多数病原菌对传统药物具有较高的耐药性。小檗碱是从黄连中提取的活性成分，具有多种活性，可通过降低病原菌耐药性，阻止病原菌复制，减轻肺部炎症反应，调节免疫功能，抑制肺纤... 详细信息

肺部感染临床常以肺炎形式存出现，治疗核心为抗感染，但多数病原菌对传统药物具有较高的耐药性。小檗碱是从黄连中提取的活性成分，具有多种活性，可通过降低病原菌耐药性，阻止病原菌复制，减轻肺部炎症反应，调节免疫功能，抑制肺纤维化进程，保护血管内皮细胞以治疗肺部感染，减轻肺组织损伤。综述了小檗碱用于肺部感染治疗的药理作用研究进展，为小檗碱临床治疗肺部感染提供依据。

关键词：小檗碱肺部感染耐药性病原菌复制炎症反应免疫功能肺纤维化血管内皮细胞

EB病毒感染所致肝脏损伤患者病毒特异性CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞功能分析

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中华肝脏病杂志 2024年第1期32卷 64-71页

作者：李彧奚逢瑜张维华高瑛陕西省人民医院感染性疾病科西安710068 陕西省人民医院检验科西安710068 陕西省人民医院血液内科西安710068

目的分析EB病毒(EBV)感染者中发生肝脏损伤和未发生肝脏损伤患者病毒特异性CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞功能的差异。方法入组45例EBV感染者,28例发生肝脏损伤,17例未发生肝脏损伤。分离外周血单个核细胞,纯化CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞... 详细信息

目的分析EB病毒(EBV)感染者中发生肝脏损伤和未发生肝脏损伤患者病毒特异性CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞功能的差异。方法入组45例EBV感染者,28例发生肝脏损伤,17例未发生肝脏损伤。分离外周血单个核细胞,纯化CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞,使用重组EBV核心抗原2(EBNA2)刺激培养96 h。细胞技术试剂盒法检测细胞增殖,流式细胞术检测CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞比例。酶联免疫吸附试验检测CD4^(+)T细胞分泌细胞因子和CD8^(+)T细胞分泌毒性分子水平,实时定量PCR法检测CD4^(+)T细胞亚群转录因子mRNA水平和CD8^(+)T细胞中毒性分子mRNA水平,流式细胞术检测CD8^(+)T细胞中免疫检查点分子水平。组间比较采用t检验或Mann-Whitney检验。结果重组EBNA2刺激后外周血单个核细胞增殖、CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞比例在EBV感染无肝脏损伤组和EBV感染致肝脏损伤组之间的差异无统计学意义(P>0.05)。重组EBNA2刺激后CD4^(+)T细胞分泌相关细胞因子比例和转录因子mRNA水平在EBV感染无肝脏损伤组和EBV感染致肝脏损伤组之间的差异无统计学意义(P>0.05)。重组EBNA2刺激后EBV感染致肝脏损伤组CD8^(+)T细胞分泌穿孔素[(75.51±23.33)pg/ml对比(58.99±18.39)pg/ml,P=0.017]和颗粒酶B[(117.8±44.55)pg/ml对比(90.22±34.21)pg/ml,P=0.034]的水平高于无肝脏损伤组,EBV感染致肝脏损伤组CD8^(+)T细胞中Fas配体和肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体mRNA水平较无肝脏损伤组分别升高约1.5倍和1.2倍,差异有统计学意义(P0.05)。结论EBV感染致肝脏损伤患者病毒特异性CD8^(+)T细胞毒性作用增强,可能介导EBV诱导的肝脏损伤。

关键词：肝损伤 EB病毒 CD4^(+)T细胞 CD8^(+)T细胞

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川芎嗪防治急性胰腺炎作用机制的研究进展

现代药物与临床 2024年第3期39卷 797-800页

作者：蒋怀春陈跃菊夏达建王苹重庆市大足区人民医院急诊科重庆402360

急性胰腺炎具有发病迅速、并发症多、死亡率高等特点。川芎嗪可通过促进细胞凋亡、纠正微循环障碍、减轻炎症反应、减轻脂质过氧化反应、抑制脂多糖/Toll样受体4信号通路、保护小肠黏膜屏障功能发挥防治急性胰腺炎的作用。归纳了川芎嗪... 详细信息

急性胰腺炎具有发病迅速、并发症多、死亡率高等特点。川芎嗪可通过促进细胞凋亡、纠正微循环障碍、减轻炎症反应、减轻脂质过氧化反应、抑制脂多糖/Toll样受体4信号通路、保护小肠黏膜屏障功能发挥防治急性胰腺炎的作用。归纳了川芎嗪防治急性胰腺炎的作用机制,为急性胰腺炎的治疗提供参考。

关键词：川芎嗪急性胰腺炎细胞凋亡微循环障碍炎症反应脂质过氧化反应小肠黏膜屏障功能

基于全基因组测序的耐多黏菌素和替加环素肺炎克雷伯菌特征研究

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中国抗生素杂志 2024年第6期49卷 700-704页

作者：周燕霞郭辉金华市人民医院检验科金华321000

目的分析1株多黏菌素和替加环素均耐药的肺炎克雷伯菌基因组特征。方法肺炎克雷伯菌KP2016分离自我院临床痰液标本。采用微量肉汤稀释法测定KP2016对亚胺培南、美罗培南、多黏菌素和替加环素的最低抑菌浓度。对菌株进行第二代Illumina... 详细信息

目的分析1株多黏菌素和替加环素均耐药的肺炎克雷伯菌基因组特征。方法肺炎克雷伯菌KP2016分离自我院临床痰液标本。采用微量肉汤稀释法测定KP2016对亚胺培南、美罗培南、多黏菌素和替加环素的最低抑菌浓度。对菌株进行第二代Illumina和第三代Oxford Nanopore全基因组测序。通过Unicycler对第二代和第三代序列进行混合拼接。通过ABRicate v0.8.13调用Resfinder数据库分析耐药基因。通过ISFinder分析移动元件。利用CGE(Center for Genomic Epidemiology)网站分析菌株的ST型和质粒复制子类型。利用Proksee对质粒结构进行可视化。结果KP2016菌株对多黏菌素和替加环素均耐药,MIC分别为512和16 mg/L。MLST分析显示KP2016属于ST656,携带多黏菌素耐药相关mcr-1和mcr-8基因和替加环素耐药相关tmexCD1-toprJ1基因簇。KP2016携带1个染色体和5个环形质粒,质粒大小3,991~275,345bp,GC含量44.35%~52.20%。mcr-1基因位于约44kb的质粒p1上,上下游环境为ISKpn26-mcr-1-pap2-ISApl1;mcr-8基因位于IncR/IncN型质粒p2上,遗传结构为ISEcl1-mcr-8-orf-ISKpn26;tmexCD1-toprJ1基因簇结构为IS26-tnfxB1-tmexC1-tmexcD1-toprJ1。此外,菌株还携带多黏菌素耐药相关的染色体介导的CrrB突变(L204V、V237I)。结论肺炎克雷伯菌KP2016多黏菌素耐药由mcr-1、mcr-8和crrB突变介导,替加环素耐药由tmexCD1-toprJ1基因簇介导。应加强合理监测,防止其在医疗机构中进一步传播。

关键词：肺炎克雷伯菌全基因组测序多黏菌素替加环素质粒结构