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番茄花序发育调控进展

分子植物育种 2024年

作者：曹莉莉重庆大学生物工程学院

花序由茎尖分生组织在开花诱导后分化发育形成。番茄在世界上种植广泛，花序分枝数量是番茄重要的农艺性状，对番茄的产量和品质起着重要影响，因此合适的花序分枝数量已经成为优异番茄品种的一个重要指标。目前虽然已报道大量基因参与... 详细信息

花序由茎尖分生组织在开花诱导后分化发育形成。番茄在世界上种植广泛，花序分枝数量是番茄重要的农艺性状，对番茄的产量和品质起着重要影响，因此合适的花序分枝数量已经成为优异番茄品种的一个重要指标。目前虽然已报道大量基因参与番茄花序发育，但针对这些基因没有综合描述，本研究重点介绍茎尖分生组织的大小、花分生组织身份基因、花序分生组织确定性、ALOG家族蛋白以及激素对番茄花序结构发育的影响，以期在阐明番茄花序结构分子调控机制的基础上为培育具有优异花序分枝数量的番茄品种提供理论依据。

关键词：番茄花序发育分生组织

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基于微流控芯片的人工细胞研究进展

生物工程学报 2024年第7期40卷 2100-2119页

作者：杨雁婷邓吉楠杨军西南大学动物科学技术学院重庆400715 重庆大学生物工程学院重庆400030

合成生物学的主要目标之一是自下而上地构建人工细胞。它不仅能深入理解生命的起源和细胞功能,还能在人工细胞底盘、组织模型、工程治疗递送系统和药物筛选工具等领域发挥关键作用。然而,这一目标的实现极具挑战,细胞结构的复杂性、基... 详细信息

合成生物学的主要目标之一是自下而上地构建人工细胞。它不仅能深入理解生命的起源和细胞功能,还能在人工细胞底盘、组织模型、工程治疗递送系统和药物筛选工具等领域发挥关键作用。然而,这一目标的实现极具挑战,细胞结构的复杂性、基础模块的微型化和多样性对构建方法提出了极高要求。微流控芯片作为一种先进的分析系统,为人工细胞的构建提供了一种有效工具,能够更精确地控制其结构及局部微环境,成为当前研究的首选途径。本文综述了基于微流控芯片的人工细胞构建、操作与分析方法,强调了微环境对生命系统和人工自我维持体系的重要性,展示了人工细胞在多个关键生物医学领域的广泛应用。通过探讨不同微流控方法的优缺点及其在各种应用中的表现,帮助研究人员更深入地理解人工细胞相关研究。最后,对基于微流控技术的人工细胞研究的未来发展进行了展望,期待这一领域能够取得更大突破和进步。

关键词：合成生物学巨型脂质体微环境区室结构

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以上海某公司为例的组织文化个案研究

心理传记与质性心理学

心理传记与质性心理学 2024年第1期 191-234+242-243页

作者：屠珺楠东南大学生物科学与医学工程学院博士后流动站

叙事心理学较多地被应用于个人的生命叙事与自我叙事之中,但很少体现在组织心理学领域。本研究即以一家品牌咨询企业M公司为研究对象,研究者以实习生身份进入组织田野约三个月时间,借由观察与访谈等研究方式,并以Schein的组织文化理论... 详细信息

叙事心理学较多地被应用于个人的生命叙事与自我叙事之中,但很少体现在组织心理学领域。本研究即以一家品牌咨询企业M公司为研究对象,研究者以实习生身份进入组织田野约三个月时间,借由观察与访谈等研究方式,并以Schein的组织文化理论为视框,探究组织文化并形成组织叙事。本研究在介绍研究视角与研究思路之后,通过详细叙说创始人故事和策略师、设计师群像,并补充描述公司内部人与人的互动场面,以此作为支点来讨论企业组织文化内涵及其与知识管理的关系。研究结果完整地呈现了一个上海公司的组织文化,包括基本假定、外显与内隐价值观与人为事物。研究贡献在于三方面:一是详细地描述了一家上海公司的组织文化,可以为组织发展与组织变革提供一定参考,也可以为个人就业或生涯选择发挥相关借鉴作用;二是尝试组织叙事研究的新形式,即使用日记体与论文体相结合的模式建构组织文化内涵;三是讨论了知识管理与组织文化对于现代企业的意义。

关键词：组织文化组织叙事质性研究

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重组大肠杆菌催化橙皮素合成新橙皮苷

生物工程学报 2024年第9期40卷 3011-3024页

作者：张萱刘世柯曾伟主周景文侯颖天津科技大学生物工程学院天津300457 江南大学生物工程学院江苏无锡214122

新橙皮苷是一种黄酮糖苷,广泛应用于食品和药品行业。目前新橙皮苷生产主要通过植物提取法,需要大量的有机溶剂,而生物转化法绿色环保、转化率高,具有较高的经济效益。本研究在大肠杆菌中引入拟南芥来源的糖基转移酶UGT73B2、葡萄来源... 详细信息

新橙皮苷是一种黄酮糖苷,广泛应用于食品和药品行业。目前新橙皮苷生产主要通过植物提取法,需要大量的有机溶剂,而生物转化法绿色环保、转化率高,具有较高的经济效益。本研究在大肠杆菌中引入拟南芥来源的糖基转移酶UGT73B2、葡萄来源的鼠李糖合酶VvRHM-NRS和柚子来源的鼠李糖转移酶Cm1,2RhaT,构建了新橙皮苷的生物合成路径。通过模块优化和糖基供体强化后,重组菌株在5 L发酵罐中合成新橙皮苷的产量达到4.64 g/L,底物橙皮素的摩尔转化率为45.8%,这是目前报道的微生物中异源合成新橙皮苷的最高产量。本研究为新橙皮苷高产菌株的构建与应用奠定了基础,也为代谢工程改造微生物生产其他黄酮糖苷提供了借鉴。

关键词：新橙皮苷黄酮糖苷二磷酸尿苷-葡萄糖大肠杆菌

Plectin通过诱导F-actin聚合增强肝癌细胞的迁移能力

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四川大学学报（医学版） 2024年第1期55卷 60-66页

作者：徐茹霜杨凌霄宋关斌重庆大学生物工程学院重庆400030 重庆市第六人民医院重庆400060

目的研究Plectin的表达与肝癌细胞迁移能力的关系,揭示Plectin表达影响肝癌细胞迁移行为的分子机理。方法首先,Western blot检测正常肝细胞和肝癌细胞中Plectin的表达。其次,构建Plectin下调的肝癌细胞株,设立对照组(shNC组)和shPLEC组... 详细信息

目的研究Plectin的表达与肝癌细胞迁移能力的关系,揭示Plectin表达影响肝癌细胞迁移行为的分子机理。方法首先,Western blot检测正常肝细胞和肝癌细胞中Plectin的表达。其次,构建Plectin下调的肝癌细胞株,设立对照组(shNC组)和shPLEC组,各组分别设溶剂对照组(shNC+DMSO组或shPLEC+DMSO组)和F-actin骨架聚合诱导剂Jasplakinolide组(shNC+Jasp组或shPLEC+Jasp组)。采用Western blot检测各组肝癌细胞中Plectin的表达及上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关分子(N-cadherin、vimentin和E-cadherin)的表达;采用Transwell小室法分析肝癌细胞的迁移能力;采用KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析与Plectin基因有关的信号通路;采用免疫荧光技术检测Plectin表达变化对细胞骨架F-actin聚合的影响。结果与正常肝细胞相比,Plectin在肝癌细胞中高表达。与shNC组相比,shPLEC组Plectin的表达降低(P后,与shPLEC+DMSO组相比,shPLEC+Jasp组肝癌细胞迁移能力增强(P<0.05),EMT进程有所恢复(N-cadherin和vimentin表达升高,E-cadherin表达降低)(P<0.05),同时肝癌细胞骨架F-actin聚合亦有所恢复。结论Plectin在肝癌细胞中高表达,肝癌细胞中Plectin通过诱导F-actin聚合促进肝癌细胞的迁移和EMT。

关键词： Plectin 肝癌细胞细胞迁移分析上皮-间质转化细胞骨架 F-actin

多萜醇磷酸β-葡萄糖基转移酶的活性和底物特异性分析

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生物工程学报 2024年第6期40卷 1833-1844页

作者：栗瑞杰胡芸尚尔菲高晓冬王宁江南大学生物工程学院江苏无锡214122

内质网(endoplasmic reticulum,ER)是蛋白质折叠和质量控制的主要场所,其内部驻留的分子伴侣能够帮助新生多肽链形成正确的三级结构。部分分子伴侣通过特异性识别葡萄糖基化的N-寡糖结构与糖肽结合,进而促进相应蛋白的折叠。作为ER腔内... 详细信息

内质网(endoplasmic reticulum,ER)是蛋白质折叠和质量控制的主要场所,其内部驻留的分子伴侣能够帮助新生多肽链形成正确的三级结构。部分分子伴侣通过特异性识别葡萄糖基化的N-寡糖结构与糖肽结合,进而促进相应蛋白的折叠。作为ER腔内葡萄糖基化反应的糖基供体,体外获取多萜醇磷酸葡萄糖(dolichol phosphate glucose,Dol-P-Glc)或其类似物对解析N-寡糖生物合成途径及糖蛋白质量控制体系具有重要意义,一直受到科学家们的关注。本研究以化学合成的一系列多萜醇(dolichol)类似物作为底物,对大肠杆菌表达的阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)来源的多萜醇磷酸β-葡萄糖基转移酶E(dolichyl-phosphateβ-glucosyltransferase E,Alg5E)进行了研究。结果表明该重组蛋白在体外具有较强的催化活性,可以识别不同链长的脂肪醇,底物中脂肪醇碳链越长其酶促反应进程越快,且对脂肪醇中异戊二烯的支链甲基表现出偏好性。研究还确认了重要的天冬氨酸-任意氨基酸-天冬氨酸(aspartate-anyresidue-aspartate,DXD)基序与二价金属离子的结合是该酶发挥催化功能的关键。上述工作为多萜醇寡糖(dolichol-linked oligosaccharide,DLO)合成途径中葡萄糖基转移酶Alg6、Alg8和Alg10的研究打下了基础。

关键词：葡萄糖基转移酶 N-糖基化多萜醇底物特异性

Cl_(2)和O_(2)在TiC(100)表面共吸附行为的密度泛函理论分析

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高等学校化学学报 2024年第4期45卷 104-112页

作者：陈荣温良英岳东杨仲卿重庆大学材料科学与工程学院重庆400044 重庆大学能源与动力工程学院重庆400044

基于密度泛函理论的第一性原理从头计算方法,建立了Cl_(2)和O_(2)在TiC(100)表面的共吸附模型.通过分析吸附能、电荷密度和偏态密度(PDOS)等参数,研究了Cl_(2)和O_(2)在TiC(100)表面的反应机理,发现解离后的Cl原子和O原子与TiC(100)表... 详细信息

基于密度泛函理论的第一性原理从头计算方法,建立了Cl_(2)和O_(2)在TiC(100)表面的共吸附模型.通过分析吸附能、电荷密度和偏态密度(PDOS)等参数,研究了Cl_(2)和O_(2)在TiC(100)表面的反应机理,发现解离后的Cl原子和O原子与TiC(100)表面的原子均成键,从而破坏了Ti—C键.Cl_(2)分子在吸附过程中充当电子的受体,得到与之成键的Ti原子贡献的电子,O_(2)分子在吸附过程中也充当电子的受体,得到C原子贡献的电子.TiC(100)表面在吸附分子后,Ti—C成键轨道上电子占据数变少,反键轨道上电子占据数增多,Ti原子与C原子之间的成键作用减弱.同时,Ti3d与Cl3s,Cl3p发生轨道重叠杂化作用,O2p轨道和C2p轨道存在较强的共振峰,Cl原子和O原子与TiC表面相互作用强烈.

关键词：碳化钛吸附行为氯气氧气密度泛函理论

酿酒酵母孢子固定化聚对苯二甲酸乙二醇酯水解酶的酶学性质研究

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食品与发酵工业 2024年

作者：白佳文王亚森杜祥坤佀辰钰兰周格中西秀树李子杰江南大学生物工程学院

基于酿酒酵母孢子表面展示系统，实现聚对苯二甲酸乙二醇酯（polyethylene terephthalate，PET）水解酶FAST-PETase的孢子固定化。使用整合型质粒pRS306-TEF1pr-ss-FAST-PETase，将编码FAST-PETase的基因插入到酿酒酵母dit1Δ缺陷型菌... 详细信息

基于酿酒酵母孢子表面展示系统，实现聚对苯二甲酸乙二醇酯（polyethylene terephthalate，PET）水解酶FAST-PETase的孢子固定化。使用整合型质粒pRS306-TEF1pr-ss-FAST-PETase，将编码FAST-PETase的基因插入到酿酒酵母dit1Δ缺陷型菌株的基因组中，使蛋白更加稳定的表达。以双-2-（羟乙基）对苯二甲酸酯[bis(2-hydroxyethyl) terephthalate，BHET]为底物，对孢子固定化FAST-PETase的最适反应条件、热稳定性、pH耐受性、洗涤剂/有机试剂耐受性和重复使用能力进行研究。孢子固定化FAST-PETase的最适反应条件为50 ℃，pH 8.0。在30～80 ℃孵育12 h后，能保留82%以上的活性。同样地，在pH 5.0～9.0孵育12 h后，也能保持78%以上的活性。与游离酶相比，孢子固定化FAST-PETase对有机试剂也有一定的抗性，在重复使用7次后仍然保留初始活性的35%。该研究利用酿酒酵母孢子表面展示系统成功实现孢子固定化FAST-PETase，并将其应用于BHET的水解中，为PET塑料的长期降解提供了新的平台。

关键词：酿酒酵母孢子表面展示 FAST-PETase BHET降解酶学性质

植物乳植杆菌J50产抗菌肽的分离纯化及基因组学分析

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微生物学通报 2024年

作者：周恺颉王辰汇李崎钮成拓郑飞云刘春凤江南大学生物工程学院酿酒科学与工程研究室江南大学生物工程学院

【背景】食品腐败的主要原因是食源性致病菌的污染。乳酸菌产生抗菌肽能够有效抑制食源性致病菌的生长。【目的】对一株具有广谱抑菌能力的植物乳植杆菌（Lactiplantibacillus plantarum） J50展开研究，分离纯化其产生的抑菌物质并开... 详细信息

【背景】食品腐败的主要原因是食源性致病菌的污染。乳酸菌产生抗菌肽能够有效抑制食源性致病菌的生长。【目的】对一株具有广谱抑菌能力的植物乳植杆菌（Lactiplantibacillus plantarum） J50展开研究，分离纯化其产生的抑菌物质并开展其基因组学分析。【方法】通过多种酶处理判断抑菌物质种类，通过有机溶剂萃取、凝胶过滤层析和半制备高效液相色谱对其分离纯化，使用液质联用表征，人工合成后测定其稳定性和最低抑制浓度，并对菌株开展基因组学分析。【结果】通过酶敏感性实验，判断其产生的抑菌有效物质为抗菌肽，分离纯化得到抗菌肽纯品，表征出肽段序列为：SGAGY（N→C），相对分子质量=453.44 Da。其在pH≤5.5时能保持有效抑菌能力，具有较强的热稳定性和紫外线照射稳定性，对实验的G+和G-型食源性致病菌的最低抑制浓度在0.7-1.6 g/L。基因组学分析显示抗菌肽SGAGY是非核糖体肽，且J50具有双肽细菌素plantaricin EF合成相关基因。【结论】菌株J50至少能够产生2种高效抗菌肽，抑菌谱系较广，具有应用于食品工业的潜在价值。

关键词：乳酸菌抗菌肽分离纯化最低抑制浓度基因组学