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肝癌细胞株-乙型肝炎病毒DNA整合事件的高通量靶向捕获测序分析

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陆军军医大学学报 2024年第2期46卷 110-117页

作者：羊泽锐邓海君胡源重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400016

目的采用探针捕获和高通量测序技术研究HepG2.2.15与HepAD38 2个乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)肝癌细胞系中病毒DNA在宿主基因组中的整合位点特征。方法提取HepG2.2.15与HepAD38细胞基因组DNA,采用探针捕获和高通量测序策略对... 详细信息

目的采用探针捕获和高通量测序技术研究HepG2.2.15与HepAD38 2个乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)肝癌细胞系中病毒DNA在宿主基因组中的整合位点特征。方法提取HepG2.2.15与HepAD38细胞基因组DNA,采用探针捕获和高通量测序策略对2个肝癌细胞株中整合的HBV DNA进行捕获测序,使用Trimmomatic、BBAP、BWA(Burrows-Wheeler Aligner)等生物信息学软件进行数据分析;最后通过聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)及克隆测序对病毒DNA整合特征进行验证。结果利用探针捕获和高通量测序技术分别在HepG2.2.15与HepAD38细胞系中检测出12、7个HBV DNA整合事件,随机分布在chr1、chr2、chr7、chr9、chr16、chr17、chr19、chrX染色体上,整合位点上下游基因出现频率较高的有DPP7、TRIM56、GPC3等。结论成功建立基于探针捕获和高通量测序技术检测HBV DNA在宿主基因组上的整合片段的方法,HepG2.2.15与HepAD38细胞系中HBV整合事件在染色体上随机发生,大部分整合位点发生在HBV基因组上的X基因区域。

关键词：乙型肝炎病毒 HBV整合探针捕获高通量测序克隆测序

核苷类似物与核苷酸类似物基于非抗病毒作用对慢性乙型肝炎相关结局的影响

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中华肝脏病杂志 2023年第8期31卷 880-885页

作者：段袁琴陈志伟任红胡鹏重庆医科大学病毒性肝炎研究所感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆医科大学附属第二医院感染科重庆400010

在慢性乙型肝炎(CHB)的治疗中,核苷(酸)类似物不仅可对大部分CHB患者实现长期病毒抑制,亦能对其他CHB治疗目标和预后的改善产生积极影响。核苷酸类似物如富马酸替诺福韦二吡呋酯、富马酸丙酚替诺福韦与核苷类似物如恩替卡韦对CHB临床结... 详细信息

在慢性乙型肝炎(CHB)的治疗中,核苷(酸)类似物不仅可对大部分CHB患者实现长期病毒抑制,亦能对其他CHB治疗目标和预后的改善产生积极影响。核苷酸类似物如富马酸替诺福韦二吡呋酯、富马酸丙酚替诺福韦与核苷类似物如恩替卡韦对CHB临床结局的影响可观察到一定差异;机制研究结果也提示,这两类药物除阻断HBV逆转录酶的直接抗病毒作用外,还通过非抗病毒作用机制对免疫相关信号通路、基因表达、基因组稳定性等造成不同影响。现根据最新研究进展,综述核苷(酸)类似物潜在的非抗病毒作用机制证据,并提出核苷酸类似物在CHB患者临床结局上有相对优势这一观察趋势的初步解释。

关键词：慢性乙型肝炎核苷类似物替诺福韦恩替卡韦

卵巢癌结构域蛋白酶-1基因拮抗IFN-α抗病毒效应研究

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第5期44卷 382-389页

作者：周明慧江彦君宋术义胡源重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400016

目的研究卵巢癌结构域蛋白酶-1(ovarian tumor domain-containing protease-1,OTUD1)基因对Ⅰ型干扰素信号通路的影响以及对IFN-α抗病毒效应的影响。方法双荧光素酶报告试验检测OTUD1基因对IFN-α诱导的干扰素刺激应答元件(interferon-... 详细信息

目的研究卵巢癌结构域蛋白酶-1(ovarian tumor domain-containing protease-1,OTUD1)基因对Ⅰ型干扰素信号通路的影响以及对IFN-α抗病毒效应的影响。方法双荧光素酶报告试验检测OTUD1基因对IFN-α诱导的干扰素刺激应答元件(interferon-stimulated response elements,ISRE)启动子转录活性的影响;实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测OTUD1对IFN-α诱导的干扰素刺激基因(interferon-stimulated genes,ISGs)表达水平的影响;Western blot检测OTUD1对干扰素信号通路关键分子表达的调控作用,qPCR和ELISA检测其对IFN-α抑制乙型肝炎病毒复制的影响。结果在HEK293T和Huh7.0细胞中,OTUD1下调了干扰素信号通路下游的ISRE启动子转录活性以及ISG15和ISG56等抗病毒基因的表达。在HEK293T细胞中,OTUD1降低了磷酸化蛋白质酪氨酸激酶(phospho-Jak1,p-JAK1)的蛋白质表达水平,但是OTUD1酶活突变体C320S不能调控ISGs和p-JAK1的表达。在Huh7.0细胞中,OTUD1降低了IFN-α抑制乙型肝炎病毒复制的效应。结论OTUD1通过其泛素化酶活性下调p-JAK1的蛋白质表达水平,抑制干扰素JAK-STAT信号通路及ISGs表达。OTUD1拮抗IFN-α抑制病毒复制的效应可能与干扰素诱导的JAK-STAT信号通路有关。

关键词：卵巢癌结构域蛋白酶-1(OTUD1) IFN-α JAK-STAT信号通路抗病毒

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新型冠状病毒肺炎疫苗混合接种方案研究进展

中华内科杂志 2022年第7期61卷 816-821页

作者：陈志伟胡鹏重庆医科大学附属第二医院感染科重庆医科大学病毒性肝炎研究所感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400010

目前,全球新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)疫情仍处于大流行阶段,疫苗接种是最有效的防控策略之一。同源接种是现阶段标准的COVID-19疫苗接种方案,但是由于疫苗可及性、保护效力下降等问题,疫苗混合接种方案的研... 详细信息

目前,全球新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)疫情仍处于大流行阶段,疫苗接种是最有效的防控策略之一。同源接种是现阶段标准的COVID-19疫苗接种方案,但是由于疫苗可及性、保护效力下降等问题,疫苗混合接种方案的研究正逐步开展。本文综述疫苗混合接种的最新研究进展,探讨其安全性和有效性,为后续COVID-19疫情防控策略的制定提供新思路。

关键词：疫苗新型冠状病毒混合接种有效性安全性

富马酸替诺福韦二吡呋酯对血脂影响的研究进展

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中华肝脏病杂志 2023年第10期31卷 1103-1107页

作者：段袁琴胡鹏重庆医科大学附属第二医院感染科教育部感染性疾病分子生物学重点实验室重庆医科大学病毒性肝炎研究所重庆400010

富马酸替诺福韦二吡呋酯(TDF)是一种新型核苷酸类逆转录酶抑制剂,主要用于治疗人类免疫缺陷病毒和乙型肝炎病毒感染。近年来越来越多的研究发现,TDF治疗可以降低艾滋病和慢性乙型肝炎患者的血脂,而血脂又和疾病进展以及心血管事件的发... 详细信息

富马酸替诺福韦二吡呋酯(TDF)是一种新型核苷酸类逆转录酶抑制剂,主要用于治疗人类免疫缺陷病毒和乙型肝炎病毒感染。近年来越来越多的研究发现,TDF治疗可以降低艾滋病和慢性乙型肝炎患者的血脂,而血脂又和疾病进展以及心血管事件的发生息息相关。现就TDF对血脂影响的研究进展作一综述,旨在为TDF的合理用药提供依据。

关键词：乙型肝炎病毒血脂人类免疫缺陷病毒富马酸替诺福韦二吡呋酯

乙型肝炎病毒相关肝癌中表观遗传学的调控机制与应用前景

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中华微生物学和免疫学杂志 2023年第11期43卷 868-873页

作者：李善唐霓重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400016

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是肝癌的主要危险因素之一,HBV相关肝癌是全球最常见的肝癌类型。表观遗传学改变在HBV相关肝癌的进展过程中发挥重要作用。本综述主要介绍了HBV相关肝癌的表观遗传学改变,包括异常的DNA甲基化... 详细信息

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是肝癌的主要危险因素之一,HBV相关肝癌是全球最常见的肝癌类型。表观遗传学改变在HBV相关肝癌的进展过程中发挥重要作用。本综述主要介绍了HBV相关肝癌的表观遗传学改变,包括异常的DNA甲基化、组蛋白修饰等。同时,本文还阐述了表观遗传学在HBV相关肝癌诊断、治疗和预后评估中的应用,以及对未来研究方向的展望。

关键词： HBV相关肝癌表观遗传学 DNA甲基化组蛋白修饰

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慢性乙型肝炎病毒感染与细胞免疫

中华微生物学和免疫学杂志 2023年第7期43卷 494-501页

作者：胡接力黄爱龙重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400016

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)的持续感染是机体未能有效建立HBV特异性免疫的结果,这种情形也可称为机体对HBV的免疫耐受。成人急性感染HBV时,绝大多数可以发生正常的特异性免疫应答,因而得以自愈。围产期感染HBV,绝大多数导致... 详细信息

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)的持续感染是机体未能有效建立HBV特异性免疫的结果,这种情形也可称为机体对HBV的免疫耐受。成人急性感染HBV时,绝大多数可以发生正常的特异性免疫应答,因而得以自愈。围产期感染HBV,绝大多数导致慢性化,提示存在HBV特异性免疫应答异常。典型的特异性免疫应答包括4个过程:抗原提呈、特异性CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞激活以及B细胞激活。慢性HBV感染时,机体的免疫应答异常必然涉及这4个过程的部分或者全部。本文主要讨论了慢性HBV感染与细胞免疫的关系,希望为进一步思考HBV特异性免疫重建路径与策略提供参考。

关键词：乙型肝炎病毒慢性感染免疫耐受细胞免疫

血管性血友病因子及VITRO评分评估HBV感染患者疾病进展的临床价值

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中华肝脏病杂志 2022年第3期30卷 309-315页

作者：关雅兰张大志杨轶轩万仁均唐璐琪曾维琼康娟重庆医科大学附属第二医院感染科重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400010 重庆医科大学病毒性肝炎研究所重庆400010

目的:探讨血管性血友病因子(vWF)及VITRO评分(vWF/血小板计数数值的比值)评估乙型肝炎病毒(HBV)感染患者疾病进展的临床价值。方法:随机收集重庆医科大学附属第二医院2018年12月1日—2021年1月5日308例HBV感染患者(包括154例慢性乙型肝... 详细信息

目的:探讨血管性血友病因子(vWF)及VITRO评分(vWF/血小板计数数值的比值)评估乙型肝炎病毒(HBV)感染患者疾病进展的临床价值。方法:随机收集重庆医科大学附属第二医院2018年12月1日—2021年1月5日308例HBV感染患者(包括154例慢性乙型肝炎、66例乙型肝炎肝硬化代偿期、88例乙型肝炎肝硬化失代偿期)的相关临床数据,vWF数值均采用统一的光学法测定,所有数据均使用统一标准纳入,并分析血浆vWF水平及VITRO评分在慢性乙型肝炎、乙型肝炎肝硬化代偿期及失代偿期各组中的差别及意义。结果:慢性乙型肝炎组的血浆vWF水平及VITRO评分数值分别为(139.47%±76.44%、0.86±0.8),乙型肝炎肝硬化代偿期组分别为(164.95%±67.12%和1.44±1.14)、乙型肝炎肝硬化失代偿期组分别为(317.48%±103.32%和6.81±4.98);血浆vWF水平及VITRO评分随HBV感染患者疾病进展而增高,差异有统计学意义(F值分别为133.669、137.598,P值均学意义(F值分别为60.236、32.854,P值均学意义(P学意义(P学意义(P感染患者肝脏疾病进展程度及肝硬化失代偿期程度,且对肝硬化失代偿后各种并发症有预测作用,对尽早作出干预措施有一定指导意义。

关键词：慢性乙型肝炎肝硬化血管性血友病因子 VITRO评分消化道出血

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乙型肝炎病毒感染调控细胞自噬的研究进展

中华微生物学和免疫学杂志 2023年第11期43卷 874-880页

作者：魏真李思慧李辰唐海欢林永重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400016

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染可导致慢性乙型肝炎、肝硬化和肝细胞癌等一系列严重肝脏疾病,目前仍是全球最严重的公共卫生问题之一。自噬是广泛存在于真核细胞内的一种非常保守的溶酶体依赖降解途径,也是宿主细胞固有免疫... 详细信息

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染可导致慢性乙型肝炎、肝硬化和肝细胞癌等一系列严重肝脏疾病,目前仍是全球最严重的公共卫生问题之一。自噬是广泛存在于真核细胞内的一种非常保守的溶酶体依赖降解途径,也是宿主细胞固有免疫应答的重要组成。HBV生命周期的多个过程(包含病毒复制、成熟和分泌)与细胞自噬密切相关。自噬能调控宿主肝细胞HBV复制、包装与分泌等过程,并参与固有免疫和适应性免疫应答清除HBV。HBV感染能够诱导肝细胞产生较强的自噬反应,并通过相关机制逃逸自噬性降解。本文全面总结近年来HBV感染诱导细胞自噬以及逃逸自噬性降解的最新研究进展,为深入了解HBV感染调控细胞自噬的具体机制以及开发抗HBV治疗新策略提供理论参考。

关键词：乙型肝炎病毒自噬自噬性降解固有免疫适应性免疫