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基于全基因组测序的耐多黏菌素和替加环素肺炎克雷伯菌特征研究

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中国抗生素杂志 2024年第6期49卷 700-704页

作者：周燕霞郭辉金华市人民医院检验科金华321000

目的分析1株多黏菌素和替加环素均耐药的肺炎克雷伯菌基因组特征。方法肺炎克雷伯菌KP2016分离自我院临床痰液标本。采用微量肉汤稀释法测定KP2016对亚胺培南、美罗培南、多黏菌素和替加环素的最低抑菌浓度。对菌株进行第二代Illumina... 详细信息

目的分析1株多黏菌素和替加环素均耐药的肺炎克雷伯菌基因组特征。方法肺炎克雷伯菌KP2016分离自我院临床痰液标本。采用微量肉汤稀释法测定KP2016对亚胺培南、美罗培南、多黏菌素和替加环素的最低抑菌浓度。对菌株进行第二代Illumina和第三代Oxford Nanopore全基因组测序。通过Unicycler对第二代和第三代序列进行混合拼接。通过ABRicate v0.8.13调用Resfinder数据库分析耐药基因。通过ISFinder分析移动元件。利用CGE(Center for Genomic Epidemiology)网站分析菌株的ST型和质粒复制子类型。利用Proksee对质粒结构进行可视化。结果KP2016菌株对多黏菌素和替加环素均耐药,MIC分别为512和16 mg/L。MLST分析显示KP2016属于ST656,携带多黏菌素耐药相关mcr-1和mcr-8基因和替加环素耐药相关tmexCD1-toprJ1基因簇。KP2016携带1个染色体和5个环形质粒,质粒大小3,991~275,345bp,GC含量44.35%~52.20%。mcr-1基因位于约44kb的质粒p1上,上下游环境为ISKpn26-mcr-1-pap2-ISApl1;mcr-8基因位于IncR/IncN型质粒p2上,遗传结构为ISEcl1-mcr-8-orf-ISKpn26;tmexCD1-toprJ1基因簇结构为IS26-tnfxB1-tmexC1-tmexcD1-toprJ1。此外,菌株还携带多黏菌素耐药相关的染色体介导的CrrB突变(L204V、V237I)。结论肺炎克雷伯菌KP2016多黏菌素耐药由mcr-1、mcr-8和crrB突变介导,替加环素耐药由tmexCD1-toprJ1基因簇介导。应加强合理监测,防止其在医疗机构中进一步传播。

关键词：肺炎克雷伯菌全基因组测序多黏菌素替加环素质粒结构

腹部CT、B超与磁共振胰胆管成像检查对肝外胆管结石的诊断效能比较

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中国民康医学 2024年第7期36卷 149-151,159页

作者：李益华新邵县人民医院影像科湖南邵阳422900

目的:比较腹部CT、B超与磁共振胰胆管成像检查对肝外胆管结石的诊断效能。方法:选取2021年5月至2022年5月该院收治的100例疑似肝外胆管结石患者进行前瞻性研究,均行腹部CT、B超和磁共振胰胆管成像检查,以经内镜逆行胰胆管造影结果为金标... 详细信息

目的:比较腹部CT、B超与磁共振胰胆管成像检查对肝外胆管结石的诊断效能。方法:选取2021年5月至2022年5月该院收治的100例疑似肝外胆管结石患者进行前瞻性研究,均行腹部CT、B超和磁共振胰胆管成像检查,以经内镜逆行胰胆管造影结果为金标准,统计3种检查方法诊断肝外胆管结石的结果,并比较其对肝外胆管结石的诊断效能、直径≤8 cm结石检出率和检查时间。结果:100例疑似肝外胆管结石患者中,经内镜逆行胰胆管造影检查结果显示,阳性91例,阴性9例;腹部CT检查结果显示,阳性88例,阴性12例;腹部B超检查结果显示,阳性83例,阴性17例;磁共振胰胆管成像检查结果显示,阳性90例,阴性10例;腹部CT、B超检查诊断肝外胆管结石的灵敏度、特异度和准确度比较,差异均无统计学意义(P>0.05);磁共振胰胆管成像检查诊断肝外胆管结石的灵敏度、特异度均高于腹部B超,准确度高于腹部CT、B超,差异有统计学意义(P<0.05);磁共振胰胆管成像检查对直径≤8 cm结石的检出率均高于腹部CT、B超,差异有统计学意义(P<0.05);磁共振胰胆管成像检查时间均长于腹部CT、B超,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:磁共振胰胆管成像检查对肝外胆管结石的诊断效能高于CT、B超,但检查时间相对较长。

关键词：肝外胆管结石磁共振胰胆管成像腹部CT 腹部B超检查诊断效能

Hsa_circ_0003928在糖尿病足溃疡中的表达及其与病情严重程度及预后的关系

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中国糖尿病杂志 2024年第2期32卷 108-112页

作者：王少娜王娇华吴毓斌苏永焕詹文丽海口市骨科与糖尿病医院检验科 570100 海口市人民医院检验科

目的探讨Hsa_circ_0003928在糖尿病足溃疡(DFU)中的表达及其与病情严重程度及预后的关系。方法选取2020年1月至2022年12月于我院内分泌科收治的DFU患者113例,按照感染严重程度分为1级19例(无感染)、2级40例(轻度感染)、3级20例(中度感... 详细信息

目的探讨Hsa_circ_0003928在糖尿病足溃疡(DFU)中的表达及其与病情严重程度及预后的关系。方法选取2020年1月至2022年12月于我院内分泌科收治的DFU患者113例,按照感染严重程度分为1级19例(无感染)、2级40例(轻度感染)、3级20例(中度感染)及4级34例(重度感染)。根据DFU患者预后情况分为预后良好组(GP,n=63)和预后不良组(PP,n=50)。比较各组基线资料及IL-6、C-RP、Hsa_circ_0003928。Logistic回归分析DFU患者预后不良的影响因素。受试者工作特征(ROC)曲线分析Hsa_circ_0003928、C-RP及IL-6预测DFU患者预后不良的价值。结果PP组DFU病程、感染程度3~4级、血肌酐、BUN、血尿酸、C-RP、IL-6及Hsa_circ_0003928高于GP组(P<0.05或P<0.01)。3~4级DFU患者Hsa_circ_0003928表达高于1~2级(P<0.01)。Logistic回归分析显示,DFU病程长、感染程度3~4级以及BUN、C-RP、IL-6、Hsa_circ_0003928升高是DFU患者预后不良的影响因素。ROC曲线分析显示,Hsa_circ_0003928预测DFU患者预后不良的曲线下面积最大(0.882,95%CI 0.819~0.942),敏感度为87.5%,特异度为85.6%。结论 Hsa_circ_0003928升高与DFU患者病情严重程度及预后不良相关,对DFU患者预后不良有较好的预测价值。

关键词：糖尿病足溃疡 Hsa_circ_0003928 病情严重程度预后

血清PCT、AngⅡ表达对老年脓毒症患者并发弥散性血管内凝血的预测价值

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中国老年学杂志 2024年第20期 4956-4960页

作者：余杏陈丽旧周丹霞蔡丽云海口市人民医院检验科

目的探讨血清降钙素原(PCT)、血管紧张素(Ang)Ⅱ对老年脓毒症患者并发弥散性血管内凝血(DIC)的预测价值。方法选取120例老年脓毒症患者，统计入院7 d内并发DIC情况，并将入院7 d内并发DIC的患者纳入DIC组，未并发DIC患者纳入非DIC组... 详细信息

目的探讨血清降钙素原(PCT)、血管紧张素(Ang)Ⅱ对老年脓毒症患者并发弥散性血管内凝血(DIC)的预测价值。方法选取120例老年脓毒症患者，统计入院7 d内并发DIC情况，并将入院7 d内并发DIC的患者纳入DIC组，未并发DIC患者纳入非DIC组。对比治疗前、治疗后3 d老年脓毒症患者、不同基线资料老年脓毒症患者血清PCT、AngⅡ水平；对比DIC组与非DIC组血清PCT、AngⅡ水平；分析血清PCT、AngⅡ水平与老年脓毒症并发DIC的相关性；探讨血清PCT、AngⅡ水平对老年脓毒症并发DIC的预测价值。结果治疗3 d时老年脓毒症患者血清PCT、AngⅡ水平低于治疗前，差异有统计学意义(P0.05)。120例老年脓毒症患者中有47例(39.17%)并发DIC。DIC组急性生理学和慢性健康状况评估(APACHE)Ⅱ评分及血清PCT、AngⅡ水平显著高于非DIC组(P<0.001)。经点二列相关性分析提示，血清PCT、AngⅡ水平与老年脓毒症并发DIC有关(P<0.001)。绘制受试者工作特征(ROC)曲线结果显示，血清PCT、AngⅡ水平单独及联合预测年脓毒症并发DIC的曲线下面积(AUC)分别为0.753、0.746、0.825,联合预测的价值最高。结论血清PCT、AngⅡ预测老年脓毒症患者并发DIC价值较高，血清PCT、AngⅡ高表达可增加患者并发DIC的风险。

关键词：脓毒症弥散性血管内凝血降钙素原血管紧张素Ⅱ 急性生理学和慢性健康状况评估Ⅱ

血清PTX3、CK-MB水平对慢性失代偿心力衰竭患者容量负荷的评估价值

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中国医师杂志 2024年第1期26卷 87-92页

作者：曹明善王春娣胡小倩孟令慧武瑜丰刘欢杨华邢台市中心医院检验科邢台054000 临西县人民医院心内科临西054900 邢台市人民医院检验科邢台054031

目的探讨血清正五聚蛋白3(PTX3)、肌酸激酶同工酶MB(CK-MB)水平对慢性失代偿心力衰竭(CDHF)患者容量负荷的评估价值。方法选取2019年7月至2022年7月于邢台市中心医院就诊的300例CDHF患者,根据患者容量平衡水平将其分为容量负荷过载组(n=... 详细信息

目的探讨血清正五聚蛋白3(PTX3)、肌酸激酶同工酶MB(CK-MB)水平对慢性失代偿心力衰竭(CDHF)患者容量负荷的评估价值。方法选取2019年7月至2022年7月于邢台市中心医院就诊的300例CDHF患者,根据患者容量平衡水平将其分为容量负荷过载组(n=182)和非容量负荷过载组(n=118)。对比分析两组临床资料,利用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清PTX3、CK-MB水平对CDHF患者容量负荷的评估价值,利用单因素分析两组患者的临床疾病特征,采用logistic回归分析CDHF患者容量负荷的影响因素,构建列线图模型并验证。结果容量负荷过载组患者BMI、腰围、收缩压、舒张压、空腹血糖(FBG)、糖化血红蛋白(HbA1c)、C反应蛋白(CRP)、尿酸(UA)、胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)均高于非容量负荷过载组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。容量负荷过载组患者的PTX3、CK-MB、肺毛细血管楔压(PCWP)、CVP水平高于非容量负荷过载组,清蛋白、血红蛋白、红细胞比容低于非容量负荷过载组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。ROC曲线显示,PTX3、CK-MB预测CDHF患者容量负荷过载的曲线下面积(AUC)为0.795、0.718,灵敏度分别为86.2%、83.7%,特异度分别为65.4%、68.6%,预测准确性较高;两项联合预测的AUC为0.817、灵敏度为92.5%、特异度为70.6%,预测准确性高于PTX3(Z=3.812,P<0.05)和CK-MB(Z=3.365,P<0.05)。PTX3、CK-MB、清蛋白、血红蛋白、红细胞比容、PCWP、中心静脉压(CVP)均为CDHF患者的容量负荷状态的影响因素(均P<0.05),据此建立的列线图风险预测模型在临床治疗上有着高准确性和强适用性。结论血清PTX3、CK-MB水平为CDHF患者发生容量过载的影响因素,联合清蛋白、血红蛋白、红细胞比容、PCWP、CVP等指标构建的列线图模型对CDHF的容量负荷状态具有较高的预测价值。

关键词：心力衰竭正五聚蛋白3 肌酸激酶,MB型容量负荷

结核分枝杆菌特异性IFN-γ、IL-2联合检测在肺结核与细菌性肺炎鉴别诊断中的应用

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中国感染控制杂志 2024年第9期23卷 1173-1177页

作者：许静王伟李团团阜阳市人民医院检验科安徽阜阳236000 阜阳市第二人民医院检验科安徽阜阳236000

目的评价结核分枝杆菌特异性细胞因子干扰素-γ(IFN-γ)、白细胞介素-2(IL-2)双因子联合检测在肺结核与细菌性肺炎鉴别诊断中的应用价值。方法选择阜阳市人民医院2022年1月-2023年10月呼吸科住院患者91例,明确诊断为肺结核患者45例(肺... 详细信息

目的评价结核分枝杆菌特异性细胞因子干扰素-γ(IFN-γ)、白细胞介素-2(IL-2)双因子联合检测在肺结核与细菌性肺炎鉴别诊断中的应用价值。方法选择阜阳市人民医院2022年1月-2023年10月呼吸科住院患者91例,明确诊断为肺结核患者45例(肺结核组)和细菌性肺炎患者46例(肺炎组),均进行双因子联合检测,比对分析双因子联合检测与C反应蛋白(CRP)对肺结核和细菌性肺炎鉴别诊断的效果。结果使用双因子联合检测对肺结核与细菌性肺炎进行鉴别诊断,灵敏度为86.7%、特异度为84.8%,受试者工作特征曲线下面积(AUC)值为0.928(95%CI:0.870~0.986),与CRP的鉴别诊断效果相比差异有统计学意义(P<0.05)。结论结核分枝杆菌特异性细胞因子IFN-γ、IL-2联合检测在鉴别肺结核与细菌性肺炎时具有较高的应用价值,能为临床肺结核和细菌性肺炎的鉴别诊断提供依据。

关键词：肺结核细菌性肺炎 IFN-γ IL-2 联合检测鉴别诊断

miR-214-3p调控FOXM1在子宫内膜样腺癌迁移、侵袭中的作用

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中国老年学杂志 2024年第17期 4291-4296页

作者：张红康朋朋种肖宇胡景玉张长庚衡水市人民医院检验科衡水市人民医院病理科

目的探究子宫内膜样腺癌侵袭、迁移作用的调控机制。方法选取子宫内膜样腺癌细胞HEC-1-A、AN3-CA及人类子宫内膜正常上皮细胞CP-H058为研究细胞，分为对照组、模型组、mimic-NC组、mimic-miR组、mimic-miR+oe-NC组、mimic-miR+oe-FOXM... 详细信息

目的探究子宫内膜样腺癌侵袭、迁移作用的调控机制。方法选取子宫内膜样腺癌细胞HEC-1-A、AN3-CA及人类子宫内膜正常上皮细胞CP-H058为研究细胞，分为对照组、模型组、mimic-NC组、mimic-miR组、mimic-miR+oe-NC组、mimic-miR+oe-FOXM1组。采用实时荧光定量-聚合酶链反应(RT-qPCR)检测正常人子宫内膜上皮细胞和子宫内膜样腺癌细胞中miR-214-3p的差异表达，构建miR-214-3p mimic转染至子宫内膜样腺癌细胞并使用RT-qPCR验证其转染效率。通过噻唑蓝(MTT)法、流式细胞术、Transwell实验分别检测细胞活力、凋亡、迁移和侵袭能力，通过Western印迹检测叉头盒蛋白(FOX)M1蛋白表达水平。利用生物信息学预测网站预测miR-214-3p的靶基因FOXM1,采取双荧光素酶精准靶点验证实验。miR-214-3p mimic和pcDNA3.1-FOXM1共同转染至子宫内膜样腺癌细胞中验证miR-214-3p通过调控靶基因FOXM1对子宫内膜样腺癌进展产生抑制作用。结果 miR-214-3p在子宫内膜样腺癌细胞中明显低表达(P<0.05);在子宫内膜样腺癌细胞中过表达miR-214-3p明显抑制细胞活力、迁移、侵袭，明显促进细胞凋亡(P<0.05);miR-214-3p靶向负调控FOXM1,高表达miR-214-3p和高表达FOXM1联合处理子宫内膜样腺癌细胞部分逆转了以上细胞行为。结论 miR-214-3p介导FOXM1抑制子宫内膜样腺癌侵袭、转移。

关键词：子宫内膜样腺癌 miR-214-3p 叉头盒蛋白(FOX)M1 凋亡细胞活力迁移侵袭

AML化疗期间不同时间点流式细胞术MRD检测对预后的影响

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中国实验血液学杂志 2024年第4期32卷 1051-1057页

作者：居瑞雪孙凤强王育慧潍坊市人民医院检验科山东潍坊261041

目的:探讨AML化疗期间不同时间点流式细胞术微小残留病(MRD)检测对预后的影响。方法:回顾性分析2018年3月到2022年3月确诊并规范化疗的130例成人原发AML患者,用流式细胞术检测MRD,Kaplan-Meier曲线进行生存分析,log-rank检验进行差异性... 详细信息

目的:探讨AML化疗期间不同时间点流式细胞术微小残留病(MRD)检测对预后的影响。方法:回顾性分析2018年3月到2022年3月确诊并规范化疗的130例成人原发AML患者,用流式细胞术检测MRD,Kaplan-Meier曲线进行生存分析,log-rank检验进行差异性分析,Cox比例风险回归模型进行影响患者生存的单因素和多因素分析。竞争风险模型进行影响患者累计复发率(CIR)的分析,Fine-Gray进行差异性分析。结果:130例患者中,CR181例,CR226例,PR 14例,NR 9例。CR1组OS高于CR2、PR、NR组。CR2组OS高于PR组,但与NR组比较无统计学差异;PR组OS与NR组比较无统计学差异。CR1和CR2的107例患者根据流式细胞术检测的MRD分组,第一次诱导化疗后MRD~-和MRD~+组患者的4年预期RFS率分别为65.3%和27.9%,4年预期OS率分别为58.7%和41.4%,4年预计CIR率分别为34.7%和69.7%,2组比较差异均有统计学意义(χ^(2)=6.639,P=0.010;χ^(2)=6.131,P=0.013;χ^(2)=6.637,P=0.010);第二次化疗后MRD~-和MRD~+组患者的4年预期RFS率分别为50.8%和37.9%,4年预期OS率分别为49.2%和44.5%,4年预计CIR率分别为49.2%和59.5%,2组比较差异均无统计学意义(χ^(2)=1.475,P=0.225;χ^(2)=2.432,P=0.119;χ^(2)=1.416,P=0.234);巩固治疗期间MRD~-和MRD~+组患者的4年预期RFS率分别为51.9%和29.6%,4年预期OS率分别为67.5%和24.6%,4年预计CIR率分别为48.1%和70.4%,2组比较差异均有统计学意义(χ^(2)=20.982,P<0.001;χ^(2)=17.794,P<0.001;χ^(2)=19.879,P<0.001);3个时间点MRD均为阴性和任一时间点为阳性患者的4年预期RFS率分别为69.9%和33.3%,4年预期OS率分别为59.1%和44.7%,4年预计CIR率分别为30.1%和65.1%,2组比较差异均有统计学意义(χ^(2)=7.367,P=0.007;χ^(2)=6.042,P=0.014;χ^(2)=7.662,P=0.006)。单因素分析结果显示,染色体高危核型是影响患者RFS和OS的不利因素,诱导化疗2个疗程达CR、第一次诱导化疗后MRD~-和第二次化疗MRD~-是患者RFS和OS的保护因素;巩固治疗期间MRD~-和3个时间点MRD~-是患者RFS、OS和CIR的保护因素。多因素分析结果显示,诱导化疗2个疗程达CR是患者RFS和CIR的保护因素,巩固治疗期间MRD~-是RFS、OS和CIR的保护因素。结论:成人AML患者早期获得CR和MRD~-,特别是巩固治疗期间的MRD~-是预后良好的标志,流式细胞术是AML患者MRD检测最常用的方法。

关键词：急性髓系白血病成人化疗微小残留病预后

海南省类鼻疽伯克霍尔德菌临床分离株的基因岛特征和毒力因子分析

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中国人兽共患病学报 2024年第4期40卷 359-368,390页

作者：符晓莹李欢李沙王立程王崇圳黎元莉陈海朱雄三亚市人民医院检验科三亚572000

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)临床分离株的基因岛(genomic island,GI)特征和毒力因子差异,为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集***临床分离株,PCR检测和测序分析毒力相关GI,在Islandviewr 4平台上提交全... 详细信息

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)临床分离株的基因岛(genomic island,GI)特征和毒力因子差异,为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集***临床分离株,PCR检测和测序分析毒力相关GI,在Islandviewr 4平台上提交全基因组序列注释格式文件,整合SIGI-HMM与IslandPath-DIMOB两种算法预测GI,通过序列比对分析GI独特性和毒力因子差异。结果共收集到52株***临床分离株,结果显示,52个基因组按进化距离分为3个分枝,其中82.69%(43/52)菌株集中在分枝1。52个***基因组共识别出828个GI,按序列相似性聚类为157个GI cluster。GI在基因组中占比达2.05%~6.38%。GI cluster1和2存在全部菌株中,但84个(53.50%)GI cluster只聚类到单个基因组。10个GI cluster很可能是特有的,其中5个来源同属细菌,2个来源其他属,3个来源不确定。25个GI cluster与毒力相关,*** BP76和BP169含有其中8个,是所有菌株中毒力相关GI最多的。52株***的毒力基因除了fhaB1、fhaB2、BPSL1661、cheY1、wzM、tssH-5/clpV、tssA-5、boaA和boaB存在差异,其余都表现一致。与泰国和澳大利亚***临床菌株比较,boaA、boaB、cheY1和chbp在两个国家的菌株中都表现出差异,同时fhaB1、fhaB3和bimA在澳大利亚菌株中表现出差异。结论海南地区*** GI具有保守性和独特性,通过特有GI和毒力因子研究,可以发现菌株水平基因转移(Horizontal gene transfer,HGT)的来源和分子水平的毒力差异。

关键词：类鼻疽伯克霍尔德菌基因组基因岛毒力因子水平基因转移