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环介导等温扩增技术在病原微生物临床检测中的应用

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检验医学与临床 2024年第7期21卷 1003-1007,1024页

作者：廖川梁丽娜黄少宇马梦霞李雪斌(综述) 韦贵将(审校) 右江民族医学院附属医院医学检验中心/广西高校高发病临床分子诊断研究重点实验室/百色市高发病临床分子诊断与研发重点实验室广西百色533000 广西壮族自治区田东县人民医院医学检验科广西百色533000 右江民族医学院医学检验学院广西百色533000 右江民族医学院附属医院神经内科广西百色533000

病原微生物是威胁人类健康的重要因素之一,快速、准确的检测方法对于感染性疾病的诊断具有重要意义。环介导等温扩增(LAMP)是一种恒温扩增方法,具有反应时间短、操作简便、灵敏度高、特异度高、检测成本低等优点,因此被广泛应用于感染... 详细信息

病原微生物是威胁人类健康的重要因素之一,快速、准确的检测方法对于感染性疾病的诊断具有重要意义。环介导等温扩增(LAMP)是一种恒温扩增方法,具有反应时间短、操作简便、灵敏度高、特异度高、检测成本低等优点,因此被广泛应用于感染性疾病的快速诊断。基于这种情况,该文主要阐述了LAMP的原理、特点及其在临床常见病原微生物检测方面的应用与研究进展。LAMP技术现在已经被应用于病原微生物的检测,且具有较高的灵敏度及特异度,但该技术仍有易产生假阳性、引物设计复杂等不足之处。该文综述了近年来LAMP技术在病原微生物感染中的应用与进展,并对其未来的发展前景进行了展望,以期在资源有限的环境中为病原微生物感染的快速诊断提供合理的研究方向。

关键词：环介导等温扩增技术核酸检测病原微生物核酸扩增结核分枝杆菌

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桥接基因型与表型的功能性精准肿瘤学

科学通报 2024年

作者：吴先国朱永良黄建浙江大学医学院附属第二医院乳腺外科浙江大学医学院附属第二医院检验科浙江大学医学院附属第二医院消化实验室浙江省肿瘤免疫诊断与治疗新技术创新国际合作基地浙江省肿瘤微环境与免疫治疗重点实验室

基于基因组学的精准肿瘤学为肿瘤诊治带来了革命性的进步,然而因此获益的人群却非常有限,究其原因是大多数肿瘤为多基因性疾病,其基因组稳定性的改变可导致产生大量复杂的遗传学易损性和非遗传学易损性.这些肿瘤易损性具有多样性、动态... 详细信息

基于基因组学的精准肿瘤学为肿瘤诊治带来了革命性的进步,然而因此获益的人群却非常有限,究其原因是大多数肿瘤为多基因性疾病,其基因组稳定性的改变可导致产生大量复杂的遗传学易损性和非遗传学易损性.这些肿瘤易损性具有多样性、动态化、连续性特征,可造成肿瘤基因型与表型间不匹配,表现为随时空进化的肿瘤异质性和肿瘤微环境异质性,并引起不同层级的肿瘤生态位动态重构.目前基于精准肿瘤学的干预措施无法应对这些复杂的异质性场景,也无法捕捉随时空改变的肿瘤易损性,因此,除了了解基因组学研究中发现的各种肿瘤基因突变所引发的功能改变、寻找突变基因型与肿瘤功能表型间的联系及其参与肿瘤发生、发展的规律,更亟需新的复合性方案来弥补精准肿瘤学的不足,以帮助指导临床实践.不同于基于基因组的精准肿瘤学,功能性精准肿瘤学基于患者来源、高保真肿瘤原始特征的可视化模型,可复现肿瘤细胞与肿瘤微环境互作的真实场景,对肿瘤易损性进行功能性分析,且可不依赖基因组信息,桥接肿瘤基因型与表型,弥合了基因型和表型之间的差距,助力精准医学实现给正确的患者匹配正确治疗的目标.

关键词：精准肿瘤学功能性精准肿瘤学肿瘤易损性驱动突变异质性

中国多中心侵袭性感染毛孢子菌的抗真菌药物敏感性

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中国真菌学杂志 2024年第3期19卷 250-256页

作者：于淑颖张丽徐英春郭莉娜中国医学科学院北京协和医院检验科疑难重症及罕见病国家重点实验室北京100730 侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室北京100730

目的本研究旨在调查中国多中心侵袭性感染毛孢子菌的抗真菌药物敏感性分布特征。方法选取2009年8月—2016年7月CHIF-NET监测网43个监测中心收集的133株侵袭性感染毛孢子菌。利用基因测序分析实现菌种的准确鉴定和基因分型,按照美国临床... 详细信息

目的本研究旨在调查中国多中心侵袭性感染毛孢子菌的抗真菌药物敏感性分布特征。方法选取2009年8月—2016年7月CHIF-NET监测网43个监测中心收集的133株侵袭性感染毛孢子菌。利用基因测序分析实现菌种的准确鉴定和基因分型,按照美国临床和实验室标准协会(CLSI)推荐的微量肉汤稀释法检测菌株的体外抗真菌药物敏感性。结果中国多中心侵袭性毛孢子菌感染中,共分离到10个菌种,阿萨希毛孢子菌是主要的致病菌(108/133株),血液是最常见的标本类型(36.8%)。利用IGS1序列,将108株阿萨希毛孢子菌分为5个型别,基因型1型(41.7%)、4型(31.5%)和3型(23.1%)是我国主要的基因型。体外药物敏感性结果显示,阿萨希毛孢子菌对两性霉素B的MIC值的总体分布高于非阿萨希毛孢子菌,GM值分别是1.36μg/mL和0.7μg/mL。47.2%的阿萨希毛孢子菌(51/108株)对两性霉素B的MIC值≥2μg/mL,而全部非阿萨希毛孢子菌(25株)对两性霉素B的MIC值小于1μg/mL。25%的阿萨希毛孢子菌(27/108株)、2株***、1株星形毛孢子菌、1株黏质毛孢子菌和1株***对氟康唑呈现较高的MIC值(≥8μg/mL)。伏立康唑对毛孢子菌呈现出最有效的体外抗真菌活性,GM值为0.09μg/mL。我国阿萨希毛孢子菌对氟康唑、伏立康唑、伊曲康唑和泊沙康唑的ECV值分别采用16μg/mL、0.25μg/mL、1μg/mL和1μg/mL,而对两性霉素B和5-氟胞嘧啶的ECV值均采用4μg/mL。结论本研究系统调查了抗真菌药物敏感性分布情况,并试验性建立了我国阿萨希毛孢子菌的流行病学折点。

关键词：毛孢子菌药物敏感性分子分型流行病学折点

以ETV6/RUNX1探针为例探讨FISH性能验证方法

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中华血液学杂志 2024年第1期45卷 48-53页

作者：肖静郑迎春赵佳炜崔成华王慧君孙琦马娇马跃申宋振肖志坚李承文中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所) 血液与健康全国重点实验室国家血液系统疾病临床医学研究中心细胞生态海河实验室天津300020 天津医学健康研究院天津301600

目的探讨FISH探针应用于临床检测前的规范化性能验证。方法选取20名正常供者检测后剩余的骨髓样本进行间期细胞和中期分裂象FISH杂交,分析ETV6/RUNX1探针的灵敏度和特异性。采用反β函数建立该探针的阈值体系,并制定判读标准。最后以PC... 详细信息

目的探讨FISH探针应用于临床检测前的规范化性能验证。方法选取20名正常供者检测后剩余的骨髓样本进行间期细胞和中期分裂象FISH杂交,分析ETV6/RUNX1探针的灵敏度和特异性。采用反β函数建立该探针的阈值体系,并制定判读标准。最后以PCR检测为对照组,对286例中国医学科学院血液病医院患者骨髓样本进行平行对照研究,分析ETV6/RUNX1探针FISH检测的临床敏感性、特异性、诊断符合率,并采用Kappa检验分析两种方法诊断一致性。结果ETV6/RUNX1探针灵敏度为98.47%,特异性为100%。计数50、100和200个细胞时经典阳性信号阈值分别为5.81%、2.95%和1.49%,非经典阳性信号阈值分别为13.98%、9.75%和6.26%。FISH检测临床敏感性为96.1%,特异性为99.6%,诊断符合率为99.00%,诊断一致性检验Kappa值为0.964,P值实验室自建方法验证标准进行探针的规范化性能验证和方法学性能确认,以保证为临床诊疗提供可靠、精准的参考依据。

关键词：荧光原位杂交灵敏度特异性诊断符合率实验室自建方法

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延安地区白念珠菌的临床分布及其耐药性分析

中国真菌学杂志 2024年第2期19卷 117-121页

作者：封小川郑莹莹元航张欠欠延安大学医学院延安716000 延安市人民医院延安716000 延安市病原微生物检验与分子诊断重点实验室延安716000 延安大学附属医院延安716000

目的分析延安地区白念珠菌的临床分布特征及其耐药情况,为临床诊治和医院感染的监控提供依据。方法回顾性分析2012年1月—2021年12月临床分离出白念珠菌患者的临床资料,对性别、年龄、标本类型、科室分布及其危险因素以及抗真菌药物敏... 详细信息

目的分析延安地区白念珠菌的临床分布特征及其耐药情况,为临床诊治和医院感染的监控提供依据。方法回顾性分析2012年1月—2021年12月临床分离出白念珠菌患者的临床资料,对性别、年龄、标本类型、科室分布及其危险因素以及抗真菌药物敏感性等进行分析。结果本地区白念珠菌占念珠菌的73.48%,60岁以上患者占62.38%;临床标本类型以痰液为主(608例,58.34%),其次尿液标本(106例,10.17%);患者主要来自呼吸内科(370例,35.51%),其次ICU病房(200例,19.19%)和儿科(132例,12.67%);导致分离出白念珠菌的主要危险因素为患者年龄≥60岁、广谱抗生素使用、侵入性操作等;临床白念珠菌对氟康唑耐药率最高(11.71%)。结论白念珠菌是延安地区念珠菌属的主要分离菌株,以呼吸内科和老年患者为主,并对氟康唑的耐药性表现较为严重。白念珠菌感染的临床分布及耐药性分析对于临床用药策略有指导意义。

关键词：白念珠菌临床分布耐药性回顾性分析

民族地区医学检验技术本科教育与创新创业教育融合的实践研究

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科学咨询(科技·管理) 2024年第8期 144-147页

作者：覃海媚杨正合赵小阳黄章花邢志勇陈祥凤宗子傲王荣右江民族医学院附属医院广西高校桂西高发病临床分子诊断研究重点实验室右江民族医学院医学检验学院右江民族医学院生物医药大健康与现代产业学院

创新创业教育融入医学检验技术本科教育是新时代下院校内涵发展的必然要求，是医学检验技术专业毕业生提高就业率的重要保障。创新创业教育融入民族地区医学检验技术本科教育，是民族地区实现医疗技术创新的迫切需要，是区域特色环境疾... 详细信息

创新创业教育融入医学检验技术本科教育是新时代下院校内涵发展的必然要求，是医学检验技术专业毕业生提高就业率的重要保障。创新创业教育融入民族地区医学检验技术本科教育，是民族地区实现医疗技术创新的迫切需要，是区域特色环境疾病与方案解决的定势趋向。针对目前学生实践能力缺乏、思维定式化、民族地区医疗诊断行业发展区域性等问题，本文从课堂内容、教学模式、师资强化等三个方面探索创新创业教育下的应用型医学检验技术本科人才培养模式，以满足具有强适应力、高技术力、新创造力的人才质量需求。

关键词：民族地区医学检验技术本科教育创新创业教育

三方基序蛋白13的生物学特征和功能及与疾病发生的关系

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生物化学与生物物理进展 2024年

作者：姜淼蒋丽娜董玥宏姚咏明赵自刚牛春雨河北医科大学基础医学院河北北方学院基础医学院/微循环研究所河北北方学院医学检验学院免疫教研室河北省急危重症发病机制及干预重点实验室解放军总医院医学创新研究部转化医学研究中心

三方基序蛋白（tripartite motif containing， TRIM）13具备一个独特的跨膜结构域，锚定在内质网，通过调节泛素化途径影响诸多关键信号通路，对于调节内质网功能以及免疫反应、代谢紊乱、炎症疾病和肿瘤抑制，具有重要作用。本文综述T... 详细信息

三方基序蛋白（tripartite motif containing， TRIM）13具备一个独特的跨膜结构域，锚定在内质网，通过调节泛素化途径影响诸多关键信号通路，对于调节内质网功能以及免疫反应、代谢紊乱、炎症疾病和肿瘤抑制，具有重要作用。本文综述TRIM13蛋白结构和功能，特别是在内质网自噬、炎症反应和肿瘤抑制中的作用及其在多种疾病中的潜在意义，期望深化对TRIM13蛋白及其在相关疾病发生过程中调控机制的认识，为疾病诊断和治疗提供新的靶点。

关键词：三方基序蛋白13 泛素化内质网自噬免疫调控

结核分枝杆菌GroES蛋白表达、纯化及其生物信息学分析

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齐齐哈尔医学院学报 2024年第4期45卷 306-313页

作者：郭方正魏婧宋亚敏袁美丽王楚彤李柏青汪洪涛许涛蚌埠医学院检验医学院检验医学实验中心慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室安徽蚌埠233000 蚌埠医学院检验医学院免疫学教研室安徽蚌埠233000 蚌埠医学院检验医学院临床检验诊断学教研室安徽蚌埠233000

目的将结核分枝杆菌H37Ra株GroES蛋白进行原核表达与纯化,并对其进行生物信息学分析。方法通过PCR扩增GroES基因并克隆至pET28a中,测序鉴定后将pET28a-GroES转化至大肠杆菌BL21(DE3)中,IPTG诱导GroES蛋白表达,SDS-PAGE分析表达产物,... 详细信息

目的将结核分枝杆菌H37Ra株GroES蛋白进行原核表达与纯化,并对其进行生物信息学分析。方法通过PCR扩增GroES基因并克隆至pET28a中,测序鉴定后将pET28a-GroES转化至大肠杆菌BL21(DE3)中,IPTG诱导GroES蛋白表达,SDS-PAGE分析表达产物,镍亲和层析柱纯化重组GroES蛋白,Western blot鉴定GroES的免疫反应性。应用ORF Finder、ProtParam、TMHMM Server 2.0、NetPhos 3.1 Server、NetNGlyc1.0 Server、SignalP 4.1 Server、BLAST、Softberry、PSORT、Vaxijen、SOPMA、SWISS-MODE、ABC-pred、IEDB、SYFPEITHI、STRING工具对GroES的结构和功能进行生物信息学预测。结果成功构建重组pET28a-GroES重组体,用ITPG诱导后GroES在大肠杆菌以可溶性形式表达,纯化后GroES纯度达90%,Western blot证实GroES具有免疫反应性。生物信息学显示GroES蛋白由100个氨基酸组成,分子式为C478H776N124O147S1,等电点为4.62,为亲水性蛋白,有9个磷酸化位点,无跨膜区及信号肽序列,其编码基因MRA-3458全长303bp,含1个开放阅读框;GroES二级结构中,α-螺旋占5%,β-折叠占37%,β-转角占8%,无规则卷曲占50%;预测GroES具有多种与之相互作用的蛋白质和潜在的T、B细胞表位。结论成功表达和纯化具有免疫反应性的重组GroES蛋白,并预测了GroES结构与功能,提示GroES可作为制备结核疫苗或药物的候选蛋白,为更深入理解结核分枝杆菌的感染免疫机制奠定基础。

关键词：结核分枝杆菌 GroES 基因重组生物信息学

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γδ T细胞在结核免疫中的作用

生命的化学 2024年第3期44卷 431-440页

作者：宋亚敏魏婧郭方正李柏青汪洪涛许涛蚌埠医学院检验医学院检验医学实验中心蚌埠233030 蚌埠医学院慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室蚌埠233030 蚌埠医学院检验医学院免疫学教研室蚌埠233030 蚌埠医学院检验医学院临床检验诊断学教研室蚌埠233030

T细胞是执行固有免疫功能的T细胞,其T细胞表面受体(T cell receptor,TCR)由γ和δ链组成,连接固有免疫和适应性免疫。γδ T细胞不依赖主要组织相容性复合物(major histocompatibility complex,MHC),不需抗原提呈细胞(antigen-presentin... 详细信息

T细胞是执行固有免疫功能的T细胞,其T细胞表面受体(T cell receptor,TCR)由γ和δ链组成,连接固有免疫和适应性免疫。γδ T细胞不依赖主要组织相容性复合物(major histocompatibility complex,MHC),不需抗原提呈细胞(antigen-presenting cells,APC)的提呈,直接识别并结合抗原分子。γδ T细胞在结核免疫中发挥重要作用。本文就γδ T细胞免疫功能及其在抗结核免疫中的作用进行综述,旨在为γδ T细胞抗结核细胞免疫治疗与疫苗开发等提供新的思路。

关键词： γδT细胞结核病抗菌免疫治疗方法