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不同恢复年限刺槐林林下草本层的物种多样性

浙江农林大学学报 2024年

作者：南国卫王静慧秦淑莹韩磊何馨雨延安大学生命科学学院延安大学陕西省区域生物资源保育与利用工程技术研究中心

【目的】研究黄土高原丘陵沟壑区不同恢复年限刺槐Robinia pseudoacacia林林下草本植物的物种组成及多样性指标，探讨不同恢复年限刺槐林林下草本物种多样性的变化特征及主要影响因素，以期为区域植被恢复实践提供参考。【方法】采用空... 详细信息

【目的】研究黄土高原丘陵沟壑区不同恢复年限刺槐Robinia pseudoacacia林林下草本植物的物种组成及多样性指标，探讨不同恢复年限刺槐林林下草本物种多样性的变化特征及主要影响因素，以期为区域植被恢复实践提供参考。【方法】采用空间替代时间的方法，以陕西省子长市不同恢复年限(7、12、22、45 a)的刺槐林为研究对象，通过样地调查法对不同恢复年限刺槐林林下草本层的物种组成进行调查，采用冗余分析(RDA)对草本层物种多样性指数的主要影响因素进行分析。【结果】(1)不同恢复年限刺槐的草本植物共有55种，分属18科，优势种主要为菊科Asteraceae、禾本科Graminae和豆科Leguminosae植物，整体表现为多数优势种属于少数科，而少数弱势种属于多数科的特征。北艾Artemisia vulgaris、青蒿A. caruifolia、铁杆蒿A. gmehinii等蒿类植物具有较高的重要值。(2)刺槐林林下草本植物的地上生物量随年限的增加而增加，恢复年限显著增加了刺槐林林下草本层的地上生产力(P生物量的主要影响因素。而土壤全氮、土壤全磷、土壤铵态氮、土壤粉粒则是影响Shannon-Wiener指数和Pielou指数的主要因素。【结论】刺槐林林下草本层在不同恢复年限表现出不同的物种多样性特征。蒿类植物在各个恢复年限均表现出极强的适应能力。物种多样性指标和生物量均受到土壤水分和养分的重要影响。因此，在黄土高原地区未来的造林实践中要注重土壤水分和养分的平衡，增强人工林生态系统发展的稳定性和可持续性。图2表2参31

关键词：不同恢复年限林下草本层物种多样性地上生物量影响因素

嗜酸氧化亚铁硫杆菌作用下含黄铁矿废石的生物溶解和动力学

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Transactions of Nonferrous Metals Society of China 2024年第7期34卷 2342-2353页

作者：洪茂鑫王军杨宝军刘洋廖甤于世超刘仕统汤安妮王炜邱冠周中南大学资源加工与生物工程学院长沙410083 中南大学生物冶金教育部重点实验室长沙410083 生态环境部华南环境科学研究所广州510655

使用生物淋洗处理黄铁矿废石,从源头上缓解其产生酸性矿山废水(AMD)的风险。生物淋洗结果显示,在嗜酸氧化亚铁硫杆菌(***)的作用下,40天内可以从黄铁矿废石中去除近82%的铁和硫。动力学研究结果表明,废石中黄铁矿的去除主要受化学反应... 详细信息

使用生物淋洗处理黄铁矿废石,从源头上缓解其产生酸性矿山废水(AMD)的风险。生物淋洗结果显示,在嗜酸氧化亚铁硫杆菌(***)的作用下,40天内可以从黄铁矿废石中去除近82%的铁和硫。动力学研究结果表明,废石中黄铁矿的去除主要受化学反应和内扩散控制。X射线衍射(XRD)和X射线光电子能谱(XPS)的结果表明,在***细菌介导下,生物源黄钾铁矾能够钝化废石中残余的黄铁矿。对渣样进行二次生物浸出,试验发现溶液pH没有明显下降,且仅有8 mg/L和160mg/L的铁从两个黄铁矿废石渣样中溶出,表明渣样的酸和铁释放能力得到削弱。

关键词：酸性矿山废水黄铁矿生物浸出矿山废弃物黄钾铁矾生物钝化

沙棘LBD基因家族鉴定及其在花芽发育过程中的表达分析

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生物工程学报 2024年

作者：李昕娟杨盼盼张恬任乾丹周武新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源与基因工程重点实验室青海大学生态环境工程学院

外侧器官边界域(lateral organ boundaries domain， LBD)转录因子广泛存在于高等植物中，并在植物生长发育和逆境胁迫等过程中发挥了非常重要的作用。沙棘(Hippophae rhamnoides L.)作为一种抗旱、耐寒、耐盐碱的灌木，具有一定的生态... 详细信息

外侧器官边界域(lateral organ boundaries domain， LBD)转录因子广泛存在于高等植物中，并在植物生长发育和逆境胁迫等过程中发挥了非常重要的作用。沙棘(Hippophae rhamnoides L.)作为一种抗旱、耐寒、耐盐碱的灌木，具有一定的生态价值和经济价值。为了分析LBD基因家族在中国沙棘雌雄花芽发育过程中的作用，本研究利用生物信息学方法从沙棘全基因组数据中鉴定出了11个LBD基因。LBD基因家族不均匀分散在5条染色体上，编码159-302个氨基酸，分子质量18 249.91-33 202.01 Da。亚细胞定位预测表明蛋白质分布于细胞核或叶绿体中；LBD序列较为保守，具有高度相似的基序、基因结构和蛋白质三维结构；将沙棘与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、大麦(Hordeum vulgare)的LBD基因进行系统发育分析发现，HrLBD基因家族均可细分为Class Ⅰ和Class Ⅱ两大亚家族；转录组及RT-qPCR结果显示，HrLBD基因在沙棘雄性花芽发育过程中表达量更高，并随着花芽发育过程表达量逐渐升高，推测HrLBD基因在特定时期影响沙棘雄性花芽发育。本研究为初步阐明HrLBD基因在沙棘雌雄花芽生长发育中的作用和性别分化机制奠定了理论基础。

关键词：沙棘外侧器官边界域基因家族花芽发育基因表达实时荧光定量PCR

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我国土壤线虫生态研究新进展

应用生态学报 2024年第8期35卷 2282-2290页

作者：梁思维刘笑彤李英滨梁文举辽宁省农业科学院耕作栽培研究所沈阳110161 中国科学院沈阳应用生态研究所沈阳110016 辽宁省农业科学院植物营养与环境资源研究所沈阳110161

土壤线虫是地下生态系统的重要组成部分,关注其群落分布、组成结构、生态功能及其与周围环境互作机制的线虫生态学研究,一直是土壤生物学研究的热点。本文系统介绍了土壤线虫多样性高和食性多样的特点,阐述了土壤线虫作为指示生物和模... 详细信息

土壤线虫是地下生态系统的重要组成部分,关注其群落分布、组成结构、生态功能及其与周围环境互作机制的线虫生态学研究,一直是土壤生物学研究的热点。本文系统介绍了土壤线虫多样性高和食性多样的特点,阐述了土壤线虫作为指示生物和模式生物的优点,及其在生物防治、生态系统功能和土壤健康表征上的作用。回顾了近年来国内在土壤线虫生态学方面的研究进展,包括分子生物学鉴定方法、对全球变化的响应、食物网结构功能、地上地下多样性关系和大尺度多样性格局等。探讨了土壤线虫生态学的发展趋势,重点评述了采用高通量测序技术进行线虫分类和定量研究的前景,建立通用分析平台推广土壤线虫研究的必要性,以及加强大尺度土壤线虫调查的重要性。

关键词：土壤线虫生态学土壤微食物网生态服务功能土壤生物健康

基于熵权TOPSIS模型的农业绿色发展水平评价——以河南省为例

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浙江大学学报（农业与生命科学版） 2024年第2期50卷 221-230页

作者：郭书娟许亚东黄进勇郑州大学农学院河南郑州450001 郑州大学生命科学学院河南郑州450001 河南省伏牛山生物资源与生态环境野外科学观测研究站河南南阳473000

现代农业绿色发展水平反映了农业综合实力,通过评估河南省农业绿色发展水平,可为河南省建设现代农业强省提供指导。本研究采用熵权TOPSIS模型,构建了包含资源节约、环境友好、生态保育、质量高效4个维度14个指标的农业绿色发展综合评价... 详细信息

现代农业绿色发展水平反映了农业综合实力,通过评估河南省农业绿色发展水平,可为河南省建设现代农业强省提供指导。本研究采用熵权TOPSIS模型,构建了包含资源节约、环境友好、生态保育、质量高效4个维度14个指标的农业绿色发展综合评价指数,对河南省2007—2021年农业绿色发展水平动态变化及河南省下辖18个地市2019—2021年农业绿色发展水平(3年的平均值)进行了综合分析。结果表明:反映河南省农业绿色发展水平的综合评价指数呈波动上升趋势,但该指数反映的整体水平仍然较低;河南省各地市之间农业绿色发展水平差异较大,西部地区明显低于其他地区;根据聚类分析结果,河南省不同地市可划分为Ⅰ区(现代农业区)、Ⅱ区(传统农业区)和Ⅲ区(都市农业发展区)3个区域类型。河南省各地市应依据本地资源禀赋,面向国家发展战略需要,因地制宜,重点突破影响现代农业绿色发展的薄弱环节,进一步推进农业绿色发展进程。

关键词：农业绿色发展综合评价熵权法 TOPSIS模型河南省

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类芽孢杆菌(Paenibacillus sp.)蛋白质组学研究中三种蛋白提取方法的比较分析

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微生物学报 2024年第2期64卷 623-632页

作者：宋丽丽张雪张更新魏鑫丽王先平中国科学院青藏高原研究所青藏高原地球系统与资源环境重点实验室北京100101 兰州大学生态学院甘肃兰州730000 中国科学院微生物研究所北京100101 中国科学院生物物理研究所北京100101

【目的】革兰氏阳性类芽孢杆菌(Paenibacillus sp.)本身细胞壁的结构特点导致其菌体全蛋白不易获得。本研究选取了3种破碎方法——溶菌酶联合超声破碎法(方法一)、溶菌酶联合SDS热处理破碎法(方法二)、液氮联合超声破碎法(方法三)进行... 详细信息

【目的】革兰氏阳性类芽孢杆菌(Paenibacillus sp.)本身细胞壁的结构特点导致其菌体全蛋白不易获得。本研究选取了3种破碎方法——溶菌酶联合超声破碎法(方法一)、溶菌酶联合SDS热处理破碎法(方法二)、液氮联合超声破碎法(方法三)进行革兰氏阳性菌的细胞破碎,以期获得适于样品菌株基于质谱技术进行蛋白质组学研究的制备方法。【方法】在蛋白样品的制备过程中,对3种不同破碎方法的蛋白提取得率和SDS-PAGE检测分析结果进行比较;随后将3种蛋白样品制备方法的样品用质谱技术进行鉴定,分析不同蛋白样品基于质谱技术鉴定蛋白的差异。【结果】在蛋白样品的制备提取过程中,不同破碎方法的蛋白提取率大致相同。用单因素方差比较3种提取方法质谱鉴定蛋白数的差异性,方法三鉴定的蛋白数最多(2638个),其次是方法一(2452个),方法二鉴定的蛋白数最少(2003个)。进一步用韦恩图分析比较不同提取方法的蛋白鉴定通量差异,综合考虑蛋白提取效率的结果以及液氮研磨法提取蛋白的缺点,最终选取溶菌酶联合超声破碎法(方法一)提取菌株全蛋白作为该菌基于质谱分析其蛋白质组学研究中最适合的方法。最后,对质谱鉴定菌株蛋白包括分子量、等电点、疏水性的基本性质进行分析,发现3种破碎方法质谱鉴定的蛋白与模式菌株多黏类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)基因组中预测蛋白的各个组分分布占比基本一致,都保证了菌株蛋白质组数据信息的完整性。【结论】基于质谱技术开展革兰氏阳性类芽孢杆菌(Paenibacillus sp.)的蛋白质组学研究,溶菌酶联合超声破碎法是提取该菌株全蛋白最适合的方法。

关键词：革兰氏阳性菌蛋白裂解液蛋白质组学多肽

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浙江丽水发现德化脊蛇

动物学杂志 2024年

作者：黄汝怡杨典成吴军朱滨清黄松李晨虹黄山诺尔生物多样性研究所生态环境部南京环境科学研究所上海海洋大学水产与生命学院安徽师范大学生命科学学院安徽省生物资源保护与开发重点实验室

2021年10月8日和2022年5月18日，于浙江省丽水市龙泉市剑池街道石武村（119°09′38″E,28°04′59″N，海拔225 m）和兰巨乡炉岙村（119°12′25″E,27°55′25″N，海拔933 m）分别采到1条小型蛇类。这2号标本在形态上与德化脊蛇（Ach... 详细信息

2021年10月8日和2022年5月18日，于浙江省丽水市龙泉市剑池街道石武村（119°09′38″E,28°04′59″N，海拔225 m）和兰巨乡炉岙村（119°12′25″E,27°55′25″N，海拔933 m）分别采到1条小型蛇类。这2号标本在形态上与德化脊蛇（Achalinusdehuaensis）相近；在基于线粒体COI基因片段构建的脊蛇属系统发育树上，它们与德化脊蛇正模标本（采集号：YBU13013）高支持率（92%）聚为单系，与德化脊蛇正模标本间的未校正遗传距离为3.19%，小于脊蛇属物种间的未校正遗传距离（4.47%～23.34%）。因此，结合形态和分子数据，将其鉴定为是闪皮蛇科（Xenodermidae）脊蛇属的德化脊蛇，系浙江省爬行动物分布新记录种，标本现保存在安徽师范大学标本馆（馆藏号：ANU20230018和ANU20230019）。

关键词：德化脊蛇浙江省新记录线粒体COI基因系统发育分析未校正遗传距离

微生物-肠-肝轴与酒精性肝病及其营养干预研究进展

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食品科学 2024年

作者：郑红星冀乐祁珊珊陕西理工大学生物科学与工程学院陕西理工大学秦巴生物资源与生态环境省部共建国家重点实验室陕南秦巴山区生物资源综合开发协同创新中心陕西省资源生物重点实验室陕西省黑色有机食品工程技术研究中心

酒精性肝病（Alcoholic liver disease，ALD）是全球最普遍的慢性肝病类型，早期表现为脂肪肝，进而演变成脂肪性肝炎，随着饮酒时间增长会发展成肝纤维化和肝硬化。肠-肝轴是指肠道及其微生物群与肝脏之间的双向作用，由门静脉和胆道... 详细信息

酒精性肝病（Alcoholic liver disease，ALD）是全球最普遍的慢性肝病类型，早期表现为脂肪肝，进而演变成脂肪性肝炎，随着饮酒时间增长会发展成肝纤维化和肝硬化。肠-肝轴是指肠道及其微生物群与肝脏之间的双向作用，由门静脉和胆道建立。酒精会破坏这一双向作用，导致肠道微生物群紊乱和病原体易位到肝脏，造成肝损伤。本文以肠道屏障、肠道微生物组成、肠道微生物成分和肠道微生物代谢产物为主，综述了肠-肝轴介导ALD发生发展的作用机制以及ALD的营养干预措施，尤其是靶向噬菌体干预肠道微生物群以及三甲胺、溶细胞素、念珠菌溶素在ALD中的作用，以期为以肠-肝轴为靶点抗ALD功能物质的发现、营养干预和功能性食品的开发提供基础资料。

关键词：酒精性肝病肠-肝轴肠道微生物肠道微生物代谢产物营养干预

基于血细胞全长转录物组和血清差异蛋白质组的厚壳贻贝新型免疫相关蛋白质鉴定

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第7期40卷 947-963页

作者：肖文慧王昊东阳宗欣宋方王月何建瑜张晓林严小军廖智浙江海洋大学海洋科学与技术学院海洋生物资源与分子工程研究室浙江舟山316022

贻贝是一类极具经济价值和生态价值的双壳贝类,对其先天免疫防御机制的研究在海洋生物免疫学研究中占据重要地位。血淋巴是贻贝的主要免疫组织,采用贻贝血细胞Nanopore全长转录物组,结合基于SDS-PAGE分析的血清差异蛋白质组学手段,开展... 详细信息

贻贝是一类极具经济价值和生态价值的双壳贝类,对其先天免疫防御机制的研究在海洋生物免疫学研究中占据重要地位。血淋巴是贻贝的主要免疫组织,采用贻贝血细胞Nanopore全长转录物组,结合基于SDS-PAGE分析的血清差异蛋白质组学手段,开展了厚壳贻贝血淋巴对不同微生物免疫响应的关键分子挖掘。研究结果表明,在不同微生物诱导后的贻贝血清中,共鉴定到蛋白质44种,其中26种蛋白质表现为在不同微生物胁迫后具有与对照组相比的显著差异表达(P研究结果为了解贻贝先天免疫系统在应对不同类别微生物侵袭过程中,其差异化免疫响应机制,以及贻贝在微生物感染后,特异性标志蛋白质的筛选提供了新的科学依据,也为后续贝类养殖业的健康发展和病害防治提供了思路。

关键词：厚壳贻贝血淋巴全长转录物组差异蛋白质组免疫

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