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秦岭细鳞鲑子二代与野生群体肠道组织结构、消化酶、抗氧化酶及肠道菌群研究

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南方水产科学 2025年第1期21卷 85-95页

作者：宋荣群王桢璐郭星辰王艺舟熊冬梅叶欢李志刚邵俭贵州大学动物科学学院/渔业资源与环境保护实验室/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025 贵州大学特种水产研究所贵州贵阳550025 西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712199 中国水产科学研究院长江水产研究所/农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室湖北武汉430223 宝鸡市水产工作站陕西宝鸡721008

为探究秦岭细鳞鲑(Brachymystax tsinlingensis Li, 1966)亚成体在不同群体的消化系统特性,并为其规模化人工繁育和资源养护利用提供参考,运用组织学和16S rRNA高通量测序技术检测分析了秦岭细鳞鲑人工繁育子二代[Bt,体长(15.40±0.82) ... 详细信息

为探究秦岭细鳞鲑(Brachymystax tsinlingensis Li, 1966)亚成体在不同群体的消化系统特性,并为其规模化人工繁育和资源养护利用提供参考,运用组织学和16S rRNA高通量测序技术检测分析了秦岭细鳞鲑人工繁育子二代[Bt,体长(15.40±0.82) cm,体质量(51.50±11.90) g]与自然生境野生群体[WBt,体长(18.17±2.57) cm,体质量(85.68±34.85) g]肠道组织、消化酶、抗氧化酶及肠道菌群多样性的特征。结果显示:Bt和WBt肠道组织结构一致,均有肠腺组织;其中,WBt的肌层厚度显著高于Bt (p0.05)。在肠道超氧化物歧化酶活性上,Bt显著高于WBt (p研究表明,秦岭细鳞鲑野生群体在肠道发育、消化吸收能力、抗氧化应激能力及微生物多样性方面均优于子二代群体,而子二代的肠道菌群引发致病性的风险较低。

关键词：秦岭细鳞鲑肠道组织消化酶抗氧化酶肠道菌群

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稻田金背鲤尾柄肌纤维特征及相关代谢酶与基因表达研究

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南方水产科学 2023年第4期19卷 77-85页

作者：张文争杨立姚俊杰蒙庆米纪达贵州大学渔业资源与环境研究中心贵州贵阳550025 贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025

稻田金背鲤(Cyprinus carpio ***)是经过多个世代自然选择和人工选择生活于稻田的鲤鱼。为推广金背鲤-稻田养殖模式,为该模式下的良种选育提供数据支撑,以池塘养殖的金背鲤为对照组,采用组织学、酶学及分子生物学方法分析了其尾柄肌纤... 详细信息

稻田金背鲤(Cyprinus carpio ***)是经过多个世代自然选择和人工选择生活于稻田的鲤鱼。为推广金背鲤-稻田养殖模式,为该模式下的良种选育提供数据支撑,以池塘养殖的金背鲤为对照组,采用组织学、酶学及分子生物学方法分析了其尾柄肌纤维及相关代谢酶与基因表达,探究了稻田金背鲤尾柄肌肉在稻田浅水生态条件下生长的适应性特征。结果显示:在水稻扬花期和渔获期,尾柄肌纤维直径稻田组均大于池塘组,并存在显著性差异(P研究显示,稻田金背鲤尾柄肌肉有更大的肌纤维直径和横截面积,尾柄肌肉呈现较高的LDH和Ca2+-ATP酶活性,这是其适应稻田浅水生活的特点;稻田金背鲤的尾柄抗阻运动会引起肌肉肥大,与其激活蛋白质合成通路有关,而池塘金背鲤通常进行长时间的耐力运动,与其线粒体生物合成有关;在水稻扬花期,稻田金背鲤PGC-1α基因表达量较高,可能与此阶段水稻开花、稻田中昆虫增多、生物多样性增加以及生物量增加有关。

关键词：稻田金背鲤尾柄肌纤维代谢酶基因表达

南亚热带典型河流轮虫物种和功能多样性的空间与季节变化:以柳江为例

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贵州师范大学学报(自然科学版) 2025年第1期43卷 15-24,45页

作者：张亚男何安尤刘斐黄琦肖林万凌琳暨南大学生态学系/水生生物研究中心广东广州510632 广西壮族自治区水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室广西南宁530021

以柳江为对象,探讨南亚热带典型河流轮虫物种和功能α多样性及β多样性的时空变化,并采用多元分析方法探究了环境的空间异质性、轮虫的物种组成和功能性状组成及其影响因子。结果表明:在柳江这一典型的南亚热带河流中,轮虫多度低但物种... 详细信息

以柳江为对象,探讨南亚热带典型河流轮虫物种和功能α多样性及β多样性的时空变化,并采用多元分析方法探究了环境的空间异质性、轮虫的物种组成和功能性状组成及其影响因子。结果表明:在柳江这一典型的南亚热带河流中,轮虫多度低但物种多样性高,多数种类为沿岸带种类,物种和功能组成分布反映了其对生境的适应;轮虫的物种和功能α多样性平水期时最高,物种和功能α多样性的变化主要与水温、食物资源有关;物种和功能β多样性丰水期时最高,β多样性变化主要由物理因子、化学因子解释,这可能是由自然干扰和人为干扰同时作用的结果;功能β多样性组分变化比物种β多样性组分变化对环境条件的变化更加敏感;在对河流轮虫群落研究时,应考虑轮虫的物种和功能性状组成。

关键词：轮虫功能性状 β多样性周转季节性空间异质性

基于水体及胃含物DNA宏条形码技术的斑鳠幼鱼食性分析

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南方水产科学 2024年第5期20卷 149-158页

作者：蒙庆米马兰陈继位莫显义姚俊杰杨立贵州大学渔业资源与环境研究中心/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025 罗甸县养殖业发展中心贵州罗甸550100

为摸清斑鳠(Mystus guttatus)幼鱼的食性和生物学特征,为其资源保护和种群恢复提供科学依据,采用DNA宏条形码技术分析了贵州省罗甸县斑鳠保种场河道中的斑鳠幼鱼胃含物及水体的物种特征。结果显示:1)在斑鳠幼鱼胃含物中共鉴定出109种生... 详细信息

为摸清斑鳠(Mystus guttatus)幼鱼的食性和生物学特征,为其资源保护和种群恢复提供科学依据,采用DNA宏条形码技术分析了贵州省罗甸县斑鳠保种场河道中的斑鳠幼鱼胃含物及水体的物种特征。结果显示:1)在斑鳠幼鱼胃含物中共鉴定出109种生物,分属于15个门,12大类。从门水平看,节肢动物门相对丰度最高,其次是轮虫动物门、绿藻门、脊索动物门。从属水平看,中镖水蚤属(Sinodiaptomus)相对丰度最高,其次是臂尾轮虫属(Brachionus)、鲃属(Barbus)和Paralamyctes。2)在斑鳠幼鱼生存的河道中,共获得193个物种,分属于18个门。从门水平来看,节肢动物门相对丰度最高,其次是绿藻门。从属水平来看,中镖水蚤属的相对丰度最高,其次是衣藻属(Chlamydomonas),占比较高的还有臂尾轮虫属、筒壳虫属(Tintinnidium)和单壳缝藻属(Monoraphidium)。节肢动物门、轮虫动物门和绿藻门在斑鳠幼鱼胃含物中和水体中都是相对丰度较高的类群。在水体中,脊索动物门相对丰度较低(第15位),而在胃含物中列第4位。研究揭示了斑鳠幼鱼食性选择受水域环境食物的易得性及其喜好性两方面的影响。从能量收支效益的角度来看,斑鳠幼鱼在摄食过程中遵循以最小的能量投入获取最大收益的原则,利于幼鱼存活与生长。

关键词：斑鳠幼鱼胃含物食性 DNA宏条形码技术

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基于转录组测序的棘胸蛙SSR和SNP分子标记开发

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南方农业学报 2022年第3期53卷 759-767页

作者：魏朝宇谢永广魏秀英罗华辉陈敦学贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州大学渔业资源与环境研究中心贵州贵阳550025

【目的】基于转录组开发SSR和SNP分子标记用于评价棘胸蛙(Quasipaa spinosa)遗传多样性,为其种质资源的创新利用提供理论支撑。【方法】采用TRIzol试剂盒提取棘胸蛙肝脏、肌肉和肾脏组织总RNA,构建cDNA文库后利用Illumina HiSeq 2500测... 详细信息

【目的】基于转录组开发SSR和SNP分子标记用于评价棘胸蛙(Quasipaa spinosa)遗传多样性,为其种质资源的创新利用提供理论支撑。【方法】采用TRIzol试剂盒提取棘胸蛙肝脏、肌肉和肾脏组织总RNA,构建cDNA文库后利用Illumina HiSeq 2500测序平台进行高通量测序,通过MISA对棘胸蛙转录组测序数据进行SSR检索,并以SAMtools和VarScan v.2.2.7进行SNP查找。【结果】棘胸蛙转录组测序共获得93887条非冗余基因(Unigenes),序列总长度达91352712 bp,且所有转录组Q30均超过95.00%。在93887条Unigenes中发现33019个SSRs,其中21966条Unigenes含有SSR,6688条Unigenes含有超过1个SSR;以单核苷酸重复型SSR数最多,达25788个,且出现频率最高(27.47%)。SSR的平均长度以四核苷酸重复型最长,达35.47 bp;棘胸蛙SSR以(A/T)_(n)为绝对优势重复基元,占总SSR的65.51%,然后依次为(C/G)_(n)、(AT/AT)_(n)、(AC/GT)_(n)、(AG/CT)_(n)、(AAT/ATT)_(n)、(AGG/CCT)_(n),分别占总SSR的12.59%、5.66%、5.55%、3.31%、1.55%和1.30%。在33019个SSRs中,核苷酸重复次数主要集中在5~25次,占总SSR的99.91%,且大部分SSR位于非编码区,仅有1633个SSRs位于编码区;长度≥12 bp的SSR共计17244个,占总SSR的58.53%。挑选120对SSR引物进行引物有效性验证,发现有57对引物扩增出单一条带,且条带大小与预期结果一致。对棘胸蛙转录组序列进行SNP检索,共发现87634个SNPs,其中,56300个SNPs属于转换位点、31334个SNPs属于颠换位点,转化/颠换比达1.80,碱基的转换频率明显高于颠换频率。【结论】利用高通量转录组测序开发棘胸蛙SSR和SNP分子标记是一种切实可行的方法,能开发出通用性较高、数量较多、覆盖性较广的分子标记。棘胸蛙具有中度偏高的遗传多样性,可作为种质材料进一步开发利用。

关键词：棘胸蛙 SSR分子标记 SNP分子标记分布特征转录组测序

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4种水产消毒剂对棘胸蛙蝌蚪急性毒性研究

水产科学 2023年第3期42卷 502-508页

作者：谢永广魏朝宇魏秀英罗华辉陈敦学贵州大学动物科学学院贵州大学渔业资源与环境研究中心贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025

两栖类作为一类重要的水产养殖品种,目前养殖规模日益扩大,消毒剂的使用已不可避免。为探明常用水产消毒剂对两栖类急性毒性的影响,保障两栖类养殖中消毒剂的安全使用,选取38~39期的棘胸蛙蝌蚪作为试验材料,选择氯化钠、甲醛、高锰酸钾... 详细信息

两栖类作为一类重要的水产养殖品种,目前养殖规模日益扩大,消毒剂的使用已不可避免。为探明常用水产消毒剂对两栖类急性毒性的影响,保障两栖类养殖中消毒剂的安全使用,选取38~39期的棘胸蛙蝌蚪作为试验材料,选择氯化钠、甲醛、高锰酸钾和聚维酮碘4种常见水产消毒剂作为试验药物,进行急性毒性试验,结果显示,4种消毒剂在24、48、72、96h的半致死质量浓度排序均为:氯化钠>甲醛>高锰酸钾>聚维酮碘。其中氯化钠、甲醛、高锰酸钾、聚维酮碘4种药物对棘胸蛙蝌蚪96h的半致死质量浓度分别为7145.53、16.32、3.61、2.93mg/L,安全质量浓度分别为1949.01、4.80、0.88、1.85 mg/L。根据生态环境部发布的毒性分类标准,氯化钠和甲醛属于低毒消毒剂,而高锰酸钾和聚维酮碘属于中毒消毒剂。充分考虑剂量敏感性和使用方便性,推荐使用聚维酮碘作为消毒剂。此外由于蝌蚪对消毒剂的敏感性通常高于鱼类,因此在棘胸蛙等两栖类养殖过程中,需要减少消毒剂的使用剂量。试验结果将对两栖类的规模化养殖中消毒剂的安全使用提供依据,助力两栖类养殖业的健康发展。

关键词：棘胸蛙蝌蚪水产消毒剂急性毒性半致死质量浓度安全质量浓度

贵州7个鲤养殖群体遗传多样性与遗传结构分析

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海洋渔业 2023年第3期45卷 257-266页

作者：纪达杨玉梅姚俊杰王益海张书海贵州大学渔业资源与环境研究中心贵阳550025 贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 黔东南州水产技术推广站贵州凯里556000

为探究贵州鲤(Cyprinus carpio)养殖群体遗传多样性与遗传分化现状,基于线粒体DNA Cyt b基因,采用PCR扩增与直接测序法,对贵州7个鲤养殖群体进行了遗传多样性及遗传结构分析。结果显示,152尾个体共界定了16种单倍型,7个养殖群体整体单... 详细信息

为探究贵州鲤(Cyprinus carpio)养殖群体遗传多样性与遗传分化现状,基于线粒体DNA Cyt b基因,采用PCR扩增与直接测序法,对贵州7个鲤养殖群体进行了遗传多样性及遗传结构分析。结果显示,152尾个体共界定了16种单倍型,7个养殖群体整体单倍型多样性指数(H_(d))、核苷酸多样性指数(P_(i))分别为0.792、0.00323。单倍型网络图(network)显示,7个养殖群体间没有形成明显的谱系结构和地理结构。AMOVA分析结果显示,群体间和群体内变异占比分别为41.63039%和58.36961%,遗传分化指数(Fst)为0.41630,达到极显著差异水平(P贵州7个鲤养殖群体总体核苷酸多样性指数偏低,其中,松浦镜鲤、松浦红镜鲤、福瑞鲤核苷酸多样性指数极低;7个鲤养殖群体总体遗传分化程度较高;各群体遗传变异主要发生在群体内部,遗传多样性有待提高。

关键词：贵州省鲤养殖群体遗传多样性遗传结构

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稻田增加沟坑对金背鲤肠道结构、消化酶活性及微生物群落的影响

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华南农业大学学报 2024年第6期45卷 889-897页

作者：马兰蒙庆米李嘉尧秦国兵姚俊杰王秀龙杨立贵州大学渔业资源与环境研究中心/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025 上海海洋大学农业农村部稻渔综合种养生态重点实验室上海201306 贵阳市水产站贵州贵阳550081

【目的】探究金背鲤Cyprinus carpio ***的稻田适应性特征及其肠道与不同稻田生长环境的关系。【方法】以在平板式、“一”字沟以及“十”字沟稻田生长的金背鲤为研究对象,采用形态学、酶学及生物信息学的方法探究稻田增加沟坑对金背鲤... 详细信息

【目的】探究金背鲤Cyprinus carpio ***的稻田适应性特征及其肠道与不同稻田生长环境的关系。【方法】以在平板式、“一”字沟以及“十”字沟稻田生长的金背鲤为研究对象,采用形态学、酶学及生物信息学的方法探究稻田增加沟坑对金背鲤肠道结构、消化酶活性及微生物群落的影响。【结果】“十”字沟组金背鲤肠道的绒毛最宽(173.59μm),其次是“一”字沟组(157.72μm),最窄的是平板式组(139.69μm)。“十”字沟组、“一”字沟组的胰蛋白酶活性分别为4662.65、4676.12 U·mg^(−1),显著高于平板式组的3752.34 U·mg^(−1)(P环境,但金背鲤肠道核心菌群的组成保持相对稳定。

关键词：稻田沟坑金背鲤肠道结构消化酶微生物群落

贵州福泉的索氏桃花水母生长及精巢发育初步研究

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动物学杂志 2019年第4期54卷 581-588页

作者：陶莎姚俊杰谭华杨梅石让安贵州大学渔业资源与环境研究所高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 贵州省福泉县水产站贵阳550025

2017年10月中旬,在贵州省福泉县一个池塘中发现了桃花水母,经分子鉴定确认为索氏桃花水母(Craspedacusta sowerbyi)。研究了其生长发育的情况,建立了拟合优度线性相关函数,并观察了雄性索氏桃花水母精巢外形发育过程。结果表明,福泉的... 详细信息

2017年10月中旬,在贵州省福泉县一个池塘中发现了桃花水母,经分子鉴定确认为索氏桃花水母(Craspedacusta sowerbyi)。研究了其生长发育的情况,建立了拟合优度线性相关函数,并观察了雄性索氏桃花水母精巢外形发育过程。结果表明,福泉的索氏桃花水母雌雄异体,雌性触手细长,伸向上方;雄性触手短粗,垂向下方。缘膜宽度、口径宽度、触手数量与伞径相关函数的相关系数r均大于0.75,说明3个指标与伞径之间均存在极强正相关关系。福泉的索氏桃花水母雄性个体性腺4个,淡绿色,成熟雄性个体精巢呈囊状、三角囊状、长三角囊状,4个精巢的发育不同步。研究表明,当伞径小于12 mm时,福泉的索氏桃花水母处于生长发育期,缘膜、口径宽度、触手数量、雄性精巢4个性状随之增长而变化,当伞径大于等于12 mm时,个体处于成熟期,上述4个性状相对稳定,变化不大。本文对于性腺作为桃花水母分类指标的有效性做了探讨。

关键词：贵州福泉索氏桃花水母生长性腺精巢