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杜仲法呢基焦磷酸合酶EuFPS1互作蛋白筛选及分析

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植物生理学报 2024年第3期60卷 585-595页

作者：曾琴梁青赵丹贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵阳550025

法呢基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,FPS)是杜仲胶生物合成途径中的关键酶之一,EuFPS1基因对杜仲胶积累有促进作用,但对其调控的分子机制尚不清楚。本研究采用SMART同源重组技术构建了杜仲酵母cDNA表达文库,以EuFPS1基因... 详细信息

法呢基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,FPS)是杜仲胶生物合成途径中的关键酶之一,EuFPS1基因对杜仲胶积累有促进作用,但对其调控的分子机制尚不清楚。本研究采用SMART同源重组技术构建了杜仲酵母cDNA表达文库,以EuFPS1基因为诱饵筛选互作蛋白,经测序和BLAST比对初步筛选出41个互作蛋白。GO和KEGG分析结果显示,互作蛋白主要参与卟啉化合物代谢调控、紫外线与冷响应、叶片发育等生物进程,MEP代谢、卟啉代谢、泛素介导的蛋白质水解等代谢途径。选取3个互作蛋白(EuUFM1、EuLHC1、EuKS1)进一步验证互作关系,qRT-PCR分析发现EuFPS1与EuUFM1、EuLHC1、EuKS1基因在杜仲不同组织中均表达,其中EuFPS1与EuKS1的表达呈负相关。本研究为解析杜仲EuFPS1及其与互作蛋白的作用机制奠定了基础。

关键词：杜仲法呢基焦磷酸合酶酵母双杂交互作蛋白基因表达

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橘绿木霉GF-11发酵刺梨渣的响应面法优化

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中国生物防治学报 2024年第2期40卷 448-457页

作者：杨昌发唐彩艳孙冰张锐费正林葛永怡贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵阳550025

木霉具有抑制病原菌、促进植物生长和改善土壤营养等作用。刺梨渣是刺梨榨汁后的废弃物,具有极高的利用价值。本文拟采用刺梨渣为原料,麸皮为辅料进行固体发酵,以橘绿木霉GF-11的分生孢子数量为筛选指标,通过Plackett-Burman试验设计及B... 详细信息

木霉具有抑制病原菌、促进植物生长和改善土壤营养等作用。刺梨渣是刺梨榨汁后的废弃物,具有极高的利用价值。本文拟采用刺梨渣为原料,麸皮为辅料进行固体发酵,以橘绿木霉GF-11的分生孢子数量为筛选指标,通过Plackett-Burman试验设计及Box-Behnken设计-响应曲面法(responsesurface methodology,RSM)对影响发酵刺梨渣的条件进行优化。结果表明,培养基配方中对橘绿木霉GF-11产孢影响最显著的3个主要因素麸皮占比、接种量、发酵天数。优化后的发酵培养条件为麸皮占比61%、接种量10.48%、硫酸锌0.5%、含水率250%、发酵天数10d。在此优化条件下发酵获得橘绿木霉菌株GF-11的分生孢子产量为2.32×10^(10)CFU/g。该研究为刺梨渣发酵提供了合适的工艺条件,为减少刺梨渣污染环境及其有效利用提供了基础,也为生产高质量生物有机肥提供了新的途径。

关键词：橘绿木霉固体发酵响应面法刺梨渣

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贵州荞麦重要种质的遗传多样性分析及分子身份证构建

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华中农业大学学报 2024年第3期43卷 148-157页

作者：冷宇鑫闵义付阳云周奎何颖文晓鹏贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵阳550025

为精准鉴定贵州荞麦种质资源,采用SSR分子标记对60份荞麦种质进行遗传多样性分析,构建DNA分子身份证数据库。结果显示,从100对SSR引物中筛选出16对稳定性好、多态性丰富的引物,在60份供试种质中共扩增出174个多态性条带;Shannon’s信息... 详细信息

为精准鉴定贵州荞麦种质资源,采用SSR分子标记对60份荞麦种质进行遗传多样性分析,构建DNA分子身份证数据库。结果显示,从100对SSR引物中筛选出16对稳定性好、多态性丰富的引物,在60份供试种质中共扩增出174个多态性条带;Shannon’s信息指数、Nei’s多样性指数、多态信息指数均值分别为0.337、0.206、0.693,引物的多态性较好,能有效揭示60份荞麦种质的遗传多样性;在Dice遗传相似系数为0.374时,所有供试材料可聚为A、B、C三组;当Dice遗传相似系数为0.484时,将苦荞组(A组)更细分为A1、A2两个小组。采用毛细管电泳及8%的聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳对SSR标记扩增产物进行双验证,2种方法的聚类结果一致。结果表明,本研究开发的高效性SSR分子标记能够有效地鉴定贵州荞麦重要种质的遗传多样性且用于构建分子身份证。

关键词：荞麦 SSR标记毛细管电泳遗传多样性 DNA分子身份证

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纳米零价铁协同反硝化细菌去除硝酸盐的研究进展

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生物工程学报 2024年

作者：赵洪何腾霞郑春霞王侧容刘欢田亚菲刘建蕊贵州大学生命科学学院农业生物工程研究院山地生态与农业生物工程协同创新中心山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室

硝酸盐(NO3–-N)是一种水体中常见的无机氮污染物，过量的NO3–-N会使水体富营养化并对人体健康构成威胁。纳米零价铁(nanoscale zero-valent iron， nZVI)因其具有高比表面积和可作为优良电子供体的优点在NO3–-N去除方面备受关注。nZV... 详细信息

硝酸盐(NO3–-N)是一种水体中常见的无机氮污染物，过量的NO3–-N会使水体富营养化并对人体健康构成威胁。纳米零价铁(nanoscale zero-valent iron， nZVI)因其具有高比表面积和可作为优良电子供体的优点在NO3–-N去除方面备受关注。nZVI协同反硝化细菌(denitrifying bacteria， DNB)可高效地转化NO3–-N为氮气(N2)，该方法不仅能显著提高NO3–-N的去除率，而且比传统的化学脱氮法更绿色环保，在NO3–-N污染治理中具有更大的应用潜力。因此，有必要深入认识nZVI协同DNB高效去除NO3–-N的互作机理。本论文详细阐述了影响nZVI与DNB协同去除NO3–-N的相关因素；综述了nZVI协同DNB去除NO3–-N的最新研究进展；系统分析了nZVI与DNB协同去除NO3–-N相互作用机理；综合讨论了nZVI协同DNB高效去除NO3–-N所面临的挑战，并对未来的研究方向进行了展望。旨在为开发更高效治理NO3–-N污染的方法提供理论依据和参考。

关键词：纳米零价铁(nZVI) 硝酸盐(NO -N) 反硝化细菌(DNB) 毒害作用生物脱氮微生物

CO加富和供磷水平对辣椒苗期生长及营养元素吸收的影响

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作物杂志 2024年

作者：雷云刘月炎王健健贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室

为探究CO2加富、供磷水平及二者交互作用对辣椒苗期生长及营养元素吸收的影响，以艳椒425为试材，在两个CO2浓度(自然CO2：(400±30)μmol/mol、CO2加富：(800±30)μmol/mol)及三个供磷水平(0、50、250 mg/kgP)处理下，测定了辣椒形态... 详细信息

为探究CO2加富、供磷水平及二者交互作用对辣椒苗期生长及营养元素吸收的影响，以艳椒425为试材，在两个CO2浓度(自然CO2：(400±30)μmol/mol、CO2加富：(800±30)μmol/mol)及三个供磷水平(0、50、250 mg/kgP)处理下，测定了辣椒形态指标、生物量及营养元素含量指标。结果表明：(1)单独CO2加富或增加供磷水平及二者互作，均促进辣椒形态生长及生物量积累；(2)CO2加富或增加供磷水平，辣椒根、茎、叶中C含量显著增加，N、K含量显著降低，施磷还促进辣椒对P的吸收；(3)CO2加富，辣椒C/N、C/K、C/P、N/P显著增大；供磷水平对辣椒各器官C/N、C/K无显著影响，C/P、N/P显著降低；与CK相比，CO2加富与施加磷肥交互处理下辣椒C/N显著增大，C/K、C/P、N/P均显著降低；(4)CO2加富，增加辣椒整体Mg、Fe、Mn、Zn含量，减少Ca含量，供磷水平增加，辣椒整体Ca、Mg、Fe、Zn含量增加，Mn含量减少，CO2加富和供磷水平增加互作促进辣椒吸收Mg、Fe、Mn、Zn，抑制对Ca的吸收。综上所述，在实际生产过程中，可适当提高CO2浓度，合理适量施用磷肥，有利于辣椒生长及对土壤中营养元素的吸收。

关键词： CO 浓度磷肥辣椒生长元素吸收

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贵州百香果主要种植区病毒种类的检测

热带作物学报 2024年第7期45卷 1478-1488页

作者：闫艺心乔光周奎张曼莹李蕊蕊文晓鹏贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵州贵阳550025

百香果(Passiflora edulis)作为贵州特色优势水果,在巩固脱贫攻坚成果和深入实施乡村振兴战略中具有重要意义。但近年来百香果病毒病危害日趋严重,造成产量和品质急剧下降,严重影响产业发展。为确定贵州百香果主要种植区病毒种类、分布... 详细信息

百香果(Passiflora edulis)作为贵州特色优势水果,在巩固脱贫攻坚成果和深入实施乡村振兴战略中具有重要意义。但近年来百香果病毒病危害日趋严重,造成产量和品质急剧下降,严重影响产业发展。为确定贵州百香果主要种植区病毒种类、分布及复合侵染情况,本研究从贵州省罗甸县、从江县、榕江县、镇宁县和贞丰县5个百香果主要种植区采集疑似感病叶片153份,采用RT-PCR技术对其进行检测。结果表明:样本共检测到7种病毒,分别是东亚西番莲病毒(East Asian Passiflora virus,EAPV)、夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus,TeMV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)、西番莲斑驳病毒(Passiflora mottle virus,PaMV)、西番莲潜隐病毒(Passiflora latene carlavirus,PLV)和马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)。EAPV检出率最高,达96.08%,以下依次为TeMV(81.70%)、CMV(78.43%)、TuMV(44.44%)、PaMV(26.80%)、PVY(24.84%)和PLV(15.03%);值得重视的是,PVY主要为害马铃薯,而侵染百香果为首次报道。本次检测到的7种病毒的测序结果与相应参考序列的核酸一致性均在95%以上,经构建进化树发现,EAPV、TeMV、PaMV、PLV、TuMV分别与中国各省份的百香果病毒分离物存在一定的地理聚集性,而CMV和PVY分别与西班牙CMV甜瓜分离物和卢旺达PVY辣椒分离物亲缘关系最近,这说明这些病毒来源及感染途径复杂,未在国内大面积传播。本次共检测到24种复合侵染类型,以3~5种复合侵染类型为主,复合侵染率达94.77%,其中EAPV+TeMV+CMV组合是复合侵染中出现最多的类型;EAPV、TeMV和CMV的检出率高达78.43%~96.08%,在5个百香果主要种植区均有检出,且在多种复合侵染类型中普遍存在,因此这3种病毒为侵染贵州百香果主要种植区的优势病毒。此外,本研究建立了EAPV、TeMV和CMV的多重PCR检测体系,为相关病毒的快速检测提供技术支持。

关键词：贵州百香果病毒检测 RT-PCR 复合侵染

喀斯特森林表层土壤持水能力空间分布特征及其影响因素

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水土保持通报 2024年第2期44卷 57-69页

作者：袁冬梅杨熳严令斌刘锋张慧敏曹秀刚喻理飞贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵州贵阳550025

[目的]探究喀斯特森林表层土壤持水能力空间分布特征及其影响因素,为提升该地区森林土壤水源涵养能力提供科学参考。[方法]以贵州省茂兰喀斯特原始森林表层土壤(0—10 cm)为研究对象,采用环刀法与室内浸泡法对土壤物理结构和持水特性进... 详细信息

[目的]探究喀斯特森林表层土壤持水能力空间分布特征及其影响因素,为提升该地区森林土壤水源涵养能力提供科学参考。[方法]以贵州省茂兰喀斯特原始森林表层土壤(0—10 cm)为研究对象,采用环刀法与室内浸泡法对土壤物理结构和持水特性进行测定,并利用方差分析、RDA分析等方法探究不同地形部位土壤持水能力空间分布差异及其影响因素。[结果]①土壤物理特征呈高异质性,土壤容重、土壤含水量、孔隙度、机械组成等在不同坡向、坡位和海拔间均具有显著性差异。②土壤持水率在不同坡向间差异最显著,土壤持水量在不同岩石裸露等级间差异最显著。土壤最大持水率、毛管持水率、饱和持水量与毛管持水量均随着坡位和海拔的增加而增加,且随着岩石裸露等级的下降而增加。土壤综合持水能力在低裸露、低海拔地区较好。③相关分析表明,地形特征、土壤物理特性与土壤持水率的相关性更强,林分特征与持水量的相关性更强,林分密度与持水量显著负相关,平均胸径、平均树高与持水量显著正相关。④PCA分析结果表明,土壤持水量是表征茂兰喀斯特森林表层土壤持水性能的第一主要因子,土壤持水率为第二主要因子,主成分一、二累计贡献率为77.5%。RDA分析结果表明,土壤孔隙度、岩石裸露等级是茂兰喀斯特森林表层土壤持水能力的主要影响因素。[结论]茂兰喀斯特森林土壤持水能力具有高异质性,在不同地形部位间差异显著,非毛细孔隙度(P nc)是影响土壤持水能力的主要因子。

关键词：土壤物理性质土壤持水能力影响因素喀斯特

全基因组eQTL揭示猪11号染色体肉质性状新候选位点

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农业生物技术学报 2024年第4期32卷 807-819页

作者：郑韵頔冉雪琴牛熙黄世会李升王嘉福贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室

全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)挖掘了大量猪肉肉质性状关联的遗传变异，但是多数变异的调控机制未知。遗传变异主要通过调控基因表达水平影响复杂性状，通过定位表达数量性状位点(expression quantitative tra... 详细信息

全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)挖掘了大量猪肉肉质性状关联的遗传变异，但是多数变异的调控机制未知。遗传变异主要通过调控基因表达水平影响复杂性状，通过定位表达数量性状位点(expression quantitative trait locus, eQTL)鉴定基因表达水平相关的遗传变异，有助于阐释变异位点与性状之间的关联。为筛选肉质性状候选基因与位点，本研究以F2代的19个杂交香猪(Sus scrofa)(大白猪♂×从江香猪♀)个体为试验材料，使用全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)和背最长肌组织的RNA-seq数据进行全基因组eQTL分析，在11号染色体上共检测到1 332个cis-eQTLs(PFDRG，与MIPEP基因表达水平显著相关(PFDR=8.81E-03)。RNA-seq统计分析发现，rs319855910不同基因型显著影响MIPEP基因表达(P研究为猪种选育和遗传改良提供基础资料。

关键词：猪全基因组测序(WGS) 转录组测序表达数量性状位点(eQTL) SNP 肉质性状

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柳叶马鞭草离体快繁体系建立

种子 2024年第2期43卷 135-141,149,F0003页

作者：王思思蔡菊张涛袁丹丹杨秀柳李岩贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵阳550025

本研究以柳叶马鞭草盆栽苗为实验材料,探索其快繁体系。结果表明,将5~6 cm的带腋芽茎段以75%酒精与20%NaClO组合设计试验,发现用75%酒精消毒30 s, 20%NaClO消毒8 min的效果最好,7 d后污染率为12.78%,死亡率为4.44%,成活率达82.78%。将3~... 详细信息

本研究以柳叶马鞭草盆栽苗为实验材料,探索其快繁体系。结果表明,将5~6 cm的带腋芽茎段以75%酒精与20%NaClO组合设计试验,发现用75%酒精消毒30 s, 20%NaClO消毒8 min的效果最好,7 d后污染率为12.78%,死亡率为4.44%,成活率达82.78%。将3~4 cm腋芽放在添加不同浓度6-BA、NAA的MS培养基中进行增殖诱导培养,发现在培养基为MS+1.5 mg/L 6-BA+0.10 mg/L NAA培养时,30 d后诱导率为100%,增殖系数达4.77,产生的丛生芽数目多。将3~4 cm的丛生芽剪成单芽,在培养基为MS+0.10 mg/L NAA进行培养时,15 d后株高差为4.64 cm,芽苗健壮且无枯萎现象。将长势好、高度5 cm左右的柳叶马鞭草无根苗置于培养基中探索IBA、NAA激素浓度,在MS+0.10 mg/L IBA+0.05 mg/L NAA条件下,15 d后生根率为100%,平均生根数为40.43,平均根长为3.27 cm;45 d后,平均根长为14.33 cm。进一步以蛭石代替琼脂作为基质,15 d后生根率为100%,平均根长可达4.50 cm, 45 d后平均根长可达42.33 cm,显著高于琼脂基质中的平均根长。自然光条件下炼苗4 d后,移栽至配比为V_(蛭石)∶V_(营养土)=1∶2的基质上,30 d后成活率为93.33%。

关键词：柳叶马鞭草离体快繁增殖