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不同种植模式对青稞根际土壤微生物群落结构的影响

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西北农业学报 2021年第4期30卷 545-554页

作者：姚有华王玉林姚晓华安立昆白羿雄李新吴昆仑省部共建青稞和秏牛种质资源与遗传改良国家重点实验室/西藏自治区农牧科学院拉萨850002 青海大学农林科学院/青海省农林科学院西宁810016 青海省青稞遗传育种重点实验室西宁810016 国家麦类改良中心青海青稞分中心西宁810016

采用Illumina MiSeq高通量测序技术,对6种种植模式下青稞根际土壤的16S rDNA和18S rDNA基因相关区片段进行测序,研究根际土壤细、真菌群落结构的变化,并结合土壤理化性质,分析环境因子与群落结构的关系,从根际土壤微生物生态系统的角度... 详细信息

采用Illumina MiSeq高通量测序技术,对6种种植模式下青稞根际土壤的16S rDNA和18S rDNA基因相关区片段进行测序,研究根际土壤细、真菌群落结构的变化,并结合土壤理化性质,分析环境因子与群落结构的关系,从根际土壤微生物生态系统的角度解析青稞连作障碍的发生机制。6种种植模式中,土壤有机质和全氮含量WHD模式最高,全磷含量YC模式最高,全钾含量MLS模式最高,pH均为碱性;3种连作模式下,随着连作年限的增长,土壤有机质、全氮和全钾逐年降低,全磷显著升高。6种种植模式下,细菌和真菌群落Alpha多样性指数和覆盖度没有显著差异,与连作相比,WHD和MLS模式可显著提高细菌群落的Shannon指数、ACE指数和Chao1指数;与混作、轮作相比,连作显著提高真菌群落的Shannon指数和ACE指数,但Chao1指数差异不显著;连作使细菌群落Alpha多样性减小,真菌群落Alpha多样性增加。6种种植模式下,genus水平群落结构表现为连作使青稞根际土壤中微生物区系发生较大改变,导致有害菌群丰度增加,有益菌群数量减少,尤其是真菌菌群发生较大改变,而轮、混作模式使优势菌群及新种数量明显增加。细菌、真菌群落PCoA分析结果表明,微生物群落在6种种植模式间变异较小且未发生明显分化,PC1、PC2的总解释能力均大于80%,表明有显著主导因子。细菌、真菌群落与土壤理化性质关系显示,土壤有机质、全氮与提高WDH、QKA模式下的细菌群落多样性呈正相关,而pH、有机质、全氮与提高WDH、YC、QKB模式下的真菌群落多样性呈正相关。表明,与连作相比,WDH和MLS模式可改善土壤理化性质,提高根际细菌群落结构多样性及微生物群落组成,是缓解青稞连作障碍的可能途径,可为青稞连作障碍修复措施的制定提供科学依据。

关键词：种植模式青稞根际土壤高通量测序微生物群落结构

斯布牦牛线粒体D_Loop区域遗传多样性研究

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中国饲料 2024年第11期 27-32页

作者：朱勇俄广鑫信金伟陈晓英张强曹涵文姜辉陆东祥张成福省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏拉萨850000 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所西藏拉萨850000 西南大学动物科学技术学院重庆400416

作为我国西藏重要的牦牛国家遗传资源代表性品种,斯布牦牛对藏区畜牧业经济发展具有不可替代价值。本研究旨在利用线粒体D_Loop区域遗传变异评估不同被毛颜色的斯布牦牛类群遗传多样性。结果显示:在全部152个个体内的768 bp长度的D_Loo... 详细信息

作为我国西藏重要的牦牛国家遗传资源代表性品种,斯布牦牛对藏区畜牧业经济发展具有不可替代价值。本研究旨在利用线粒体D_Loop区域遗传变异评估不同被毛颜色的斯布牦牛类群遗传多样性。结果显示:在全部152个个体内的768 bp长度的D_Loop区域中,共发现57个多态位点,构建获得51个D_Loop单倍型,单倍型多样性(Hd)分布为0.893(黑色)~0.944(棕色),全部单倍型归属于两大系统发育分支,有12个D_Loop单倍型为两群体间共享单倍型。两群体Tajima'D和Fu's D参数均为不显著(P>0.05)且群体间遗传分歧不显著(F_(ST)=0.00409,P>0.05)。总体而言,斯布牦牛群体母系遗传多样性丰富,种群近期历史上未出现群体扩张,不同被毛颜色斯布牦牛遗传背景无显著差异。该研究对进一步明确斯布牦牛种群关系及群体遗传多样性保护提供数据支撑。

关键词：斯布牦牛线粒体DNA 遗传多样性系统发育

不同糯性青稞材料籽粒灌浆期miRNA的鉴定和表达分析

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分子植物育种 2022年

作者：羊海珍巴桑玉珍曾兴权省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏自治区农牧科学院农业研究所

为了探究青稞灌浆期籽粒中的miRNA及其表达特性，本研究以糯青稞‘08-1127’和非糯青稞‘藏青2000’为研究对象，分别构建开花后8、12、16和20 d籽粒样品的小RNA文库，并进行高通量测序。2个青稞材料中共鉴定到298个已知miRNA及78个新mi...

为了探究青稞灌浆期籽粒中的miRNA及其表达特性，本研究以糯青稞‘08-1127’和非糯青稞‘藏青2000’为研究对象，分别构建开花后8、12、16和20 d籽粒样品的小RNA文库，并进行高通量测序。2个青稞材料中共鉴定到298个已知miRNA及78个新miRNA。表达分析显示，‘08-1127’和‘藏青2000’在籽粒发育的4个阶段分别有133个和144个miRNA差异表达。71个miRNA在‘08-1127’和‘藏青2000’间显著差异表达，GO功能注释显示，差异表达miRNA的靶基因参与了代谢、细胞反应等生物过程，其分子功能主要为催化活性和结合；KEGG通路分析表明，靶基因参与环境适应、翻译、次生代谢物生物合成等18条通路。本研究为解析糯青稞、非糯青稞籽粒发育的分子机制提供了参考。

关键词：

白粉病菌(Blumeria graminis)胁迫下西藏青稞lncRNA全谱解析

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分子植物育种 2021年第17期19卷 5581-5590页

作者：魏玲玲王玉林原红军旺姆曾兴权西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850002 西藏大学农牧学院林芝860000 西藏自治区农牧科学院农业研究所拉萨850002

白粉病是麦类作物中最具破坏性的病害之一,对谷物产量和品质造成严重损失。为明确西藏青稞对白粉病的抗病分子机制,本研究对两个青稞品种‘甘农大7号’(G7:高抗)和‘藏青13’(Z13:高感)进行白粉菌(Blumeria graminis ***,Bgh)接种,研究... 详细信息

白粉病是麦类作物中最具破坏性的病害之一,对谷物产量和品质造成严重损失。为明确西藏青稞对白粉病的抗病分子机制,本研究对两个青稞品种‘甘农大7号’(G7:高抗)和‘藏青13’(Z13:高感)进行白粉菌(Blumeria graminis ***,Bgh)接种,研究其基因的差异表达模式。对G7和Z13白粉菌接种前后的差异基因比较发现,钙依赖蛋白激酶、谷胱甘肽S-转移酶、纤溶酶原激活物抑制剂1、丝氨酸型内肽酶和MADS-box转录因子的编码基因在G7中表达水平较高,表明它们可能在抗Bgh中发挥作用。G7高表达的基因主要参与了离子通道、钙依赖蛋白激酶、植物激素途径等生物过程。另外,16个lncRNA及其21个候选靶基因表现出协同表达模式,这些表达模式丰富了植物激素信号转导和离子结合的过程。本研究结果对后续青稞及其近缘物种抗白粉病的分子机制研究具有一定的参考价值。

关键词：青稞白粉病长链非编码RNA 植物激素途径

促生菌接种对青稞根际土壤微生物群落结构的影响

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西南农业学报 2021年第6期34卷 1277-1285页

作者：姚有华王玉林姚晓华白羿雄安立昆李新吴昆仑省部共建青棵和秏牛种质资源与遗传改良国家重点实验室/西藏自治区农牧科学院西藏拉萨850002 青海大学农林科学院/青海省农林科学院青海西宁810016 青海省青稞遗传育种重点实验室青海西宁810016 国家麦类改良中心青海青稞分中心青海西宁810016

【目的】本研究探讨了促生菌浸种处理对青稞根际土壤微生物群落结构和菌群多样性的影响,旨在为促生菌在青稞生产中应用提供理论依据。【方法】利用前期筛选出的2株促生菌TSXJ4与GSXJ进行浸种处理,于青稞灌浆期采集根际土壤样品,采用MiSe... 详细信息

【目的】本研究探讨了促生菌浸种处理对青稞根际土壤微生物群落结构和菌群多样性的影响,旨在为促生菌在青稞生产中应用提供理论依据。【方法】利用前期筛选出的2株促生菌TSXJ4与GSXJ进行浸种处理,于青稞灌浆期采集根际土壤样品,采用MiSeq高通量测序技术,分析鉴定青稞根际土壤微生物群落结构和菌群多样性。【结果】促生菌浸种改变了青稞根际土壤中细菌及真菌的群落结构,真菌群落结构的变化较为明显。根际土壤细菌丰富度和多样性表现为GSXJ4>TSXJ4>CK,真菌丰富度和多样性结果与细菌相反;细菌群落中影响较大的为Actinobacteria及Sphingobacteriia,通过浸种处理,Actinobacteria数量明显上升,而Sphingobacteriia数量明显下降;在真菌群落中影响较大的为Agaricomycetes及Pezizomycetes,通过浸种处理,Agaricomycetes数量明显下降,而Pezizomycetes,数量明显上升。【结论】促生菌浸种提高了青稞根际土壤中细菌的丰富度和多样性,而降低了真菌的丰富度和多样性;青稞根际土壤放线菌纲微生物反应对促生菌浸种较为敏感,且真菌各菌群数目变化波动较大;促生菌浸种使青稞根际土壤细菌种群多样性增加,但优势菌群种类及数量较稳定,且真菌种类变化较细菌明显。

关键词：促生菌接种青稞根际土壤微生物群落结构

基于TMT蛋白组学及生物信息学分析牦牛抗冻差异蛋白

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南方农业学报 2022年第1期53卷 1-11页

作者：贾银海张成福张强姬秋梅黄光云姜辉文信旺黄明光彭夏云吴柱月广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室南宁530001 西藏农牧科学院畜牧兽医研究所/省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850000

【目的】从蛋白水平阐明牦牛抗寒性能机理,并进一步从营养学角度提高其代谢性能,为牦牛有效抵御外界恶劣气候条件提供科学依据。【方法】应用TMT蛋白组学技术对寒冷季节(1月)和温暖季节(8月)的牦牛抗冻蛋白进行挖掘,并对鉴定到的牦牛抗... 详细信息

【目的】从蛋白水平阐明牦牛抗寒性能机理,并进一步从营养学角度提高其代谢性能,为牦牛有效抵御外界恶劣气候条件提供科学依据。【方法】应用TMT蛋白组学技术对寒冷季节(1月)和温暖季节(8月)的牦牛抗冻蛋白进行挖掘,并对鉴定到的牦牛抗冻蛋白进行亚细胞定位、结构域、GO功能富集、KEGG信号通路注释、蛋白相互作用等生物信息学分析。【结果】从牦牛耳组织中共鉴定获得21856个肽段(Peptide),其中特有肽段(Unique peptide)序列为18452个,定量获得4519个蛋白,最终筛选出144个差异蛋白,其中上调蛋白89个、下调蛋白55个。144个牦牛抗冻差异蛋白亚细胞定位到7个条目上,分别是细胞核蛋白56个、细胞质蛋白51个、质膜蛋白24个、细胞外蛋白23个、线粒体蛋白18个、细胞骨架蛋白1个和溶酶体蛋白1个;共鉴定到194个结构域。GO功能富集分析结果显示,生物过程主要富集到细胞过程蛋白79个、代谢过程蛋白70个和生物调控蛋白42个等,分子功能主要富集到结合功能蛋白75个和催化活性蛋白64个等,细胞组分主要富集到细胞部分蛋白89个和细胞蛋白89个等。144个牦牛抗冻差异蛋白在KEGG数据库中注释到205条KEGG信号通路,主要涉及核糖体、氮代谢、胞质DNA感受、动物体内生热作用、氧化磷酸化、白细胞介素-17及钙离子信号等通路。牦牛抗冻差异蛋白相互作用网络分析发现L8IHE5的关联度最高,且冷诱导RNA结合蛋白(CIRP)和HSP70结合蛋白在蛋白相互作用网络中具有更多的相互作用关系。【结论】基于TMT蛋白组学对牦牛抗冻差异蛋白进行挖掘,结果鉴定获得144个抗冻差异蛋白(上调蛋白89个,下调蛋白55个),其中CIRP和HSP70在冷应激条件下呈上调趋势,能促使牦牛肌体适应低温环境,可作为牦牛抗冻性育种的候选分子标记。

关键词：牦牛 TMT蛋白组学生物信息学抗冻性差异蛋白

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72份青稞氨基酸组成与营养价值评价

植物遗传资源学报 2021年第1期22卷 121-129页

作者：翟会生李俏张玉红曾兴权唐亚伟尼玛扎西邓光兵龙海潘志芬余懋群中国科学院成都生物研究所成都610041 西藏自治区农牧科学院拉萨850002 西藏自治区青稞种质改良和牦牛繁育重点实验室拉萨850002

为了解青稞氨基酸的组成及营养品质,本研究测定了72份青稞材料籽粒的17种氨基酸(色氨酸除外)含量,通过对供试青稞材料氨基酸含量进行聚类分析,并比较育成品种与地方品种的氨基酸组成差异,对青稞的氨基酸进行了营养价值评价。结果表明,... 详细信息

为了解青稞氨基酸的组成及营养品质,本研究测定了72份青稞材料籽粒的17种氨基酸(色氨酸除外)含量,通过对供试青稞材料氨基酸含量进行聚类分析,并比较育成品种与地方品种的氨基酸组成差异,对青稞的氨基酸进行了营养价值评价。结果表明,青稞氨基酸总含量平均为87.454 mg/g DW,变幅为47.8~178.7 mg/g DW,其中必需氨基酸含量占37.15%,谷氨酸的含量最高且变异大,蛋氨酸含量最低,赖氨酸含量变异小,91.67%的青稞材料的第一限制性氨基酸为赖氨酸。青稞氨基酸的贴近度为0.903,与世界粮农组织(FAO)、世界卫生组织(WHO)、联合国大学(UNU)提出的模式蛋白质的必需氨基酸组成较接近,氨基酸比值系数分SRC(73.14)较高。非必需氨基酸占青稞总氨基酸含量的62.85%,其中鲜味和甜味氨基酸含量分别为26.58 mg/g DW和21.85 mg/g DW,分别占总氨基酸含量的30.04%和24.43%。不同青稞材料的氨基酸含量和营养价值有很大的差异,地方品种各氨基酸含量均高于育成品种。供试材料中有4份青稞的氨基酸营养价值及风味氨基酸含量均较高。研究结果可为优质氨基酸组成的青稞选育及青稞加工提供指导。

关键词：青稞氨基酸营养品质

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密度和肥料运筹对青稞秸秆产量及品质的影响

麦类作物学报 2023年第7期43卷 933-939页

作者：严谈松扎西罗布唐亚伟吕超郭宝健朱娟王菲菲许如根江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省作物遗传生理重点实验室/扬州大学农学院/江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心江苏扬州225009 西藏自治区农牧科学院农业研究所西藏拉萨850000

为探究二棱青稞在藏区的应用潜力及关键栽培技术,以二棱型青稞品系14-3492为材料,以六棱品种藏青3000为对照,设置不同种植密度、肥料运筹处理,研究了种植密度和肥料运筹对青稞秸秆产量及品质的影响。结果表明,秸秆产量和蛋白质含量在不... 详细信息

为探究二棱青稞在藏区的应用潜力及关键栽培技术,以二棱型青稞品系14-3492为材料,以六棱品种藏青3000为对照,设置不同种植密度、肥料运筹处理,研究了种植密度和肥料运筹对青稞秸秆产量及品质的影响。结果表明,秸秆产量和蛋白质含量在不同材料间差异显著;六棱品种藏青3000秸秆产量和蛋白质含量受密度影响较大,二棱品系14-3492的秸秆产量和蛋白质含量受肥料运筹影响较大。施用拔节肥青稞秸秆蛋白质含量最高,穗肥次之;相同施肥量,施用拔节肥+穗肥处理的秸秆产量显著高于单次施肥处理。从协同秸秆产量与蛋白质含量角度,低密度时,基肥+拔节肥的施肥模式可以同时提高分蘖成穗数及穗粒数;高密度时,基肥+拔节肥+穗肥的施肥模式可以保证青稞的稳健生长;二棱青稞品系14-3492的秸秆产量和品质总体优于六棱品种藏青3000。

关键词：青稞密度肥料运筹模式产量品质

不同生育期青稞对两种价态硒吸收积累特性分析

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分子植物育种 2023年

作者：黎春想曹张印高雪卓玛孙媛媛贵州师范大学贵州省植物生理与发育调控重点实验室贵州师范大学生命科学学院西藏自治区农牧科学院农业资源与环境研究所西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

西藏地处中国缺硒地带，影响当地人民身体健康，是大骨节病高发区域。食用青稞是藏区人民摄入硒的重要途径之一。因此，明确青稞不同生育期对硒的吸收积累特性，有助于改善当地居民日常摄入硒的状况，对保障居民健康具有重要意义。本研... 详细信息

西藏地处中国缺硒地带，影响当地人民身体健康，是大骨节病高发区域。食用青稞是藏区人民摄入硒的重要途径之一。因此，明确青稞不同生育期对硒的吸收积累特性，有助于改善当地居民日常摄入硒的状况，对保障居民健康具有重要意义。本研究选用当地优良青稞品种‘喜拉22’为试验材料，研究不同生育期的青稞对亚硒酸盐(SeIV)和硒酸盐(SeVI) (0.5 mg/L)的吸收转运规律，以及硒价态对青稞生长的影响。结果显示，随着生长时间的延长，SeIV和SeⅥ均能显著提高青稞植株硒的积累量，且抽穗期和灌浆期增幅最大。成熟期时，SeIV处理下青稞植株硒累积量显著高于SeⅥ处理；SeIV处理下青稞硒主要分布于根系中(TC地上/地下为0.53)，而SeⅥ处理下青稞硒主要分布于地上部(TC地上/地下为1.91)；就可食部位而言，SeⅥ处理下青稞籽粒硒含量显著高于SeIV处理，达0.588 3 mg/kg。该结果可为富硒青稞栽培及硒生物强化提供理论支持。

关键词：青稞硒价态吸收累积