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江西养殖水体细菌群落结构及其与环境因子的关系

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大连海洋大学学报 2024年

作者：钟可儿王静宇黄江峰章海鑫周智勇徐先栋江西省水产科学研究所

为深入了解江西水产养殖系统中细菌资源分布规律和水环境因素对细菌群落的影响，应用Illumina MiSeq高通量测序技术对江西省鄱阳湖周边多种鱼类养殖池塘水体进行16S rRNA测序，并探讨细菌群落多样性及结构特征。结果表明：放线菌门是优... 详细信息

为深入了解江西水产养殖系统中细菌资源分布规律和水环境因素对细菌群落的影响，应用Illumina MiSeq高通量测序技术对江西省鄱阳湖周边多种鱼类养殖池塘水体进行16S rRNA测序，并探讨细菌群落多样性及结构特征。结果表明：放线菌门是优势菌门(Actinobacteriota，19.80%～68.86%)，其次主要类群有变形菌门(Proteobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidota)、HgcI＿Clade、CL500-29＿marine＿group以及Cyanobium＿PCC-6307等。各养殖池塘Shannon指数范围为2.47～4.25，平均值为3.31，Simpson指数范围为0.03～0.23，平均值为0.06，Chao1指数范围为140.07 ～573.17，平均值为353.23，Ace指数范围为146.52～564.34，平均值为350.73。各站点之间细菌群落丰富度、均匀度存在较大跨度，其中，位于万年的山塘养殖在本研究细菌群落多样性中表现最优；在空间上，细菌群落多样性不存在显著差异，而对于不同养殖模式，Ace指数与Chao1指数均表现为混养池塘＞单养池塘(P<0.01)。相关性分析显示，养殖水体的TSS、DO与细菌α多样性相关性最强，WT、TN、NH4+-N、TP、CODMn等环境因素显著影响水体微生物群落结构(P<0.05)。研究表明，水环境因素具有改变菌群结构的潜能，可通过适当的增氧、提高循环率、增加养殖鱼类种类等措施提高养殖水体细菌多样性，实现高效养殖。

关键词：养殖池塘细菌多样性环境因子 16S rRNA

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脑室注射葡萄糖对翘嘴鳜摄食和糖代谢的影响

水产学报 2024年第4期48卷 298-309页

作者：曾妍芝李红燕王广军谢骏田晶晶龚望宝夏耘张凯李志斐郁二蒙上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部亚热带热带水产资源利用与养殖重点实验室中国水产科学研究院海南创新研究院

为探究鳜下丘脑葡萄糖感知系统的存在和对摄食的影响，实验以翘嘴鳜为研究对象，对鳜分别进行脑室注射生理盐水(对照组)、2-DG (葡萄糖代谢拮抗剂，100 mg/kg)和葡萄糖(10 mg/kg)，探究注射后3、6和12 h不同时间点鳜摄食及糖代谢的响应... 详细信息

为探究鳜下丘脑葡萄糖感知系统的存在和对摄食的影响，实验以翘嘴鳜为研究对象，对鳜分别进行脑室注射生理盐水(对照组)、2-DG (葡萄糖代谢拮抗剂，100 mg/kg)和葡萄糖(10 mg/kg)，探究注射后3、6和12 h不同时间点鳜摄食及糖代谢的响应机制。结果显示，脑室注射葡萄糖显著抑制鳜的摄食，而不同时间点鳜血浆葡萄糖含量无显著差异。脑室注射葡萄糖显著诱导下丘脑葡萄糖激酶基因gk (glucokinase, 6 h)，表明鳜下丘脑葡萄糖感知体系的存在。且脑室注射葡萄糖显著促进可卡因和苯丙胺调节转录肽基因cart(cocaine and amphetamine regulated transcript, 3 h)的表达量，这可能与鳜mTOR (mammalian target of rapamycin)在下丘脑(12 h)和肝脏(6 h)中的基因表达水平的显著上调有关。另外，脑室注射葡萄糖显著诱导鳜肝脏gk (6 h)和pk (pyruvate kinase, 3 h)的表达，促进糖酵解，表明脑室通过感知的葡萄糖水平促进分解代谢为机体供能。综上，本研究首次通过脑室注射葡萄糖探究鳜下丘脑葡萄糖感知系统的存在，同时发现鳜下丘脑对葡萄糖脑室注射存在响应。且脑室注射葡萄糖可能通过对gk的调控影响AMPK/mTOR通路，调控机体食欲相关基因表达进而抑制摄食。研究结果为翘嘴鳜对饲料碳水化合物的高效利用和摄食调控研究提供理论依据。

关键词：翘嘴鳜葡萄糖感知脑室注射摄食调控糖代谢

鄱阳湖凶猛性鱼类鲶和乌鳢对克氏原螯虾幼体的捕食选择性研究

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水生生物学报 2024年第5期48卷 799-807页

作者：赵明光陈建华冯广朋王海华张燕萍江苏海洋大学海洋科学与水产学院连云港222005 中国水产科学研究院东海水产研究所上海200090 江西省水产科学研究所南昌330039

自长江禁渔以来,鄱阳湖凶猛性鱼类数量呈持续增长的态势,为明确凶猛性鱼类的捕食活动是否会对克氏原螯虾的种群造成影响,研究以鲶(Silurus asotus)、乌鳢(Channa argus)为捕食者,选择8种不同种类的饵料生物,即3种规格[小:(39.20±1.30)... 详细信息

自长江禁渔以来,鄱阳湖凶猛性鱼类数量呈持续增长的态势,为明确凶猛性鱼类的捕食活动是否会对克氏原螯虾的种群造成影响,研究以鲶(Silurus asotus)、乌鳢(Channa argus)为捕食者,选择8种不同种类的饵料生物,即3种规格[小:(39.20±1.30)mm;中:(49.82±2.13)mm;大:(58.99±1.16)mm]的克氏原螯虾(Procambarus clarkii)幼体、鲤(Cyprinus carpio)、鲫(Carassius auratus)、赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)、食蚊鱼(Gambusia affinis)、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、麦穗鱼(Pseudorasbora parva)和日本沼虾(Macrobrachium nipponense)为猎物,分别开展鲶和乌鳢对饵料生物种类和克氏原螯虾幼体规格的选择性研究。结果表明:(1)鲶、乌鳢均喜好在夜间捕食,并且鲶、乌鳢的捕食高峰期均集中在为20:00—8:00;(2)多种饵料生物同时存在时,鲶、乌鳢均未捕食克氏原螯虾幼体,并且对鲤、食蚊鱼和日本沼虾表现出较明显的捕食偏好性。(3)同种规格克氏原螯虾幼体的组合中,鲶对小规格克氏原螯虾幼体存在明显的捕食偏好性,同时乌鳢捕食小规格克氏原螯虾幼体的数量也显著高于大规格的数量(P<0.05)。(4)多种规格克氏原螯虾幼体等量混养组合中,鲶、乌鳢对小规格克氏原螯虾幼体存在明显的捕食偏好性,并且这种偏好性随克氏原螯虾幼体间规格差距增大而升高。综上,在多种饵料生物共存时,克氏原螯虾不是凶猛性鱼类的最佳猎物;但当其他饵料生物种类及数量较少时,较小的克氏原螯虾幼体依旧面临较高的捕食威胁。

关键词：鄱阳湖鲶乌鳢饵料生物克氏原螯虾幼体捕食选择性

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茶多酚对嗜水气单胞菌致病力的抑制作用

中国食品学报 2024年第1期24卷 21-30页

作者：张德福闫天慧励建荣杨秋红艾晓辉董靖渤海大学食品科学与工程学院辽宁锦州121013 中国水产科学研究院长江水产研究所武汉420223

针对嗜水气单胞菌污染水产品所致动物感染和消费者食源性疾病等问题,筛选能够抑制嗜水气单胞菌致病力的天然产物茶多酚。溶血试验表明茶多酚对气溶素溶血活性具有直接抑制作用,通过荧光热漂移和七聚体形成试验分析其作用机制。结果表明... 详细信息

针对嗜水气单胞菌污染水产品所致动物感染和消费者食源性疾病等问题,筛选能够抑制嗜水气单胞菌致病力的天然产物茶多酚。溶血试验表明茶多酚对气溶素溶血活性具有直接抑制作用,通过荧光热漂移和七聚体形成试验分析其作用机制。结果表明,茶多酚虽在128μg/mL以下不抑制嗜水气单胞菌的生长,但能在1~8μg/mL直接抑制其主要毒力蛋白气溶素的溶血活性。荧光热漂移和七聚体试验发现,茶多酚通过与气溶素直接结合,降低了气溶素七聚体的形成并抑制其活性。细胞试验结果表明,4~8μg/mL茶多酚能对气溶素导致的人肺癌上皮细胞死亡具有显著的保护作用。此外,50 mg/kg茶多酚治疗可使斑点叉尾鮰嗜水气单胞菌感染模型的存活率提高至60%。综上,茶多酚通过直接与气溶素结合,抑制气溶素形成功能性七聚体而降低其活性,从而显著降低嗜水气单胞菌的体内、外致病力。研究结果提示茶多酚可作为抗生素替代或辅助药物用于治疗嗜水气单胞菌相关感染。

关键词：嗜水气单胞菌气溶素茶多酚抗毒力水产品

β-伴大豆球蛋白诱导杂交黄颡鱼肠道上皮细胞内质网应激模型的建立

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水生生物学报 2024年

作者：张子豪郭朝辉张美娜洪佳乐于光晴董鹏生黄小城杨振江王延晖李明刘变枝河南省水产科学研究院河南农业大学动物科技学院

实验旨在利用β-伴大豆球蛋白构建黄颡鱼上皮细胞内质网应激(Endoplasmic reticulum stress, ERS)模型。利用酶消化法分离得到黄颡鱼肠道上皮细胞,通过细胞形态、角蛋白18 (Cytokeratin-18, CK-18)免疫荧光染色和碱性磷酸酶染色法鉴定... 详细信息

实验旨在利用β-伴大豆球蛋白构建黄颡鱼上皮细胞内质网应激(Endoplasmic reticulum stress, ERS)模型。利用酶消化法分离得到黄颡鱼肠道上皮细胞,通过细胞形态、角蛋白18 (Cytokeratin-18, CK-18)免疫荧光染色和碱性磷酸酶染色法鉴定。利用不同浓度β-伴大豆球蛋白刺激24h后, RT-qPCR检测相关基因转录表达水平,筛选最合适刺激浓度。在此浓度下分别刺激黄颡鱼肠道上皮细胞0、12h、24h、36h, RT-qPCR、CCK8、透射电镜和免疫荧光染色等方法检测相关指标,筛选最适刺激时间。结果表明:(1)成功分离培养黄颡鱼肠道上皮细胞,细胞呈铺路石状, CK-18和碱性磷酸酶染色呈阳性;(2)成功筛选到4 mg/mL β-伴大豆球蛋白为最佳刺激浓度。在该浓度下,除grp78、jnk、il-10、atf6外,内质网应激、自噬、凋亡、炎症等相关基因表达水平均显著最高(P<0.05);成功筛选24h为最适刺激时间。4 mg/mL β-伴大豆球蛋白刺激细胞24h显著降低细胞活力,同时引起内质网显著肿胀, GRP78、LC3、Caspase3蛋白表达和Tunel信号显著升高(P<0.01),perk、atf6、beclin1、lc3a、bcl2、caspase3、caspase9、il-12 mRNA表达水平显著最高(P<0.05)。综上,实验成功分离得到黄颡鱼肠道上皮细胞,构建了黄颡鱼肠道上皮细胞内质网应激模型。实验为进一步研究未折叠反应信号通路在黄颡鱼豆粕诱导肠炎发生发展中的作用奠定基础。

关键词：伴大豆球蛋白肠道上皮细胞内质网应激黄颡鱼

基于简化基因组测序筛选白斑狗鱼耐热性状关联的InDel标记

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水产学报 2024年第3期48卷 58-65页

作者：海萨·艾也力汗张钰杨博文咸玉兰高攀沈玉帮新疆维吾尔自治区水产科学研究所上海海洋大学水产与生命学院

为了能给白斑狗鱼耐高温性状的改良提供有效的分子标记，本研究基于白斑狗鱼热敏感组(109尾)和耐高温组(103尾)进行简化基因组测序，对25个染色体中的InDel标记，以前两个PCA为协变量，利用MLM模型(Masked Language Mode)与白斑狗鱼的... 详细信息

为了能给白斑狗鱼耐高温性状的改良提供有效的分子标记，本研究基于白斑狗鱼热敏感组(109尾)和耐高温组(103尾)进行简化基因组测序，对25个染色体中的InDel标记，以前两个PCA为协变量，利用MLM模型(Masked Language Mode)与白斑狗鱼的耐热性状进行了关联分析。结果显示，大部分InDel分布在内含子(63.69%)，外显子分布的InDel位点较少(1.30%)。通过GWAS分析，发现5个位点与白斑狗鱼耐热性状显著关联，分别位于safb基因、未知基因LOC117593903和CLSTN2基因内含子中。其中9N del、4N del-1和4N del-2三个InDel位点均位于CLSTN2基因第3内含子，这3个位点在212尾个体中基因型分布高度连锁。本研究中发现的5个InDel突变可能会对白斑狗鱼的耐热性状产生显著的影响，可作为白斑狗鱼耐热性状改良的候选分子标记。进一步在验证群体中利用KASP技术对部分位点进行了验证。发现9N del位点DD基因型个体在热敏感组中占优势，DI基因型个体在耐高温组中占优势，与简化基因组测序结果基本一致。位于CLSTN2基因第2内含子的3个InDel位点可能影响CLSTN2基因的转录，该基因可能是白斑狗鱼耐高温性状相关的重要候选基因。研究结果为白斑狗鱼分子标记辅助育种提供了理论依据，为白斑狗鱼耐热性状的改良提供了候选分子标记。

关键词：白斑狗鱼耐热性状 InDel 全基因组关联分析

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冰藏条件下不同贮存形式养殖大菱鲆品质对比

食品科学 2024年第12期45卷 243-252页

作者：庄小妹郑尧马园郭全友中国水产科学研究院东海水产研究所上海200090 上海海洋大学食品学院上海201306

为探究不同贮存形式对养殖大菱鲆(Scophthalmus maximus)品质的影响,测定其3种贮存形式(整鱼、去内脏和鱼片)在冰藏期间菌落总数、总挥发性盐基氮(total volatile base nitrogen,TVB-N)、硫代巴比妥酸(thiobarbituric acid,TBA)值、K值... 详细信息

为探究不同贮存形式对养殖大菱鲆(Scophthalmus maximus)品质的影响,测定其3种贮存形式(整鱼、去内脏和鱼片)在冰藏期间菌落总数、总挥发性盐基氮(total volatile base nitrogen,TVB-N)、硫代巴比妥酸(thiobarbituric acid,TBA)值、K值、水分分布、微观结构及蛋白降解程度的变化,采用电子舌采集其滋味轮廓,通过气相色谱-离子迁移谱对不同处理大菱鲆挥发性物质进行分析检测。结果表明:鱼片组在贮藏过程中菌落总数、TVB-N及TBA值较高,其中菌落总数在冰藏12 d时达7.05(lg(CFU/g)),超过贮藏终点。除此之外,鱼片组盐溶性蛋白质量分数在第19天时降至最低,为1.57%,同时肌纤维断裂和间隙增大的程度也更严重。与整鱼组相比,去内脏组第19天时菌落总数和TVB-N值均较高,分别为6.58(lg(CFU/g))和16.72 mg/100 g。贮藏末期整鱼组和去内脏组自由水含量占比分别为0.21%和0.28%,显著低于鱼片组(P<0.05),说明其肌肉组织结构也维持较好。最后根据气相色谱-离子迁移谱采集的指纹图谱,结合正交偏最小二乘判别分析及聚类热图分析可将不同冰藏时间下3种贮存形式大菱鲆区分开。综上所述,冰藏条件下鱼片组品质劣化速度最快,去内脏组次之,整鱼组最慢,研究结果可为替代大菱鲆传统“活品”流通方式提供参考。

关键词：大菱鲆冰藏整鱼去内脏鱼鱼片品质

产细菌素Enterocin Y3粪肠球菌对小鼠肠道菌群及代谢功能的影响

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中国食品学报 2024年第2期24卷 99-109页

作者：杨珍珠陶乐仁赵陆恺王元迟海中国水产科学研究院东海水产研究所上海200090 上海理工大学健康科学与工程学院上海200093

为探讨产细菌素Enterocin Y3粪肠球菌DH9003的益生菌作用,对15只健康C57雄性小鼠进行等体积灌胃无菌生理盐水(对照组,n=7)和粪肠球菌DH9003(处理组,n=8),4周后收集小鼠粪便,测定粪肠球菌DH9003对小鼠肠道菌群结构和代谢功能的影响。结... 详细信息

为探讨产细菌素Enterocin Y3粪肠球菌DH9003的益生菌作用,对15只健康C57雄性小鼠进行等体积灌胃无菌生理盐水(对照组,n=7)和粪肠球菌DH9003(处理组,n=8),4周后收集小鼠粪便,测定粪肠球菌DH9003对小鼠肠道菌群结构和代谢功能的影响。结果显示,用粪肠球菌DH9003灌胃小鼠,7 d内就可在其体内大量定植;7~28 d时,该细菌数量缓慢增加并趋近稳定。通过观察小鼠肠道和肝脏组织切片研究病理学特征,灌胃粪肠球菌DH9003不会对小鼠肠道和肝脏产生有害影响,相反会使小鼠的肠黏膜更为密集且长度增加,改善小鼠肠黏膜。用粪肠球菌DH9003灌胃使该菌株成为不同分组小鼠肠道差异的主要物种。同时,补充粪肠球菌DH9003对小鼠肠道的菌群结构具有一定的调节作用,导致门水平上的变化为拟杆菌门和厚壁菌门相对丰度的差异变化。灌胃粪肠球菌DH9003前和灌胃28 d后,从小鼠粪便中共检出254种差异代谢物,其中124种显著上调,130种显著下调。基于KEGG通路富集分析发现显著性水平较高的代谢通路有ABC转运蛋白和蛋白消化吸收通路。结论:小鼠摄入粪肠球菌DH9003后可在其体内定植并对肠道菌群和代谢能力有一定影响。

关键词：粪肠球菌粪肠球菌素Y3 肠道菌群代谢组学组织切片

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四川泡菜母水的微生物群落与理化特性分析

中国食品学报 2024年第2期24卷 281-291页

作者：胡此海杨絮郭全友郑尧李保国范逸文上海理工大学健康科学与工程学院上海200093 中国水产科学研究院东海水产研究所上海200090

为明确泡菜母水中的优势微生物与理化特性的相关性,采用高通量测序技术分析母水中的微生物群落结构,并进行相关性分析。结果表明:泡菜母水的总酸含量为3.00~18.90 g/kg,pH值为3.27~4.71,盐含量为11.00~15.50 g/100 g,检出草酸、苹果酸... 详细信息

为明确泡菜母水中的优势微生物与理化特性的相关性,采用高通量测序技术分析母水中的微生物群落结构,并进行相关性分析。结果表明:泡菜母水的总酸含量为3.00~18.90 g/kg,pH值为3.27~4.71,盐含量为11.00~15.50 g/100 g,检出草酸、苹果酸、琥珀酸和乳酸等7种有机酸。微生物主要群落包括厚壁菌门和子囊菌门2个门,占比均超过99.00%。优势细菌是乳杆菌属、片球菌属,优势真菌是毕赤酵母属、哈克斯坦酵母属、德巴利酵母属。相关性分析表明,乳酸杆菌属与乳酸呈显著正相关关系(P<0.05),与乙酸呈极显著正相关关系(P<0.01)。片球菌属与苹果酸呈极显著正相关关系(P<0.01)。结论:乳酸杆菌和片球菌是泡菜母水的优势微生物,研究结果为泡菜母水高效发酵菌株的选育和泡菜工业化生产提供试验参考。

关键词：泡菜母水高通量测序微生物多样性理化特性相关性