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向日葵YABBY基因家族鉴定及表达分析

生物技术通报 2024年

作者：王茜周家燕王倩邓玉萍张敏慧陈静杨军邹建西南野生动植物资源保护教育部重点实验室西华师范大学生命科学学院

【目的】鉴定向日葵中花发育相关的HaYABBY基因，有助于探究其在向日葵花发育过程中的生物学功能和调控机制，为向日葵品种选育提供重要的分子线索。【方法】基于向日葵基因组和转录组数据，使用生物信息学方法，分析向日葵YABBY基因家... 详细信息

【目的】鉴定向日葵中花发育相关的HaYABBY基因，有助于探究其在向日葵花发育过程中的生物学功能和调控机制，为向日葵品种选育提供重要的分子线索。【方法】基于向日葵基因组和转录组数据，使用生物信息学方法，分析向日葵YABBY基因家族成员的染色体定位、系统进化关系、基因结构、保守基序、蛋白结构及理化性质、启动子顺式作用元件和组织表达模式等，并通过RT-q PCR分析HaYABBY基因在WT向日葵和花分生组织决定和花器官分化缺陷突变体cb1中st2-st8时期的表达差异。【结果】在向日葵基因组中鉴定到12个YABBY基因家族成员，分属于4个亚家族，分布在8条染色体上，并且同一亚家族中成员在基因结构和保守基序组成上高度相似。其中8个基因HaYABBY1a、HaYABBY1c、HaYABBY3、HaYABBY4b、HaYABBY5a、HaYABBY5b、HaCRABS CLAWa、HaCRABS CLAWb在向日葵花发育时期特异性高表达。在这8个基因中，HaYABBY3、HaYABBY5a和HaYABBY5d在突变体cb1花发育后期表达上调，且与WT花发育早期水平相当；而HaYABBY4b和HaCRABS CLAWa在cb1中的表达被强烈抑制。顺式作用元件分析显示，HaYABBY均含有多个启动子顺式作用元件，部分元件仅存在于特定基因中。其中，胚乳表达元件存在于HaCRABS CLAWa和HaYABBY4a中；生长素响应元件存在于HaCRABS CLAWa、HaCRABS CLAWb、HaYABBY4a、Ha YABBY4b和HaYABBY5c中；分生组织表达元件存在于HaYABBY1a、HaYABBY1c、HaYABBY4b、HaYABBY5a和HaYABBY5d中；赤霉素响应元件存在于HaCRABS CLAWa、HaYABBY5b、HaYABBY5c和HaYABBY5d中；种子特异性调控元件存在于HaYABBY5a、HaYABBY5c和HaYABBY5d中。【结论】HaYABBY3、HaYABBY4b、HaYABBY5a、HaYABBY5d和HaCRABS CLAWa等5个HaYABBY基因在花分生组织的转变和花器官发生过程中可能发挥重要作用，它们在花分生组织转变和花器官发生调控中可能受到生长素响应因子ARF、赤霉素响应因子MYB以及MADS-box等关键因子调节。

关键词：向日葵 YABBY基因家族花发育花分生组织转变花器官发生基因表达

草黄口蘑多糖对S180荷瘤小鼠抗肿瘤活性分子机制研究

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食品与发酵工业 2024年第11期50卷 27-37页

作者：赵倪慧蒋琳张丁段江波丁祥侯怡铃西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室四川南充637009 西华师范大学环境科学与工程学院四川南充637009

多糖作为口蘑属真菌的主要功能成分之一,具有免疫调节、抗氧化及抗肿瘤等活性。为明确草黄口蘑多糖的结构特征及其对S180荷瘤小鼠抗肿瘤活性相关分子机制,该研究以草黄口蘑子实体经热水浸提法提取的草黄口蘑多糖[Tricholoma lascivum (F... 详细信息

多糖作为口蘑属真菌的主要功能成分之一,具有免疫调节、抗氧化及抗肿瘤等活性。为明确草黄口蘑多糖的结构特征及其对S180荷瘤小鼠抗肿瘤活性相关分子机制,该研究以草黄口蘑子实体经热水浸提法提取的草黄口蘑多糖[Tricholoma lascivum (Fr.)Gillet polysaccharide,TLG-1]为实验材料,初步解析TLG-1结构,以S180荷瘤小鼠为模型检测体内抗肿瘤活性,并采用转录组测序技术对S180肿瘤组织总RNA进行测序分析。结果表明,TLG-1重均分子质量为13 442 Da,由木糖、甘露糖、葡萄糖和半乳糖4种单糖组成,其比例为1.57∶1.45∶2.84∶4.14。TLG-1可显著抑制荷瘤小鼠S180肿瘤的生长(P<0.01),抑瘤率为53.8%。转录组测序分析显示,TLG-1能显著上调mt-Co1、Prlr、Foxa1以及下调Pitx2、Rplp1、Eef1a1及Lgals1等基因,影响S180肿瘤细胞的代谢途径,调控细胞周期并抑制上皮间质转化过程。基因本体富集分析表明,TLG-1可激活细胞因子介导的信号通路,引发细胞免疫。京都基因与基因组百科全书富集分析显示,在Jak-STAT信号通路中的Il21、Il12rb2、Il12b、Il2ra、Il2rb、Il2rg、Il15ra和Ifng等基因显著上调,通过转换肿瘤相关巨噬细胞表型及分泌干扰素-γ等,增强小鼠抗肿瘤免疫应答。该研究结果为草黄口蘑多糖的开发和利用提供了一定的理论基础。

关键词：草黄口蘑多糖TLG-1 抗肿瘤 S180 转录组测序技术 Jak-STAT信号通路

高原湿地公路工程边坡不同恢复措施下土壤理化性质及酶活性

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水土保持通报 2024年

作者：马龙李亚玲刘诗琪尹才佳邹书珍康迪西南野生动植物资源保护教育部重点实验室(西华师范大学) 西华师范大学生命科学学院

[目的]研究高寒湿地高速公路工程干扰后不同恢复措施下边坡土壤理化性质及酶活性影响,为高寒湿地植被恢复模式的筛选,水土流失治理,改善生态环境提供理论依据。[方法]以自然演替、喷播植草、草皮回覆3种处理边坡模式为研究对象,并以原... 详细信息

[目的]研究高寒湿地高速公路工程干扰后不同恢复措施下边坡土壤理化性质及酶活性影响,为高寒湿地植被恢复模式的筛选,水土流失治理,改善生态环境提供理论依据。[方法]以自然演替、喷播植草、草皮回覆3种处理边坡模式为研究对象,并以原始未扰动植被作为对照,测定土壤理化指标和土壤酶活性,分析其相互关系及影响因素。[结果](1) 3种恢复措施与对照相比均导致土壤p H值、全钾显著升高(p<0.05),土壤有机质、全氮、细根生物量、速效钾显著降低(p<0.05)在自然演替处理下都最小分别为15.16(±0.15),0.75(±0.01),0.60(±0.27),65.00(±4.5);喷播植草、草皮回覆处理下土壤颗粒中黏粉粒比例显著降低(p<0.05);喷播植草、自然演替与对照相比丰富度指数显著降低(p<0.05)在自然演替下最小为1.29(±0.02),草皮回覆与喷播植草2种恢复措施的土壤p H值、有机质、全氮、速效钾、细根生物量及其丰富度指数高于自然演替。(2)与自然演替相比喷播植草与草皮回覆能更好的恢复蔗糖酶、脲酶、碱性磷酸酶、过氧化氢酶活性,甚至过氧化氢酶活性能恢复至接近对照,在自然演替都最小分别为12.65(±10.87),0.24(±0.03),0.23(±0.05),1.73(±0.48)。(3)4种酶活性与土壤理化性质之间相关性显著,脲酶活性对土壤理化性质最为敏感,能够很好评价高原湿地边坡土壤质量。[结论]采取喷播植草、草皮回覆相对于自然演替可有效改善土壤理化性质和提高土壤酶活性,土壤酶活性能作为评价高原湿地边坡土壤质量的敏感性指标。

关键词：高原湿地草皮回覆土壤酶活性土壤理化性质

南充市昆虫传粉网络及其对主要授粉作物传粉服务价值研究

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昆虫学报 2024年第2期67卷 255-269页

作者：胡丹李秀山常雪梅胥勋露曾桂王琼西华师范大学生命科学学院西南地区野生动植物资源保护教育部重点实验室南充637009

【目的】查明四川省南充市传粉昆虫资源,研究当地植物-昆虫的传粉网络,评估传粉昆虫对该市主要授粉作物的传粉服务价值及其对农业生产的贡献。【方法】2021-2022年采用随机网捕采集、样方调查传粉昆虫资源、构建传粉网络,通过套袋隔离... 详细信息

【目的】查明四川省南充市传粉昆虫资源,研究当地植物-昆虫的传粉网络,评估传粉昆虫对该市主要授粉作物的传粉服务价值及其对农业生产的贡献。【方法】2021-2022年采用随机网捕采集、样方调查传粉昆虫资源、构建传粉网络,通过套袋隔离试验测定作物对昆虫的传粉依存度,并依据2020年南充市相关农林经济数据评估了昆虫的传粉服务价值和经济贡献率。【结果】2021-2022年从南充市共调查到传粉昆虫79种,隶属于18科50属,授粉农作物和野生蜜源植物有59种,隶属于20科50属;传粉网络呈现低连接度、中嵌套度、低等网络特化程度的结构特征;2020年南充市传粉昆虫的传粉服务价值为332 501.76~507 279.12万元,占当年农业生产总值的8.45%~12.88%。【结论】南充市的传粉昆虫资源丰富,为当地的蔬菜、水果和油料作物生产提供了充分的传粉服务;南充市传粉网络的特征明显,传粉昆虫能够维持生态系统稳定和植物物种多样性;主要授粉作物对昆虫传粉的依赖程度高,农业生产与传粉昆虫之间关系紧密,保护传粉昆虫资源有助于保障南充市农业生产,并维持野生植物群落的稳定。

关键词：传粉昆虫传粉网络传粉依存度传粉服务价值

不同植被恢复类型对四川泸石高速公路边坡土壤胞外酶及化学计量特征的影响

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土壤通报 2024年第1期55卷 161-172页

作者：杨敏阳珍胥晓严贤春刘华峰陈亚梅西华师范大学生命科学学院四川南充637009 西华师范大学西南野生动植物资源保护教育部重点实验室四川南充637009

【目的】研究不同植被恢复类型边坡土壤理化性质、胞外酶活性及其化学计量比,以及驱动土壤酶活性变化的主要因子,为边坡植被恢复提供科学依据和技术参考。【方法】以泸石高速公路边坡裸地(BL)、恢复草地(RG)、恢复林地(RW)和自然草地(NG... 详细信息

【目的】研究不同植被恢复类型边坡土壤理化性质、胞外酶活性及其化学计量比,以及驱动土壤酶活性变化的主要因子,为边坡植被恢复提供科学依据和技术参考。【方法】以泸石高速公路边坡裸地(BL)、恢复草地(RG)、恢复林地(RW)和自然草地(NG)为研究对象,测定土壤含水量、pH值、碳、氮、磷及酶活性等相关指标。【结果】①自然草地和恢复林地土壤含水量最高,裸地含水量最低,而自然草地和恢复草地土壤氮含量最高,裸地最低;②裸地土壤纤维二糖水解酶、β-葡萄糖苷酶、1,4-β-N-乙酰葡糖胺糖苷酶和酸性磷酸酶活性均低于其余三种植被类型;③除向量长度(VL)外,不同植被恢复类型土壤酶化学计量比差异显著,且向量角度均大于45°,这表明四种植被恢复类型土壤微生物更易受到磷元素限制;(4)冗余分析表明,土壤C/N、含水量、pH值、全C含量和N含量5个土壤因子共同解释土壤酶活性及其化学计量比变异的84.7%;其中,土壤C/N和含水量分别解释其变异的52.4%和39.2%。【结论】不同植被恢复类型能显著影响土壤理化性质、胞外酶活性及其化学计量比,土壤C/N和含水量对土壤胞外酶活性及酶化学计量比起主要调控作用,土壤微生物生长和活性主要受磷元素限制。整体来看,自然草地和恢复草地要优于其他两种植被类型。

关键词：公路边坡植被恢复土壤胞外酶酶化学计量比泸石高速

EPF/EPFL家族基因调控植物生长发育和非生物胁迫响应的研究进展

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生命科学 2024年

作者：聂天巡国钰环彭正松杨在君西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室西昌学院农业科学学院

表皮模式建成因子EPF/EPFL (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR/ EPF-LIKE)家族基因是植物中特有的富含半胱氨酸的一类小分泌肽。EPF/EPFL家族通常作为配体与特定受体结合，激活下游信号途径，从而参与植物的生长发育及非生物胁迫等重要的生... 详细信息

表皮模式建成因子EPF/EPFL (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR/ EPF-LIKE)家族基因是植物中特有的富含半胱氨酸的一类小分泌肽。EPF/EPFL家族通常作为配体与特定受体结合，激活下游信号途径，从而参与植物的生长发育及非生物胁迫等重要的生理过程。本文综述了EPF/EPFL家族成员的进化、结构特征，重点介绍了其在植物生长发育以及非生物胁迫方面的研究进展。并对研究EPF/EPFL家族基因的意义及有待解决的问题进行展望，旨在为进一步研究EPF/EPFL家族基因的功能提供一定的参考。

关键词：小分泌肽 EPF/EPFL 生长发育非生物胁迫

线粒体分裂基因dnm1缺失对粟酒裂殖酵母细胞有丝分裂及能量代谢的影响

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北京师范大学学报（自然科学版） 2024年第3期60卷 331-343页

作者：张丁余雯刘梦楠青昕丁祥侯怡铃西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室四川南充西华师范大学环境科学与工程学院四川南充

在粟酒裂殖酵母细胞中,线粒体分裂蛋白Dnm1是调控线粒体分裂和融合动态过程的关键蛋白.为研究酵母细胞dnm1基因缺失后对有丝分裂和能量代谢的影响,采用活细胞成像技术分析其细胞有丝分裂动力学的变化、RTqPCR技术分析cdc2和cdc13基因的... 详细信息

在粟酒裂殖酵母细胞中,线粒体分裂蛋白Dnm1是调控线粒体分裂和融合动态过程的关键蛋白.为研究酵母细胞dnm1基因缺失后对有丝分裂和能量代谢的影响,采用活细胞成像技术分析其细胞有丝分裂动力学的变化、RTqPCR技术分析cdc2和cdc13基因的转录水平、高效液相色谱质谱联用技术检测其能量代谢物的变化并验证.结果表明dnm1基因缺失后抑制裂殖酵母生长.活细胞成像显示dnm1Δ菌株在有丝分裂间期微管束长度较野生型增长了(0.83±0.70)μm(P野生型.本研究为进一步探寻Dnm1蛋白在细胞有丝分裂中的功能和相关分子机制提供了一定的科学依据.

关键词：裂殖酵母线粒体 dnm1基因有丝分裂能量代谢

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黄颡鱼的毒棘结构

水产学报 2024年第6期48卷 27-35页

作者：冯晓玉肖瑾吴邦元曾燏杜涌徽张富斌西华师范大学环境科学与工程学院国家淡水渔业工程技术研究中心(武汉)西南分中心西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护与利用教育部重点实验室成都自然博物馆

为深入了解黄颡鱼的毒棘结构，增强人们对淡水刺毒鱼类的认知。本研究结合宏观毒棘骨骼标本制作和微观组织切片等方法，深入探究黄颡鱼的毒棘结构。结果显示，黄颡鱼的胸鳍和背鳍均具有尖锐的倒刺棘骨，棘骨外包围着皮膜，皮膜拥有能分... 详细信息

为深入了解黄颡鱼的毒棘结构，增强人们对淡水刺毒鱼类的认知。本研究结合宏观毒棘骨骼标本制作和微观组织切片等方法，深入探究黄颡鱼的毒棘结构。结果显示，黄颡鱼的胸鳍和背鳍均具有尖锐的倒刺棘骨，棘骨外包围着皮膜，皮膜拥有能分泌毒液的毒腺细胞，它们共同组成了黄颡鱼毒棘装置。毒棘骨骼宏观结构表明，黄颡鱼的背鳍和胸鳍毒棘均具有贯穿全棘骨的中央管和包围棘骨的皮膜；背鳍棘骨细长、锥形，且轻微拱起，顶部骤尖，后缘为弱锯齿；胸鳍棘骨前后缘均有锯齿，但后缘为强锯齿。背鳍和胸鳍毒棘基部结构的髁突形状、大小、位置全然不同。微观结构显示，皮膜中的毒腺细胞聚集成层，位于鳞状上皮与色素层之间，未见导管与之相连，背鳍和胸鳍毒棘的分支性骨管中均未发现毒腺细胞。胸鳍和背鳍锁紧装置可让毒棘保持倒伏或者直立的锁定状态，降低猎物挣脱几率。本研究有助于深入了解黄颡鱼的毒棘结构和特征，并增强人们对淡水刺毒鱼类的认知。

关键词：黄颡鱼刺毒鱼类毒棘组织切片

笼养绿尾虹雉源肠球菌的分离鉴定及耐药性分析

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微生物学通报 2024年

作者：陈方山冯少华丁小保罗维陈黎李万洪马红张龙吴邦元西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室四川蜂桶寨国家级自然保护区管理中心西华师范大学生态研究院

【背景】绿尾虹雉是我国特有的一级重点保护野生鸟类，长期以来由于受人类活动及疾病等因素影响，其种群数量不断减少。肠球菌是一类广泛存在于自然界中的条件性致病菌，其耐药性强，治疗困难，对野生动物的保护带来挑战。【目的】因此... 详细信息

【背景】绿尾虹雉是我国特有的一级重点保护野生鸟类，长期以来由于受人类活动及疾病等因素影响，其种群数量不断减少。肠球菌是一类广泛存在于自然界中的条件性致病菌，其耐药性强，治疗困难，对野生动物的保护带来挑战。【目的】因此，为了更好的保护绿尾虹雉，关注其肠球菌感染或携带情况，以及对肠球菌特性的相关研究是很有必要的，这对绿尾虹雉种群的生存与保护有重要意义。【方法】本试验采集了蜂桶寨国家级自然保护区的笼养绿尾虹雉1年中4个不同月份的粪便，对其中的细菌进行分离纯化，再通过形态学鉴定、生化鉴定、分子学鉴定确定分离菌株种类，最后进行药敏试验探究其耐药性。【结果】试验共分离出17株菌株，其菌落在培养基上均呈现出灰白色不透明、表面光滑、直径1 mm内的圆形，菌株的糖发酵试验、温度控制试验、胆汁七叶苷水解试验呈阳性，接触酶试验和产气试验呈阴性，所有结果均符合肠球菌的基本特征，16S rDNA测序进一步验证了该结果。药敏试验结果表明绿尾虹雉源肠球菌具有较强的耐药性，其中对四环素、环丙沙星、诺氟沙星、左氧氟沙星等药物的耐药性最高。【结论】本试验成功分离出绿尾虹雉源肠球菌，并对其耐药情况进行了研究，为绿尾虹雉携带肠球菌的现状及其耐药情况提供了初步数据分析，同时对其疾病防控提供了参考。

关键词：绿尾虹雉肠球菌分离鉴定耐药性