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越橘VcANS基因的克隆及表达分析

西北农林科技大学学报（自然科学版） 2012年第6期40卷 201-209页

作者：李晓艳裴嘉博张志东吴林刘海广李海燕李亚东吉林农业大学园艺学院吉林长春130118 教育部生物反应器与药物开发工程研究中心吉林长春130118

【目的】从越橘果实中克隆花色素合成酶(ANS)基因cDNA,为研究越橘花色素苷合成的分子机制奠定基础。【方法】以越橘(Vacciniumspp.)品种"北陆"(*** L.)为试材,并以Illumina测序文库(NCBI登录号:SRA046311)中差异表达的Unigene 38125片... 详细信息

【目的】从越橘果实中克隆花色素合成酶(ANS)基因cDNA,为研究越橘花色素苷合成的分子机制奠定基础。【方法】以越橘(Vacciniumspp.)品种"北陆"(*** L.)为试材,并以Illumina测序文库(NCBI登录号:SRA046311)中差异表达的Unigene 38125片段为基础,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得花色素合成酶基因全长cDNA,利用DNAMAN和MEGA软件进行多序列比对和系统进化分析,探讨ANS基因在不同组织和器官中的相对表达量及其与对应花色素苷含量的关系。【结果】成功克隆了越橘花色素合成酶基因序列,命名为VcANS,GenBank登录号为JN654701。序列分析结果表明,VcANS全长1 424bp,包含93bp的5′非编码区、248bp的3′非编码区和1个长度为1 083bp编码360个氨基酸的开放阅读框,该基因编码的蛋白具有ANS家族普遍存在的2-酮戊二酸和Fe2+-依赖的氧化酶超家族的保守结构域。序列比对和系统进化分析表明,VcANS与杜鹃花科植物亲缘关系最近。在越橘果实发育的不同阶段,VcANS相对表达量的变化与花色素苷含量的变化趋势具有一致性。【结论】获得了越橘花色素合成酶基因全长,推测其对越橘花色素苷的形成起调控作用。

关键词：越橘花色素合成酶 RACE 序列分析基因表达

CRISPR/Cas9基因编辑系统在获取放线菌天然产物中的应用

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有机化学 2021年第11期41卷 4279-4288页

作者：乔怡张庆林陈单丹刘美娜刘文上海应用技术大学化学与环境工程学院上海201418 中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室上海200032 中国科学院上海有机化学研究所湖州生物制造创新中心浙江湖州313000

作为临床药物的重要来源,放线菌天然产物及其衍生物已被大规模开发并应用于临床.为了实现放线菌来源活性天然产物的高效合成、新型天然产物的结构衍生以及未知天然产物的定向挖掘,往往需要聚焦于生物合成基因簇,运用生物学技术开展理性... 详细信息

作为临床药物的重要来源,放线菌天然产物及其衍生物已被大规模开发并应用于临床.为了实现放线菌来源活性天然产物的高效合成、新型天然产物的结构衍生以及未知天然产物的定向挖掘,往往需要聚焦于生物合成基因簇,运用生物学技术开展理性的遗传改造.规律性成簇间隔的短回文重复序列及相关蛋白(CRISPR/Cas)是部分细菌和古细菌在长期自然进化过程中发展而来的一种对抗外源遗传物质入侵的适应性免疫防御系统.以CRISPR/Cas9为代表的基因编辑系统已被广泛应用于脱氧核糖核酸(DNA)片段的靶向特异性切割,为生物技术领域的发展提供了无限可能.综述了CRISPR/Cas9系统在放线菌遗传改造中的应用情况,包括在基因簇抓取、编辑与重构、原位同源重组以及代谢调控方面的研究进展,涉及全新的CRISPR/Cas9介导的基因编辑方法以及代表性的成功案例,为高效利用CRISPR/Cas9系统获取放线菌天然产物提供了借鉴.

关键词：放线菌天然产物生物合成基因簇基因编辑规律性间成簇间隔的短回文重复序列及相关蛋白9(CRISPR/Cas9)

痘病毒E3L蛋白在调控细胞程序性死亡中的功能

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中国兽医科学 2023年第2期53卷 223-230页

作者：蒙泽菁房永祥韦雨松谭金龙高真贞陈国华何小兵景志忠王晓霞兰州大学公共卫生学院营养与食品卫生学研究所甘肃兰州730000 中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部兽医公共卫生重点实验室甘肃兰州730046 榆林学院生命科学学院陕西榆林719000

细胞程序性死亡是一种受基因调控的细胞死亡方式,包括细胞凋亡、焦亡、坏死性凋亡、铁死亡、自噬等,这些多元化的细胞程序性死亡方式在病毒的复制和传播中发挥重要作用。其中,痘病毒通过编码大量的病毒蛋白(例如E3L、F1L等)参与介导痘... 详细信息

细胞程序性死亡是一种受基因调控的细胞死亡方式,包括细胞凋亡、焦亡、坏死性凋亡、铁死亡、自噬等,这些多元化的细胞程序性死亡方式在病毒的复制和传播中发挥重要作用。其中,痘病毒通过编码大量的病毒蛋白(例如E3L、F1L等)参与介导痘病毒免疫逃逸,抵抗宿主细胞死亡,以此维持自身复制。本文综述了痘病毒E3L蛋白在调控细胞凋亡、焦亡、坏死性凋亡中的作用,深入剖析了PKR、F1L和Zα结构域介导的E3L相关细胞程序性死亡分子机制,以期为痘病毒免疫逃逸机制探索、抗病毒药物开发等提供新思路。

关键词：痘病毒 E3L 细胞凋亡坏死性凋亡细胞焦亡

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胚胎干细胞的制备及应用

中文科技期刊数据库（引文版）教育科学 2015年第9期 3-3页

作者：陈婷河北大学生命科学院河北保定071002

近年来,胚胎干细胞(embryonic stem cell 或者embryo derived stem cells, ES cell)以其所具有的全能性、多能行、可操作性及可塑性等诸多优点,成为医学和生命科学领域研究的热点问题之一。ES细胞是研究哺乳动物胚胎早期发生、细胞分化... 详细信息

近年来,胚胎干细胞(embryonic stem cell 或者embryo derived stem cells, ES cell)以其所具有的全能性、多能行、可操作性及可塑性等诸多优点,成为医学和生命科学领域研究的热点问题之一。ES细胞是研究哺乳动物胚胎早期发生、细胞分化、基因调控等发育生物学基本问题的理想模型,也是组织工程、药理学和临床医学研究的重要工具。胚胎干细胞已在发育生物学、人类疾病和药物开发等研究领域中得到广泛应用。本文通过查阅不同的资料获得了根据不同的分离方法制备胚胎干细胞的方法,并概括了胚胎干细胞的研究意义。

关键词：胚胎干细胞分离方法制备方法

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平利县药用植物资源调查与开发利用初探

中国野生植物资源 2020年第9期39卷 64-70,74页

作者：陈利军吕鼎豪王璐史美荣陈宏殷刚肖娅萍牛俊峰陕西师范大学生命科学学院西北濒危药材资源开发国家工程实验室药用植物资源与天然药物化学教育部重点实验室陕西西安710119 山西省医药与生命科学研究院山西太原030000 陕西省微生物研究所陕西西安710043 陕西国际商贸学院医药学院陕西西安712046 平利县中医医院陕西安康725500 平利县神草园茶叶有限公司陕西安康725502

为了更好的了解和掌握陕西省安康市平利县野生药用植物资源的组成及药用特点,结合全国第四次中药资源普查,从2012年至2014年通过野外调查、查阅文献、归纳总结的方法对平利县药用植物资源的种类、生长型、药用器官类型、药效类型等进行... 详细信息

为了更好的了解和掌握陕西省安康市平利县野生药用植物资源的组成及药用特点,结合全国第四次中药资源普查,从2012年至2014年通过野外调查、查阅文献、归纳总结的方法对平利县药用植物资源的种类、生长型、药用器官类型、药效类型等进行研究。结果显示:(1)平利县共调查得到具有药用价值的野生植物有86科265种。其中被子植物有215种,占药用植物总数的81.13%;蕨类植物有47种,占药用植物总数的17.74%;菌类与裸子植物野生资源仅分别为1种和2种,分别占药用植物总数的0.37%和0.76%;重点野生药用植物共有25种,占全县药用植物总科数的24.42%,物种数占药用植物总数的9.43%。(2)在这些药用植物中草本植物最多,有142种,占药用植物总数的53.58%;木本植物占46.04%,有122种;菌类1种,占总数的0.37%;在所有木本植物中,灌木最多、乔木次之、藤本最少。(3)从药用植物的药用器官类型看,全草入药的最多,有87种,占32.83%;根及根茎入药的次之,有79种,占29.81%。(4)从药用植物的药效类型看,清热药和解毒杀虫药最多,都有92种,分别占到平利县所调查获得的药用植物资源的32.17%。最终结合平利县实际情况提出对药用植物资源进行合理保护及开发利用的建议,为制定平利县及陕西省中药产业发展政策与规划提供科学依据。

关键词：药用植物资源普查开发利用平利县

腊肠树叶绿体基因组序列特征及其系统发育分析

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环球中医药 2022年第12期15卷 2266-2274页

作者：向如双段宝忠孙伟宋驰王艳 Atia tul Wahab 孟祥霄大理大学药学院 671000 中国中医科学院中药研究所中国中医科学院中药生物技术中心中国中医科学院中药数据中心成都中医药大学本草基因组学研究院卡拉奇大学国际化学与生命科学研究院化学研究所卡拉奇大学分子医学与药物研究所

目的获取腊肠树(Cassia fistula L.)叶绿体基因组信息特征,对其在决明属(Cassia Linn.)中的系统发育位置进行研究,为腊肠树有效的开发、保护和利用提供理论依据。方法使用Illumina测序技术对腊肠树进行测序,并结合生物信息学方法对其进... 详细信息

目的获取腊肠树(Cassia fistula L.)叶绿体基因组信息特征,对其在决明属(Cassia Linn.)中的系统发育位置进行研究,为腊肠树有效的开发、保护和利用提供理论依据。方法使用Illumina测序技术对腊肠树进行测序,并结合生物信息学方法对其进行叶绿体基因组组装、注释和系统发育分析。结果腊肠树叶绿体基因组长度为161,724 bp,具有典型的四分体结构,总GC含量为36.1%,包含128个基因,其中83个蛋白质编码基因,37个tRNA基因和8个rRNA基因。系统发育分析表明,7个决明属物种被聚为3支,美丽决明***、望江南***、铁刀木***和决明***聚为一支,腊肠树***与布鲁斯特决明***聚为一支,山扁豆Chamaecrista mimosoides单独聚为一支,且腊肠树与布鲁斯特决明***的亲缘关系最近。结论从叶绿体基因组系统发育的角度来看,本研究支持2010版的Flora of China的决明亚族植物种类的划分结论,决明属物种中的美丽决明***、望江南***、铁刀木***和决明***应归为番泻决明属(Senna),腊肠树***应归为决明属(Cassia),山扁豆***应归为山扁豆属(Chamaecrista)。

关键词：腊肠树叶绿体基因组决明属系统发育分子鉴定传统药物

捻转血矛线虫耐苯并咪唑虫株与敏感虫株P-gp基因的比较分析

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捻转血矛线虫耐苯并咪唑虫株与敏感虫株P-gp基因的比较分析

中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第六次代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：王瑞杨晓野刘鑫远曲娜蔡葵蒸农业部动物临床诊疗技术重点实验室内蒙古农业大学兽医学院西北民族大学生命科学与工程学院

捻转血矛线虫(Haemonchus contortus)是一种严重危害羊群健康的寄生性线虫,传统的防治方法是依靠化学药物进行驱虫。据资料报道和临床驱虫工作显示,捻转血矛线虫对常用驱虫药的耐药性已成为全世界所面临的严重问题。影响虫体耐药性产生...

捻转血矛线虫(Haemonchus contortus)是一种严重危害羊群健康的寄生性线虫,传统的防治方法是依靠化学药物进行驱虫。据资料报道和临床驱虫工作显示,捻转血矛线虫对常用驱虫药的耐药性已成为全世界所面临的严重问题。影响虫体耐药性产生和发展的因素很多,有资料显示虫体的基因改变可导致其产生耐药性,P-糖蛋白(P-gp)基因便是其中与耐药性相关结构的一类基因。为了研究羊捻转血矛线虫耐药性与P-gp基因的相关性及P-gp基因在耐药虫株和敏感虫株之间的差异,本试验取分离自田间并已鉴定为耐苯并咪唑的羊捻转血矛线虫(Haemonchus contortus)虫株和实验室保存的对苯并咪唑敏感的羊捻转血矛线虫虫株,按照标准方法提取其基因组DNA,利用PCR扩增耐药虫株和敏感虫株P-gp基因部分序列并测序分析。结果显示:试验所得羊捻转血矛线虫的P-gp基因片段为831bp,其中对苯并咪唑产生了耐药性的羊捻转血矛线虫的P-gp基因片段与敏感株相比,426bp处的碱基由G变为了C。这一结果为今后利用分子生物学方法检测羊捻转血矛线虫耐药性提供了参考依据,同时也为研究捻转血矛线虫耐药性产生的机制提供了基础数据。

关键词：

来源： cnki会议评论

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类器官——抗肿瘤药物研究的新模型

中药药理与临床 2022年第5期38卷 200-208页

作者：李娇李睿赵海洋吴梦春李莉张翼冠谭蕊蓉赵军宁四川大学华西药学院成都610041 四川省中医药科学院四川省中医药转化医学中心国家中医药管理局中药质量生物评价重点研究室中医药转化医学四川省重点实验室四川省道地药材形成原理与品质评价工程研究中心四川省道地药材系统开发工程技术研究中心成都610041 电子科技大学医学院附属肿瘤医院四川省肿瘤医院放疗中心成都610041 西南科技大学生命科学与工程学院绵阳621010 成都大学食品与生物工程学院成都610106

类器官是近年发展起来的基于干细胞或器官前体细胞体外培养而成的3D器官类似物,有研究表明肿瘤类器官能够很好地保留来源肿瘤的基因型和组织学特性。目前包括肺癌、肝癌、结直肠癌、乳腺癌、等在内的肿瘤类器官都表现出了与临床效果相... 详细信息

类器官是近年发展起来的基于干细胞或器官前体细胞体外培养而成的3D器官类似物,有研究表明肿瘤类器官能够很好地保留来源肿瘤的基因型和组织学特性。目前包括肺癌、肝癌、结直肠癌、乳腺癌、等在内的肿瘤类器官都表现出了与临床效果相似的药物敏感性,在临床前药物研究中也体现了与基因型相关的药物预测潜力,是极具潜力的抗肿瘤药物新模型。本文综述了类器官技术的发展现状、肿瘤类器官在药物研究方面的应用,并对比了类器官与其他肿瘤模型的优势和局限,对于促进恶性肿瘤的新药研究及个体化治疗意义重大。

关键词：类器官恶性肿瘤抗肿瘤药物

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系统药理学原理、方法及在中医药中的应用

世界中医药 2015年第2期10卷 280-286页

作者：张文娟王永华西北农林科技大学生命学院生物信息学中心系统药理学实验室咸阳712100

目的:建立科学有效的现代中药研究体系,是中医药现代化进程中亟待解决的关键问题之一,然而目前从系统和整体水平研究中药的理论和方法均不成熟。方法:本文将综述当前系统药理学的最新进展,阐明如何整合药效学、药动学以及基因、蛋白、... 详细信息

目的:建立科学有效的现代中药研究体系,是中医药现代化进程中亟待解决的关键问题之一,然而目前从系统和整体水平研究中药的理论和方法均不成熟。方法:本文将综述当前系统药理学的最新进展,阐明如何整合药效学、药动学以及基因、蛋白、药物网络分析等技术,形成一个完整的可供中药药理学、药效学预测和验证的技术体系。结果:重点从中药基础理论、复方解析、注射液的研究、老方优化和新药开发方面介绍系统药理学在中医药中的应用。结论:本文提出的系统药理学研究体系为中药的现代研究提供了新方法学,将有助于系统、深刻地从系统水平和分子水平揭示中药和机体的相互作用机制,从而指导中药新药研发。

关键词：系统药理学系统生物学生物信息学中药