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东北春播区糜子核心种质的荧光微卫星标记鉴定

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作物学报 2024年第7期50卷 1728-1739页

作者：丁艺冰辛旭霞冯智尊郭娟曹越陈喜明王晓丹曹晓宁 SANTRA Dipak K 陈凌乔治军王瑞云山西农业大学农学院中国山西太谷030801 山西农业大学玉米研究所中国山西忻州034000 山西农业大学农业基因资源研究中心/农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室中国山西太原030031 内布拉斯加大学林肯分校农艺系小宗粮豆研究与推广中心美国内布拉斯加州斯克茨布拉夫69361

优异种质资源是糜子新品种选育和产业发展的基础。本研究以190份东北春播区糜子核心种质为材料,利用前期构建的SSR标记在5'端标注荧光,进行PCR扩增和毛细管电泳。根据毛细管电泳检测的片段有无采用“0/1”表示,利用ID Analysis4.0进行区... 详细信息

优异种质资源是糜子新品种选育和产业发展的基础。本研究以190份东北春播区糜子核心种质为材料,利用前期构建的SSR标记在5'端标注荧光,进行PCR扩增和毛细管电泳。根据毛细管电泳检测的片段有无采用“0/1”表示,利用ID Analysis4.0进行区分,使用PopGene、PowerMarker、MEGA、Structure、NTSYS进行遗传多样性分析。试验结果表明,3个荧光SSR标记组合(RYW3+RYW6+RYW28)可区分190份材料,共检测出等位变异73个,平均为24.3333;有效等位基因数(Ne)为5.4728(RYW3)~15.8922(RYW6),平均为9.6496;检出Shannon多样性指数(I)为2.0851(RYW3)~2.9457(RYW6),平均为2.4896;观测杂合度(Ho)为0.7529(RYW6)~0.9574(RYW28),平均为0.8876;期望观测杂合度(He)为0.8194(RYW3)~0.9398(RYW6),平均为0.8765;Nei’s基因多样性指数(Nei)为0.8173(RYW3)~0.9371(RYW6),平均为0.8741;多态性信息含量(PIC)为0.8656(RYW3)~0.9722(RYW6),平均为0.9198。基于UPGMA将190份资源划分为3个群组。基于Structure的遗传结构分析(K=3)将糜子核心种质分为3个类群,来源于东北地区的4个基因库(黑龙江、吉林、辽宁和内蒙古的一部分)。基于主成分分析将材料分为4个类群,与地理来源一致。利用在线二维码技术(https://***/)构建了190份东北糜子核心种质的DNA分子身份证。

关键词：糜子东北春播区荧光微卫星标记毛细管电泳 DNA分子身份证

应用自动荧光测序系统分析不同水稻基因型SSLPs

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作物学报 2000年第5期26卷 565-569页

作者：李莉杨剑波 D.J.Mackill P.M.Colowit 安徽省农业科学院水稻遗传育种农业部重点开放实验室安徽合肥230031 美国加州大学戴维斯分校水稻遗传实验室

本研究使用 30对微卫星引物 ,对 14个不同类型及来源的水稻基因型材料进行 SSR片段长度的多态性分析 ,并运用自动荧光测序系统精确检测 SSL P片段的长度 ,结合 Gene Scan2 .1和 Genotype2 .0分析软件进行数据输出和图象处理 ,得到了多... 详细信息

本研究使用 30对微卫星引物 ,对 14个不同类型及来源的水稻基因型材料进行 SSR片段长度的多态性分析 ,并运用自动荧光测序系统精确检测 SSL P片段的长度 ,结合 Gene Scan2 .1和 Genotype2 .0分析软件进行数据输出和图象处理 ,得到了多态性丰富的微卫星标记。可以利用这些标记区别和鉴定不同类型和来源的水稻种质材料。

关键词：自动荧光测序水稻简单序列重复多态性分析

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外源性电场对组织修复过程中细胞行为的影响

中国细胞生物学学报 2014年第4期36卷 552-556页

作者：刘永玲高润池赵三军赵敏王晓燕云南师范大学再生生物学实验室昆明650500 美国加州大学戴维斯分校医学院

组织修复涉及一系列复杂的生理学、免疫学及细胞生物学过程。研究表明,受损组织周围存在着一定强度的内源性电场,类似生理强度的外源性电场能指导细胞定向迁移、控制细胞极化、调节细胞增殖和分化等一系列生物学行为。该文针对外源性电... 详细信息

组织修复涉及一系列复杂的生理学、免疫学及细胞生物学过程。研究表明,受损组织周围存在着一定强度的内源性电场,类似生理强度的外源性电场能指导细胞定向迁移、控制细胞极化、调节细胞增殖和分化等一系列生物学行为。该文针对外源性电场在伤口愈合、骨组织愈合以及血管新生过程中的细胞生物学作用及其对修复过程中组织水平的影响进行综述,以期为外源性电场在今后临床中的应用提供参考。

关键词：外源性电场细胞行为组织修复

东北春播区糜子核心种质及其DNA分子身份证构建

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作物学报 2024年第5期50卷 1181-1192页

作者：丁艺冰辛旭霞冯智尊曹越郭娟 Dipak K SANTRA 王瑞云陈喜明山西农业大学玉米研究所中国山西忻州034000 山西农业大学农学院中国山西太谷030801 内布拉斯加大学林肯分校农艺系小宗粮豆研究与推广中心美国内布拉斯加州斯克茨布拉夫69361 山西农业大学杂粮种质创新与分子育种山西省重点实验室中国山西太原030000

本研究以500份东北春播区糜子资源为材料,利用169个SSR标记,采用UPGMA聚类分组,进行分层抽样,构建核心种质,同时应用ID Analysis 4.0软件构建分子身份证。利用等位基因数(Na)等遗传多样性衡量指标评估核心种质的遗传差异,并利用PCOA分... 详细信息

本研究以500份东北春播区糜子资源为材料,利用169个SSR标记,采用UPGMA聚类分组,进行分层抽样,构建核心种质,同时应用ID Analysis 4.0软件构建分子身份证。利用等位基因数(Na)等遗传多样性衡量指标评估核心种质的遗传差异,并利用PCOA分析核心种质。结果表明,对169对SSR引物进行筛选,发现30对多态性好,利用30对SSR引物构建的糜子核心种质包含190份材料,占全部种质的38%,全部种质与核心种质的均检测出91个等位变异,保留了100%等位基因;有效等位基因数为2.2977~2.9975和2.2872~3.0173,平均值分别为2.8198和2.8297;Shannon多样性指数为0.9532~1.0990和0.9535~1.1162,平均值为1.0645和1.0667;观测杂合度为0.3434~0.8037和0.3162~0.7849,平均值为0.5399和0.5359;期望杂合度为0.5654~0.6672和0.5645~0.6707,平均值为0.6448和0.6473;Nei’s基因多样性指数为0.5648~0.6664和0.5628~0.6686,平均值为0.6441和0.6452;多态性信息含量为0.6657~0.8356和0.6493~0.8340,平均值为0.7974和0.7944。全部种质与核心种质的分子标记的相关指标进行t检验,结果无显著性差异,且PCOA分析表明核心种质与全部种质具有相似的遗传多样性和群体结构,同时发现8个SSR标记(RYW5、RYW8、RYW16、RYW28、RYW40、RYW53、RYW62和RYW67)可区分190份核心种质,构建了东北糜子核心种质的分子身份证。

关键词：糜子东北春播区 SSR 核心种质 DNA分子身份证

全球化时代的人文知识分子与大学人文教育——鲁晓鹏教授访谈录

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中国农业大学学报（社会科学版） 2015年第2期32卷 5-17页

作者：鲁晓鹏李焕征美国加州大学戴维斯校区比较文学系美国加州大学比较文学研究中心中国农业大学人文与发展学院

引言：2013—2014年间,我在美国加州大学访学,听课、学习之余暇,跟鲁晓鹏教授多有接触,对他的学术抱负和成就也是心向往之。2014年4月14日下午,在加州大学戴维斯校区人文学院鲁晓鹏教授的办公室,就有关知识分子和人文教育的话题,我专门... 详细信息

引言：2013—2014年间,我在美国加州大学访学,听课、学习之余暇,跟鲁晓鹏教授多有接触,对他的学术抱负和成就也是心向往之。2014年4月14日下午,在加州大学戴维斯校区人文学院鲁晓鹏教授的办公室,就有关知识分子和人文教育的话题,我专门采访了他。从传统知识分子到全球化时代的新知识分子,再到当下的中美人文教育,

关键词：美国加州大学人文知识分子全球化时代人文教育教授访谈录传统知识分子新知识分子

小鼠皮肤黑色素瘤细胞在三种不同基质上的趋电性比较

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中国细胞生物学学报 2014年第6期36卷 799-804页

作者：许琳峰赵敏王晓燕赵三军云南师范大学再生生物学实验室昆明650500 美国加州大学戴维斯分校医学院再生治疗研究所

微小直流电场具有指导细胞进行定向迁移的作用。各种细胞外基质的物理、化学性质会影响细胞的迁移。该研究以小鼠皮肤黑色素瘤细胞(B16-F10)为模型,比较微直流电场(250 mV/mm)指导下细胞在平滑基底与两种不同市售基质Matrigel及FNC上的... 详细信息

微小直流电场具有指导细胞进行定向迁移的作用。各种细胞外基质的物理、化学性质会影响细胞的迁移。该研究以小鼠皮肤黑色素瘤细胞(B16-F10)为模型,比较微直流电场(250 mV/mm)指导下细胞在平滑基底与两种不同市售基质Matrigel及FNC上的趋电性。结果显示,黑色素瘤细胞在三种基底上均有明显的向电场阴极迁移的趋电运动,但在不同基质上细胞趋电的方向性无显著差异,但细胞迁移速度及在细胞沿电场进行定向迁移的持续性有显著差异。

关键词：黑色素瘤细胞微直流电场基质细胞迁移

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影响细胞趋电性因素的研究

中国细胞生物学学报 2015年第3期37卷 441-449页

作者：魏喆赵三军赵敏高润池施利民王晓燕云南师范大学再生生物学实验室昆明650500 美国加州大学戴维斯分校医学院

细胞在直流电场中因受电场诱导而做出的方向性迁移被称为细胞的趋电性。细胞的趋电性涉及胚胎发育、炎症反应、肿瘤转移、损伤修复以及组织再生等复杂的生物学过程。研究表明,细胞的趋电性主要由细胞内外多方面因素共同影响。该文针对... 详细信息

细胞在直流电场中因受电场诱导而做出的方向性迁移被称为细胞的趋电性。细胞的趋电性涉及胚胎发育、炎症反应、肿瘤转移、损伤修复以及组织再生等复杂的生物学过程。研究表明,细胞的趋电性主要由细胞内外多方面因素共同影响。该文针对离子浓度、膜电位与电压门控离子通道、细胞外基质与血清、生长因子及其受体、蛋白激酶信号通路以及细胞骨架等因素对细胞趋电性的影响进行综述,以期为阐明细胞趋电性相应的机制提供参考。

关键词：细胞趋电性外源性电场影响因素

饥饿对盘基网柄菌细胞迁移特征及伪足性状的影响

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中国细胞生物学学报 2013年第4期35卷 494-501页

作者：郭晓慧赵敏王晓燕赵三军高润池高晶施利民云南师范大学再生生物学实验室昆明650500 美国加州大学戴维斯分校医学院再生治疗研究所皮肤科美国约翰.霍普金斯大学医学院细胞生物学系

该实验通过研究饥饿条件下盘基网柄菌(Dictyostelium discoideum)的迁移特征及其伪足性状参数的变化情况,揭示能量匮乏时细胞迁移特征与其伪足性状之间的相关性。结果显示,与营养充足的对照组细胞相比,饥饿处理后细胞运动速度和运动方... 详细信息

该实验通过研究饥饿条件下盘基网柄菌(Dictyostelium discoideum)的迁移特征及其伪足性状参数的变化情况,揭示能量匮乏时细胞迁移特征与其伪足性状之间的相关性。结果显示,与营养充足的对照组细胞相比,饥饿处理后细胞运动速度和运动方向持续性显著增加,饥饿3 h后运动速度达到最大,为8.36μm/min,饥饿5 h后运动方向持续性最强。随饥饿时间的延长,细胞平均每分钟形成的伪足数目显著增加,饥饿3 h后细胞形成的伪足数目最多,为5.18条/min,裂生型伪足在饥饿5 h时形成比例最大,达73.55%。细胞迁移特征与其伪足性状相关性分析的结果显示,盘基网柄菌的迁移速度与伪足数目呈正相关,而裂生型伪足的比例影响了细胞运动方向的持续性,细胞伪足延伸时间、延伸面积、伪足长度受饥饿的影响程度较小。

关键词：盘基网柄菌饥饿迁移伪足

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同步辐射核共振振动能谱学(上)：原理篇

物理 2014年第9期43卷 579-588页

作者：王宏欣周朝晖徐伟劳伦兹·伯克利国家实验室美国加州伯克利94720 加州大学戴维斯分校化学系美国加州戴维斯95616 厦门大学化学化工学院厦门361005 中国科学院高能物理研究所北京100049

核共振振动能谱学(简称核振能谱)是一种以同步辐射为实验基础的新型的振动能谱学方法。与红外、拉曼等传统的振动光谱学方法相比,核振能谱在理论上和实验上具有一系列突出的特点和优越性,从而在各学科,特别是在铁基化学和铁基生物化学... 详细信息

核共振振动能谱学(简称核振能谱)是一种以同步辐射为实验基础的新型的振动能谱学方法。与红外、拉曼等传统的振动光谱学方法相比,核振能谱在理论上和实验上具有一系列突出的特点和优越性,从而在各学科,特别是在铁基化学和铁基生物化学的研究中有着广泛的应用。文章分为上下两篇,上篇介绍核振能谱的基本概念、基本理论、实验方法和实验条件等基础内容,并以简单的四氯化铁离子([FeCl4]-)为例,演示由原始核振能谱到振动态密度函数(PVDOS)的分析流程。在选材上,文章侧重先进性、代表性和实用性;在叙述上,考虑到非同步辐射专业研究者的阅读需要,文章突出实验科学和应用科学的内容,力求简单明了、通俗易懂。下篇将系统介绍该能谱学方法在化学与生物化学中的应用实例。

关键词：核共振振动能谱学(简称核振散射) 核散射 X射线非弹性散射振动态密度函数简正模态分析密度泛函理论