检索结果-南通市图书馆

水稻OsGRF6基因的克隆及调控初生根发育功能初步分析

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西北植物学报 2024年第1期44卷 22-33页

作者：余青青单玉爽尚汇鑫曾川张泽勇厅市共建甘薯及特色豆科作物种质创新与利用四川省重点实验室四川南充637000 细胞活动与逆境适应教育部重点实验室兰州730000 重庆三峡农业科学院重庆万州404001

【目的】OsGRF6隶属于GRF家族,参与调控植物的生长发育和植物对非生物胁迫的耐受性。试验旨在探究OsGRF6参与调控水稻初生根发育的分子机制,为深入研究OsGRF6参与调控水稻根的发育提供新线索。【方法】通过PCR从水稻品种‘ZH11’中克隆得到转录因子基因OsGRF6,对其进行进化树构建、启动子分析;同时对OsGRF6-OE(过表达材料)和osgrf6(突变体)进行基因型分析、qRT-PCR鉴定和水稻表型观察,采用酵母单杂交技术对OsGRF6的结合基序进行检测,并通过ChIP-seq和RNA-seq数据对OsGRF6下游的直接靶基因进行分析。【结果】(1)OsGRF6含有1个QLQ和1个WRC保守的功能结构域,与拟南芥AtGRF1和AtGRF2以及水稻OsGRF7亲缘关系较近,且OsGRF6启动子区域含有多个非生物胁迫和激素响应顺式作用元件;(2)OsGRF6在水稻种子、幼穗和根中表达量较高,而在叶中表达量较低;OsGRF6定位于细胞核,并且具有转录激活活性;(3)与野生型相比,OsGRF6-OE转基因材料初生根长度较长,而osgrf6突变体材料表现出初生根变短的表型;(4)OsGRF6能与CGGCA基序结合;(5)ChIP-seqs和RNA-seqs分析发现,OsGRF6靶基因中包含OsARF7、OsARF4等多个参与调控水稻根发育的基因。【结论】OsGRF6除了参与调控水稻株型和种子发育外,还能通过直接调控生长素途径中基因(如OsARF7、OsARF4等)的表达调控水稻根的发育。

关键词：水稻 OsGRF6 初生根发育

白色侧齿霉菌在文物表面的生态适应及其防治研究进展

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应用生态学报 2024年第3期35卷 837-846页

作者：马小瑞武发思马文霞张琪冯虎元兰州大学生命科学学院细胞活动与逆境适应教育部重点实验室兰州730000 敦煌研究院国家古代壁画与土遗址保护工程技术研究中心甘肃敦煌736200 古代壁画保护国家文物局重点科研基地甘肃敦煌736200 甘肃省敦煌文物保护研究中心甘肃敦煌736200

文物是人类历史的结晶,是不可再生、不可替代的资源。微生物广泛定殖于古代壁画、石质文物及其他类型文化遗产上并造成危害,其中优势病害真菌白色侧齿霉菌的分布尤为广泛,其可在多种文物和极端环境中生存,严重威胁着珍贵文化遗产的长久... 详细信息

文物是人类历史的结晶,是不可再生、不可替代的资源。微生物广泛定殖于古代壁画、石质文物及其他类型文化遗产上并造成危害,其中优势病害真菌白色侧齿霉菌的分布尤为广泛,其可在多种文物和极端环境中生存,严重威胁着珍贵文化遗产的长久保存。白色侧齿霉菌的分类命名经历了几次变化,导致其对文物的影响尚未被特别关注。本文以白色侧齿霉菌为主线,梳理了其分类发展简史、分布范围、文化遗产类型偏好,分析了其生理、生化、生态特征及潜在的生物退化机制,提出了其可作为文化遗产微生物危害的指示物种,讨论了此类典型壁画微生物的防治对策,并展望了该领域未来的重点研究方向。

关键词：优势病害真菌耐盐嗜温酶生产者文化遗产

绿脓菌素抑制缺铁环境中铜绿假单胞菌的生长代谢

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兰州大学学报（自然科学版） 2024年第2期60卷 269-275页

作者：范颖俞晓泉冯瀚中王勇何永兴郭玎玎兰州大学药学院兰州730000 兰州大学第二医院泌尿外科甘肃省泌尿系疾病研究重点实验室兰州730030 兰州大学生命科学学院细胞活动与逆境适应教育部重点实验室兰州730000 兰州大学口腔医学院牙颌面重建与生物智能制造重点实验室兰州730000

为了探究铁离子对铜绿假单胞菌(PA)的影响,在缺铁及加铁条件下探究PA绿脓杆菌(PAO1)的生长状态,结果发现缺铁离子限制PAO1的生长.利用蛋白质组学质谱技术检测PAO1在不同铁离子条件下的蛋白表达差异,结果表明与合成绿脓菌素相关的吩嗪类... 详细信息

为了探究铁离子对铜绿假单胞菌(PA)的影响,在缺铁及加铁条件下探究PA绿脓杆菌(PAO1)的生长状态,结果发现缺铁离子限制PAO1的生长.利用蛋白质组学质谱技术检测PAO1在不同铁离子条件下的蛋白表达差异,结果表明与合成绿脓菌素相关的吩嗪类蛋白在缺铁条件下表达量发生显著上调;定量检测结果验证PAO1在缺铁环境中产生绿脓菌素的量相较于加铁环境显著增加;通过检测外源加入的绿脓菌素对PAO1在缺铁及加铁条件下生长状态的影响,表明绿脓菌素会导致PAO1在生长初期生长缓慢且在生长中期菌体密度显著下降. PA生长状态的变化可能是由于缺铁条件下PAO1产生的绿脓菌素对其自身的杀伤作用所致.

关键词：铜绿假单胞菌绿脓杆菌缺铁环境绿脓菌素蛋白质组学

果生刺盘孢致病关键转录因子CfCrzA的功能

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菌物学报 2024年第1期43卷 45-57页

作者：卢一鸣刘广利杨文睿梁晓飞孙广宇张荣西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室、植保资源与病虫害治理教育部重点实验室、农业农村部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室陕西杨凌712100

由果生刺盘孢Colletotrichumfructicola引起的苹果炭疽叶枯病是我国苹果上的一种新病害。前期通过组学分析发现一个在侵染早期表达的转录因子CfCrzA,本研究拟明确其在果生刺盘孢生长发育和致病中的作用。生物信息学分析显示,CfCrzA为刺... 详细信息

由果生刺盘孢Colletotrichumfructicola引起的苹果炭疽叶枯病是我国苹果上的一种新病害。前期通过组学分析发现一个在侵染早期表达的转录因子CfCrzA,本研究拟明确其在果生刺盘孢生长发育和致病中的作用。生物信息学分析显示,CfCrzA为刺盘孢属保守基因。采用同源重组方法获得2个敲除突变体。表型分析显示,突变体ΔCfCrzA与野生型WT生长速率无明显差别;致病性测定显示,ΔCfCrzA对苹果叶片和果实致病力显著下降。玻璃纸接种试验显示ΔCfCrzA孢子萌发率降低26%±3%,附着胞形成率降低43%±1%;叶片组织学观察发现ΔCfCrzA附着胞形成率降低60%±1%,但侵染泡囊和初生菌丝形成不受影响。培养发现ΔCfCrzA对细胞壁胁迫相关SDS的敏感性显著提升。这些结果表明转录因子CfCrzA为果生刺盘孢的关键致病因子,主要通过影响分生孢子萌发、附着胞形成等影响其致病力。

关键词：果生刺盘孢苹果转录因子C2H2 炭疽叶枯病

小麦miR393基因家族的生物信息学分析及靶基因鉴定

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分子植物育种 2024年

作者：梁慧慧何甜甜孙迪虎仲崇佳生嘉诚李俊蓉赵昕鹏张震李浩刘昕晔郭光辉河南大学农学院河南大学省部共建作物逆境适应与改良国家重点实验室河南大学生命科学学院河北师范大学分子细胞生物学教育部重点实验室

MiRNA在植物生长发育过程中发挥着重要作用，miR393是许多植物中非常保守的一类miRNA，能够靶向生长素受体基因Transport Inhibitor Response 1(TIR1)/Auxin Signaling F-box (AFB)，是生长素信号途径的重要调节器，可以影响植物的生长... 详细信息

MiRNA在植物生长发育过程中发挥着重要作用，miR393是许多植物中非常保守的一类miRNA，能够靶向生长素受体基因Transport Inhibitor Response 1(TIR1)/Auxin Signaling F-box (AFB)，是生长素信号途径的重要调节器，可以影响植物的生长发育并参与对胁迫的响应。本研究通过生物信息学方法，分析探究了小麦中miR393家族(Tae-miR393)成员构成、在植物中的进化关系、表达模式及其靶基因。研究结果表明，miR393成熟体序列在植物中高度保守，7个小麦Tae-miR393成员根据其成熟体序列的不同分为a(Tae-miR393a)和b (Tae-miR393b)两种类型，两种类型的成熟体序列长度皆为21 nt；7个Tae-miR393基因定位于2A、2B、2D、3A、3B和3D染色体上；靶基因预测分析结果表明，Tae-miR393能够靶向6个小麦TIR1基因和8个非TIR1基因，其中降解组数据支持Tae-miR393对小麦TIR1基因TraesCS2D02G285000、 TraesCS2B02G302900的靶向。小麦不同组织小RNA测序数据和转录组数据分析结果表明，Tae-miR393a成熟体在叶片中表达量较高，在种子和根中表达量较低，Tae-miR393b成熟体在所有组织中表达量均比较低；预测到的Tae-miR393靶基因在叶片中表达量低，与Tae-miR393表达量呈现出明显的负相关关系。这些研究结果为后续小麦miR393基因的功能解析奠定了基础。

关键词：生物信息学 miR393鉴定靶基因预测表达模式分析

转录因子在植物内质网胁迫中的作用及分子机制研究进展

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植物生理学报 2024年

作者：白雨婷张文晓周倩向凤宁山东大学生命科学学院植物发育与环境适应生物学教育部重点实验室山东大学生命科学学院植物发育与环境适应生物学教育部重点实验室

植物的一生常遭受各种胁迫,导致错误折叠蛋白或未折叠蛋白在细胞内积累,进而引发内质网胁迫。植物主要通过内质网质量监控系统(ER quality control, ERQC)、内质网相关降解(ER-associated degradation, ERAD)、未折叠蛋白反应(unfolded ... 详细信息

植物的一生常遭受各种胁迫,导致错误折叠蛋白或未折叠蛋白在细胞内积累,进而引发内质网胁迫。植物主要通过内质网质量监控系统(ER quality control, ERQC)、内质网相关降解(ER-associated degradation, ERAD)、未折叠蛋白反应(unfolded protein response, UPR)以及自噬来抵抗内质网胁迫。其中UPR是一种通过信号转导来增强蛋白质折叠和修复能力以及促进错误折叠蛋白降解的途径,植物UPR中IRE1和bZIP17/28两种途径已被证实。许多转录因子(transcription factors)参与响应内质网胁迫,主要涉及bZIP、NAC、HSF、WRKY和NF-Y核因子等基因家族,是作物抗逆遗传改良的目标基因,因此研究内质网应激调控机制具有重要意义。本文主要简述了内质网应激中ERQC、ERAD、UPR以及自噬反应的一般原理并对参与内质网应激的转录因子的调控机制研究进展进行综述,以期为植物内质网胁迫中转录因子的作用机制解析及作物抗逆遗传改良提供参考。

关键词：植物转录因子内质网胁迫 UPR 逆境胁迫

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枸杞叶片酚酸类物质的自毒作用分析

江苏农业学报 2024年第2期40卷 213-222页

作者：宋燕芳彭彤马少兰马彩霞高娜李凯乐张传继蒲美运纳小凡兰州大学生命科学学院甘肃兰州730000 细胞活动与逆境适应教育部重点实验室甘肃兰州730000 彭阳县第一中学宁夏固原756500 宁夏大学生命科学学院宁夏银川750021

自毒作用是植物连作障碍形成的主要原因之一,严重影响植物生长和粮食生产。前期研究结果表明,土壤微生物多样性下降、土传病害加重是枸杞园连作障碍形成的重要原因,但枸杞残体的自毒作用及其物质基础目前仍不明确。为探讨自毒物质的主... 详细信息

自毒作用是植物连作障碍形成的主要原因之一,严重影响植物生长和粮食生产。前期研究结果表明,土壤微生物多样性下降、土传病害加重是枸杞园连作障碍形成的重要原因,但枸杞残体的自毒作用及其物质基础目前仍不明确。为探讨自毒物质的主要来源,本研究对比分析了枸杞(Lycium barbarum L.)叶、茎、根等组织浸提液对枸杞幼苗生长的影响。浓度梯度试验结果表明,叶片浸提液的抑制效应高于根、老根皮及茎浸提液。向无枸杞种植历史的农田土壤中添加枸杞叶片干粉能够显著抑制枸杞幼苗生长及叶片光合作用,证实了枸杞叶片具有自毒作用。联合UPLC-QTOF-MS和GC-TOF-MS技术对生长季末期枸杞叶片进行代谢组分析,共鉴定出有机酸112种、醇类41种、氨基酸37种、醛酮类28种和糖类48种。对其中24种有机酸及衍生物的分析发现,20种有机物能够不同程度抑制枸杞幼苗初生根生长。其中水杨酸、邻苯二甲酸、对羟基苯甲酸和香豆素在浓度低至10μmol/L时仍具显著抑制效应。UPLC结果进一步显示,长期连作导致枸杞园土壤香豆素、水杨酸、苯甲酸、阿魏酸和香豆酸积累。此外,土壤总酚酸含量也随种植年限增加显著增加。这些结果表明土壤中枸杞叶片酚酸能够在长期连作下积累并诱发自毒作用,这为进一步探索枸杞连作障碍形成机制提供了研究基础。

关键词：枸杞连作障碍自毒物质叶片酚酸

鲁氏接合酵母对高盐和高温胁迫响应的差异性与共性分析

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食品科学 2024年第2期45卷 79-88页

作者：刘梦奇闫珍珍胡娜陈雄李欣湖北工业大学生物工程与食品学院发酵工程教育部重点实验室湖北省工业微生物重点实验室湖北省工业发酵协同创新中心湖北武汉430068

针对高温(40℃)和高盐(18%NaCl)逆境设计了最低营养需求全合成培养基,分析了鲁氏接合酵母(Zygosaccharomyces rouxii)在长期逆境下生长的营养需求差异,重点解析了酵母细胞从生长适应期到对数生长初期阶段有机酸、氨基酸和糖类物质的代... 详细信息

针对高温(40℃)和高盐(18%NaCl)逆境设计了最低营养需求全合成培养基,分析了鲁氏接合酵母(Zygosaccharomyces rouxii)在长期逆境下生长的营养需求差异,重点解析了酵母细胞从生长适应期到对数生长初期阶段有机酸、氨基酸和糖类物质的代谢及基因表达差异。研究结果显示,遭遇高盐压力的鲁氏接合酵母细胞更需要外源氨基酸,而补充维生素和氨基酸有助于缓解酵母细胞的高温压力。鲁氏接合酵母针对高盐和高温逆境采用了差异明显的有机酸、氨基酸和糖代谢策略。MSN4(逆境转录子基因)和HOG1(高渗调控蛋白基因)响应高盐,而HSF1(热激调控蛋白基因)和SOD1(超氧化物歧化酶基因)对高温响应。本研究加深了对耐盐鲁氏接合酵母耐温机制的理解,有助于双抗新能力酿造酵母菌株的研制。

关键词：鲁氏接合酵母高盐逆境高温逆境全合成培养基营养需求代谢差异基因表达

青杄PwRhomboid基因表达特性及其抗旱作用

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陕西师范大学学报(自然科学版) 2024年

作者：杨沛欣刘奎李兴芬汪晴晴曹一博张凌云北京林业大学林学院林木资源高效生产全国重点实验室森林培育与保护教育部重点实验室

通过对青杄转录组测序分析,筛选出干旱响应基因PwRhomboid,分析该基因在耐旱方面的功能特性,为揭示青杄的耐旱机理提供理论基础。采用生物信息学对PwRhomboid的氨基酸序列和同源基因进行比对;利用RT-qPCR技术分析PwRhomboid对不同非生... 详细信息

通过对青杄转录组测序分析,筛选出干旱响应基因PwRhomboid,分析该基因在耐旱方面的功能特性,为揭示青杄的耐旱机理提供理论基础。采用生物信息学对PwRhomboid的氨基酸序列和同源基因进行比对;利用RT-qPCR技术分析PwRhomboid对不同非生物胁迫和激素的响应情况;通过瞬时转化烟草叶片检测PwRhomboid蛋白的亚细胞定位;获得拟南芥和马铃薯的PwRhomboid转基因株系并进行干旱表型验证。研究结果显示,PwRhomboid的氨基酸序列在N端与其同源物种的氨基酸序列具有较大差异,在C端相似度较高,保守性较好;其蛋白主要定位于细胞膜。PwRhomboid的表达量经干旱、低温和脱落酸诱导后发生有显著变化,在成熟叶中表达量最高,其能够提高转基因拟南芥和马铃薯的耐旱性。经干旱处理后,与对照组拟南芥野生型和pCM1205株系相比,PwRhomboid过表达株系PwRhomboid-L1和PwRhomboid-L2的存活率更高,叶绿素荧光最大光化学效率和实际光化学效率更高;在经聚乙二醇模拟干旱处理后,与野生型相比,过表达株系PwRhomboid-L3、PwRhomboid-L4的马铃薯苗高更高。结果表明PwRhomboid的表达量会受到干旱等逆境和激素的影响,过表达PwRhomboid能够提高拟南芥和马铃薯的耐旱性。

关键词：青杄 Rhomboid蛋白耐旱性基因表达