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基于肠道菌群的帕金森病早期预测模型建立及生物信息分析

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中华疾病控制杂志 2024年第9期28卷 1096-1103页

作者：何长颖韦雨婷陈佳陆军军医大学军事预防医学系军队卫生统计学教研室重庆400038

目的探究基于肠道菌群对人群未来患帕金森症(parkinson′s disease,PD)的早期预测模型进行构建与评价,并对肠道菌群宏基因KO组进行功能分析,探讨PD的潜在治疗靶点。方法基于Zenodo数据库,一方面对肠道菌群相对丰度数据进行标准分数标准... 详细信息

目的探究基于肠道菌群对人群未来患帕金森症(parkinson′s disease,PD)的早期预测模型进行构建与评价,并对肠道菌群宏基因KO组进行功能分析,探讨PD的潜在治疗靶点。方法基于Zenodo数据库,一方面对肠道菌群相对丰度数据进行标准分数标准化及ZicoSeq降维,采用基于自适应最小绝对收缩和选择算法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)变量选择的logistic回归算法建立预测模型,使用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve,AUC)和校准曲线评价模型预测效能,采用临床决策曲线(decision curve analysis,DCA)进行临床使用价值的评价;另一方面,对肠道菌群宏基因KO组数据使用limma包鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。通过结合蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction networks,PPI)、支持向量机-递归特征消除(support vector machine-recursive feature elimination,SVM-RFE)和随机森林(random forest,RF)对DEGs进行筛选。结果基于自适应LASSO变量选择的logistic回归分析模型的ROC曲线以及校准曲线显示模型预测效果良好。DCA结果显示模型净收益较大。通过PPI网络分析及机器学习方法,最终筛选出6个核心DEGs,即阿拉伯糖转运系统渗透蛋白(L-arabinose operon Q,araQ)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶,Ⅱ型、dCTP脱氨酶(dCTP deaminase,dcd)、颗粒19 kDa蛋白(signal recognition particle 19,SRP19)、加工前体5,核糖核酸酶P/MRP亚基(芽殖酵母)[processing of precursor 5,ribonuclease P/MRP subunit(***),POP5]、肌醇-3-磷酸合酶1(inositol-3-phosphate synthase 1,ISYNA1)。结论基于自适应LASSO变量选择的logistic回归分析模型对PD的预测具有优势,从而实现对PD患者的早发现、早干预、早治疗;相关核心基因的发现为PD的治疗提供科学指导和帮助。

关键词：帕金森病肠道菌群机器学习生物信息学分析

基于SMOTE算法和机器学习模型建立原发性肝癌术后的预后预测模型

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陆军军医大学学报 2024年第19期46卷 2236-2240页

作者：潘比余靖华黄译贤伍亚舟李芳陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军队卫生统计学教研室重庆400038

目的基于合成少数类过采样技术(synthetic minority over-sampling technique,SMOTE)算法和机器学习模型构建原发性肝癌术后的预后预测模型。方法选取美国国立癌症研究所的监测、流行病学及最终结果(Surveillance,Epidemiology,and End ... 详细信息

目的基于合成少数类过采样技术(synthetic minority over-sampling technique,SMOTE)算法和机器学习模型构建原发性肝癌术后的预后预测模型。方法选取美国国立癌症研究所的监测、流行病学及最终结果(Surveillance,Epidemiology,and End Results,SEER)数据库中4297例患者进行回顾性队列研究,通过独热编码和平均值插补法进行数据预处理,利用SMOTE算法解决数据类别不平衡问题,将临床变量纳入机器学习模型,基于决策树(decision tree,DT)、随机森林(random forest,RF)、梯度提升决策树(gradient boosting decision tree,GBDT)、极限梯度提升算法(eXtreme Gradient Boosting,XGBoost)方法构建预后预测模型(SMOTE+DT/RF/GBDT/XGBoost),通过比较多种模型的性能,筛选出最佳的预测模型。结果组合模型SMOTE+RF展示出最优的预测性能,受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)下的面积(area under the curve,AUC)、准确率和精确率均高于其他模型,分别为0.895、0.811、0.806。结论基于SMOTE+RF算法的原发性肝癌的预后预测模型可有效预测原发性肝癌患者的生存结局。

关键词：原发性肝癌少数类过采样技术算法机器学习预测模型

普通病房护士安宁疗护基本能力评估量表的研制及信效度检验

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陆军军医大学学报 2024年第20期46卷 2337-2345页

作者：吴昱齐雷蕾马会娟王鹏宇罗羽陆军军医大学(第三军医大学)护理系重庆400038 陆军军医大学(第三军医大学)陆军特色医学中心胸外科重庆400042 陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军队卫生统计学教研室重庆400038

目的研制普通病房护士安宁疗护基本能力量表,并检测其信效度。方法通过文献回顾、小组讨论、专家咨询、小样本预调查等方法募集、筛选条目初步形成测试量表;于2021年1-3月用该量表对1000名来自各内科、各外科、急诊科、妇产科及重症监... 详细信息

目的研制普通病房护士安宁疗护基本能力量表,并检测其信效度。方法通过文献回顾、小组讨论、专家咨询、小样本预调查等方法募集、筛选条目初步形成测试量表;于2021年1-3月用该量表对1000名来自各内科、各外科、急诊科、妇产科及重症监护室等科室的护士进行调查;使用SPSS和AMOS软件对数据进行项目分析、探索性因子分析和验证性因子分析,以验证量表的信效度,最终形成正式量表。结果经因子分析提取5个公因子,37个条目,累计方差贡献率71.031%,量表整体Cronbach’sα系数为0.953,折半信度为0.772,重测信度为0.963,验证性因子分析模型拟合良好,χ^(2)/df=2.57,近似误差均方根(root mean square error of approximation,RMSEA)=0.059,比较拟合指数(comparative fit index,CFI)=0.909,增量拟合指数(incremental fit index,IFI)=0.910,非规范拟合指数(Tucker-Lewis index,TLI)=0.901。结论本研究构建的普通病房护士安宁疗护基本能力评估量表信效度良好,可以用于评价普通病房护士安宁疗护基本能力。

关键词：普通病房护士安宁疗护基本能力量表研制信度效度

多阅片者多病例设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法

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中国循证医学杂志 2024年第9期24卷 1085-1093页

作者：何倩潘喆敏向蔓宛慧琴秦婴逸贺佳海军军医大学军队卫生统计学教研室上海200433 同济大学医学院上海200092

目的通过公式推导和实例验证,分析多阅片者多病例(multi-reader multi-case,MRMC)设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法。方法本研究包括理论推导和实例验证两个部分。理论部分详细介绍了MRMC统计分析方法,特别是Obuchowski-Rocket... 详细信息

目的通过公式推导和实例验证,分析多阅片者多病例(multi-reader multi-case,MRMC)设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法。方法本研究包括理论推导和实例验证两个部分。理论部分详细介绍了MRMC统计分析方法,特别是Obuchowski-Rockette(OR)与Dorfman-Berbaum-Metz(DBM)方法的原理和步骤。实例部分研究共纳入了100例受试者,其中67例疾病患者。四名阅片者分别采用传统胶卷影像方法和数字化影像方法进行阅片。通过OR与DBM方法对阅片结果进行分析。结果实例研究显示,OR和DBM方法结果具有较高的一致性。当OR方法采用Jackknife估计协方差矩阵时,其结果与DBM方法完全吻合。结论为准确评估影像诊断试验的临床性能,推荐采用OR和DBM方法进行影像诊断试验准确性评价的统计分析,以确保阅片者因素对评价结果的影响得到充分考虑。OR与DBM方法的结果较为接近,实际应用时应考虑具体数据特点和研究设计选择合适的分析方法。同时,OR与DBM方法的应用目前仍存在一定挑战,如软件实现、缺失数据处理,未来仍需要进一步的探索。

关键词：多阅片者多病例影像诊断试验准确性

新兵知觉压力与认知灵活性、生活满意度的关系及正念认知干预研究

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陆军军医大学学报 2024年第10期46卷 1180-1186页

作者：张一苇彭李许辰李敏陆军军医大学(第三军医大学)医学心理系军事心理学教研室重庆400038

目的探讨认知灵活性在新兵知觉压力与生活满意度中的关系,构建正念认知干预方案,研究该方案对新兵认知灵活性和生活满意度的影响作用。方法采用整群抽样法对某部965名新兵进行问卷调查。评估工具包括中文版知觉压力量表(Chinese Perceiv... 详细信息

目的探讨认知灵活性在新兵知觉压力与生活满意度中的关系,构建正念认知干预方案,研究该方案对新兵认知灵活性和生活满意度的影响作用。方法采用整群抽样法对某部965名新兵进行问卷调查。评估工具包括中文版知觉压力量表(Chinese Perceived Stress Scale,CPSS)、认知灵活性量表(Cognitive flexibility Inventory,CFI)和生活满意度量表(Satisfaction Life Scale,SWLS)。其中61名新兵,以排为单位分为训练组(n=31)和对照组(n=30),训练组接受6周正念认知干预,对照组每周仅接受心理健康教育。采用问卷以及行为学实验(线索任务转换范式)对训练效果进行评估。结果①知觉压力和认知灵活性、生活满意度均呈显著负相关(r=-0.78,P统计学意义。结论正念认知干预能有效提升新兵认知灵活性水平,提升新兵的生活满意度水平。

关键词：知觉压力认知灵活性生活满意度线索任务转换

环状RNA mmu_circ_0005019影响小鼠心肌细胞钙激活钾通道电流及动作电位

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陆军军医大学学报 2024年第2期46卷 100-109页

作者：杨岚清邬娜陈鹏慧袁志权李成英吴龙钟理李亚斐陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军队流行病学教研室重庆400038 陆军军医大学(第三军医大学)基础医学院神经生物学教研室重庆400038 重庆医科大学附属第三医院心血管疾病中心重庆401120

目的探索环状RNA mmu_circ_0005019调控小电导钙激活钾(small-conductance calcium-activated potassium, SK)通道蛋白亚基SK3编码基因Kcnn3的表达,以及对小电导钙激活钾通道电流(IK,Ca)和动作电位时程(action potential duration, APD)的影响。方法在小鼠HL-1细胞中分别构建mmu_circ_0005019过表达和干扰模型,分为过表达组(n=3)、空质粒组(n=3)、干扰1组(n=3)、干扰2组(n=3)、对照组(n=3),通过RT-qPCR、Western blot分析mmu_circ_0005019调节Kcnn3表达的分子机制,应用膜片钳技术电流钳模式记录全细胞的IK,Ca,并用电压钳模式记录APD。结果成功构建了环状RNA mmu_circ_0005019过表达和干扰的HL-1细胞模型。过表达组的Kcnn3基因表达与空质粒组相比明显上调(P<0.05);干扰1组和干扰2组的Kcnn3基因表达与对照组相比均明显下调(P<0.05)。电生理发现过表达mmu_circ_0005019增加了HL-1细胞IK,Ca电流密度,APD显著缩短;相反,干扰mmu_circ_0005019减少了IK,Ca电流密度,APD显著延长。结论 mmu_circ_0005019可以上调小鼠HL-1细胞Kcnn3的表达水平,从而改变IK,Ca和APD,提示环状RNA mmu_circ_0005019可能在房颤发生中起到促进作用。

关键词：环状RNA 心肌细胞小电导钙激活钾通道动作电位时程膜片钳

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高原军人健康素养现况调查及影响因素分析

陆军军医大学学报 2024年第11期46卷 1306-1315页

作者：金鹏荣红辉张玲郑传芬陈济安陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军队健康教育教研室重庆400038

目的了解高原军人的健康素养水平,并分析其影响因素。方法采用《全国居民健康素养监测调查问卷》(2015版),通过查阅文献设计人口学资料,加入心理弹性量表、简易应对方式量表、正性负性情绪量表3种心理问卷,采用“问卷星”对2516名高原... 详细信息

目的了解高原军人的健康素养水平,并分析其影响因素。方法采用《全国居民健康素养监测调查问卷》(2015版),通过查阅文献设计人口学资料,加入心理弹性量表、简易应对方式量表、正性负性情绪量表3种心理问卷,采用“问卷星”对2516名高原军人健康素养进行现况调查并分析其影响因素。结果调查显示,2516名高原军人的总体健康素养水平为20.03%。基本知识和理念、健康生活方式与行为、健康技能素养水平分别为31.08%、26.23%、26.63%;科学健康观、传染病防治、慢性病防治、安全与急救、基本医疗、健康信息素养水平依次为40.58%、19.36%、9.62%、82.75%、29.61%、45.03%。多元非条件Logistic回归分析结果显示:高原军人健康素养水平的影响因素为工作年限(OR=1.857,95%CI:1.391~2.479;OR=4.657,95%CI:3.297~6.578)、民族(OR=0.394,95%CI:0.251~0.620)、婚姻(OR=0.609,95%CI:0.430~0.861)、独生子女(OR=0.759,95%CI:0.585~0.985)、家庭所在地(OR=0.545,95%CI:0.359~0.827)、吸烟(OR=1.579,95%CI:1.254~1.988)、文化程度(OR=3.638,95%:1.500~8.822)、每周网络游戏时间(OR=0.517,95%CI:0.365~0.731;OR=0.351,95%CI:0.172~0.716)、每年体检次数(OR=3.251,95%CI:1.359~7.778;OR=4.545,95%CI:1.841~11.221)、父亲职业(OR=5.185,95%CI:1.800~14.933;OR=3.229,95%CI:1.261~8.270)、母亲职业(OR=0.221,95%CI:0.086~0.568;OR=0.218,95%CI:0.081~0.587;OR=0.046,95%CI:0.018~0.118)、积极应对(OR=1.052,95%CI:1.033~1.072)、消极应对(OR=0.950,95%CI:0.929~0.972)。结论该部队高原军人健康素养水平整体较低,相关部门应根据健康素养的影响因素,积极探索有效的干预措施,全面提升其健康素养。

关键词：高原健康素养现况调查影响因素

TIMBER对意外创伤肢体功能障碍康复期患者创伤后应激症状的影响

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陆军军医大学学报 2024年第4期46卷 396-402,F0003页

作者：刘洋黄英陈翰韩亚楠许辰李敏陆军军医大学(第三军医大学)医学心理系军事心理学教研室重庆400038 陆军军医大学(第三军医大学)第一附属医院康复医学科重庆400038

目的探讨基于正念的消退和再巩固创伤干预(trauma interventions using mindfulness based extinction and reconsolidation, TIMBER)对意外创伤肢体功能障碍康复期患者创伤后应激症状的影响。方法采用方便取样的方法,选取2022年3月至... 详细信息

目的探讨基于正念的消退和再巩固创伤干预(trauma interventions using mindfulness based extinction and reconsolidation, TIMBER)对意外创伤肢体功能障碍康复期患者创伤后应激症状的影响。方法采用方便取样的方法,选取2022年3月至2023年5月陆军军医大学第一附属医院康复医学科收治的创伤康复期患者(impact of event scale-revised, IES-R总分≥33分)46例,采用随机数字表法分为干预组和对照组,干预组接受TIMBER干预,对照组进行心理健康相关知识宣教。在干预前(T1)、干预结束时(T2)和干预结束后1个月(T3)使用事件影响量表修订版(IES-R)、医院焦虑抑郁量表(HADS)、睡眠状况自评量表(SRSS)对所有被试进行测量,比较两组患者创伤后应激症状、焦虑症状、抑郁症状和睡眠的变化。结果两组患者人口统计学信息及各心理学变量在T1时差异均无统计学意义(P>0.05);干预组在T2和T3时的IES-R总分及各维度评分、焦虑、抑郁和睡眠评分显著低于对照组(P统计学意义(P统计学意义(P>0.05)。结论 TIMBER可以显著改善意外创伤肢体功能障碍康复期患者的创伤后应激症状、焦虑抑郁症状及睡眠。

关键词：正念消退与再巩固干预创伤后应激症状创伤康复

含时间依赖性治疗变量预后预测模型构建策略的模拟研究

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中国循证医学杂志 2024年第4期24卷 490-496页

作者：钱迪金志超赵艳芳海军军医大学卫生勤务学系军队卫生统计学教研室上海200433

目的探究构建临床预后预测模型中时间依赖性变量的处理方法,将边际结构模型与临床预后预测模型结合,为患者的个体化预后评估提供更精确的预测工具。方法通过数据模拟,构建样本量为7000的训练数据集、样本量为3000的验证数据集,设置在不... 详细信息

目的探究构建临床预后预测模型中时间依赖性变量的处理方法,将边际结构模型与临床预后预测模型结合,为患者的个体化预后评估提供更精确的预测工具。方法通过数据模拟,构建样本量为7000的训练数据集、样本量为3000的验证数据集,设置在不同随访时间及不同情境下,分别比较忽略治疗模型、基线无治疗模型、基线治疗预测模型和边际结构预测模型的预测效能。结果模拟研究设置2种随访时间点情况(2个、5个时间点),64种不同的治疗变量、时依性协变量、结局变量三者之间关系,共128种模拟情境。2个随访时间点情况下,边际结构预测模型预测效能与基线治疗预测模型预测效能未见明显差别,但均高于忽略治疗模型和基线无治疗模型;5个随访时间点情况下,边际结构预测模型预测效能优于其余三个预测模型。结论观察性队列存在时间依赖性治疗情况,在构建临床预后预测模型时,应该考虑基线后治疗发生变化的情况,否则会降低预后预测模型的预测效能。

关键词：预后预测模型边际结构模型模拟研究