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基于变性泡介导的加速链交换扩增技术在新型冠状病毒核酸检测中的性能分析

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青岛科技大学学报（自然科学版） 2024年第2期45卷 23-28,37页

作者：陈磊赵晓丽潘兆宝程娟王怀杰曲梅花石超杨国儒马翠萍潍坊市第二人民医院检验科转化医学中心呼吸与危重症医学科山东潍坊261041 青岛科技大学教育部生命科学光电传感与分析化学重点实验室山东省生化工程重点实验室:海洋科学与生物工程学院青岛核酸快速检测工程研究中心山东青岛266042 青岛大学生命科学学院核酸快速检测国际科技合作基地基础医学院附属医院临床检验科山东青岛266071

运用变性泡介导的加速链交换扩增技术,建立一种新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测的新方法。收集潍坊市第二人民医院检验科1492例疑似SARS-CoV-2样本,以荧光定量PCR结果为参考,计算ASEA-SARS-CoV-2核酸检测试剂盒检测新型冠状病毒样本... 详细信息

运用变性泡介导的加速链交换扩增技术,建立一种新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测的新方法。收集潍坊市第二人民医院检验科1492例疑似SARS-CoV-2样本,以荧光定量PCR结果为参考,计算ASEA-SARS-CoV-2核酸检测试剂盒检测新型冠状病毒样本结果的敏感性、特异性、阳性预测值(PPV)、阴性预测值(NPV)。结果表明:ASEA可在30min内完成核酸扩增,检测限为1000拷贝·mL^(-1)。敏感性为96.7%,特异性为99.9%。该方法可在30min内检测SARS-CoV-2,而之前报道的传统qPCR方法需要数小时。建立了一种基于变性泡介导的加速链交换扩增技术检测新型冠状病毒的新方法。

关键词：加速链交换扩增新型冠状病毒核酸检测 RNA检测

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辣椒来源外泌体样纳米囊泡通过ERK1/2通路拮抗巨噬细胞向泡沫细胞转化

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中国动脉硬化杂志 2024年第6期32卷 503-513页

作者：王文琳罗烨柯晓南华大学中国医学科学院阜外医院深圳医院协作培养基地广东省深圳市518057 北京大学深圳医院心内科广东省深圳市518057 中国医学科学院阜外医院深圳医院心内科广东省深圳市518057

[目的]研究辣椒来源外泌体样纳米囊泡(CDELN)抑制氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导THP-1源性巨噬细胞泡沫化的作用机制。[方法]通过组织破碎、差速/超速离心及蔗糖密度梯度离心等步骤,分离提纯CDELN。利用ox-LDL刺激THP-1源性巨噬细胞24 ... 详细信息

[目的]研究辣椒来源外泌体样纳米囊泡(CDELN)抑制氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导THP-1源性巨噬细胞泡沫化的作用机制。[方法]通过组织破碎、差速/超速离心及蔗糖密度梯度离心等步骤,分离提纯CDELN。利用ox-LDL刺激THP-1源性巨噬细胞24 h建立泡沫细胞模型,并进一步研究CDELN对巨噬细胞泡沫化的作用及其机制。采用激光共聚焦显微镜检测THP-1源性巨噬细胞对CDELN和人DiL标记乙酰化低密度脂蛋白(DiL-ac-LDL)的摄取;采用油红O染色检测细胞内胆固醇含量,通过分析细胞油红O染色阳性面积评估细胞内脂质累积影响;RT-qPCR和Western blot检测清道夫受体A(SRA)、脂肪酸转运蛋白(CD36)、凝集素样氧化型低密度脂蛋白受体1(LOX-1)、ATP结合盒转运体A1/G1(ABCA1/G1)以及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路p-ERK、p-p38 MAPK和p-c-Jun的mRNA和蛋白表达水平。[结果]CDELN是大小均一、具有双层膜结构、富含蛋白质和核酸的外泌体样纳米囊泡,能被巨噬细胞摄取。DiL-ac-LDL摄取实验提示CDELN可抑制巨噬细胞的胆固醇摄取。油红O染色实验提示CDELN可减轻ox-LDL诱导下的胞内胆固醇蓄积。RT-qPCR及Western blot显示,CDELN能够显著降低ox-LDL诱导的THP-1源性巨噬细胞基质金属蛋白酶9(MMP-9)、SRA、CD36、LOX-1的mRNA水平,以及降低p-ERK、SRA、CD36、LOX-1蛋白水平。加入p-ERK激动剂Yoda1后,CDELN的保护作用被明显逆转。[结论]CDELN可显著抑制巨噬细胞泡沫化,该作用可能与抑制MAPK通路ERK1/2的磷酸化水平有关。

关键词：动脉粥样硬化辣椒来源外泌体样纳米囊泡泡沫细胞 MAPK 巨噬细胞

多重套式RT-PCR检测患者凝血块中登革病毒RNA(英文)

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中国人兽共患病学报 2012年第8期28卷 832-836页

作者：张拥军黄萌翁育伟郑友限王金章福建省人兽共患病研究重点实验室(福建省疾病预防控制中心) 福州350001 福建医科大学公共卫生学院教学基地福建省泉州市疾病预防控制中心

目的建立简便、灵敏、适合于全部血清型登革病毒核酸检测的多重套式RT-PCR体系,检测临床样品中登革病毒RNA,作为实验室辅助诊断的依据。方法利用登革病毒标准株核酸,建立多重RT-PCR检测方法。提取患者凝血块总RNA,分别用一步法RT-PCR及... 详细信息

目的建立简便、灵敏、适合于全部血清型登革病毒核酸检测的多重套式RT-PCR体系,检测临床样品中登革病毒RNA,作为实验室辅助诊断的依据。方法利用登革病毒标准株核酸,建立多重RT-PCR检测方法。提取患者凝血块总RNA,分别用一步法RT-PCR及多重套式RT-PCR检测。结果通过对检测体系进行优化,多重RT-PCR能够同时检测4种血清型登革病毒核酸。采用多重套式RT-PCR方法,从8例登革热患者凝血块中有4例检测到病毒RNA,而其它核酸检测方法仅检出1例阳性。结论多重套式RT-PCR的方法能够从临床凝血块样品中检测到登革病毒核酸,并同时进行血清学分型,简化了登革病毒核酸检测步骤,有利于对临床样品开展病毒核酸检测。

关键词：登革病毒多重套式RT-PCR 核酸检测

福建省境外输入性新型冠状病毒肺炎确诊病例特征分析

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中国预防医学杂志 2021年第10期22卷 736-740页

作者：陈光敏蓝梅芳谢剑锋欧剑鸣郑奎城福建医科大学公共卫生学院教学基地福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室福建福州350001

目的分析福建省境外输入性新型冠状病毒肺炎的流行病学特征,以期为调整防控策略和措施提供科学依据。方法收集福建省2020年3月19日—2021年5月31日报告的境外输入性新型冠状病毒肺炎确诊病例325例,运用描述性分析方法开展特征分析。结果... 详细信息

目的分析福建省境外输入性新型冠状病毒肺炎的流行病学特征,以期为调整防控策略和措施提供科学依据。方法收集福建省2020年3月19日—2021年5月31日报告的境外输入性新型冠状病毒肺炎确诊病例325例,运用描述性分析方法开展特征分析。结果2020年3月19日—2021年5月31日,福建省共报告境外输入性新型冠状病毒肺炎325例,无死亡病例,未报告境外输入性病例引起的本土关联病例。2020年11月、2021年4月和2021年5月的入境病例报告比位居前三位,分别为1.95‰、1.51‰、1.28‰。厦门、福州和泉州3个国际航班入境较多的口岸城市报告输入病例数最多,共323例(99.38%),主要输入国为菲律宾64例(19.69%)、美国50例(15.38%)、俄罗斯联邦29例(8.92%)。入境当天采样并进行新型冠状病毒肺炎病毒核酸检测阳性133例(40.92%),入境7 d内累计核酸检测阳性267例(82.15%),入境14 d内累计核酸检测阳性309例(95.08%),入境21 d内累计核酸检测阳性323例(99.38%)。男女性别比为2.46∶1;年龄1个月~71.27岁,年龄中位数36.10岁,>29~39岁年龄段报告病例数最多,86例(26.46%);职业以工人82例(25.23%)、商业服务50例(15.38%)、学生49例(15.08%)、家务及待业44例(13.54%)和海员及长途驾驶员23例(7.08%)为主。普通型病例年龄中位数38岁,轻型病例年龄28岁,不同临床类型病例的年龄中位数差异有统计学意义(H=20.27,P核酸检测为阳性时间间隔1(P_(25)~P_(75):0~6)d,轻型病例入境至病毒核酸检测为阳性时间间隔4(P_(25)~P_(75):0~7)d,不同临床型别入境至病毒核酸检测阳性时间间隔差异有统计学意义(H=7.25,P=0.03)。结论2020年3月19日—2021年5月31日,福建省新型冠状病毒肺炎疫情以境外输入性为主,以普通型为主,大部分在入境后14 d内检测出核酸阳性,未发现本土关联病例。输入病例的主要地市为福州、厦门、泉州等沿海口岸城市,应提高重点地区防范措施。需对菲律宾、美国、俄罗斯等高风险输入国的入境人员加强入境检疫检测,严格实施隔离措施,特别是提高病例诊断及时性,加强解除隔离后的健康监测。

关键词：新型冠状病毒肺炎境外输入性病例流行病学特征

2022年荆州市1起人偏肺病毒感染暴发疫情调查

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寄生虫病与感染性疾病 2024年

作者：江鸿杨梦珠肖林刘天姚梦雷荆州市疾病预防控制中心麻城市疾病预防控制中心

目的分析1起人偏肺病毒感染暴发疫情的流行特征和主要原因，为今后疫情防控工作提供参考。方法 2022年7月对湖北省荆州市某精神病院人偏肺病毒感染暴发疫情进行现场流行病学调查；开展环境卫生学调查，了解疫情传播因素；采集患者咽拭... 详细信息

目的分析1起人偏肺病毒感染暴发疫情的流行特征和主要原因，为今后疫情防控工作提供参考。方法 2022年7月对湖北省荆州市某精神病院人偏肺病毒感染暴发疫情进行现场流行病学调查；开展环境卫生学调查，了解疫情传播因素；采集患者咽拭子，开展22种常见呼吸道病原体核酸检测，明确病原体；使用Excel 2013、SPSS 18.0软件进行数据整理和统计分析，以P核酸阳性，阳性率56.25%（9/16）。结论医务人员在院外感染后带病上岗、继发病例未及时隔离治疗是本起暴发疫情的主要原因；夏季空调病房门窗紧闭、消毒频次不足是疫情扩散的重要危险因素。

关键词：人偏肺病毒呼吸道感染暴发

江苏省3个城市疱疹性咽峡炎流行病学与病原学特征分析

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中华流行病学杂志 2024年第7期45卷 977-982页

作者：樊欢李明阳石平曹子轩许倩嵇红江苏省疾病预防控制中心急性传染病防制所国家卫生健康委员会肠道病原微生物重点实验室南京210009 南通市疾病预防控制中心急性传染病防制科南通226001 无锡市疾病预防控制中心急性传染病防制科无锡214023 盐城市疾病预防控制中心急性传染病防制科盐城224001 苏州市疾病预防控制中心急性传染病防制科苏州215026

目的分析江苏省3个城市疱疹性咽峡炎(HA)流行病学与病原学特征,为江苏省HA的精准防控提供参考依据。方法选择无锡市、苏州市和盐城市的3家监测哨点医院,2018年5月至2022年12月定期从医院住院管理系统分年龄段收集HA的就诊和住院病例的... 详细信息

目的分析江苏省3个城市疱疹性咽峡炎(HA)流行病学与病原学特征,为江苏省HA的精准防控提供参考依据。方法选择无锡市、苏州市和盐城市的3家监测哨点医院,2018年5月至2022年12月定期从医院住院管理系统分年龄段收集HA的就诊和住院病例的相关信息。采用RT-PCR方法进行肠道病毒核酸检测,并对主要流行株的衣壳蛋白VP1编码基因序列进行测序分析、基因亚型的鉴别和系统进化分析。结果无锡市、苏州市和盐城市的HA就诊病例数为57709例,是同期报告的手足口病例数的1.76倍(57709/32831);HA住院占比为1.35%(781/57709),住院占比逐年呈上升趋势(χ^(2)=62.79,P福建省、广州市、江西省、云南省、天津市等)毒株的遗传距离和亲缘关系较为接近。结论HA疾病负担较重,12~59月龄组是HA发病的重点人群,流行高峰为5-7月。HA病原多样化,以肠道病毒A组为主。HA流行株具有较低的型内分化,未发现新的进化分支。建议将HA纳入手足口病监测工作或法定传染病。

关键词：疱疹性咽峡炎流行病学特征肠道病毒基因型

两种方法在城市污水新型冠状病毒与多种腹泻病毒检测中的差异分析

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国际病毒学杂志 2024年第4期31卷 301-305页

作者：杜阳光王潇耿洁魏丹童晶江苏省徐州市疾病预防控制中心微生物检验科 221006

目的研究两种浓缩方法在新型冠状病毒与多种腹泻病毒核酸检测中的差别,了解污水中不同病毒的流行趋势,为防控方案的制定提供理论依据。方法使用聚乙二醇沉淀法和阴离子膜法对污水中新型冠状病毒、诺如病毒、轮状病毒、札如病毒、腺病毒... 详细信息

目的研究两种浓缩方法在新型冠状病毒与多种腹泻病毒核酸检测中的差别,了解污水中不同病毒的流行趋势,为防控方案的制定提供理论依据。方法使用聚乙二醇沉淀法和阴离子膜法对污水中新型冠状病毒、诺如病毒、轮状病毒、札如病毒、腺病毒、人类星状病毒进行富集浓缩和核酸检测,对其结果进行分析。结果腺病毒阴离子膜法浓缩效果优于聚乙二醇沉淀法,诺如病毒、轮状病毒和札如病毒聚乙二醇沉淀法效果更好,人类星状病毒两种浓缩效果没有统计学差异。新型冠状病毒检出率随时间有波动,3月2日以后聚乙二醇沉淀法检出的ORF1ab基因和N基因的浓缩效果优于阴离子膜法。结论两种方法对污水中不同病毒的富集浓缩效果不同,可根据工作需要选用合适的病毒浓缩方法。

关键词：污水富集浓缩新型冠状病毒腹泻病毒

深圳市基于污水流行病学的新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者来源追踪案例分析

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中华医学杂志 2024年第4期104卷 302-307页

作者：彭悦景李迎慧杜琛郭寅生宋江腾贾春艳张鑫刘慕军王子苗刘斌严淑兰杨煜祥唐湘良林革新李学云张勇袁建辉许世宽陈传德逯建华邹旋万成松扈庆华南方医科大学公共卫生学院生物安全研究中心，广州510515 深圳市疾病预防控制中心病原微生物检测所，深圳518055 深圳市疾病预防控制中心突发公共卫生应急部，深圳518055 深圳市生态环境局水生态环境处，深圳518040 深圳市福田区水务局，深圳518035 深圳市福田区水务局供排水管理科，深圳518035 深圳市南山区水务局排水与灾害防御科，深圳518052 深圳市生态环境局罗湖管理局，深圳518001 深圳市生态环境局罗湖管理局环境管理科，深圳518001 深圳市福田区疾病预防控制中心，深圳518040 深圳市福田区疾病预防控制中心微生物检验科，深圳518040 深圳市南山区疾病预防控制中心，深圳518054 深圳市南山区疾病预防控制中心传染病防制科，深圳518054 深圳市罗湖区疾病预防控制中心，深圳518020 深圳市疾病预防控制中心，深圳518055 南方医科大学公共卫生学院生物安全研究中心，广州510515 南方医科大学公共卫生学院广东省热带病研究重点实验室BSL-3实验室，广州510515

污水流行病学(WBE)是一门新兴学科,已被应用于药物滥用追踪和传染病病原体监测。在新型冠状病毒(简称新冠病毒)感染疫情期间,WBE被应用于监测疫情流行趋势和提供早期预警。为了及时发现隐匿的新冠病毒感染者,防止其在社区的传播,深圳市... 详细信息

污水流行病学(WBE)是一门新兴学科,已被应用于药物滥用追踪和传染病病原体监测。在新型冠状病毒(简称新冠病毒)感染疫情期间,WBE被应用于监测疫情流行趋势和提供早期预警。为了及时发现隐匿的新冠病毒感染者,防止其在社区的传播,深圳市于2022年7月26日至11月30日在福田、南山、罗湖和盐田区的口岸地带、城中村、居民小区等重点场所布设369个污水采样点位,覆盖193万人口,开展污水监测新冠病毒的工作。每日在用水高峰时段进行3 h连续采样,采用聚乙二醇沉淀法和RT-qPCR进行污水病毒富集浓缩及新冠病毒核酸检测,并形成了阳性水样处置流程。本文旨在介绍深圳市基于城市污水开展新冠病毒感染者来源追踪的相关案例,在罗湖区洪湖水质净化厂污水监测有效发挥了早期预警作用并实现感染者来源追踪;在福田区福田南路阳性水样处置中获得监测点位布设的重要经验;在南山区南山村污水监测中揭示了隐匿感染者的存在。分享基于WBE的新冠病毒监测和感染者追踪,避免新冠病毒感染者在社区传播的经验,总结污水监测的优势和应用前景,为未来具有肠道排毒的新发或再发传染病病原体监测提供新的研究思路。

关键词：污水流行病学污水监测新型冠状病毒

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福建省沿海地区居民碘营养状况调查

中国地方病学杂志 2011年第6期30卷 606-610页

作者：陈志辉许龙善王木华吴佳妮何萌胡旻马宁林兆和福建省疾病预防控制中心地方病防治科福建医科大学预防医学专业教学基地福州350001

目的了解福建省沿海地区居民碘营养现状，为有效落实科学补碘防控策略提供依据。方法2009年，在福建省6个设区市各选择1个区，每个区选择1个街道办事处，每个街道办事处选择1个居委会；选择11个县（市、区），每个县（市、区）选择1个... 详细信息

目的了解福建省沿海地区居民碘营养现状，为有效落实科学补碘防控策略提供依据。方法2009年，在福建省6个设区市各选择1个区，每个区选择1个街道办事处，每个街道办事处选择1个居委会；选择11个县（市、区），每个县（市、区）选择1个乡（镇），每个乡（镇）选择1个村。每个居委会（村）选择30户居民户，检测饮用水水碘、盐碘，用3日称量法测算该户居民人均食盐摄入量；选择18～45岁成人20名，检测尿碘；每个街道（乡、镇）选择孕妇和哺乳期妇女各30名，选择8～10岁儿童50名，检测尿碘。结果沿海城市、内陆城市、内陆农村、沿海农村、沿海山区农村分别调查153、30、94、183、62个居民户，盐碘中位数范围为28．4～30．8mg／kg，沿海城市、内陆城市、内陆农村、山区农村碘盐覆盖率和合格碘盐食用率都在90％以上，沿海农村碘盐覆盖率和合格碘盐食用率分别为86．9％（159／183）、83．6％（153／183）。沿海城市、沿海农村、内陆城市、内陆农村、沿海山区分别调查了258、300、110、160、101名8～10岁儿童，尿碘中位数分别为191．0、165．6、267．7、269．0、161．0μg/L；分别调查了101、123、118、63、41名成人，尿碘中位数分别为197．6、2034、174．7、302．8、1549μg／L；分别调查了151、181、50、101、63名孕妇，尿碘中位数分别为156．5、141．7、116．2、163．0、126．2μg／L；分别调查了154、184、40、111、70名哺乳期妇女，尿碘中位数分别为130．3、118．8、110．9、154．6、175．9μg／L。结论沿海地区居民碘营养水平适宜，不存在碘过量的问题，沿海地区仍需供应碘盐；应高度关注孕妇的碘营养状况，并将这部分人群监测纳入常规监测范围。

关键词：碘尿氯化钠,膳食营养状况数据收集