检索结果-南通市图书馆

抗虫转基因水稻及其杂交水稻对土壤微生物群落多样性与组成的影响

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国生态农业学报（中英文） 2024年第1期32卷 15-29页

作者：宋亚娜陈在杰林艳胡太蛟吴明基王锋福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室福州350003

微生物是土壤物质循环与肥力演变的驱动者,其群落组成关系到土壤微生态系统的稳定与可持续性。对抗虫转基因水稻土壤微生物群落变化的研究是其环境安全性评价的重要内容。本研究基于细菌16S rRNA基因和真菌ITS基因的高通量测序,分析了... 详细信息

微生物是土壤物质循环与肥力演变的驱动者,其群落组成关系到土壤微生态系统的稳定与可持续性。对抗虫转基因水稻土壤微生物群落变化的研究是其环境安全性评价的重要内容。本研究基于细菌16S rRNA基因和真菌ITS基因的高通量测序,分析了田间试验中抗虫转基因水稻‘MFB’及其转基因杂交水稻‘闽丰A/MFB’‘天丰A/MFB’和‘谷丰A/MFB’与非转基因常规水稻‘闽恢3301’及杂交水稻‘天优华占’的土壤微生物群落多样性与组成的差异,并得出以下结果。首先,与两个非转基因水稻品种相比,抗虫转基因水稻及转基因杂交水稻均能显著增产(P所提高,且分别在水稻成熟期或分蘖期达到显著性水平(P生物群落β-多样性分析结果表明,本田间试验中不同品种水稻土壤细菌或真菌的群落组成均没有显著差异。但与‘闽恢3301’相比,稻田土壤细菌中丰度最高的变形菌门的相对丰度在‘MFB’土壤中明显增加,且在水稻分蘖期及成熟期达显著水平(P生物群落的功能组成预测可见,随水稻生长,‘MFB’与‘闽恢3301’的土壤细菌群落功能组成间差异存在增大的趋势。综上所述,本研究田间试验中,抗虫转基因水稻及其转基因杂交水稻在增产的同时提高了稻田土壤细菌或真菌群落的多样性,改变了主要细菌或真菌种类的相对丰度,但对细菌或真菌的群落及功能组成的影响不显著。

关键词：抗虫转基因水稻细菌群落真菌群落高通量测序

维普期刊数据库博看期刊

低甲烷排放转基因水稻对土壤微生物群落的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生态学报 2024年

作者：宋亚娜张珊珊胡太蛟吴明基福建省农业科学院生物技术研究所福建省农业遗传工程重点实验室

低甲烷排放转基因水稻是实现水稻低碳生产的理想材料。土壤微生物驱动了稻田甲烷的产生，低甲烷排放转基因水稻土壤微生物群落组成的变化不仅影响稻田甲烷排放，也关系到土壤微生态系统的稳定性。本研究通过对细菌16S rRNA基因、真菌IT... 详细信息

低甲烷排放转基因水稻是实现水稻低碳生产的理想材料。土壤微生物驱动了稻田甲烷的产生，低甲烷排放转基因水稻土壤微生物群落组成的变化不仅影响稻田甲烷排放，也关系到土壤微生态系统的稳定性。本研究通过对细菌16S rRNA基因、真菌ITS基因的高通量测序及mcrA、nifH、amoA和nirS等功能基因的荧光定量PCR，分析了低甲烷排放转基因水稻（86R27-3）与野生型水稻（MH86）土壤微生物群落间的差异。结果显示：稻田土壤细菌群落的α-多样性指数在86R27-3与MH86间无明显差异，且仅在水稻分蘖期86R27-3的土壤真菌群落多样性指数Shannon、Simpson及均匀度指数Pielou＿e显著高于MH86 (P生物群落功能预测显示，86R27-3土壤氮、硫和锰代谢细菌功能群丰度显著低于MH86 (P生物银耳目、嗜热囊菌科、镰刀菌属及韦斯特氏菌功能群丰度显著降低（P生物毕赤酵母属和未定义腐生物马勃科功能群丰度显著提高（P所述，低甲烷排放转基因水稻（86R27-3）对土壤细菌或真菌的群落组成没有影响，但可引起主要细菌或真菌种类的相对丰度及某些细菌或真菌功能群丰度发生变化，并显著降低了稻田土壤微生物功能基因丰度。

关键词：低甲烷排放转基因水稻微生物群落功能基因高通量测序

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

玉米CBS基因家族的鉴定和特征分析

江苏农业科学 2024年第4期52卷 41-49页

作者：陈子强李刚颜静宛郭新睿胡昌泉王月王锋田大刚福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室福建福州350003

为研究玉米CBS(ZmCBS)基因家族的特征,探讨其功能,对ZmCBS基因家族进行鉴定,分析其染色体定位、基因结构、保守结构域及进化关系,并对ZmCBS家族基因在玉米组织中的表达情况及其在非生物胁迫下的表达变化进行分析。基于玉米基因组数据库... 详细信息

为研究玉米CBS(ZmCBS)基因家族的特征,探讨其功能,对ZmCBS基因家族进行鉴定,分析其染色体定位、基因结构、保守结构域及进化关系,并对ZmCBS家族基因在玉米组织中的表达情况及其在非生物胁迫下的表达变化进行分析。基于玉米基因组数据库,鉴定到37个CBS基因家族成员,它们不均匀地分布在玉米的8条染色体上。该家族蛋白除保守的CBS结构域外,多数成员还包含其他结构域,包括电压门控的氯化物通道蛋白(voltage gated ClC)、Phox/Bemp1(PB1)结构域、五肽重复序列(penatricopeptider repeat, PPR)和E_SET结构域等。按照基因结构和进化关系可分为6个亚类,且同一进化分支上的基因具有相似的外显子结构和CDS长度,但内含子长度差异很大。启动子分析结果表明,ZmCBS基因启动子上含有响应激素和非生物胁迫的顺式作用元件。转录组数据的基因表达谱分析显示,ZmCBS基因家族部分成员在叶、花粉或胚中优势表达。ZmCBS3和ZmCBS14受冷胁迫诱导表达,ZmCBS14和ZmCBS22受干旱胁迫诱导表达,暗示这些基因在玉米响应外界胁迫中起重要作用。分析结果将为进一步研究ZmCBS家族基因奠定基础。

关键词：玉米 CBS基因家族生物信息学生物胁迫非生物胁迫特征分析

兔促性腺激素抑制激素受体基因NPFFR1的克隆及其在HPT轴的表达分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

农业生物技术学报 2024年第5期32卷 1102-1110页

作者：桑雷高承芳孙世坤王锦祥陈冬金谢喜平福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽遗传育种重点实验室

神经肽FF受体1 (neuropeptide FF receptor 1, NPFFR1)是促性腺激素抑制激素(gonadotropininhibitory hormone, GnIH)的主要受体，在调控动物生殖生理方面起着重要作用。为了解NPFFR1基因的功能，本研究以闽西南黑兔(Oryctolagus cuniculus)为研究对象，采用cDNA末端快速克隆(rapid amplification of cDNA ends, RACE)技术克隆了NPFFR1基因(GenBank No. OP791886)，并对其进行了生物信息学和时空表达谱分析；此外，公兔腹腔注射0、0.5、5和50μg GnIH多肽，利用q PCR方法检测下丘脑-垂体-睾丸(hypothalamic-pituitary-testicular, HPT)轴中NPFFR1基因的表达水平。生物信息学分析表明，兔NPFFR1全长3 712 bp，编码432个氨基酸；其翻译的蛋白由α螺旋、无规卷曲和β折叠组成，是镶嵌于质膜的7次跨膜蛋白，与高原鼠兔(Ochotona curzoniae)和北美鼠兔(Ochotona princeps) NPFFR1高度同源。qPCR结果表明，NPFFR1基因在HPT轴中均有表达，在下丘脑的表达量显著高于垂体和睾丸(P研究为深入探讨兔NPFFR1在生殖生理方面的作用机制提供基础资料。

关键词：兔促性腺激素抑制激素(GnIH) 神经肽FF受体1基因(NPFFR1) 克隆基因表达

同方期刊数据库

稻米蒸煮食味品质的全基因组关联分析及遗传解析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

江苏农业科学 2024年第12期52卷 34-44页

作者：林艳林旻陈在杰顾建强潘雷博陈光伟胡昌泉福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室福建福州350001 福建农林大学生命科学学院福建福州350002

随着人们生活水平的提高,对稻米品质的要求越来越高,蒸煮食味品质逐渐成为水稻育种家的重要育种目标与工作难点。对稻米蒸熟食味品质相关性状的遗传解析、探索基于优异单倍型组合是改善、提升水稻蒸煮食味品质的基础。考察收集的199份... 详细信息

随着人们生活水平的提高,对稻米品质的要求越来越高,蒸煮食味品质逐渐成为水稻育种家的重要育种目标与工作难点。对稻米蒸熟食味品质相关性状的遗传解析、探索基于优异单倍型组合是改善、提升水稻蒸煮食味品质的基础。考察收集的199份华南优质稻直链淀粉含量、蛋白质含量、碱消值、食味值、蒸煮食味值等5个稻米蒸煮食味品质性状,结合全基因组测序(覆盖深度20×)所得4818707个单核苷酸多态性(SNP),用混合线性模型进行稻米蒸煮食味品质的全基因组关联分析。结果表明,共定位到显著性位点342个,其中5个为已克隆的与蒸煮食味品质相关的候选基因/QTL,包括调节稻米中直链淀粉含量的基因Du3、Flo2、OsSSI、Wx与控制稻米糊化温度的主效基因ALK。针对极显著关联的ALK与Wx基因功能变异位点,结合水稻基因组序列变异数据库RiceVarMap开展功能单倍型分析,发现Wx基因的Hap2(T)、ALK基因的Hap3(CAC)有利于提高稻米的蒸煮食味品质。研究结果可为利用优质单倍型组合提高稻米蒸煮食味品质的水稻分子设计育种研究提供理论参考。

关键词：蒸煮食味品质全基因组关联分析单倍型遗传解析

丝瓜WRKY基因家族鉴定及其低温胁迫下表达分析

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

西南农业学报 2024年

作者：康玉妹薛珠政李永平马慧斐黄昊福建省农业科学院作物研究所/福建省蔬菜遗传育种重点实验室

【目的】WRKY转录因子在植物响应低温胁迫中发挥重要的调控作用，但丝瓜[Luffa cylindrica（L.) Roem.]WRKY基因家族的全基因组鉴定及其响应低温胁迫分子机制的报道较少。【方法】本研究采用生信数据处理等方法全基因组鉴定丝瓜WRKY基... 详细信息

【目的】WRKY转录因子在植物响应低温胁迫中发挥重要的调控作用，但丝瓜[Luffa cylindrica（L.) Roem.]WRKY基因家族的全基因组鉴定及其响应低温胁迫分子机制的报道较少。【方法】本研究采用生信数据处理等方法全基因组鉴定丝瓜WRKY基因家族，分析丝瓜WRKY基因家族特点、功能及表达情况，并利用LC-MC技术检测丝瓜响应低温胁迫分子机制。【结果】丝瓜全基因组中共鉴定出62个LcWRKYs，非均匀地分布在13条染色体上；系统进化树分析发现，丝瓜WRKY成员被分成3大类群(Ⅰ-Ⅲ)，第Ⅲ类群又被分成5个亚群(Ⅲa-e)；共线性分析发现，丝瓜和拟南芥(Arabidopsis thaliana) WRKY基因家族之间具有共线基因对56个，LcWRKYs基因之间具有片段复制基因对17个；分析启动子发现，LcWRKYs启动子具有顺式调控元件，多种与激素和逆境响应等相关；低温胁迫表达分析发现，4个LcWRKYs受低温胁迫显著上调表达；基于LC-MC检测获得激素JA、MEJA、SA、ABA含量，分析丝瓜响应低温胁迫分子机制，LcWRKYs含有茉莉酸甲酯、脱落酸、水杨酸响应元件，可能参与调节丝瓜的生物学过程及逆境胁迫响应。【结论】该研究结果为解析WRKY基因在丝瓜低温胁迫响应中的作用以及WRKY基因家族的进一步功能分析提供新信息，并为后续耐低温LcWRKY功能、编辑等研究提供基础，为创制耐寒材料及培育丝瓜耐寒品种提供技术支持。

关键词： WRKY基因家族表达模式低温胁迫丝瓜

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

基于根区温度和肥料浓度耦合的草莓生长调控

农业工程学报 2024年第12期40卷 109-116页

作者：樊小雪陈晓东金晶蔡伟建王庆莲赵密珍毛晓娟任妮江苏省农业科学院农业信息研究所农业农村部长三角智慧农业技术重点实验室南京210014 江苏省农业科学院果树研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室南京210014

为探索草莓根区加热的最适温度及施肥浓度,该研究设置3个根区温度水平(不加温(8℃)、16、22℃)和3个肥料浓度水平(0.5、1.5、2.5 g/L),共计9个处理。分析了根区温度和肥料浓度协同作用对草莓产量、品质、肥料偏生产力、水分利用率的影... 详细信息

为探索草莓根区加热的最适温度及施肥浓度,该研究设置3个根区温度水平(不加温(8℃)、16、22℃)和3个肥料浓度水平(0.5、1.5、2.5 g/L),共计9个处理。分析了根区温度和肥料浓度协同作用对草莓产量、品质、肥料偏生产力、水分利用率的影响。结合层次分析法和CRITIC客观赋权法,运用优劣解距离法对各处理进行基于草莓产量、品质、肥料偏生产力、水分利用率的综合评价。结果表明:1)采用根区加温对设施草莓生长有促进作用。在采摘第3茬果实时,加温到16℃和22℃的处理下可以采摘的草莓植株数量相较于不加温处理明显增加。2)肥料浓度对草莓生长综合评分的影响大于根区温度。高肥料浓度(2.5 g/L)会降低草莓产量,中肥料浓度(1.5 g/L)不仅能增加单果质量,还能提高肥料偏生产力和水分利用率,具有更好的经济效益。3)基于TOPSIS综合评价建立了设施草莓生长综合评价体系,得出评分最高的处理为T5处理(16℃,1.5 g/L)。通过寻找最优区间,结果发现根区温度在13.10~18.47℃,肥料浓度在1.43~1.87g/L时,设施草莓生长效果较好。该研究结果可为设施草莓冬季及早春的温度和肥水管理提供理论依据。

关键词：作物肥料根区温度草莓综合评价生长调控

同方期刊数据库

基于转录组学探究高糖饮食诱导秀丽线虫衰老的分子机制

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

食品科学 2024年第11期45卷 24-30页

作者：李蓉徐艳缪园欣陶明芳荆楚理工学院农业生物技术研究所湖北荆门448000 湖北省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所农产品营养品质与安全湖北省重点实验室湖北武汉430064

为了揭示高糖饮食对衰老影响的分子机制,利用转录组学技术探究高糖饮食对秀丽线虫体基因表达谱的影响。结果表明,高糖饮食造成线虫体内4183个基因表达发生显著变化。此外,基因本体论富集分析表明,高糖处理后线虫差异表达基因在衰老、未... 详细信息

为了揭示高糖饮食对衰老影响的分子机制,利用转录组学技术探究高糖饮食对秀丽线虫体基因表达谱的影响。结果表明,高糖饮食造成线虫体内4183个基因表达发生显著变化。此外,基因本体论富集分析表明,高糖处理后线虫差异表达基因在衰老、未折叠蛋白反应、压力应激响应、自噬、转移酶活力、催化酶活力、热休克蛋白连接等方面显著富集。京都基因与基因组百科全书富集分析表明,差异表达基因在线虫寿命调节途径、自噬调节、丙酮酸代谢、FOXO信号通路、糖酵解/糖异生、谷胱甘肽代谢、转化生长因子-β信号通路也显著富集。通过对相关差异基因表达进行验证,发现高糖会上调胰岛素信号通路相关基因和糖脂代谢相关基因的表达,下调热应激抗性和抗氧化调控相关基因的表达。本研究结果可为深入阐释高糖饮食对寿命及代谢影响的分子机制提供理论依据。

关键词：高糖饮食秀丽隐杆线虫转录组学衰老

同方期刊数据库

普通丝瓜PYL基因家族鉴定及在果实发育中表达分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

西北植物学报 2024年

作者：王玉倩彭丽娟刘建汀温庆放钟凤林朱海生福建省蔬菜遗传育种重点实验室福建省农业科学院作物研究所福建农林大学园艺学院

【目的】探究普通丝瓜PYL基因在ABA处理下的表达模式,以期为深入研究其基因功能提供参考依据,也为分子抗性育种以及提高普通丝瓜品质和产量提供新思路。【方法】用生物信息学方法,对普通丝瓜全基因组进行鉴定,PYL基因家族在的染色体定... 详细信息

【目的】探究普通丝瓜PYL基因在ABA处理下的表达模式,以期为深入研究其基因功能提供参考依据,也为分子抗性育种以及提高普通丝瓜品质和产量提供新思路。【方法】用生物信息学方法,对普通丝瓜全基因组进行鉴定,PYL基因家族在的染色体定位、基因结构、基因共线性、选择压力、进化亲缘关系和顺式作用元件分析,并通过qRT-PCR验证在不同浓度ABA下基因特征表达。【结果】在普通丝瓜全基因组中鉴定到11个LcPYL基因,CDS长度576～966bp,编码蛋白均具有典型PYR＿PYL＿RCAR＿like结构;共线性分析发现7对片段复制基因对,普通丝瓜PYL基因启动子含多个与植物激素相关的顺式作用元件,其成员的表达具有一定的组织特异性;普通丝瓜果实在不同浓度外源ABA处理下:2mg/mLABA处理LcPYLs表达无显著变化,4mg/mLABA处理LcPYL5、LcPYL7、LcPYL11显著上调表达,8mg/mLABA处理LcPYL1、LcPYL7开花当天显著表达。【结论】对普通丝瓜PYL家族成员进行了系统的鉴定与分析,明确其分子结构特征和表达模式,其中LcPYL1、LcPYL5、LcPYL7和LcPYL11可能是与内源ABA生物合成密切相关的关键基因。

关键词：普通丝瓜 PYL基因家族果实发育外源ABA处理表达分析