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SiFa STR 23plex检测体系在福建地区汉族人群中的应用

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福建医药杂志 2024年第4期46卷 22-26页

作者：吴贻晨余鸿陈点王尧城赖力福建省立医院输血科福州350001 福建医科大学省立临床医学院福建省立医院司法鉴定所福建省心血管病重点实验室福州350001

目的调查SiFa STR 23plex检测体系中21个常染色体STR基因座和1个Y-InDel位点在福建地区汉族群体中的遗传多态性,并探讨其在法医物证鉴定方面的应用价值。方法采用SiFa STR 23plex检测体系对302例福建地区汉族无关个体血样进行分型检测,... 详细信息

目的调查SiFa STR 23plex检测体系中21个常染色体STR基因座和1个Y-InDel位点在福建地区汉族群体中的遗传多态性,并探讨其在法医物证鉴定方面的应用价值。方法采用SiFa STR 23plex检测体系对302例福建地区汉族无关个体血样进行分型检测,并通过PowerStats v12软件统计福建地区汉族人群上述遗传标记的等位基因频率数据和群体遗传学参数。结果21个常染色体STR基因座多态信息含量为0.5843~0.9117,平均个体识别率为0.9285,平均杂合度为0.7834,检测体系累计个体识别力大于0.9999999999,累计非父排除率大于0.999999992,各STR基因座均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。异常基因座分型2例,1例为D1S1656基因座出现三带型等位基因14/15/17.3,另发现1例Amelogenin性别基因座缺失AMEL-X基因分型。男性个体的Y-InDel位点的“缺失”基因型占82.9%,“插入”基因型占17.1%。结论SiFa STR 23plex检测体系在福建地区汉族人群中具有高度的遗传多态性和较强的法医鉴别能力,能够作为个体识别和亲权鉴定的重要手段并对建立群体DNA数据库提供数据支持。

关键词：遗传多态性 STR基因座福建汉族插入缺失多态性

C57BL/6小鼠微小三毛滴虫的观察与种系发育分析

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福建畜牧兽医 2024年第4期46卷 10-12,18页

作者：温福利福建医科大学省立临床医学院/福建省立医院/福州大学附属省立医院福州350001

为鉴定从某外单位引进的C57BL/6小鼠粪样检测中发现的虫体种类,本试验对虫体进行形态学观察,并进行种系发育分析。取C57BL/6小鼠粪样涂片和瑞士染色后进行显微镜观察,提取粪样总DNA,根据三毛滴虫的16S rRNA进行PCR扩增后测序,运用MEGA1... 详细信息

为鉴定从某外单位引进的C57BL/6小鼠粪样检测中发现的虫体种类,本试验对虫体进行形态学观察,并进行种系发育分析。取C57BL/6小鼠粪样涂片和瑞士染色后进行显微镜观察,提取粪样总DNA,根据三毛滴虫的16S rRNA进行PCR扩增后测序,运用MEGA11进行种系发育分析。显微镜观察发现,虫体符合微小三毛滴虫的形态学特征,测序发现微小三毛滴虫的基因序列与鼠三毛滴虫高度同源。

关键词： C57BL/6小鼠微小三毛滴虫 16S rRNA 种系发育分析

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基于机器学习算法的深静脉血栓代谢标志物的分析策略

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分析化学 2024年第7期52卷 1039-1054页

作者：刘明锋吴妍娟周世栋党丽虹李健杜艳孙俊红曹洁山西医科大学法医学院上海市法医学重点实验室司法部司法鉴定重点实验室(司法鉴定科学研究院)

深静脉血栓形成（DVT）是临床常见的周围血管病，具有发病隐匿和病因复杂等特征。由于缺乏准确有效的早期诊断方法，DVT易被漏诊或误诊，筛选可靠的生物标志物是目前亟需解决的关键问题。本研究采用基于气相色谱-质谱联用（GC-MS）的代... 详细信息

深静脉血栓形成（DVT）是临床常见的周围血管病，具有发病隐匿和病因复杂等特征。由于缺乏准确有效的早期诊断方法，DVT易被漏诊或误诊，筛选可靠的生物标志物是目前亟需解决的关键问题。本研究采用基于气相色谱-质谱联用（GC-MS）的代谢组学技术考察DVT大鼠尿液中的内源性代谢物变化规律，结合多元统计分析和多种特征选择算法筛选特征代谢物，构建了DVT机器学习诊断模型。建立了下腔静脉结扎大鼠模型，在代谢笼中收集血栓形成期（48～72 h）尿液，采用GC-MS技术采集DVT及对照组尿液代谢谱。经FiehnLib气相色谱-质谱数据库比对，在大鼠尿液中共鉴定出176种内源性代谢物；使用正交偏最小二乘判别分析（OPLS-DA）结合Mann-Whitney U检验，筛选出26种DVT差异代谢物；联合多种特征选择算法进一步筛选获得13种与DVT发生密切相关的关键代谢物。构建了高斯朴素贝叶斯（GNB）、支持向量机（SVM）、逻辑回归（LR）和线性判别分析（LDA）机器学习模型并用于DVT诊断。对各模型的性能进行评估比较发现，使用13种关键代谢物构建的诊断模型准确率高、稳定性好，其预测性能优于使用176种代谢物及26种差异代谢物构建的诊断模型。研究结果表明，联合多种特征选择算法分析DVT大鼠尿液的代谢物信息，可有效筛选出可靠的DVT潜在标志物，构建的机器学习模型可为DVT的自动化诊断提供新的技术手段。

关键词：深静脉血栓形成机器学习代谢组学气相色谱-质谱联用特征选择

来源：博看期刊

胃腺癌预后非编码长链RNA及抗肿瘤药敏分析

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中国临床药理学杂志 2024年第1期40卷 22-26页

作者：黄玉妹黄静吴阿贞厦门大学附属第一医院药剂科福建厦门361001 福建医科大学肿瘤临床医学院、福建省肿瘤医院药剂科福建福州350013

目的本研究旨在探索长链非编码RNA(lncRNAs)对胃腺癌(STAD)患者的预后价值。方法从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中检索STAD患者的RNA测序数据和对应的临床资料。用生物信息学方法鉴定差异表达lncRNAs。用生存分析、独立预后分析和受试者... 详细信息

目的本研究旨在探索长链非编码RNA(lncRNAs)对胃腺癌(STAD)患者的预后价值。方法从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中检索STAD患者的RNA测序数据和对应的临床资料。用生物信息学方法鉴定差异表达lncRNAs。用生存分析、独立预后分析和受试者工作特征(ROC)曲线分析筛选并鉴定出有独立预后价值的lncRNAs。进一步对与预后lncRNAs共表达的基因进行基因本体(GO)功能富集分析,最后通过抗肿瘤药敏预测“oncoPredict”R包预测抗肿瘤临床治疗的反应。结果从343例STAD肿瘤组织和30例癌旁组织中共鉴定出差异表达的lncRNAs 1583个。通过筛选得到有生存和独立预后价值并且可以预测患者临床结局的风险因子lncRNAs AP000695.1,预测患者5年生存率的AUC达到0.836。lncRNAs AP000695.1的基因共表达分析发现,AP000695.1与16个参与肿瘤细胞侵袭、转移和扩散的基因有共表达关系。基于该因子的抗肿瘤药敏预测,发现低AP000695.1的患者对多种靶向抗肿瘤药物的敏感性更强。结论本研究发现一个有独立预后价值的风险因子lncRNAs AP000695.1,可用于预测STAD患者的临床结局和为个体化抗肿瘤治疗提供参考。

关键词：胃腺癌非编码长链RNA 药物敏感性预测预后分析

人脐带间充质干细胞外泌体miR-21-5p对颗粒细胞凋亡的影响

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中华生殖与避孕杂志 2024年第9期44卷 930-937页

作者：杜生荣杨雷孙艳林运鸿陈清汾笪琳萃黄鹏宇郑备红福建省妇幼保健院生殖医学中心福建医科大学妇儿临床医学院福州福建省妇幼保健院产科福建省母胎医学临床医学研究中心福州福建省妇幼保健院产前诊断中心福建省产前诊断与出生缺陷重点实验室福州

目的探究人脐带间充质干细胞来源的外泌体miR-21-5p对人颗粒细胞凋亡的影响。方法不同浓度(0 μmol/L、30 μmol/L、60 μmol/L和100 μmol/L)磷酰胺氮芥作用KGN细胞48 h构建颗粒细胞凋亡模型, 采用qPCR和Western blotting分别检测bax、... 详细信息

目的探究人脐带间充质干细胞来源的外泌体miR-21-5p对人颗粒细胞凋亡的影响。方法不同浓度(0 μmol/L、30 μmol/L、60 μmol/L和100 μmol/L)磷酰胺氮芥作用KGN细胞48 h构建颗粒细胞凋亡模型, 采用qPCR和Western blotting分别检测bax、bcl2的mRNA和蛋白水平, 并用流式细胞计数检测凋亡率, 以筛选出磷酰胺氮芥构建凋亡模型的最佳浓度。利用hsa-miR-21-5p过表达质粒瞬时转染人脐带间充质干细胞, 通过qPCR检测hsa-miR-21-5p表达水平;分离过表达miR-21-5p的外泌体, 利用纳米流式和电子显微镜鉴定miR-21-5p外泌体。对磷酰胺氮芥构建成功的KGN细胞凋亡模型中加入不同浓度(5 μg/mL、10 μg/mL和15 μg/mL)的过表达miR-21外泌体, 采用qPCR和Western blotting分别检测bax、bcl2的mRNA和蛋白水平, 采用PKH-26标记外泌体示踪其在颗粒细胞的位置。结果 60 μmol/L磷酰胺氮芥作用的KGN细胞中bax mRNA 和蛋白水平均显著高于0 μmol/L磷酰胺氮芥组(均P0.05)。但5 μg/mL、10 μg/mL和15 μg/mL miR-21-5-p外泌体组bax mRNA表达水平低于60 μmol/L磷酰胺氮芥组(P=0.008、P=0.003、P0.05)。与60 μmol/L 磷酰胺氮芥组比, 5 μg/mL、10 μg/mL和15 μg/mL空载外泌体组BAX蛋白表达差异均无统计学意义(均P>0.05), 而5 μg/mL、10 μg/mL和15 μg/mL miR-21-5-p外泌体组与60 μmol/L磷酰胺氮芥组比较BAX蛋白表达量降低, 差异均具有统计学意义(均P0.05)。结论通过脐血间充质干细胞过表达miR-21分泌的外泌体, 可以对人颗粒细胞有效地发挥抗凋亡的作用。

关键词：人脐带间充质干细胞外泌体颗粒细胞凋亡

基于双硫死亡的心肌缺血再灌注损伤相关风险基因筛选及分析

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重庆医科大学学报 2024年第4期49卷 401-408页

作者：杨林方林陈蔼夏冰戴佳琳乐翠云段智奥汪家文贵州医科大学法医学院/法医司法鉴定中心贵阳550004

目的:筛选基于双硫死亡的心肌缺血再灌注损伤(myocardial ischemia reperfusion injury,MIRI)相关风险基因及探索其可能的作用途径。方法:用R语言limma分析并筛选MIRI相关风险基因24 h组与Control组之间的差异表达基因。基于GO和KEGG数... 详细信息

目的:筛选基于双硫死亡的心肌缺血再灌注损伤(myocardial ischemia reperfusion injury,MIRI)相关风险基因及探索其可能的作用途径。方法:用R语言limma分析并筛选MIRI相关风险基因24 h组与Control组之间的差异表达基因。基于GO和KEGG数据库利用R语言cluterProfiler包对其进行功能富集分析。根据双硫死亡基因集以及GSE160516的表达数据,利用R语言GSVA包中的ssgsea法对其进行富集分析,并利用Venn图获得心肌缺血再灌注中双硫死亡相关基因的表达。用R语言psych包中的***计算双硫死亡相关基因与凋亡因子、线粒体、铁死亡及炎症等相关基因的相关性,并绘制热图。利用R语言Mfuzz包来进行不同时间点心肌缺血再灌注转录组数据的表达模式聚类分析并利用Venn图获取时序性差异表达的双硫死亡基因。结果:本研究共筛选出17个差异表达双硫死亡相关基因,经过双硫死亡相关基因与炎症、凋亡、铁死亡、线粒体基因相关性分析,以及双硫死亡相关基因与心肌缺血再灌注时序性分析的差异表达基因筛选,最终得到双硫死亡相关基因Flna、Myl6、Tln1在MIRI不同时间的特异性表达。结论:Flna、Myl6、Tln1在MIRI中可能起着关键作用,其基于双硫死亡同时与线粒体相关基因密切相关,可作为MIRI患者风险因素的筛选指标。

关键词：心肌缺血再灌注双硫死亡生信分析风险因素筛选指标

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不稳定冠状动脉粥样斑块病理特征及分类

法医学杂志 2024年第1期40卷 59-63页

作者：邢运虹李洋王文政王亮亮孙乐乐杜秋香曹洁何光龙孙俊红山西医科大学法医学院山西晋中030600 公安部鉴定中心北京100038 山西医科大学司法鉴定中心山西晋中030600

冠状动脉粥样硬化性心脏病猝死的法医学重要诊断指标如急性或慢性心肌缺血改变,有时由于死亡过程短暂、组织缺少反应时间,使得缺血部位定位困难,部分案件中死者首次发病即猝死,导致法医难以准确作出诊断。然而临床医学对于冠状动脉不稳... 详细信息

冠状动脉粥样硬化性心脏病猝死的法医学重要诊断指标如急性或慢性心肌缺血改变,有时由于死亡过程短暂、组织缺少反应时间,使得缺血部位定位困难,部分案件中死者首次发病即猝死,导致法医难以准确作出诊断。然而临床医学对于冠状动脉不稳定斑块的研究揭示了其病变引发的冠状动脉痉挛、血栓形成在冠心病猝死过程中所起的关键作用。本文主要归纳整理了基于临床医学研究的不稳定冠状动脉粥样斑块的病理特征,包括斑块破裂、斑块侵蚀和钙化结节,以及导致斑块不稳定的影响因素,并简述粥样斑块研究进展与研究技术方法,以期通过诊断冠状动脉粥样斑块的不同病理状态,完善冠心病猝死死亡机制研究,提高冠心病猝死法医学诊断的准确性。

关键词：法医病理学心脏性猝死冠状动脉粥样硬化性心脏病粥样斑块病理特征综述

宋慈精神与时代价值——纪念宋慈《洗冤集录》问世777周年

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法医学杂志 2024年第2期40卷 192-195页

作者：黄瑞亭陈新山福建省高级人民法院福建福州350003 福建南天鉴定有限公司司法鉴定所福建福州350101 华中科技大学同济医学院法医学系湖北武汉430030 广东金域司法鉴定所广东广州510330

今年是宋慈《洗冤集录》问世(淳祐丁未嘉平节前十日[1])777周年,重温《洗冤集录》并研究宋慈精神与时代价值,对当前司法鉴定改革与发展和促进法医学发展有重要的历史和现实意义。

关键词：法医学宋慈精神洗冤集录时代价值

高、低表达miR-296-5p的肿瘤细胞外泌体对食管鳞癌细胞迁移和侵袭的调控作用

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山东医药 2024年第5期64卷 44-48页

作者：陈河山许荣誉陈劭赓傅景梁陈泓波杜祥昆何荣琦福建医科大学附属泉州第一医院胸外科福建泉州362000 福建医科大学第三临床医学院

目的探讨高、低表达miR-296-5p的肿瘤细胞外泌体对食管鳞癌细胞(ESCC)迁移和侵袭的调控作用及其机制。方法提取转染miR-296-5p过表达和miR-296-5p干扰及其阴性对照物(NC)后的ESCC细胞外泌体,并采用透射电镜与Western blotting法进行鉴定... 详细信息

目的探讨高、低表达miR-296-5p的肿瘤细胞外泌体对食管鳞癌细胞(ESCC)迁移和侵袭的调控作用及其机制。方法提取转染miR-296-5p过表达和miR-296-5p干扰及其阴性对照物(NC)后的ESCC细胞外泌体,并采用透射电镜与Western blotting法进行鉴定;将ESCC细胞分为三组,干扰组、过表达组分别加入miR-296-5p干扰或过表达细胞的外泌体培养,NC组加入NC转染细胞的外泌体培养48 h;取各组细胞,MTT法检测细胞活力、Transwell法检测细胞侵袭迁移能力,RT-PCR、Western blotting法检测细胞黏附分子3(CADM3)、CADM1、CADM4、钙黏蛋白E(E-cadherin)及血管内皮细胞生成浸润相关蛋白CD31、CD44。结果细胞活力、迁移和侵袭细胞数过表达组>NC组>干扰组(P均NC组>过表达组,CADM3、CD31、CD44基因及蛋白表达水平过表达组>NC组>干扰组(P均<0.05)。结论高表达miR-296-5p的肿瘤细胞外泌体可能通过调控CADM、E-cadherin、CD31、CD44等基因表达提高ESCC细胞的侵袭、迁移能力。

关键词：微小核糖核酸296-5p 食管鳞癌外泌体细胞侵袭细胞迁移